183 research outputs found

    Quantification and compositional strategies

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    An Optimized Sponge for microRNA miR-9 Affects Spinal Motor Neuron Development in vivo

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    The specification of motor neuron (MN) subtypes and columnar organization in developing spinal cord is controlled by multiple transcription factors. FoxP1 drives specification of lateral motor neuron (LMN) subtypes, and we demonstrated in our previous work that FoxP1 expression levels are regulated by the microRNA miR-9. Here we show that ectopic FoxP1 expression in the chick spinal cord can rescue Lhx3 and Hb9 expression in MNs altered by miR-9 over-expression, demonstrating that FoxP1 is a critical functional interaction partner for miR-9 in LMN development. Moreover, we have optimized a technique called a miRNA sponge in vitro, to permit easy discovery of the role of individual miRNA in vivo using a loss-of-function approach. We here show that narrow spacing between binding sites, inclusion of a coding gene, and optimizing the number of miRNA binding sites can significantly increase the blocking ability of a sponge. We go on to show that a miR-9 sponge reduces detectable miR-9 in the ventral horn, preventing miR-9 silencing of FoxP1 in vivo, and in turn modifies MN subtypes in the spinal cord. Our designs for optimized sponges provide a knockdown tool that is ready to be used to study the function of miRNA in vivo, and in particular for generating transgenic animal models

    Evaluating the Feasibility of Hybrid Ventilation in Educational Spaces: A Simulation Study in the Northern Basque Country Climate

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    This paper delves into the examination of indoor comfort in classroom environments and its interplay with ventilation on human wellbeing in scenarios of varying indoor carbon dioxide concentrations. The assessment of these parameters was done according to the provisions outlined in the Spanish national Regulation of Thermal Installations in Buildings (RITE). This study also compares various ventilation strategies, namely natural, mechanical and hybrid ventilation, commenting the pros and cons of each method in the climate of the Basque Country, Spain. To do so, a classroom in the School of Architecture of San Sebastián was modelled in thermal simulation software. Simulations were carried out for full days in 5-minute intervals using Design Builder, and considered three different exterior scenarios (a cold day, temperate day, and a warm one) and three different ventilation systems (natural, mechanical with heat recovery, and hybrid). Two additional scenarios where added for control, one with no ventilation at all and another with a partial, constant, natural ventilation, like was done during the COVID-19 pandemic. Thus, the natural ventilation option was evaluated under three conditions (windows always closed, windows open 15%, and windows operated by thermal sensation of the user). The mechanical system evaluated consisted of a constant flow ventilation for IDA 2 IAQ with an airflow of 12.5 l/s·person. The modelled hybrid system consisted in a combination of simple flux mechanical ventilation and open windows and doors under some particular conditions. An occupancy rate of 50% of the theoretical maximum occupancy of the classroom and a heating setpoint of 15ºC were considered. This article presents the CO2 concentration, final energy consumption and thermal comfort results obtained in the simulation and compares between the different scenarios. The results showed that the hybrid ventilation system was able to effectively control indoor air quality, providing a healthy and comfortable environment for occupants. The hybrid system demonstrated improved energy efficiency compared to the natural ventilation system, while maintaining a high level of indoor air quality. Overall, the results of this study highlight the importance of considering hybrid ventilation in educational spaces in the northern Basque Country climate. The study provides valuable insights for building design and operation, especially for renovation of existing schools and educational facilities that lack any means of mechanical ventilation, showing some of the potential for hybrid ventilation to improve indoor air quality and energy efficiency

    Rutas de señalización moduladoras de proliferación y diferenciación en células madre y precursoras neurales

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    Leída en Universidad Complutense de Madrid. Facultad de Ciencias Biológicas el 10-19-2006; 121 págs.El control de la neurogénesis en el SNC implica regular múltiples procesos celulares, como la proliferación del los precursores y células madre neurales, la diferenciación y la apoptosis. Así, las células madre neurales del bulbo olfatorio (CMBO) dependen de la (pro)insulina o del IGF-I para suproliferación en cultivo. El IGF-I además promueve la diferenciación de las CMBO a neuronas y lía, tanto en cultivo como in vivo. Con objeto de estudiar la posible implicación de las rutas bioquímicas PI3/Akt y MAP kinasas en la señalización por factores de la familia de la insulina, las CMBO se trataron durante 30 minutos con IGF-I. Hemos visto que esta proteína estimula notablemente la fosforilación de Akt tanto en la fase de proliferación como de diferenciación de las CMBO, mientras que no activa significativamente ERK1/ERK2. La importancia de la ruta bioquímica de PI3K/Akt se comprobó mediante la sobreexpresión, utilizando construcciones retrovirales, en estas células de la fosfatasa PTEN, un inhibidor de dicha ruta. El aumento de PTEN provocó una disminución en los niveles basales de PAKT/AKT y además una reducción del número de neuronas y astrocitos derivados de las CMBO, pero no alteró su proliferación. Finalmente, para comprobar el efecto de la ausencia del IGF-I endógeno sobre la activación de Akt, hemos cuantificado esta proteína en BO de embriones knockout para IGF-I a diferentes edades. Nuestros datos muestran una disminución significativa delos niveles de PAKT/AKT en el BO de ratones nulos para IGF-1 a la edad de E16,5-E18,5. Por tanto, durante la neurogénesis del bulbo olfatorio, IGF-I activa la ruta de señalización de PI3K/Akt, siendo PTEN una molécula clave para la regulación de la diferenciación celular.Peer reviewe

    Estudio sobre las relaciones entre la percepción de competencia, el estado de ánimo y la tolerancia al estrés en jóvenes deportistas en formación

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    247 p.Este trabajo aborda el papel que juega la competencia percibida en el estado de ánimo y latolerancia al estrés de jóvenes deportistas en proceso de formación. Para ello se han realizado 2estudios. El primero con una muestra de 30 deportistas con edades comprendidas entre los 12 y20 años (M = 16.90; DT = 2.52) practicantes de 10 modalidades deportivas. El segundo conuna muestra de 74 deportistas, con edades comprendidas entre los 14 y 21 años (M = 17.63; DT= 1.90) practicantes de 18 modalidades deportivas diferentes y todos ellos pertenecientes a unprograma de apoyo a deportistas promesa de Gipuzkoa. En ambos casos el muestreo fue noprobabilístico y de tipo accidental, y el diseño ¿ex post facto¿. Los instrumentos utilizadosfueron 2 cuestionarios disponibles en la aplicación online Teskal (www.teskal.com): Perfíl delEstado de Forma del Entrenamiento (Profile of Mood States de McNair, Lorr y Droppleman,1971; Subescala de Competencia Percibida del cuestionario de Motivación de Logro de Ruiz etal., 2004; y Tolerancia Psicológica al Estrés compuesto por el RESTQ-Sport de Kellmann yKallus, 2001). Los resultados mostraron que los deportistas estudiados presentaron unoselevados niveles de competencia percibida, con un diagrama del estado de ánimo tipo PerfilIceberg (Morgan, 1980) y una alta tolerancia al estrés. Las correlaciones halladas entre lasvariables estudiadas se orientan en la dirección de que la competencia percibida genera unefecto amortiguador sobre las dimensiones negativas del estado de ánimo y de la tolerancia alestrés, y refuerza la dimensión emocional positiva y las recuperadoras del estrés. Todo ello noslleva a considerar que se pueden generar 2 perfiles de deportistas: Perfil 1: muestran una altacompetencia percibida, tolerancia a la fatiga y tolerancia al estrés, desenvolviéndose de formaacertada en las situaciones críticas de máxima exigencia personal en las que se requierenelevados niveles de esfuerzo; Perfil 2: deportistas con un nivel de competencia medio pero conuna baja tolerancia a la fatiga y al estrés, que en situaciones críticas o de máximo esfuerzo sesienten más vulnerables frente a las lesiones deportivas

    Jatorri berriztagarriko polimeroetan eta karbono-nanokargetan oinarritutako polimero-nahaste eta nanokonpositeak

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    217 p.Tesi honen abiapuntua eta erdigunea poliamida 4,10 (PA410) komertziala da, partzialki jatorri berriztagarrietatik eratorritako ingeniaritza biopolimero berria. Lanaren helburu nagusia ondorengoa da: material hori karakterizatzea eta bere propietate mekaniko eta elektrikoak hobetzea; alegia, jatorrizko materialak baino propietate mekaniko eta eroankortasun elektriko hobeak izango dituzten material berriak lortzea, material berri honen aplikazio-tartea zabaltzeko asmoz. Horretarako, PA410-a oinarritzat hartuta, hainbat polimero-nahaste eta nanokonposite (Nk) prestatu dira. Hainbat gehigarri erabili dira, eta bi bide nagusi jorratu dira: alde batetik, eroankortasun elektrikoa lortu nahian, karbonoan oinarritutako zenbait nanokarga gehitu dira, zehazki grafenoa (GR) eta karbono-nanohodiak (CNT); bestetik, poliamiden ohiko ezaugarria den talkarekiko erresistentzia txarra hobetu nahian, kautxu edo elastomeroak ere (Pebax motakoak, hain zuzen) erabili dira. Horrela, bada, horiek guztiak gehitzearen eragina aztertu da propietateetan. Horrenbestez, ekarpena egin nahi izan zaio nanokonposite polimeriko berri eta jasangarriagoen garapenari eta haien propietateen inguruko ezagutzari

    Distopia eta paradisua Euskal Hirian : Bernardo Atxagaren Etiopia makrotestuaren irakurketa semiotikorako hausnarketa kritikoak

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    Artikulu honen xedea Bernardo Atxagaren Etiopia liburuan mamituriko ideia poetikoak berraztertzea da, abiapuntutzat hartuz haietan Paradisuaren desioak eta Distopiaren esperientziak egiten duten talka. Azkerketa burutzeko, kritika-ildo semiotikoa jarraituko da, eta Ikasketa Kulturalen laguntzaz, testuaren irakurketa berritua proposatu nahi da. Horretarako, lehenik ildo pragmatikoa berrikusiko da, neobanguardiaren sustrai sozio-politikoak azaleratu eta, diktadurak idazleen literatura-poetiketan izandako eraginaren haritik, egilearen elkarrizketa eta hitzaldietan adieraziriko poetikaren zantzuetan ezarriko da fokua. Artikuluaren bigarren zatian, Etiopiaren irakurketa testualari eta transtestualari ekingo zaio ; horretarako lehenik, enuntziazio lirikoan eginiko hautu esanguratsuak deskribatuko dira. Hirugarrenik, liburuak bere osotasunean duen makrotestu-izaera hartuko da kontuan testuaren irakurketa sinboliko eta interpetatiborantz egiteko, horretarako, egitura, paratestuak eta topografia esanguratsuei buruzko irakurketa burutuz

    GIB-1aren Env gainazal proteinaren palmitoilazioak duen eragina kolesterolaren elkarrekintzan: GIB-1aren Env fusio proteinaren ingurune lipidikoaren azterketa.

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    [Euskaraz] Giza Immunoeskasiaren Birusaren (GIBaren) infekzioa mundu osoan zehar zabaldutako Hartutako Immuno Eskasiaren Sindromearen (HIESaren) kausa da. GIBaren mintzean jatorri birikoko proteina bakarra adierazten da: gainazal glikoproteina (Env). Env bi azpiunitatez osatutako trimero gisa txertatzen da mintzean: mintz kanpoko gp120 proteina eta gp41 transmintz proteina. GIBaren gp41 proteinak, Lentivirus generoko gainontzeko birus gehienek ez bezala, domeinu zitoplasmatiko (DZ) luzea du; gainera, GIBaren andui ezberdinetan sekuentzia sendoki kontserbatzen da. Honek, DZak GIBaren bizi-zikloan funtzio gakoa izan dezakeela iradokitzen du. Gure taldean burututako ikerketen emaitzek, Env proteinak kolesterolarekin elkar eragiteko gp41aren DZa nahitaezko eragilea dela frogatu dute, baita elkarrekintza hori Env proteina guztien taldekatzea (clustering-a) emateko beharrezkoa dela ere; gainera, Env azaleko glikoproteinen multzokatze hau ezinbestekoa da birusak infekzio gaitasuna eskuratu dezan. Palmitoilazioak proteinak, Env barne, kolesterolean aberatsak diren domeinuetara, baltsa lipidikoetara alegia, bideratzen dituenaren ebidentzia dago. Hala ere, ikerketa horiek detergenteekiko mintz erresistenteen (DRM, Detergent Resistant Membrane) metodoetan oinarrituta daude eta teknika honen mugak direla eta, ez dute zuzenki frogatzen baltsa lipidikoetarako asoziazioa. Izan ere, DRM erauzketa baldintzek lipido-proteina asoziazio berriak sortaraz ditzakete. Hala, lan honen helburua, gp41 proteinaren DZko palmitoilazioak Env-kolesterol elkarrekintzan daukan papera in vivo aztertzea da, klik kimika metodoaren eta lipido fotoaktibagarrien erabilerarekin. Esperimentuak gauzatzeko GIB-1NL4-3 C762S mutantea erabili da, zeinak 762. aminoazido posizioan zisteina serina ordezkapena duen eta beraz, palmitoilazioa galtzen duen. Ikerkuntza lan honek DZaren palmitoilazioa Env-kolesterol elkarrekintzaren erantzule ez dela frogatzen du, interakzioa DZaren eta mintzeko kolesterolaren artean zuzenean ematen delarik.[English] The Human Immunodeficiency Virus (HIV) infection is the cause of the worldwide spread Acquired Immune Deficiency Syndrome (AIDS). HIV expresses a single viral glycoprotein in the viral membrane: envelope (Env). This glycoprotein is formed by a trimer formed by two subunits, a surface gp120 protein and a transmembrane gp41 protein. In HIV, the cytoplasmic domain (CTD) sequence of the gp41 protein is uncommonly long among other lentiviruses and highly conserved within HIV serotypes, suggesting possible essential function in HIV´s life cycle. Preliminary results from the group show that the CTD is responsible for protein-cholesterol interaction and that such interaction is necessary for Env clustering within viral membrane. Moreover, clustering of Env has been proved to be a prerequisite for viral infection. Palmitoylation is thought to be one of the responsible factors for targeting membrane proteins, including Env, to cholesterol rich domains, commonly called, lipid rafts. However, studies were conducted by using DRM (Detergent Resistant Membrane) method which presents limitations in the establishment of a reliable direct association between proteins and lipid rafts. Since DRM extraction conditions can form new lipid-protein assemblies, the objective of this study was to clarify the role of palmitoylation in the interaction of the gp41 CTD-cholesterol in vivo by new techniques, such as, Click chemistry and radioactive photoactivable lipids. Experiments were performed with the HIV-1NL4-3 C762S mutant, which presents the substitution of the cysteine residue to serine in the 762nd position of the CTD, and therefore, it lacks of palmytoilation. The results of this scientific study demonstrate that the interaction of Env protein to cholesterol through the CTD is not due to palmitoylation, but direct domain-viral membrane interaction.[ES] La infección por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) es la causa de la propagación mundial del síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA). El VIH expresa una sola glicoproteína viral en la membrana viral: envoltura (Env). Esta glicoproteína está formada por un trímero formado por dos subunidades, una proteína gp120 de superficie y una proteína gp41 transmembrana. En el VIH, la secuencia del dominio citoplasmático (CTD) de la proteína gp41 es poco común entre otros lentivirus y está muy conservada en los serotipos del VIH, lo que sugiere una posible función esencial en el ciclo de vida del VIH. Los resultados preliminares del grupo muestran que el CTD es responsable de la interacción proteína-colesterol y que dicha interacción es necesaria para la agrupación de Env dentro de la membrana viral. Además, se ha demostrado que la agrupación de Env es un requisito previo para la infección viral. Se cree que la palmitoilación es uno de los factores responsables de dirigir las proteínas de membrana, incluida Env, a dominios ricos en colesterol, comúnmente llamados balsas lipídicas. Sin embargo, los estudios se realizaron utilizando el método DRM (Detergent Resistant Membrane) que presenta limitaciones en el establecimiento de una asociación directa confiable entre proteínas y balsas lipídicas. Dado que las condiciones de extracción de DRM pueden formar nuevos ensamblajes lípido-proteína, el objetivo de este estudio fue aclarar el papel de la palmitoilación en la interacción de la gp41 CTD-colesterol in vivo mediante nuevas técnicas, como la química Click y los lípidos fotoactivables radiactivos. Se realizaron experimentos con el mutante HIV-1NL4-3 C762S, que presenta la sustitución del residuo cisteína por serina en la posición 762 del CTD, y por tanto, carece de palmitoilación. Los resultados de este estudio científico demuestran que la interacción de la proteína Env con el colesterol a través del CTD no se debe a la palmitoilación, sino a la interacción dominio directo-membrana viral

    Thermal Comfort Evaluation of Offices Integrated Into an Industrial Building. Case Study of the Basque Country

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    This paper reports the indoor air operative temperature and relative humidity outcomes of a sixteen-month monitoring campaign of an administrative area in an industrial building in Tolosa (Spain). In a survey, users reported indoor climate dissatisfaction during the working hours, such as severe discomfort in the conference rooms due to excessive cold or overheating, poor indoor air quality or inadequate response of the HVAC systems. Internal operative temperatures and relative humidity have been analysed with and without environmental conditioning systems to study passive performance and effectiveness of active systems. These two parameters have been analysed in hourly intervals, during summer and winter periods. On the basis of the obtained data, the degree of thermal comfort of the users was evaluated, which allowed a comparison between the users' self-reported perception obtained through surveys and the monitored data. Three different standards were used to assess thermal comfort, namely the European Standard UNE-EN ISO 7730, the Spanish Regulations for thermal installations in buildings (RITE) and the criteria established by the National Institute for Occupational Safety and Health (INSHT). The study has made it possible to detect the main aspects that have a direct influence on user discomfort.The authors appreciate the support of PANELFISA and of the TOLOSALDEA LHII. Furthermore, the authors thank the Department of Architecture and the Vicerrectorate for Research of the University of the Basque County UPV/EHU for the financial support given for this research
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