47 research outputs found
Afecções associadas ao Eritrovírus B19
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Belém, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil
Prevalence and molecular diversity of adenovirus in children with severe acute gastroenteritis, in Belém, Pará State, before and after the introduction of the rotavirus vaccine in Brazil
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Amapá. Coordenação de Farmácia. Macapá, AP, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilUniversidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil.OBJETIVOS: Detectar a presença e definir os tipos de adenovírus humanos (HAdV) em indivíduos menores de 3
anos de idade, participantes de dois projetos de pesquisa sobre gastroenterites virais, realizados em Belém, estado
do Pará, Brasil: o primeiro, um estudo de vigilância hospitalar e ambulatorial, pré-vacinação contra rotavírus
(RV), realizado pelo Instituto Evandro Chagas no período de março a setembro de 2003; e o segundo, o projeto
"Rotavírus Caso-Controle", pós-vacinação, com crianças hospitalizadas apresentando quadro de gastroenterite
aguda no período de maio de 2008 a abril de 2009. MATERIAIS E MÉTODOS: Foram testadas amostras fecais de
1.160 crianças, utilizando-se as técnicas de ensaio imunoenzimático e imunocromatografia para triagem, a reação
em cadeia da polimerase e sequenciamento de nucleotídeos para tipagem e identificação molecular. RESULTADOS:
Os HAdV foram encontrados em 7,2% (84/1.160) das amostras e os adenovírus entéricos em 5,0% (58/1.160),
equivalendo a 69,0% (58/84) dos casos positivos. Desses, 3,3% (25/760) eram do estudo pré-vacinação contra
RV e 8,2% (33/400) do pós-vacinação. A reação de sequenciamento caracterizou a espécie F como a mais
prevalente na região, equivalendo a 70,0% (21/30), com o tipo 41 encontrado em 85,7% (18/21) dos casos
positivos. CONCLUSÃO: Esses resultados evidenciaram a circulação de HAdV entre a população infantil de Belém,
demonstrando a sua importância como causa de gastroenterite com ou sem hospitalização, tanto antes como após
a introdução da vacina contra RV na rede pública de saúde no Brasil.OBJECTIVES: To detect the presence and to define the human adenovirus (HAdV) types from individuals under
3 years old in two research projects on viral gastroenteritis in Belém, Pará State, Brazil: the first, an inpatient and
outpatient surveillance study on rotavirus (RV) pre-vaccination performed by Instituto Evandro Chagas from March
to September 2003; and the second, from the "Rotavirus Case-Control" (post vaccination) study, carried out from
May 2008 to April 2009, with hospitalized children due to acute gastroenteritis. MATERIALS AND METHODS: Faecal
samples were tested from 1,160 children using immunoenzymatic assay and immunochromatography techniques for
screening, polymerase chain reaction and nucleotide sequencing for typing and molecular identification. RESULTS:
HAdV were found in 7.2% (84/1,160) of the samples, and enteric adenoviruses in 5.0% (58/1,160), equivalent to
69.0% (58/84) of the positive cases. Of these, 3.3% (25/760) were from the RV pre-vaccination study and 8.2%
(33/400) from the post-vaccination. The sequencing reaction characterized the F specie as the most prevalent in
the region, equivalent to 70.0% (21/30), with the type 41 in 85.7% (18/21) of the positive cases. CONCLUSION:
These results showed HAdV circulation among the infant population in Belém, demonstrating its importance as
gastroenteritis agent either hospitalized or not, both before and after the RV vaccine introduction on the Brazilian
public health network
Prevalência e diversidade molecular de adenovírus em crianças com gastroenterite aguda grave, em Belém, estado do Pará, antes e após a introdução da vacina contra rotavírus no Brasil
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Amapá. Coordenação de Farmácia. Macapá, AP, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, BrasilUniversidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais. Belém, PA, Brasil.OBJETIVOS: Detectar a presença e definir os tipos de adenovírus humanos (HAdV) em indivíduos menores de 3
anos de idade, participantes de dois projetos de pesquisa sobre gastroenterites virais, realizados em Belém, estado
do Pará, Brasil: o primeiro, um estudo de vigilância hospitalar e ambulatorial, pré-vacinação contra rotavírus
(RV), realizado pelo Instituto Evandro Chagas no período de março a setembro de 2003; e o segundo, o projeto
"Rotavírus Caso-Controle", pós-vacinação, com crianças hospitalizadas apresentando quadro de gastroenterite
aguda no período de maio de 2008 a abril de 2009. MATERIAIS E MÉTODOS: Foram testadas amostras fecais de
1.160 crianças, utilizando-se as técnicas de ensaio imunoenzimático e imunocromatografia para triagem, a reação
em cadeia da polimerase e sequenciamento de nucleotídeos para tipagem e identificação molecular. RESULTADOS:
Os HAdV foram encontrados em 7,2% (84/1.160) das amostras e os adenovírus entéricos em 5,0% (58/1.160),
equivalendo a 69,0% (58/84) dos casos positivos. Desses, 3,3% (25/760) eram do estudo pré-vacinação contra
RV e 8,2% (33/400) do pós-vacinação. A reação de sequenciamento caracterizou a espécie F como a mais
prevalente na região, equivalendo a 70,0% (21/30), com o tipo 41 encontrado em 85,7% (18/21) dos casos
positivos. CONCLUSÃO: Esses resultados evidenciaram a circulação de HAdV entre a população infantil de Belém,
demonstrando a sua importância como causa de gastroenterite com ou sem hospitalização, tanto antes como após
a introdução da vacina contra RV na rede pública de saúde no Brasil.OBJECTIVES: To detect the presence and to define the human adenovirus (HAdV) types from individuals under
3 years old in two research projects on viral gastroenteritis in Belém, Pará State, Brazil: the first, an inpatient and
outpatient surveillance study on rotavirus (RV) pre-vaccination performed by Instituto Evandro Chagas from March
to September 2003; and the second, from the "Rotavirus Case-Control" (post vaccination) study, carried out from
May 2008 to April 2009, with hospitalized children due to acute gastroenteritis. MATERIALS AND METHODS: Faecal
samples were tested from 1,160 children using immunoenzymatic assay and immunochromatography techniques for
screening, polymerase chain reaction and nucleotide sequencing for typing and molecular identification. RESULTS:
HAdV were found in 7.2% (84/1,160) of the samples, and enteric adenoviruses in 5.0% (58/1,160), equivalent to
69.0% (58/84) of the positive cases. Of these, 3.3% (25/760) were from the RV pre-vaccination study and 8.2%
(33/400) from the post-vaccination. The sequencing reaction characterized the F specie as the most prevalent in
the region, equivalent to 70.0% (21/30), with the type 41 in 85.7% (18/21) of the positive cases. CONCLUSION:
These results showed HAdV circulation among the infant population in Belém, demonstrating its importance as
gastroenteritis agent either hospitalized or not, both before and after the RV vaccine introduction on the Brazilian
public health network
Caracterización molecular de norovirus, sapovirus y astrovirus en niños con gastroenteritis aguda en Belém (Pará, Brasil)
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.A importância dos norovírus (NoVs), sapovírus (SaVs) e astrovírus humanos (HAstVs) como causa de surtos de gastrenterites já está bem definida. Entretanto, poucos estudos têm descrito casos esporádicos de gastrenterite aguda causados por
esses agentes. O objetivo deste estudo foi determinar o papel destes vírus na etiologia das gastrenterites agudas em
crianças atendidas durante uma vigilância intensiva realizada em hospitais e ambulatórios de Belém, Brasil, de março a
setembro de 2003. Um total de 305 espécimes fecais de pacientes com gastrenterite grave foram coletados e testados por
reação em cadeia da polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR), utilizando iniciadores específicos Mon 269 e
Mon 270 para os HAstVs; p289 e p290 para os calicivírus humanos (HuCVs); e Mon 431/433 e Mon 432/434 para os
NoVs. Sequenciamento dos amplicons de HAstV, HuCVs e NoVs, obtidos por RT-PCR, foi realizado usando os mesmos
iniciadores. Das 305 amostras testadas, 96 (31,5%) apresentaram resultados positivos, sendo que 51 diagnosticadas
como HuCVs, 40 como HAstVs e cinco infecções mistas. Das 56 (18,4%) amostras de HuCVs sequenciadas, 30 foram
NoVs (9,8%) pertencentes aos genogrupos GI-4 e GII-4, e 15 (4,9%) SaVs dos grupos GI-1, GI-2 e GII-1. HAstVs foram
detectados em 45 (14,7%) das amostras, incluindo os genótipos 1, 8 e 2. Esta pesquisa ressalta a importância destas
viroses como causa de gastrenterite aguda e demonstra a circulação de diferentes genótipos durante o período de estudo.
Estes resultados reforçam a necessidade de se estabelecer uma vigilância intensiva das gastrenterite causadas por estes
vírus, de forma a poder avaliar o impacto da doença e monitorar os genótipos circulantes.The importance of norovirus (NoVs), sapovirus (SaVs) and human astrovirus (HAstVs) as causes of gastroenteritis outbreaks
is already well-defined, but a few studies have described sporadic cases of acute gastroenteritis caused by these viral
entities. The aim of this study was to determine the role of these viruses in the etiology of acute gastroenteritis in children
enrolled to participate in hospital – and emergency department – based intensive surveillance carried out in Belém, Brazil,
from March to September 2003. A total of 305 stool specimens from patients with severe gastroenteritis were collected and
screened by reverse transcription followed by polymerase chain reaction (RT-PCR), using the specific primers Mon 269 and
Mon 270 for HAstVs, p289 and p290 for human calicivirus (HuCVs), and Mon 431/433 and Mon 432/434 for NoVs.
Sequencing of RT-PCR HAstV, HuCV and NoV amplicons was carried out using the same primers. Of the 305 samples
tested, 96 (31.5%) were positive, with 51 diagnosed as HuCVs, 40 as HAstVs and five as mixed infections. Of the 56
(18.4%) HuCVs sequenced, 30 were NoVs (9.8%) of genogroups GI-4 and GII-4, and 15 (4.9%) were SaVs of types GI-1,
GI-2 and GII-1. HAstVs, including genotypes 1, 8 and 2, were detected in 45 (14.7%) samples. This study has highlighted
the importance of these viruses as causes of acute gastroenteritis and established the circulation of different genotypes
during the study period. These results reinforce the need for establishing an intensive surveillance for gastroenteritis caused
by these viruses to assess the burden of disease and to monitor the circulation of genotypes
Norovirus genotypes detected in infected children during a 30-year period (1982–2011) in different studies conducted in Belém, Brazil.
<p>(a) (I) Samples genotyped only by a partial sequence of the polymerase gene (Regions A or B); (II) Samples genotyped only by a partial sequence of the VP1 gene (Regions C or D). (b) Binary genotyping targeted two regions, polymerase (A or B) and capsid (C or D). It is noteworthy that this study did not account for samples genotyped by only one nucleotide fragment (i.e., the polymerase or the capsid region). An asterisk represents samples confirmed as recombinants (more details are in <a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0178909#pone.0178909.t004" target="_blank">Table 4</a>).</p
Evaluation of third-generation RIDASCREEN enzyme immunoassay for the detection of norovirus antigens in stool samples of hospitalized children in Belém, Pará, Brazil
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Noroviruses (NoVs) are major agents of gastroenteritis outbreaks and hospitalization worldwide. This study evaluated the sensitivity and
specificity of the commercially available third-generation RIDASCREEN® Norovirus Enzyme Immunoassay (EIA) kit in comparison to the
reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) to detect NoVs in hospitalized children with gastroenteritis. An agreement of 88%
(81/92) was observed when comparing EIA with RT-PCR. A sensitivity of 92% and a specificity of 83.3% were demonstrated. Eleven
samples were positive by 1 method only (4 RT-PCR/7 EIA). Fourteen samples were sequenced and all classified as NoV genogroup GII-4.
The 7 positive only by EIA were also evaluated by electron microscopy, and in 3 (42.9%) samples viral particles with a suggestive
morphology of NoVs were visualized. These same samples were tested by seminested-RT-PCR with a positivity of 85.7%. The results
obtained in this study demonstrated a significant improvement in the sensitivity and specificity of this updated assa
Genotype diversity and molecular evolution of noroviruses: A 30-year (1982-2011) comprehensive study with children from Northern Brazil
<div><p>A chronologically comprehensive 30-year study was conducted that involved children living in Belém, in the Amazon region of Northern Brazil, who participated in eight different studies from October 1982 to April 2011. The children were followed either in the community or in health units and hospitals in order to identify the norovirus genotypes involved in infections during this time. A total of 2,520 fecal specimens were obtained and subjected to RT-PCR and nucleotide sequencing for regions A, B, C, D and P2 of the viral genome. An overall positivity of 16.9% (n = 426) was observed, and 49% of the positive samples were genotyped (208/426), evidencing the presence of several genotypes as follows: Polymerase gene (GI.P4, GII.Pa, GII.Pc, GII.Pe, GII.Pg, GII.Pj, GII.P3, GII.P4, GII.P6, GII.P7, GII.P8, GII.P12, GII.P13, GII.P14, GII.P21, GII.P22), and VP1 gene (GI.3, GI.7, GII.1, GII.2, GII.3, GII.4, GII.6, GII.7, GII.8, GII.10, GII.12, GII.14, GII.17, GII.23). The GII.P4/GII.4 genotype determined by both open reading frames (ORFs) (partial polymerase and VP1 genes) was found for 83 samples, and analyses of the subdomain P2 region showed 10 different variants: CHDC (1970s), Tokyo (1980s), Bristol_1993, US_95/96, Kaiso_2003, Asia_2003, Hunter_2004, Yerseke_2006a, Den Haag_2006b (subcluster “O”) and New Orleans_2009. Recombination events were confirmed in 47.6% (n = 20) of the 42 samples with divergent genotyping by ORF1 and ORF2 and with probable different breakpoints within the viral genome. The evolutionary analyses estimated a rate of evolution of 1.02 x 10<sup>−2</sup> and 9.05 x 10<sup>−3</sup> subs./site/year using regions C and D from the VP1 gene, respectively. The present research shows the broad genetic diversity of the norovirus that infected children for 30 years in Belém. These findings contribute to our understanding of noroviruses molecular epidemiology and viral evolution and provide a baseline for vaccine design.</p></div
Summary information for eight studies conducted from 1982 to 2011, the fecal samples of which were included in the present study.
<p>Summary information for eight studies conducted from 1982 to 2011, the fecal samples of which were included in the present study.</p
Flow chart of study samples demonstrating a global view of the study developed during a 30-year period of study (1982–2011) in Belém, Brazil.
<p><sup>1</sup> Total of samples genotyped by at least one of the genomic regions analyzed. <sup>2</sup> Total of sequences used for recombination analysis. <sup>3</sup> Total of sequences used for phylogenetic analysis.</p
Description of 20 recombinant norovirus strains circulating in the pediatric population of Belém, Brazil over a period of 30 years (1982–2011).
<p>Description of 20 recombinant norovirus strains circulating in the pediatric population of Belém, Brazil over a period of 30 years (1982–2011).</p