Tests multiples pour la comparaison des probabilités de survenue d'une infidélité de transcription dans des ARNm sains et cancéreux

International audienceL'implication d'erreurs de transcription dans l'hétérogénéité du cancer avait jusqu'alors été peu considérée. En effet, la transcription est supposée fidèle et contrôlée par un système complexe de vérification. Afin d'étudier l'hétérogénéité des séquences d'ARNm issus de tissus sains et cancéreux de 17 gènes d'intérêt, les probabilités de survenue d'une substitution de base ont été comparées à chaque position des séquences des transcrits à l'aide d'une procédure de tests multiples. Pour cela, les séquences Expressed Sequences Tags, qui sont des copies partielles des ARNm d'un gène, ont été utilisées et un modèle prenant en compte l'erreur de séquençage inhérente à ces données a été proposé. Enfin, l'estimateur Location Based Estimator du nombre moyen de tests faux positifs a été étendu au cas de statistiques de tests discrètes. Cette étude préliminaire a ainsi permis de mettre en évidence les positions des ARNm plus fréquemment sujettes à des substitutions dans les tissus cancéreux que dans les tissus sains et d'introduire la notion d'infidélité de transcription chez l'Homme

Contribution à l'étude de la leptine et de son transport plasmatique dans l'obésité humainee

: La leptine, hormone produite par le tissu adipeux exerce un effet majeur sur la satiété. La déficience en leptine et en son récepteur induit chez l'homme et la souris, des obésités morbides survenant dès l'enfance. Toutefois, les sujets présentant une forme commune d'obésité se caractérisent par un taux élevé de leptine et donc par un état de leptino-résistance. Nous avons cherché à analyser les mécanismes responsables de cet état de résistance à la leptine. Nous avons donc étudié la relation entre masse grasse, leptinémie et concentration plasmatique de la forme soluble du récepteur à la leptine (SLR). Nos données établissent que l'obésité commune se caractérise bien par un état d'hyperleptinémie exprimé en terme absolu et relatif prenant en compte les formes libres et liées de le leptine. Par ailleurs, nous avons observé que les taux plasmatiques du SLR sont profondément diminués dans les formes communes d'obésité. Les taux plasmatiques de leptine sont corrélés à la masse grasse dans une population de femmes obèses. Toutefois cette corrélation n'est présente que chez les sujets présentant une forme modérée d'obésité. Cette corrélation n'est en effet pas retrouvée chez les sujets présentant une forme sévère d'obésité. Il existe cependant une relation indépendante entre masse grasse et leptinémie d'une part et SLR et masse grasse d'autre part, cette dernière corrélation étant négative. Nous avons toutefois observé que chez les sujets présentant une obésité sévère, une corrélation inverse existe entre les taux de leptine et les concentrations plasmatiques de SLR. Nous proposons donc que, dans les formes communes d'obésité modérée, le SLR, indépendant de la leptine, représente un facteur déterminant ou déterminé de la masse grasse. Nous proposons par ailleurs, que chez les individus présentant une forme sévère d'obésité mais disposant d'un récepteur fonctionnel à la leptine, l'hyperleptinémie relative induise une diminution de l'expression de ce récepteur.Leptin is an adipocyte-secreted hormone that exerts a major effect on satiety. In humans and in mice, leptin or leptin receptor deficiency induces severe obesity arising as early as in childhood. Nevertheless, in common obesity, leptin levels are elevated, suggesting that the hallmark of obesity is not leptin deficiency but hyperleptinemia. This phenomenon is called leptin resistance. The aim of this study was to investigate the relationship between fat mass, leptin and soluble leptin receptor (SLR) in an attempt to analyse the mechanism responsible for leptin resistance. Our data show that common obesity is characterised by hyperleptinemia expressed in absolute and relative terms and taking into account free and bound leptin. We have observed that SLR levels are strongly diminished in the case of common obesity. Plasma leptin levels and fat mass are correlated in a group of obese women. This correlation is only observed in women who are moderately obese. Indeed, this correlation is not found in obese women with severe obesity. Interestingly, there is an independent positive correlation between fat mass and leptin and a negative correlation between fat mass and SLR. However, we observed that in the case of people affected by severe obesity there is a negative correlation between leptin and SLR levels. What we suggest, then, is that in common moderate obesity, the SLR is a determinant or determined factor of fat mass independently of leptin. We further suggest that hyperleptinemia induces a lower expression of SLR in subjects with severe obesity but with a non-mutated leptin receptor.NANCY1-SCD Sciences & Techniques (545782101) / SudocSudocFranceF

Polyelectrolyte/fluorinated polymer interpenetrating polymer networks as fuel cell membrane

International audienceOriginal membranes based on an interpenetrating polymer network (IPN) architecture combining a poly(2-acrylamido-2-methyl-1-propane sulfonic acid) (AMPS) network and a fluorinated network were synthesized. The AMPS weight compositions were varied from 50 to 70 wt%. The first network was achieved by radical copolymerization of AMPS with a fluorinated telechelic diacrylate while the second one was obtained by photoinitiated cationic copolymerization of telechelic fluorinated diepoxide with trimethylol propane triglycidyl ether. The morphologies of these different IPNs were deduced from small-angle X-ray scattering (SAXS) spectra and dynamic thermomechanical analysis (DMTA). The main functional properties related to their use as proton exchange membrane in fuel cells were quantified, such as water vapor sorption, liquid water uptake (22-59 wt%), proton conductivity (1-63 mS/cm), gas permeability (0.06 and 0.80 barrer for dry oxygen and hydrogen, respectively), and oxidative and thermal stabilities. More precisely, the effects of the ionic exchange capacity (IEC) varying from 1.73 to 2.43 meq/g and the cross-linking density of the conducting phase on the morphology and the properties of IPN membranes were studied in detail. Finally, these IPN membranes were tested as fuel cell membrane and a correlation between the ex-situ and in-situ characterizations was established

Nonrandom variations in human cancer ESTs indicate that mRNA heterogeneity increases during carcinogenesis

Virtually all cancer biological attributes are heterogeneous. Because of this, it is currently difficult to reconcile results of cancer transcriptome and proteome experiments. It is also established that cancer somatic mutations arise at rates higher than suspected, but yet are insufficient to explain all cancer cell heterogeneity. We have analyzed sequence variations of 17 abundantly expressed genes in a large set of human ESTs originating from either normal or cancer samples. We show that cancer ESTs have greater variations than normal ESTs for >70% of the tested genes. These variations cannot be explained by known and putative SNPs. Furthermore, cancer EST variations were not random, but were determined by the composition of the substituted base (b0) as well as that of the bases located upstream (up to b − 4) and downstream (up to b + 3) of the substitution event. The replacement base was also not randomly selected but corresponded in most cases (73%) to a repetition of b − 1 or of b + 1. Base substitutions follow a specific pattern of affected bases: A and T substitutions were preferentially observed in cancer ESTs. In contrast, cancer somatic mutations [Sjoblom T, et al. (2006) Science 314:268–274] and SNPs identified in the genes of the current study occurred preferentially with C and G. On the basis of these observations, we developed a working hypothesis that cancer EST heterogeneity results primarily from increased transcription infidelity