Unravelling anaerobic metabolisms in hypersaline sediment

The knowledge on the microbial diversity inhabiting hypersaline sediments is still limited. In particular, existing data about anaerobic hypersaline archaea and bacteria are scarce and refer to a limited number of genera. The approach to obtain existing information has been almost exclusively attempting to grow every organism in axenic culture on the selected electron acceptor with a variety of electron donors. Here, a different approach has been used to interrogate the microbial community of submerged hypersaline sediment of Salitral Negro, Argentina, aiming at enriching consortia performing anaerobic respiration of different electron acceptor compounds, in which ecological associations can maximize the possibilities of successful growth. Growth of consortia was demonstrated on all offered electron acceptors, including fumarate, nitrate, sulfate, thiosulfate, dimethyl sulfoxide, and a polarized electrode. Halorubrum and Haloarcula representatives are here shown for the first time growing on lactate, using fumarate or a polarized electrode as the electron acceptor; in addition, they are shown also growing in sulfate-reducing consortia. Halorubrum representatives are for the first time shown to be growing in nitrate-reducing consortia, probably thanks to reduction of N2O produced by other consortium members. Fumarate respiration is indeed shown for the first time supporting growth of Halanaeroarchaeum and Halorhabdus belonging to the archaea, as well as growth of Halanaerobium, Halanaerobaculum, Sporohalobacter, and Acetohalobium belonging to the bacteria. Finally, evidence is presented suggesting growth of nanohaloarchaea in anaerobic conditions.Fil: Solchaga, Juan Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Busalmen, Juan Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales; ArgentinaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentin

Presence of structural homologs of ubiquitin in haloalkaliphilic Archaea

Ubiquitin, a protein widely conserved in eukaryotes, is involved in many cellular processes, including proteolysis. While sequences encoding ubiquitin-like proteins have not been identified in prokaryotic genomes sequenced so far, they have revealed the presence of structural and functional homologs of ubiquitin in Bacteria and Archaea. This work describes the amplification and proteomic analysis of a 400-bp DNA fragment from the haloalkaliphilic archaeon Natrialba magadii. The encoded polypeptide, P400, displayed structural homology to ubiquitin-like proteins such as those of the This family and Urm1. Expression of the P400 DNA sequence in Escherichia coli cells yielded a recombinant polypeptide that reacted with anti-ubiquitin antibodies. In addition, a putative open reading frame encoding P400 was identified in the recently sequenced genome of N. magadii. Together, these results evidence the presence in Archaea of structural homologs of ubiquitin-related proteins.Fil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Marino, Cristina Ester. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Ordoñez, Maria Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: de Castro, Rosana Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Conde, Ruben Danilo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentin

Halófilos en acción

Los organismos extremófilos se desarrollan en ambientes con condiciones adversas para la mayoría de los seres vivos, tales como temperaturas por debajo de 0 o por encima de los 80 ºC, pHs muy ácidos o básicos y alta salinidad. Los organismos halófilos son capaces de vivir en altas concentraciones de sal e incluyen algunas plantas, crustáceos, bacterias y mayoritariamente arqueas. Nuestro grupo de Investigación se ha centrado en el estudio de microorganismos halófilos obligados desde el punto de vista básico de su fisiología como así también en la exploración de sus posibles aplicaciones biotecnológicas.Nuestras líneas de investigación incluyen estudios sobre:1- La degradación y procesamiento de proteínas a nivel de la membrana celular en la haloarquea modelo Haloferax volcanii. En particular estudiamos las proteasas Lon y romboides con el fin de conocer su rol biológico, blancos de acción y su participación en la supervivencia en condiciones extremas. Estas enzimas existen en la mayoría de los organismos y han sido relacionadas con procesos de patogénesis de bacterias y hongos, así como con enfermedades humanas como la diabetes, mal de Parkinson, enfermedad de Alzheimer y cáncer. El estudio de estas proteasas en un modelo no patógeno y sencillo puede aportar conocimientos fundamentales sobre el proceso de proteólisis celular incluyendo informaciónrelevante en el área biomédica (desarrollo de estrategias terapéuticas).2- La diversidad de microorganismos con respiración anaerobia y sus diferentes aceptores de electrones, a fin de conocer las estrategias fisiológicas de adaptación a estos ambientes con escasa disponibilidad de oxígeno.3- Los sistemas de quimiosensado de bacterias halófilas, incluyendo una cepa aislada de agua del puerto de Mar del Plata, Halomonas titanicae KHS3. Esta cepa es capaz de utilizar fenantreno como única fuente de carbono y responde quimiotácticamente a compuestos aromáticos. Además, H. titanicae KHS3 sintetiza polihidroxialcanoatos, la materia prima para la fabricación de bioplásticos, a partir de diversas fuentes de carbono (incluido el fenantreno).4- La producción, extracción y caracterización de biomateriales de interés biotecnológico a partir de microorganismos halófilos. Hemos generado cepas de haloarqueas ?sobreproductoras? de pigmentos carotenoides, los cuales presentan propiedades bioactivas con aplicación en las industrias farmacéutica, cosmética y alimenticia. También estudiamos la síntesis biológica de nanopartículas metálicas que presentan actividad antimicrobiana y aplicaciones en diversos campos como el biomédico y el electrónico; y de compuestos surfactantes que podrían ser de utilidad en la industria del petróleo y en estrategias de remediación ambiental.Financiación UNMdP, ANPCyT.Fil: Costa, Mariana Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Cerletti, Micaela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Ferrari, María Celeste. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Gimenez, Maria Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Herrera Seitz, Karina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Paggi, Roberto Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Pegoraro, César Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Rabino, A.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Redersdorff, Ingrid Emelin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Solchaga, Juan Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Urquiza, Delia Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: de Castro, Rosana Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaJornadas de Investigación de la Universidad Nacional de Mar del PlataMar del PlataArgentinaUniversidad Nacional de Mar del Plat

Current Trends on Role of Biological Treatment in Integrated Treatment Technologies of Textile Wastewater

Wastewater discharge is a matter of concern as it is the primary source of water pollution. Consequently, wastewater treatment plays a key role in reducing the negative impact that wastewater discharge produce into the environment. Particularly, the effluents produced by textile industry are composed of high concentration of hazardous compounds such as dyes, as well as having high levels of chemical and biological oxygen demand, suspended solids, variable pH, and high concentration of salt. Main efforts have been focused on the development of methods consuming less water or reusing it, and also on the development of dyes with a better fixation capacity. However, the problem of how to treat these harmful effluents is still pending. Different treatment technologies have been developed, such as coagulation-flocculation, adsorption, membrane filtration, reverse osmosis, advanced oxidation, and biological processes (activated sludge, anaerobic-aerobic treatment, and membrane bioreactor). Concerning to biological treatments, even though they are considered as the most environmentally friendly and economic methods, their industrial application is still uncertain. On the one hand, this is due to the costs of treatment plants installation and, on the other, to the fact that most of the studies are carried out with simulated or diluted effluents that do not represent what really happens in the industries. Integrated treatment technologies by combining the efficiency two or more methodologies used to be more efficient for the decontamination of textile wastewater, than treatments used separately. The elimination of hazardous compounds had been reported using combination of physical, chemical, and biological processes. On this way, as degradation products can sometimes be even more toxic than the parent compounds, effluent toxicity assessment is an essential feature in the development of these alternatives. This article provides a critical view on the state of art of biological treatment, the degree of advancement and the prospects for their application, also discussing the concept of integrated treatment and the importance of including toxicity assays to reach an integral approach to wastewater treatment.Fil: Ceretta, Maria Belen. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata; ArgentinaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Wolski, Erika Alejandra. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata; Argentin

Nmag_2608, an extracellular ubiquitin-like domain-containing protein from the haloalkaliphilic archaeon Natrialba magadii

Ubiquitin-like proteins (Ubls) and ubiquitin-like domain-containing proteins (Ulds) found in both eukaryotes and prokaryotes display an ubiquitin fold. We previously characterized a 124-amino acid polypeptide (P400) from the haloalkaliphilic archaeon Natrialba magadii having structural homology with ubiquitin family proteins. The reported N. magadii's genome allowed the identification of the Nmag_2608 gene for the protein containing P400, which belongs to specific orthologs of halophilic organisms. It was found that Nmag_2608 has an N-terminal signal peptide with a lipobox motif characteristic of bacterial lipoproteins. Also, it presents partial identity with the ubiquitin-like domain-containing proteins, soluble ligand binding β-grasp proteins. Western blots and heterologous expression tests in E. coli evidenced that Nmag_2608 is processed and secreted outside the cell, where it could perform its function. The analysis of Nmag_2608 expression in N. magadii's cells suggests a co-transcription with the adjoining Nmag_2609 gene encoding a protein of the cyclase family. Also, the transcript level decreased in cells grown in low salinity and starved. To conclude, this work reports for the first time an extracellular archaeal protein with an ubiquitin-like domain.Fil: Ordoñez, Maria Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales; ArgentinaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Conde, Ruben Danilo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentin

Seasonal dynamics of extremely halophilic microbial communities in three Argentinian salterns

Seasonal sampling was carried out at three Argentinian salterns, Salitral Negro (SN), Colorada Grande (CG) and Guatraché (G), to analyze abiotic parameters and microbial diversity and dynamics. Microbial assemblages were correlated to environmental factors by statistical analyses. Principal component analysis of the environmental data grouped SN and CG samples separately from G samples owing to G's higher pH values and sulfate concentration. Differences in microbial assemblages were also found. Many archaeal sequences belonged to uncultured members of Haloquadratum and Haloquadratum-related genera, with different environmental optima. Notably, nearly half of the archaeal sequences were affiliated to the recently described ‘Candidatus Haloredividus’ (phylum Nanohaloarchaeota), not previously detected in salt-saturated environments. Most bacterial sequences belonged to Salinibacter representatives, while sequences affiliated to the recently described genus Spiribacter were also found. Seasonal analysis showed at least 40% of the microbiota from the three salterns was prevalent through the year, indicating they are well adapted to environmental fluctuations. On the other hand, a minority of archaeal and bacterial sequences were found to be seasonally distributed. Five viral morphotypes and also eukaryal predators were detected, suggesting different mechanisms for controlling prokaryotic numbers. Notably, Guatraché was the saltern that harbored the highest virus-to-cell ratios reported to date for hypersaline environments.Fil: Di Meglio, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Santos, F.. Universidad de Alicante. Facultad de Ciencias; EspañaFil: Gomariz, M.. Universidad de Alicante. Facultad de Ciencias; EspañaFil: Almansa, C.. Universidad de Alicante. Facultad de Ciencias; EspañaFil: López, C.. Universidad de Alicante. Facultad de Ciencias; EspañaFil: Anton, J.. Universidad de Alicante. Facultad de Ciencias; EspañaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentin

Biofilms of Halobacterium salinarum as a tool for phenanthrene bioremediation

The use of hyperhalophilic microorganisms is emerging as a sustainable alternative to clean hydrocarbon-polluted hypersaline water bodies. In line with this practice, this work reports on the ability of the archaeon Halobacterium salinarum to develop biofilms on a solid surface conditioned by the presence of phenanthrene crystals, which results in the removal of the contaminating compound. The cell surface hydrophobicity does not change during the removal process and this organism is shown to constitutively produce a surfactant molecule with specific action on aromatic hydrocarbons, both indicating that phenanthrene removal might proceed through a non-contact mechanism. A new approach is presented to follow the process in situ through epifluorescence microscopy by monitoring phenanthrene auto-fluorescence.Fil: Di Meglio, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Busalmen, Juan Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales; ArgentinaFil: Pegoraro, César Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentin

Exploring the multiple biotechnological potential of halophilic microorganisms isolated from two Argentinean salterns

The biodiversity and biotechnological potential of microbes from central Argentinean halophilic environments have been poorly explored. Salitral Negro and Colorada Grande salterns are neutral hypersaline basins exploded for NaCl extraction. As part of an ecological analysis of these environments, two bacterial and seven archaeal representatives were isolated, identified and examined for their biotechnological potential. The presence of hydrolases (proteases, amylases, lipases, cellulases and nucleases) and bioactive molecules (surfactants and antimicrobial compounds) was screened. While all the isolates exhibited at least one of the tested activities or biocompounds, the species belonging to Haloarcula genus were the most active, also producing antimicrobial compounds against their counterparts. In general, the biosurfactants were more effective against olive oil and aromatic compounds than detergents (SDS or Triton X-100). Our results demonstrate the broad spectrum of activities with biotechnological potential exhibited by the microorganisms inhabiting the Argentinean salterns and reinforce the importance of screening pristine extreme environments to discover interesting/novel bioactive molecules.Fil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Di Meglio, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: de Castro, Rosana Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Paggi, Roberto . Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; Argentin

Secondary structure determination by FTIR of an archaeal ubiquitin-like polypeptide from Natrialba magadii

The ubiquitin protein belongs to the β-grasp fold family, characterized by four or five β-sheets with a single α-helical middle region. Ubiquitin-like proteins (Ubls) are structural homologues with low sequence identity to ubiquitin and are widespread among both eukaryotes and prokaryotes. We previously demonstrated by bioinformatics that P400, a polypeptide from the haloalkaliphilic archaeon Natrialba magadii, has structural homology with both ubiquitin and Ubls. This work examines the secondary structure of P400 by Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR). After expression in Escherichia coli, recombinant P400 (rP400) was separated by PAGE and eluted pure from zinc-imidazole reversely stained gels. The requirement of high salt concentration of this polypeptide to be folded was corroborated by intrinsic fluorescence spectrum. Our results show that fluorescence spectra of rP400 in 1.5 M KCl buffer shifts and decreases after thermal denaturation as well as after chemical treatment. rP400 was lyophilized and rehydrated in buffer containing 1.5 M KCl before both immunochemical and FTIR tests were performed. It was found that rP400 reacts with anti-ubiquitin antibody after rehydration in the presence of high salt concentrations. On the other hand, like ubiquitin and Ubls, the amide I′ band for rP400 shows 10% more of its sequence to be involved in β-sheet structures than in α-helix. These findings suggest that P400 is a structural homologue of the ubiquitin family proteins.Fil: Ordoñez, Maria Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Guillén, J.. Universidad de Murcia. Facultad de Quimica. Dpto.de Bioqu.y Biolog.molecular E Inmunologia; EspañaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Villalaín, J.. Universidad de Miguel Hernandez. Centro de Biologia Molecular y Celular; EspañaFil: Conde, Ruben Danilo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; Argentin

Population dynamics of microbial native consortia efficient for textile wastewater degradation

Wastewater produced by textile industries is one of the most difficult effluents to treat due to its great volume, toxicity and variable composition. In this work, a comprehensive study on the degradation of pure textile effluent by two native bacterial consortia was conducted. The consortia were pre-enriched in Luria Bertani or glucose-potato media, termed as LBC and GPC, respectively. Consortia composition, structure and dynamics towards effluent biodegradation and toxicity analyses were conducted. Both bacterial communities degrade textile wastewater without pre-treatment and without the addition of nutritional sources, reducing TOC, COD and pH. One consortium was more efficient in achieving effluent decolorization and the reduction of COD, while the other showed better performance in reducing toxicity. Diversity analysis of both communities showed that there was no marked loss of diversity during degradation kinetics. The relative abundance of Gammaproteobacteria increased and within this group, Aeromonadal, Enterobacterial and Pseudomonadal were the main represented orders. The biodegradation ability of the isolated strains showed that none of them were able to degrade textile effluent independently. Toxicity assays showed the importance of carrying out these tests to appropriately select the final destination of the treated wastewater.Fil: Ceretta, Maria Belen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; ArgentinaFil: Irazoqui, José Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea. - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea; ArgentinaFil: Pérsico, María Marta. Universidad Tecnológica Nacional; ArgentinaFil: Nercessian, Debora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; ArgentinaFil: Wolski, Erika Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; Argentin