Analysis of Clinical Phenotypes through Machine Learning of First-Line H. pylori Treatment in Europe during the Period 2013–2022: Data from the European Registry on H. pylori Management (Hp-EuReg)

The segmentation of patients into homogeneous groups could help to improve eradication therapy effectiveness. Our aim was to determine the most important treatment strategies used in Europe, to evaluate first-line treatment effectiveness according to year and country. Data collection: All first-line empirical treatments registered at AEGREDCap in the European Registry on Helicobacter pylori management (Hp-EuReg) from June 2013 to November 2022. A Boruta method determined the “most important” variables related to treatment effectiveness. Data clustering was performed through multi-correspondence analysis of the resulting six most important variables for every year in the 2013–2022 period. Based on 35,852 patients, the average overall treatment effectiveness increased from 87% in 2013 to 93% in 2022. The lowest effectiveness (80%) was obtained in 2016 in cluster #3 encompassing Slovenia, Lithuania, Latvia, and Russia, treated with 7-day triple therapy with amoxicillin–clarithromycin (92% of cases). The highest effectiveness (95%) was achieved in 2022, mostly in Spain (81%), with the bismuth–quadruple therapy, including the single-capsule (64%) and the concomitant treatment with clarithromycin–amoxicillin–metronidazole/tinidazole (34%) with 10 (69%) and 14 (32%) days. Cluster analysis allowed for the identification of patients in homogeneous treatment groups assessing the effectiveness of different first-line treatments depending on therapy scheme, adherence, country, and prescription year

Evolution of the use, effectiveness and safety of bismuth-containing quadruple therapy for Helicobacter pylori infection between 2013 and 2021: results from the European registry on H. pylori management (Hp-EuReg)

background Bismuth quadruple therapies (BQTs) including bismuth, a proton pump inhibitor (PPI) and two antibiotics have been shown to be highly effective for treating Helicobacter pylori infection even in areas of high bacterial antibiotic resistance. Objective To describe the time trends of use, effectiveness and safety of BQT in Europe using the European Registry on Helicobacter pylori Management (Hp-EuReg). Design Patients registered in the Hp-EuReg from 2013 to 2021 who had received BQT were included. The regimens prescribed, the number of eradication attempts, effectiveness, adherence and safety were analysed. The effectiveness was assessed by modified intention to treat (mITT). Time-trend and multivariate analyses were performed to determine variables that predicted treatment success. results Of the 49 690 patients included in the Hp-EuReg, 15 582 (31%) had received BQT. BQT use increased from 8.6% of all treatments in 2013 to 39% in 2021. Single-capsule BQT—containing bismuth, metronidazole and tetracycline—plus a PPI (single-capsule BQT, ScBQT) was the most frequent treatment mode (43%). Schemes that obtained an effectiveness above 90% were the 10-day ScBQT and 14-day BQT using tetracycline plus metronidazole, or amoxicillin plus either clarithromycin or metronidazole. Only ScBQT achieved above 90% cure rates in all the geographical areas studied. Using the ScBQT scheme, adherence, the use of standard or high-dose PPIs, 14-day prescriptions and the use of BQT as first-line treatment were significantly associated with higher mITT effectiveness. Conclusion The use of BQT increased notably in Europe over the study period. A 10-day ScBQT was the scheme that most consistently achieved optimal effectiveness

Синдром обструктивного апное/гіпопное сну та неалкогольна жирова хвороба печінки: роль гіпоксії

Sleep disorders is one of the topical issues of our times, affecting about half of the adult population. It has been determined that the most common sleep problems are obstructive sleep apnea/hypopnea syndrome — according to the WHO, its prevalence is comparable to the prevalence of diabetes. The data on the prevalence of obstructive sleep apnea/hypopnea syndrome in patients with metabolic syndrome are presented. Attention is drawn to the importance of overweight and obesity in the occurrence of obstructive sleep apnea/hypopnea syndrome and their relationship with the severity of the latter. The main mechanisms of obstructive sleep apnea/hypopnea sleep syndrome in obesity and the main links in the pathogenesis of progression of non-alcoholic fatty liver disease are described. The role of oxidative stress in the occurrence of inflammation and liver fibrosis is emphasized. The role of hypoxia in the pathogenesis of progression of nonalcoholic fatty liver disease in its combination with obstructive sleep apnea/hypopnea syndrome and its correlation with inflammatory and fibrosing processes has been shown. The unique place of a liver in a homeostasis of oxygen in an organism is noted. The history of the discovery and distribution of the family of hypoxia-induced factors is described. It is emphasized that all alpha subunits of the GIF complex act simultaneously, affecting both common and different molecular targets, which causes their special biological effects. The role of hypoxia-induced factors in the regulation of various processes in the body is shown. The advantage of studying hypoxia-induced factor-2a in the combined course of obstructive sleep apnea/hypopnea syndrome and non-alcoholic fatty liver disease is substantiated. The role of hypoxia-induced factor-2 alpha in the development and progression of nonalcoholic fatty liver disease has been shown.Нарушения сна являются актуальной проблемой современности, поскольку касаются около половины взрослого населения. Установлено, что одной из наиболее распространенных проблем сна является синдром обструктивного апноэ/гипопноэ сна. По данным ВОЗ, его распространенность сопоставима с таковой сахарного диабета. Приведены данные о распространенности синдрома обструктивного апноэ/гипопноэ сна у пациентов с метаболическим синдромом. Обращено внимание на значимость избыточной массы тела и ожирения в возникновении синдрома обструктивного апноэ/гипопноэ сна и их связь с тяжестью течения последнего. Описаны механизмы возникновения синдрома обструктивного апноэ/гипопноэ сна при ожирении и основные звенья патогенеза прогрессирования неалкогольной жировой болезни печени. Подчеркнуто значение оксидантного стресса в возникновении воспаления и фиброза печени. Показана роль гипоксии в патогенезе прогрессирования неалкогольной жировой болезни печени при ее сочетании с синдромом обструктивного апноэ/гипопноэ сна и его связь с воспалительными и фиброзирующими процессами. Печень имеет важное значение в гомеостазе кислорода в организме. Описана история открытия семейства индуцированных гипоксией факторов. Подчеркнуто, что все α-субъединицы комплекса индуцированных гипоксией факторов действуют одновременно, поражая как общие, так и разные молекулярные цели, что обуславливает их особые биологические эффекты. Показана роль индуцированных гипоксией факторов в регулировании разных процессов в организме. Обосновано преимущество изучения индуцированного гипоксией фактора-2α при совместном течении синдрома обструктивного апноэ/гипопноэ сна и неалкогольной жировой болезни печени. Показана роль индуцированного гипоксией фактора-2α в развитии и прогрессировании неалкогольной жировой болезни печени.Порушення сну є актуальною проблемою сьогодення, оскільки стосуються близько половини дорослого населення. Встановлено, що однією з найпоширеніших проблем сну є синдром обструктивного апное/гіпопное сну. За даними ВООЗ, його поширеність порівнянна з такою цукрового діабету. Наведено дані про поширеність синдрому обструктивного апное/гіпопное сну у пацієнтів з метаболічним синдромом. Звернуто увагу на значущість надлишкової маси тіла та ожиріння у виникненні синдрому обструктивного апное/гіпопное сну та їх зв’язок з тяжкістю перебігу останнього. Описано механізми виникнення синдрому обструктивного апное/гіпопное сну при ожирінні та основні ланки патогенезу прогресування неалкогольної жирової хвороби печінки. Наголошено на значенні оксидантного стресу у виникненні запалення і фіброзу печінки. Показано роль гіпоксії в патогенезі прогресування неалкогольної жирової хвороби печінки при її поєднанні із синдромом обструктивного апное/гіпопное сну і його зв’язок із запальними та фіброзними процесами. Печінка має важливе значення в гомеостазі кисню в організмі. Описано історію відкриття сімейства індукованих гіпоксією факторів. Наголошено, що всі α-субодиниці комплексу індукованих гіпоксією факторів діють одночасно, вражаючи як загальні, так і різні молекулярні цілі, що зумовлює їх особливі біологічні ефекти. Показано роль індукованих гіпоксією факторів у регулюванні різних процесів в організмі. Обґрунтовано перевагу вивчення індукованого гіпоксією фактора-2α при спільному перебігу синдрому обструктивного апное/гіпопное сну і неалкогольної жирової хвороби печінки. Показано роль індукованого гіпоксією фактора-2α в розвитку і прогресуванні неалкогольної жирової хвороби печінки

Irritable bowel syndrome and transplantation of fecal microbiota. Review

Objective — to perform analysis of the literature data as regards the efficacy of the use of fecal microbiota transplantation (FMT) in patients with the irritable bowel syndrome (IBS).&#x0D; Materials and methods. The systematic review of the literature (PubMed, MEDLINE, Cochrane Library) has been performed to assess the results of investigation on the use of FMT in adult IBS patients.&#x0D; Results. Currently, FMT is a safe and highly successful method of treatment for recurrent Clostridium difficile infection, and possibility to use FMT in the treatment of other diseases is under investigation. The results of FMT treatment of patients with IBS are contradictory. A number of authors outline fairly high FMT efficacy when used for the treatment of patients with IBS, refractory to the standard methods: it varies from 36 % to 70 % with a duration of adequate symptoms’ relief up to 1 year. However, other authors indicate that the positive FMT clinical effect lasted from 8 weeks to 3 months, after which there was a gradual recovery of symptoms. At the same time, the researchers noted that mostly often the positive outcome was reached after FMT from donors with a higher number of streptococci in the feces. Still others point out that there was no sustained, at least 50‑point reduction in the severity of IBS symptoms from baseline. Some authors did not reveal the advantages of FMT over placebo control and even reported about the higher placebo efficacy. After data generalization no significant difference was revealed in the global improvement in IBS symptoms in patients receiving donor FM versus placebo. However, the attention is drawn to the relationship between the results of FMT with methodology. Indeed, several studies have shown that placebo capsules were more effective than capsules containing donor feces, whereas FMT from donor stool delivered by colonoscopy was superior to FMF from autologous stool. This may be due to the excipients, containing in the capsulated FMT. A number of researchers also indicated that the use of a super donor is necessary for successful FMT and that the response to FMT is dose dependent.&#x0D; Conclusions. To resolve the issue of the expediency of using FMT in routine clinical practice in patients with IBS, more qualitative controlled studies, involving large cohorts of IBS patients and long‑term follow‑up, are required.&#x0D;  </jats:p

Akkermansia mucinifila — роль у порушенні метаболізму

The article emphasizes the importance of the part that the intestinal microbiome plays in regulation of the host metabolism. The modern ideas about the role of one of the representatives of the human intestinal microbiome, the phylum Verrucomicrobia — Akkermansia muciniphila, in the pathogenetic mechanisms of chronic non-infectious diseases associated with metabolic disorders are presented. The age and anatomical features of the level of Akkermansia muciniphila colonization are shown. Its mucine-degrading properties and their role in production of short-chain fatty acids are described. The ability of Akkermansia muciniphila to create metabolic cross-interactions in the intestinal ecosystem, that influences significantly the intestinal microbiome composition, is shown separately. Abilities of Akkermansia muciniphila to produce extracellular vesicles, their effect on the immune responses in the host organism and the intestinal barrier function, as well as the dependence of the level of their production on body weight and glucose tolerance, are disclosed. The facts of Akkermansia muciniphila outer membrane proteins participation in modulation of immune responses are also presented. Special attention is paid to the influencing ability of these outer membrane proteins even in pasteurized Akkermansia muciniphila, wherein it is more pronounced than in living bacteria, that opens a prospect for development of new medicinal compounds based on them. It is also shown that autoclaving deprives these surface membrane proteins of their effect on the human body. The results of defining changes in the level of Akkermansia muciniphila colonization both in animals and in humans with metabolically associated diseases are shown. The results of studying use of Akkermansia muciniphila in experimental models for treatment of metabolically associated diseases are described and its prospects as a new-level probiotic product are laid out. The data on safety of its use are given. The part of polyphenols in potentiating enhancement of Akkermansia muciniphila colonization is featured.Подчеркнута важность роли кишечного микробиома в регуляции метаболизма хозяина. Приведены современные представления о роли одного из представителей кишечного микробиома человека — Akkermansia muciniphila (фил Verrucomicrobia) в патогенетических механизмах хронических неинфекционных заболеваний, ассоциированных с нарушениями метаболизма. Показаны возрастные и анатомические особенности уровня колонизации Akkermansia muciniphila. Описаны ее муциндеградирующие свойства и их роль в продукции короткоцепочечных жирных кислот. Показана возможность Akkermansia muciniphila создавать в экосистеме кишечника метаболические перекрестные взаимодействия, что оказывает значительное влияние на состав микробиома кишечника. Этот микроорганизм вырабатывает экстрацеллюлярные везикулы, которые влияют на иммунные реакции в организме хозяина и барьерную функцию кишечника. Продемонстрирована связь уровня их выработки с массой тела и толерантностью к глюкозе. Приведены факты участия белков наружной мембраны Akkermansia muciniphila в модуляции иммунных реакций. Обращено внимание на способность влияния белков наружной мембраны на имунные реакции даже у пастеризованных Akkermansia muciniphila, которое более выражено, чем у живых бактерий, что открывает перспективы для разработки новых лекарственных средств на их основе. Показано, что автоклавирование устраняет влияние на организм белков поверхностной мембраны. Приведены данные об изменении уровня колонизации Akkermansia muciniphila при наличии метаболически ассоциированных заболеваний как у животных, так и у людей. Описаны результаты исследований применения Akkermansia muciniphila в экспериментальных моделях для лечения метаболически ассоциированных заболеваний и перспективы ее использования в качестве пробиотического препарата нового уровня. Приведены данные о безопасности ее применения. Показана роль полифенолов в потенцировании усиления колонизации Akkermansia muciniphila.Наголошено на важливості ролі кишкового мікробіому в регуляції метаболізму хазяїна. Наведено сучасні уявлення про роль одного з представників кишкового мікробіому людини –Akkermansia muciniphila (філ Verrucomicrobia) у патогенетичних механізмах хронічних неінфекційних захворювань, які асоціюються з порушеннями метаболізму. Показано вікові і анатомічні особливості рівня колонізації Akkermansia muciniphila. Описано її муциндеградирувальні властивості та їх роль у продукції коротколанцюгових жирних кислот. Показано можливість Akkermansia muciniphila створювати в екосистемі кишечника метаболічні перехресні взаємодії, що значно впливає на склад мікробіому кишечника. Цей мікроорганізм виробляє екстрацелюлярні везикули, які впливають на імунні реакції в організмі хазяїна та бар’єрну функцію кишечника. Продемонстровано зв’язок між рівнем їх вироблення і масою тіла та толерантністю до глюкози. Наведено факти участі білків зовнішньої мембрани Akkermansia muciniphila в модуляції імунних реакцій. Звернено увагу на здатність впливу білків зовнішньої мембрани на імунні реакції навіть у пастеризованих Akkermansia muciniphila, яка більше виражена, ніж у живих бактерій, що відкриває перспективи для розроблення нових лікарських засобів на їх основі. Показано, що автоклавування усуває вплив на організм білків поверхневої мембрани. Наведено дані щодо зміни рівня колонізації Akkermansia muciniphila за наявності метаболічно асоційованих захворювань як у тварин, так і у людей. Описано результати досліджень застосування Akkermansia muciniphila в експериментальних моделях для лікування метаболічно асоційованих захворювань і перспективи її використання як пробіотичного препарату нового рівня. Наведено дані щодо безпечності її застосування. Показано роль поліфенолів у потенціюванні посилення колонізації Akkermansia muciniphila

Ендотоксин та метаболічно асоційована патологія

The article presents modern concepts on the role of the intestinal microbiome in the pathogenetic mechanisms of the development of metabolically associated diseases. The history of endotoxin discovery has been described. The multifaceted endotoxin properties have been established in relation to both infectious and non‑infectious pathology. A stress theory of the regulation of intestinal lipopolysaccharide intake into the general bloodstream is described, and research data supporting the hypothesis are presented. The data on the physiological role of lipopolysaccharide and data on its characteristics depending on age, stress and physical activity are presented. The main mechanisms of the development of endotoxemia are shown, including the role of the disturbance of eubiosis of the intestinal microbiome and an increase in intestinal permeability. The role of the liver in the primary inactivation of endotoxin in healthy individuals has been elucidated. The role of lipids in the transport of intestinal lipopolysaccharide is indicated. The concepts of «endotoxin aggression» and «metabolic endotoxin aggression» are described. The role of a high‑fat diet in the development of endotoxemia, including through the development of dysbiosis, was revealed. The results of experimental studies on the administration of lipopolysaccharide to laboratory animals are described — the administration of endotoxin induces an increase in the level of pro‑inflammatory cytokines. The mechanisms of its interaction with Toll‑like receptors and the consequences of this interaction expressed in the potentiation of chronic inflammation in the liver tissue are presented. The role of endotoxin aggression in the induction of low grade inflammation in obese patients and the relationship with changes in the intestinal microbiome have been disclosed. The effects of lipopolysaccharide in the development of insulin resistance and type 2 diabetes mellitus are shown. The data of studies on the role of endotoxinemia in the development of non‑alcoholic fatty liver disease with the specification of the mechanism of interaction of lipopolysaccharide with liver cells and the progression of its course with the development of steatohepatitis and fibrosis.Освещены современные представления о роли микробиома кишечника в патогенетических механизмах развития метаболически ассоциированных заболеваний. Описана история открытия эндотоксина. Установлена многогранность свойств эндотоксина в отношении как инфекционной, так и неинфекционной патологии. Представлена стрессовая теория регуляции поступления кишечного липополисахарида в общий кровоток и данные исследований, подтверждающие ее. Приведены также данные о физиологической роли липополисахарида и его особенностях в зависимости от возраста, стресса и физической нагрузки. Показаны основные механизмы развития эндотоксемии, в том числе роль нарушения эубиоза кишечного микробиома и повышения кишечной проницаемости. Освещено значение печени в первичной инактивации эндотоксина у здоровых лиц. Показана роль липидов в транспортировке кишечного липополисахарида. Описаны понятия «эндотоксиновая агрессия» и «метаболическая эндотоксиновая агрессия». Установлено значение высокожировой диеты в развитии эндотоксемии, в том числе за счет развития дисбиоза. Приведены результаты экспериментальных работ по введению липополисахарида лабораторным животным. Показано, что введение эндотоксина индуцирует повышение уровня провоспалительных цитокинов. Описаны механизмы взаимодействия липополисахарида с Toll‑подобными рецепторами и последствия этого взаимодействия, в частности потенцирование хронического воспаления в ткани печени. Раскрыта роль эндотоксиновой агресии в процессах индукции воспаления низкой градации у пациентов с ожирением и взаимосвязь с изменениями кишечного микробиома. Показано значение липополисахарида в развитии инсулинорезистентности и сахарного диабета 2 типа. Приведены данные исследований роли эндотоксинемии в развитии неалкогольной жировой болезни печени. Установлен механизм взаимодействия липополисахарида с клетками печени и его значение в прогрессировании неалкогольной жировой болезни печени с развитием стеатогепатита и фиброза.Висвітлено сучасні уявлення щодо ролі мікробіому кишечника в патогенетичних механізмах розвитку метаболічно асоційованих захворювань. Описано історію відкриття ендотоксину. Встановлено багатогранність властивостей ендотоксину щодо як інфекційної, так і неінфекційної патології. Представлено стресову теорію регуляції надходження кишкового ліпополісахариду в загальний кровотік і дані досліджень, які підтверджують її. Наведено також дані щодо фізіологічної ролі ліпополісахариду та його особ­ливості залежно від віку, стресу і фізичного навантаження. Показано основні механізми розвитку ендотоксемії, зокрема роль порушення еубіозу кишкового мікробіому і підвищення кишкової проникності. Висвітлено значення печінки в первинній інактивації ендотоксину у здорових осіб. Показано роль ліпідів у транспортуванні кишкового ліпополісахариду. Описано поняття «ендотоксинова агресія» і «метаболічна ендотоксинова агресія». Установлено значення високожирової дієти в розвитку ендотоксемії, зокрема за рахунок розвитку дисбіозу. Наведено результати експериментальних робіт із введенням ліпополісахариду лабораторним тваринам. Показано, що введення ендотоксину індукує підвищення рівня прозапальних цитокінів. Описано механізми взаємодії ліпополісахариду з Toll‑подібними рецепторами і наслідки цієї взаємодії, зокрема потенціювання хронічного запалення в тканині печінки. Розкрито роль ендотоксинової агресії в процесах індукції запалення низької градації у пацієнтів з ожирінням і взаємозв’язок зі змінами кишкового мікробіому. Показано значення ліпополісахариду в розвитку інсулінорезистентності та цукрового діабету 2 типу. Наведено дані досліджень ролі ендотоксинемії в розвитку неалкогольної жирової хвороби печінки. Встановлено механізм взаємодії ліпополісахариду з клітинами печінки та його значення в прогресуванні неалкогольної жирової хвороби печінки з розвитком стеатогепатиту і фіброзу

Efficacy of fecal microbiota transplantation in patients with post-infection irritable bowel syndrome with diarrhea

Objective — to evaluate efficacy of potentiation of remission and safety of fecal microbiota transplantation (TFM) in patients with post‑infection irritable bowel syndrome with predominance of diarrhea (PI — IBS‑D), in whom standard therapy was ineffective.&#x0D; Materials and methods. The study involved 16 patients with patients with moderate to severe PI — IBS with diarrhea who did not respond to standard therapy and did not have any significant comorbidities. The diagnosis of IBS was made according to the Rome IV criteria. IBS severity was assessed with the use of Irritable bowel syndrome — Severity Scoring System, and the frequency of defecation and stool consistency according to the Bristol scale. Donor selection, preparation for TFM and the procedure itself were carried out in accordance with the recommendations of the European Consensus on TFM (2017). TFM was performed once with a colonoscope in the right part of the large intestine — 180 ml of a solution prepared from 50 g of donor feces. The total follow‑up period was 6 months after TFM. Efficacy was assessed by the level of score reduction of the IBS‑SSS questionnaire — a decrease of 50 points or more was considered a significant improvement. During the observation period, the patient did not take any additional drugs and procedures.&#x0D; Results. The obtained results showed a positive TFM effects on the clinical manifestations of post‑infection IBS, resistant to standard therapy. After 1 month post transplantation, the severity of symptoms decreased by more than 75 IBS‑SSS points in 75 % of patients and 3 of them had remission. The TFM procedure resulted in a significant decrease compared to baseline in the severity of abdominal pain (37 points) and its duration (31 points), bloating (41 points), dissatisfaction with defecation (40 points) against the background of almost twofold reduction in the frequency of defecation from 3.68 to 1.81 bowel movements/day) and improved stool consistency according to the Bristol scale (from 6.81 to 5.21 points). These rates remained unchanged until the end of the third month after TFM, they did not differ significantly compared to the end of the first month: 75 % of patients experienced adequate relief of abdominal pain, satisfaction with defecation, reduced bloating and reduced impact on quality of life. However, by the end of 6th month, the symptoms of PI — IBS began to increase: the average score of IBS‑SSS increased to 169 points, including indicators of the intensity of abdominal pain and its duration, severity of bloating, dissatisfaction with defecation and defecation frequency, thus PI — IBS increasingly affected the quality of life of patients. Despite the increased PI — IBS severity by the end of 6th month after TFM, its symptoms remained significantly lower than before treatment and still 62.5 % of patients reported adequate relief of abdominal pain and satisfaction with defecation, reduction of diarrhea and bloating. None of patients reported about serious adverse events. During the first hours after procedure, only 31.25 % trial participants noticed insignificant adverse events (abdominal discomfort, flatulence and stomach growling) that disappeared on their own during the day.&#x0D; Conclusions. Colonoscopy‑delivered fecal microbiota transplantation proved to be effective and safe procedure in patients with PI — IBS who have not responded to standard therapy.&#x0D;  </jats:p