Afecções associadas ao Eritrovírus B19

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Belém, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil

Prevalence and molecular diversity of adenovirus in children with severe acute gastroenteritis, in Belém, Pará State, before and after the introduction of the rotavirus vaccine in Brazil

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Amapá. Coordenação de Farmácia. Macapá, AP, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilUniversidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil.OBJETIVOS: Detectar a presença e definir os tipos de adenovírus humanos (HAdV) em indivíduos menores de 3 anos de idade, participantes de dois projetos de pesquisa sobre gastroenterites virais, realizados em Belém, estado do Pará, Brasil: o primeiro, um estudo de vigilância hospitalar e ambulatorial, pré-vacinação contra rotavírus (RV), realizado pelo Instituto Evandro Chagas no período de março a setembro de 2003; e o segundo, o projeto "Rotavírus Caso-Controle", pós-vacinação, com crianças hospitalizadas apresentando quadro de gastroenterite aguda no período de maio de 2008 a abril de 2009. MATERIAIS E MÉTODOS: Foram testadas amostras fecais de 1.160 crianças, utilizando-se as técnicas de ensaio imunoenzimático e imunocromatografia para triagem, a reação em cadeia da polimerase e sequenciamento de nucleotídeos para tipagem e identificação molecular. RESULTADOS: Os HAdV foram encontrados em 7,2% (84/1.160) das amostras e os adenovírus entéricos em 5,0% (58/1.160), equivalendo a 69,0% (58/84) dos casos positivos. Desses, 3,3% (25/760) eram do estudo pré-vacinação contra RV e 8,2% (33/400) do pós-vacinação. A reação de sequenciamento caracterizou a espécie F como a mais prevalente na região, equivalendo a 70,0% (21/30), com o tipo 41 encontrado em 85,7% (18/21) dos casos positivos. CONCLUSÃO: Esses resultados evidenciaram a circulação de HAdV entre a população infantil de Belém, demonstrando a sua importância como causa de gastroenterite com ou sem hospitalização, tanto antes como após a introdução da vacina contra RV na rede pública de saúde no Brasil.OBJECTIVES: To detect the presence and to define the human adenovirus (HAdV) types from individuals under 3 years old in two research projects on viral gastroenteritis in Belém, Pará State, Brazil: the first, an inpatient and outpatient surveillance study on rotavirus (RV) pre-vaccination performed by Instituto Evandro Chagas from March to September 2003; and the second, from the "Rotavirus Case-Control" (post vaccination) study, carried out from May 2008 to April 2009, with hospitalized children due to acute gastroenteritis. MATERIALS AND METHODS: Faecal samples were tested from 1,160 children using immunoenzymatic assay and immunochromatography techniques for screening, polymerase chain reaction and nucleotide sequencing for typing and molecular identification. RESULTS: HAdV were found in 7.2% (84/1,160) of the samples, and enteric adenoviruses in 5.0% (58/1,160), equivalent to 69.0% (58/84) of the positive cases. Of these, 3.3% (25/760) were from the RV pre-vaccination study and 8.2% (33/400) from the post-vaccination. The sequencing reaction characterized the F specie as the most prevalent in the region, equivalent to 70.0% (21/30), with the type 41 in 85.7% (18/21) of the positive cases. CONCLUSION: These results showed HAdV circulation among the infant population in Belém, demonstrating its importance as gastroenteritis agent either hospitalized or not, both before and after the RV vaccine introduction on the Brazilian public health network

Prevalência e diversidade molecular de adenovírus em crianças com gastroenterite aguda grave, em Belém, estado do Pará, antes e após a introdução da vacina contra rotavírus no Brasil

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Amapá. Coordenação de Farmácia. Macapá, AP, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilUniversidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil.OBJETIVOS: Detectar a presença e definir os tipos de adenovírus humanos (HAdV) em indivíduos menores de 3 anos de idade, participantes de dois projetos de pesquisa sobre gastroenterites virais, realizados em Belém, estado do Pará, Brasil: o primeiro, um estudo de vigilância hospitalar e ambulatorial, pré-vacinação contra rotavírus (RV), realizado pelo Instituto Evandro Chagas no período de março a setembro de 2003; e o segundo, o projeto "Rotavírus Caso-Controle", pós-vacinação, com crianças hospitalizadas apresentando quadro de gastroenterite aguda no período de maio de 2008 a abril de 2009. MATERIAIS E MÉTODOS: Foram testadas amostras fecais de 1.160 crianças, utilizando-se as técnicas de ensaio imunoenzimático e imunocromatografia para triagem, a reação em cadeia da polimerase e sequenciamento de nucleotídeos para tipagem e identificação molecular. RESULTADOS: Os HAdV foram encontrados em 7,2% (84/1.160) das amostras e os adenovírus entéricos em 5,0% (58/1.160), equivalendo a 69,0% (58/84) dos casos positivos. Desses, 3,3% (25/760) eram do estudo pré-vacinação contra RV e 8,2% (33/400) do pós-vacinação. A reação de sequenciamento caracterizou a espécie F como a mais prevalente na região, equivalendo a 70,0% (21/30), com o tipo 41 encontrado em 85,7% (18/21) dos casos positivos. CONCLUSÃO: Esses resultados evidenciaram a circulação de HAdV entre a população infantil de Belém, demonstrando a sua importância como causa de gastroenterite com ou sem hospitalização, tanto antes como após a introdução da vacina contra RV na rede pública de saúde no Brasil.OBJECTIVES: To detect the presence and to define the human adenovirus (HAdV) types from individuals under 3 years old in two research projects on viral gastroenteritis in Belém, Pará State, Brazil: the first, an inpatient and outpatient surveillance study on rotavirus (RV) pre-vaccination performed by Instituto Evandro Chagas from March to September 2003; and the second, from the "Rotavirus Case-Control" (post vaccination) study, carried out from May 2008 to April 2009, with hospitalized children due to acute gastroenteritis. MATERIALS AND METHODS: Faecal samples were tested from 1,160 children using immunoenzymatic assay and immunochromatography techniques for screening, polymerase chain reaction and nucleotide sequencing for typing and molecular identification. RESULTS: HAdV were found in 7.2% (84/1,160) of the samples, and enteric adenoviruses in 5.0% (58/1,160), equivalent to 69.0% (58/84) of the positive cases. Of these, 3.3% (25/760) were from the RV pre-vaccination study and 8.2% (33/400) from the post-vaccination. The sequencing reaction characterized the F specie as the most prevalent in the region, equivalent to 70.0% (21/30), with the type 41 in 85.7% (18/21) of the positive cases. CONCLUSION: These results showed HAdV circulation among the infant population in Belém, demonstrating its importance as gastroenteritis agent either hospitalized or not, both before and after the RV vaccine introduction on the Brazilian public health network

Caracterización molecular de norovirus, sapovirus y astrovirus en niños con gastroenteritis aguda en Belém (Pará, Brasil)

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.A importância dos norovírus (NoVs), sapovírus (SaVs) e astrovírus humanos (HAstVs) como causa de surtos de gastrenterites já está bem definida. Entretanto, poucos estudos têm descrito casos esporádicos de gastrenterite aguda causados por esses agentes. O objetivo deste estudo foi determinar o papel destes vírus na etiologia das gastrenterites agudas em crianças atendidas durante uma vigilância intensiva realizada em hospitais e ambulatórios de Belém, Brasil, de março a setembro de 2003. Um total de 305 espécimes fecais de pacientes com gastrenterite grave foram coletados e testados por reação em cadeia da polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR), utilizando iniciadores específicos Mon 269 e Mon 270 para os HAstVs; p289 e p290 para os calicivírus humanos (HuCVs); e Mon 431/433 e Mon 432/434 para os NoVs. Sequenciamento dos amplicons de HAstV, HuCVs e NoVs, obtidos por RT-PCR, foi realizado usando os mesmos iniciadores. Das 305 amostras testadas, 96 (31,5%) apresentaram resultados positivos, sendo que 51 diagnosticadas como HuCVs, 40 como HAstVs e cinco infecções mistas. Das 56 (18,4%) amostras de HuCVs sequenciadas, 30 foram NoVs (9,8%) pertencentes aos genogrupos GI-4 e GII-4, e 15 (4,9%) SaVs dos grupos GI-1, GI-2 e GII-1. HAstVs foram detectados em 45 (14,7%) das amostras, incluindo os genótipos 1, 8 e 2. Esta pesquisa ressalta a importância destas viroses como causa de gastrenterite aguda e demonstra a circulação de diferentes genótipos durante o período de estudo. Estes resultados reforçam a necessidade de se estabelecer uma vigilância intensiva das gastrenterite causadas por estes vírus, de forma a poder avaliar o impacto da doença e monitorar os genótipos circulantes.The importance of norovirus (NoVs), sapovirus (SaVs) and human astrovirus (HAstVs) as causes of gastroenteritis outbreaks is already well-defined, but a few studies have described sporadic cases of acute gastroenteritis caused by these viral entities. The aim of this study was to determine the role of these viruses in the etiology of acute gastroenteritis in children enrolled to participate in hospital – and emergency department – based intensive surveillance carried out in Belém, Brazil, from March to September 2003. A total of 305 stool specimens from patients with severe gastroenteritis were collected and screened by reverse transcription followed by polymerase chain reaction (RT-PCR), using the specific primers Mon 269 and Mon 270 for HAstVs, p289 and p290 for human calicivirus (HuCVs), and Mon 431/433 and Mon 432/434 for NoVs. Sequencing of RT-PCR HAstV, HuCV and NoV amplicons was carried out using the same primers. Of the 305 samples tested, 96 (31.5%) were positive, with 51 diagnosed as HuCVs, 40 as HAstVs and five as mixed infections. Of the 56 (18.4%) HuCVs sequenced, 30 were NoVs (9.8%) of genogroups GI-4 and GII-4, and 15 (4.9%) were SaVs of types GI-1, GI-2 and GII-1. HAstVs, including genotypes 1, 8 and 2, were detected in 45 (14.7%) samples. This study has highlighted the importance of these viruses as causes of acute gastroenteritis and established the circulation of different genotypes during the study period. These results reinforce the need for establishing an intensive surveillance for gastroenteritis caused by these viruses to assess the burden of disease and to monitor the circulation of genotypes

Norovirus genotypes detected in infected children during a 30-year period (1982–2011) in different studies conducted in Belém, Brazil.

<p>(a) (I) Samples genotyped only by a partial sequence of the polymerase gene (Regions A or B); (II) Samples genotyped only by a partial sequence of the VP1 gene (Regions C or D). (b) Binary genotyping targeted two regions, polymerase (A or B) and capsid (C or D). It is noteworthy that this study did not account for samples genotyped by only one nucleotide fragment (i.e., the polymerase or the capsid region). An asterisk represents samples confirmed as recombinants (more details are in <a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0178909#pone.0178909.t004" target="_blank">Table 4</a>).</p

Evaluation of third-generation RIDASCREEN enzyme immunoassay for the detection of norovirus antigens in stool samples of hospitalized children in Belém, Pará, Brazil

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Noroviruses (NoVs) are major agents of gastroenteritis outbreaks and hospitalization worldwide. This study evaluated the sensitivity and specificity of the commercially available third-generation RIDASCREEN® Norovirus Enzyme Immunoassay (EIA) kit in comparison to the reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) to detect NoVs in hospitalized children with gastroenteritis. An agreement of 88% (81/92) was observed when comparing EIA with RT-PCR. A sensitivity of 92% and a specificity of 83.3% were demonstrated. Eleven samples were positive by 1 method only (4 RT-PCR/7 EIA). Fourteen samples were sequenced and all classified as NoV genogroup GII-4. The 7 positive only by EIA were also evaluated by electron microscopy, and in 3 (42.9%) samples viral particles with a suggestive morphology of NoVs were visualized. These same samples were tested by seminested-RT-PCR with a positivity of 85.7%. The results obtained in this study demonstrated a significant improvement in the sensitivity and specificity of this updated assa

Genotype diversity and molecular evolution of noroviruses: A 30-year (1982-2011) comprehensive study with children from Northern Brazil

<div><p>A chronologically comprehensive 30-year study was conducted that involved children living in Belém, in the Amazon region of Northern Brazil, who participated in eight different studies from October 1982 to April 2011. The children were followed either in the community or in health units and hospitals in order to identify the norovirus genotypes involved in infections during this time. A total of 2,520 fecal specimens were obtained and subjected to RT-PCR and nucleotide sequencing for regions A, B, C, D and P2 of the viral genome. An overall positivity of 16.9% (n = 426) was observed, and 49% of the positive samples were genotyped (208/426), evidencing the presence of several genotypes as follows: Polymerase gene (GI.P4, GII.Pa, GII.Pc, GII.Pe, GII.Pg, GII.Pj, GII.P3, GII.P4, GII.P6, GII.P7, GII.P8, GII.P12, GII.P13, GII.P14, GII.P21, GII.P22), and VP1 gene (GI.3, GI.7, GII.1, GII.2, GII.3, GII.4, GII.6, GII.7, GII.8, GII.10, GII.12, GII.14, GII.17, GII.23). The GII.P4/GII.4 genotype determined by both open reading frames (ORFs) (partial polymerase and VP1 genes) was found for 83 samples, and analyses of the subdomain P2 region showed 10 different variants: CHDC (1970s), Tokyo (1980s), Bristol_1993, US_95/96, Kaiso_2003, Asia_2003, Hunter_2004, Yerseke_2006a, Den Haag_2006b (subcluster “O”) and New Orleans_2009. Recombination events were confirmed in 47.6% (n = 20) of the 42 samples with divergent genotyping by ORF1 and ORF2 and with probable different breakpoints within the viral genome. The evolutionary analyses estimated a rate of evolution of 1.02 x 10⁻² and 9.05 x 10⁻³ subs./site/year using regions C and D from the VP1 gene, respectively. The present research shows the broad genetic diversity of the norovirus that infected children for 30 years in Belém. These findings contribute to our understanding of noroviruses molecular epidemiology and viral evolution and provide a baseline for vaccine design.</p></div

Summary information for eight studies conducted from 1982 to 2011, the fecal samples of which were included in the present study.

<p>Summary information for eight studies conducted from 1982 to 2011, the fecal samples of which were included in the present study.</p

Flow chart of study samples demonstrating a global view of the study developed during a 30-year period of study (1982–2011) in Belém, Brazil.

<p>¹ Total of samples genotyped by at least one of the genomic regions analyzed. ² Total of sequences used for recombination analysis. ³ Total of sequences used for phylogenetic analysis.</p

Detection, epidemiology and characterization of VP6 and VP7 genes of group D rotavirus in broiler chickens

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Agricultura. Laboratório Nacional Agropecuário. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Rotaviruses infect humans and animals and are classified into eight groups (A to H). Group D rotavirus (RVD) has been described in birds, although relatively few reports are available. The present study focused on RVD, including epidemiological and molecular aspects of samples collected from broiler chickens in the state of Pará, Brazil. A total of 85 faecal samples were collected between 2008 and 2011 from 37 chicken farms located in eight different municipalities. The viral double-stranded RNA was extracted from faecal suspensions and analysed using polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), followed by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RTPCR) and nucleotide sequencing of the VP6 and VP7 genes. Comparing the positive results, 16.5 per cent (14/85) were obtained by PAGE and 35.3 per cent (30/85) by RT-PCR. Samples from seven of eight municipalities were positive for RVD and infections were recorded in 17 (45.9 per cent) of 37 chicken farms. The RVD infection rate was significantly higher in the 16-day to 30-day age group (62.2 per cent; 23/37) compared with other ages. No consistent relationship was found between the infection rate and either the population density in poultry houses or the climatic conditions. The nucleotide sequences of the VP6 gene were 89.9 to 90.9 per cent similar to the prototype strain 05V0049 and were 88.3 to 100 per cent similar among themselves; VP7 gene nucleotide sequences were 84.3 to 85.4 per cent similar to the prototype strain 05V0049 and 93.8 to 100 per cent similar among themselves. Overall, this study provides new insights into the epidemiology and genome characterization of group D rotaviruse