Exploring Biogeochemistry and Microbial Diversity of Extant Microbialites in Mexico and Cuba

Microbialites are modern analogs of ancient microbial consortia that date as far back as the Archaean Eon. Microbialites have contributed to the geochemical history of our planet through their diverse metabolic capacities that mediate mineral precipitation. These mineral-forming microbial assemblages accumulate major ions, trace elements and biomass from their ambient aquatic environments; their role in the resulting chemical structure of these lithifications needs clarification. We studied the biogeochemistry and microbial structure of microbialites collected from diverse locations in Mexico and in a previously undescribed microbialite in Cuba. We examined their structure, chemistry and mineralogy at different scales using an array of nested methods including 16S rRNA gene high-throughput sequencing, elemental analysis, X-Ray fluorescence (XRF), X-Ray diffraction (XRD), Scanning Electron Microscopy-Energy Dispersive Spectroscopy (SEM-EDS), Fourier Transformed Infrared (FTIR) spectroscopy and Synchrotron Radiation-based Fourier Transformed Infrared (SR-FTIR) spectromicroscopy. The resulting data revealed high biological and chemical diversity among microbialites and specific microbe to chemical correlations. Regardless of the sampling site, Proteobacteria had the most significant correlations with biogeochemical parameters such as organic carbon (Corg), nitrogen and Corg:Ca ratio. Biogeochemically relevant bacterial groups (dominant phototrophs and heterotrophs) showed significant correlations with major ion composition, mineral type and transition element content, such as cadmium, cobalt, chromium, copper and nickel. Microbial-chemical relationships were discussed in reference to microbialite formation, microbial metabolic capacities and the role of transition elements as enzyme cofactors. This paper provides an analytical baseline to drive our understanding of the links between microbial diversity with the chemistry of their lithified precipitations

Dispositivo de iluminación para un mejor visualización de vasos sanguíneos superficiales y alteraciones cutáneas

Dispositivo de iluminación para una mejor visualización de vasos sanguíneos superficiales y alteraciones cutáneas. Comprende al menos una lámpara de luz blanca y un filtro o un conjunto de filtros cromáticos que transmite menos de un 10% de radiación visible con longitudes de onda comprendidas entre 520 nm y 580 nm, preferentemente entre 500 nm y 620 nm, de forma que la luz emergente del citado dispositivo de iluminación carece esencialmente de radiación de longitud de onda entre 520 nm y 580 nm, preferentemente entre 500 nm y 620 nm

Comparison of carcass and meat characteristics of Brahman grade cattle (Bos indicus) and crossbred water buffalo (Bubalus bubalis) fed on high roughage diet

The objective of this study was to compare the carcass and meat quality in crossbred cattle and crossbred water buffalo at the same younger age and fed with high roughage in the Philippines. Ten crossbred cattle and 10 crossbred water buffalo, with an average age of 22 months (18-24 months) were used in this experiment. The animals were fed a similar diet, which consisted of 85% Napier or Para grass and 15% concentrate mixture on a dry matter basis, for 180 days before slaughter. Slaughter weight of the crossbred water buffalo was higher (P \u3c 0.05) than that of the cattle, although the dressing percentage was significantly (P \u3c 0.01) lower for the former than for the latter. The estimated lean yield was higher (P \u3c 0.05) in crossbred cattle than crossbred water buffalo. The muscle fiber diameter of loin in buffalo meat was smaller (P \u3c 0.05) than that in cattle. In regard to carcass and meat quality, the crossbred water buffalo was comparable or slightly superior to the crossbred cattle in tenderness, sensory score of color (P \u3c 0.01) and flavor (P \u3c 0.05). These results clearly indicate that at a younger age and even under high roughage-based fattening rations, crossbred water buffalo are able to produce good quality meat, which will be by no means inferior to that of crossbred cattle in the Philippines. © 2008 Japanese Society of Animal Science

Paleopedogenesis, sedimentacion y evolucion geomorfologica holocenica en el sistema fluvial del Arroyo Tinajas, Sonora

En este trabajo se presenta un análisis integral del registro sedimentario y paleopedológico en una secuencia edafo-sedimentaria encontrada en la terraza baja del arroyo Tinajas, estado de Sonora. El objetivo de esta investigación es establecer los mecanismos de formación de dicha secuencia que permitan hacer una reconstrucción de las condiciones paleoambientales. La secuencia consiste de un suelo moderno y once paleosuelos intercalados con sedimentos fluviales. Se determinaron sus propiedades físicas (color, granulometría), químicas (pH, conductividad eléctrica, contenido de calcio total), de magnetismo de rocas y micromorfológicas. Así mismo, se hizo la identificación de la mineralogía de arcilla por difracción de rayos X. Prácticamente todos los paleosuelos están decapitados. Debido a la falta de horizontes A, el marco cronológico de la secuencia se obtuvo usando una pequeña cantidad de materia orgánica encontrada en el paleosuelo 8. Para concentrar la materia orgánica, se hizo una extracción por desmineralización con ácido fluorhídrico. Esta materia orgánica desmineralizada se dató por 14C por la técnica de AMS (Accelerator Mass Spectrometry), arrojando una edad de 8415 ± 39 años cal AP (Beta 473502). Los resultados muestran que los paleosuelos tienen un bajo grado de desarrollo. A pesar de ello, es posible establecer las principales tendencias pedogenéticas: la parte baja de la secuencia muestra paleosuelos de granulometría fina, con fuertes rasgos reductomórficos y propiedades vérticas. En contraste, los paleosuelos superiores son de textura más gruesa, con mayor porosidad biogénica e, inclusive, con revestimientos arcillosos. A partir del paleosuelo 7, se aprecia un cambio en la energía del relieve, dado por variaciones sedimentológicas (gradación inversa, aumento del tamaño de grano del sedimento), el cual es más evidente en los paleosuelos 2, 3 y 4, dada la alta concentración de gravas, mal seleccionadas y angulosas, que se asocian con procesos fluvio-coluviales. Suponemos que este cambio en el tipo de pedogénesis, sumado a las variaciones sedimentológicas, es debido a oscilaciones climáticas ocurridas en el Holoceno medio a nivel regional, ya que no se tiene documentada actividad tectónica reciente que pudiera influir

Paleopedogenesis, sedimentacion y evolucion geomorfologica holocenica en el sistema fluvial del Arroyo Tinajas, Sonora

En este trabajo se presenta un análisis integral del registro sedimentario y paleopedológico en una secuencia edafo-sedimentaria encontrada en la terraza baja del arroyo Tinajas, estado de Sonora. El objetivo de esta investigación es establecer los mecanismos de formación de dicha secuencia que permitan hacer una reconstrucción de las condiciones paleoambientales. La secuencia consiste de un suelo moderno y once paleosuelos intercalados con sedimentos fluviales. Se determinaron sus propiedades físicas (color, granulometría), químicas (pH, conductividad eléctrica, contenido de calcio total), de magnetismo de rocas y micromorfológicas. Así mismo, se hizo la identificación de la mineralogía de arcilla por difracción de rayos X. Prácticamente todos los paleosuelos están decapitados. Debido a la falta de horizontes A, el marco cronológico de la secuencia se obtuvo usando una pequeña cantidad de materia orgánica encontrada en el paleosuelo 8. Para concentrar la materia orgánica, se hizo una extracción por desmineralización con ácido fluorhídrico. Esta materia orgánica desmineralizada se dató por 14C por la técnica de AMS (Accelerator Mass Spectrometry), arrojando una edad de 8415 ± 39 años cal AP (Beta 473502). Los resultados muestran que los paleosuelos tienen un bajo grado de desarrollo. A pesar de ello, es posible establecer las principales tendencias pedogenéticas: la parte baja de la secuencia muestra paleosuelos de granulometría fina, con fuertes rasgos reductomórficos y propiedades vérticas. En contraste, los paleosuelos superiores son de textura más gruesa, con mayor porosidad biogénica e, inclusive, con revestimientos arcillosos. A partir del paleosuelo 7, se aprecia un cambio en la energía del relieve, dado por variaciones sedimentológicas (gradación inversa, aumento del tamaño de grano del sedimento), el cual es más evidente en los paleosuelos 2, 3 y 4, dada la alta concentración de gravas, mal seleccionadas y angulosas, que se asocian con procesos fluvio-coluviales. Suponemos que este cambio en el tipo de pedogénesis, sumado a las variaciones sedimentológicas, es debido a oscilaciones climáticas ocurridas en el Holoceno medio a nivel regional, ya que no se tiene documentada actividad tectónica reciente que pudiera influir.</jats:p

Interplay of microbial communities with mineral environments in coralline algae.

Coralline algae are worldwide carbonate builders, considered to be foundational species and biodiversity hotspots. Coralline habitats face increasing pressure from human activities and effects related to Global Change, yet their ecological properties and adaptive responses remain poorly understood. The relationships of the algal microbiota with the mineral bioconstructions, as well as plasticity and resilience of coralline holobionts in a changing environment, are of particular interest. In the Gulf of California, Neogoniolithon trichotomum (Rhodophyta) is the main carbonate builder in tidal pools. We performed a multi-disciplinary assessment of the N. trichotomum microstructure using XRD, SEM microscopy and SR-FTIR spectromicroscopy. In the algal perithallus, magnesium-calcite and aragonite were spatially segregated and embedded in a polysaccharide matrix (rich in sulfated polysaccharides). Mg-calcites (18-19&nbsp;mol%&nbsp;Mg) were the main mineral components of the thallus overall, followed by iron carbonates related to dolomite (ankerite) and siderite. Minerals of late evaporitic sequences (sylvite and bischofite) were also present, suggesting potential halophilic microenvironments within the algal thalli. The diverse set of abundant halophilic, halotolerant and oligotrophic taxa, whose abundance increase in the summer, further suggests this condition. We created an integrated model, based on environmental parameters and the microbiota distribution, that identified temperature and nutrient availability (particularly nitrate and silicate) as the main parameters related to specific taxa patterns. Among these, Hahella, Granulossicoccus, Ferrimonas, Spongiibacteraceae and cyanobacterial Xenococcaceae and Nostocaceae change significantly between seasons. These bacterial components might play relevant roles in algal plasticity and adaptive responses to a changing environment. This study contributes to the understanding of the interplay of the prokaryotic microbiota with the mineral microenvironments of coralline algae. Because of their carbonates with potential resistance to dissolution in a higher pCO2 world and their seasonally dynamic bacteria, coralline algae are relevant targets to study coastal resilience and carbonated systems responses to changing environments