8 research outputs found

    Phylogeography of native mitogenomes from Uruguay

    Get PDF
    Recientemente, diversos estudios sobre la población uruguaya han demostrado que está conformada por desiguales aportes de europeos, africanos y pueblos originarios, entre otros. El aporte indígena es mayor cuando se analiza la contribución por línea materna, aunque su origen étnico/geográfico no es claro, ni tampoco cuándo ni cómo llegaron los distintos grupos. Para aportar al conocimiento del poblamiento prehistórico e histórico del territorio y sus relaciones con otras poblaciones se analizan, por secuenciación masiva, 32 genomas mitocondriales completos (mitogenomas) de habitantes actuales del país, identificados previamente por sus regiones hipervariables como correspondientes a los cuatro haplogrupos principales de origen americano. Se determinaron siete nuevos subhaplogrupos (A2be, A2bf, B2an, C1d1h, C1b30, C1b31 y D1x), otro se redenominó (C1d1d - actual C1d1g) y se plantea la revisión de los criterios de asignación de B2b6 y D1g5. Se estimó la antigüedad de los subhaplogrupos nuevos, que varía entre 4554 y 11985 años, con la excepción de C1d1g, cuya edad fue estimada en 20736 años. Algunas secuencias pudieron ser vinculadas a distintos grupos étnicos o a diversas regiones geo-gráficas, como Amazonia, Chaco, Pampa, o Andes. Se discuten las nuevas asignaciones de subhaplogrupos y las de algunos previamente definidos, así como su distribución geo-gráfica y antigüedad, con relación al panorama general de América del Sur.Recently, several studies on the Uruguayan population have shown that it is formed by unequal contributions from Europeans, Africans, Native Americans, and others. The native component is larger when maternal contribution is analyzed, but its ethnic/geographic origin remains unclear, as it is also unclear how and when these groups arrived. To contribute to the knowledge about prehistoric and historic peopling of the territory and its relations with other populations, 32 complete mitochondrial genomes (mitogenomes) were obtained by next generation sequencing. They belong to present inhabitants of the country, whose hypervariable regions were previously analyzed and whose identified haplogroups belonged to one of the four main haplogroups of Native American origin. Seven new subhaplogroups (A2be, A2bf, B2an, C1d1h, C1b30, C1b31 and D1x) were determined, another was redenominated (C1d1d - present C1d1g), and the criteria to assign B2b6 and D1g5 were reviewed. The age of the new subhaplo-groups was estimated between 4.554 and 11.985 years, while the age of C1d1g was estimated in 20.736 years. Some sequences could be related to different ethnic groups, or to several geographic regions such as Amazonia, Chaco, Pampa or Andes. The new subhaplogroup assignations, together with their geographic distribution and chronology, are discussed in relation to the general panorama of South America.Asociación de Antropología Biológica Argentin

    Cystic echinococcosis in South America: systematic review of species and genotypes of Echinococcus granulosus sensu lato in humans and natural domestic hosts

    No full text
    OBJECTIVE:To systematically review publications on Echinococcus granulosus sensu lato species/genotypes reported in domestic intermediate and definitive hosts in South America and in human cases worldwide, taking into account those articles where DNA sequencing was performed; and to analyse the density of each type of livestock that can act as intermediate host, and features of medical importance such as cyst organ location.METHODS:Literature search in numerous databases. We included only articles where samples were genotyped by sequencing since to date it is the most accurate method to unambiguously identify all E. granulosus s. l. genotypes. Also, we report new E. granulosus s. l. samples from Argentina and Uruguay analysed by sequencing of cox1 gene.RESULTS:In South America five countries have cystic echinococcosis cases for which sequencing data are available: Argentina, Brazil, Chile, Peru and Uruguay, adding up 1534 cases. E. granulosus s. s. (G1) accounts for most of the global burden of human and livestock cases. Also E. canadensis (G6) plays a significant role in human cystic echinococcosis. Likewise, worldwide analysis of human cases showed that 72.9% are caused by E. granulosus s. s. (G1) and 12.2% and 9.6% by E. canadensis G6 and G7, respectively.CONCLUSIONS:E. granulosus s. s. (G1) accounts for most of the global burden followed by E. canadensis (G6 and G7) in South America and worldwide. This information should be taken into account to suit local cystic echinococcosis control and prevention programmes according to each molecular epidemiological situation. This article is protected by copyright. All rights reserved.Fil: Cucher, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Macchiaroli, Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Baldi, Germán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto de Matemática Aplicada de San Luis; ArgentinaFil: Camicia, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Prada, Laura Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Maldonado, Lucas Luciano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Avila, Héctor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Fox, Adolfo. Laboratorios Fox; ArgentinaFil: Gutierrez, Ariana. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; ArgentinaFil: Negro, Perla. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: López, Raúl . Provincia de Catamarca. Ministerio de Salud y Acción Social; ArgentinaFil: Jensen, Oscar. Provincia de Chubut. Ministerio de Salud Ministerio de Desarrollo Territorial y Sectores Productivos. Centro de Investigación en Zoonosis; ArgentinaFil: Rosenzvit, Mara Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Kamenetzky, Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin

    Implementation of new tools in molecular epidemiology studies of Echinococcus granulosus sensu lato in South America

    No full text
    The aim of this work was to determine Echinococcus granulosus sensu lato species and genotypes in intermediate and definitive hosts and in human isolates from endemic regions of Argentina and Brazil including those where no molecular data is available by a combination of classical and alternative molecular tools. A total of 227 samples were isolated from humans, natural intermediate and definitive hosts. Amplification of cytochrome c oxidase subunit I gene fragment was performed and a combination of AluI digestion assay, High Resolution Melting anal- ysis (HRM) assay and DNA sequencing was implemented for Echinococcus species/genotype determination. E. granulosus sensu stricto (G1) was found in sheep (n = 35), cattle (n = 67) and dogs (n = 5); E. ortleppi (G5) in humans (n = 3) and cattle (n = 108); E. canadensis (G6) in humans (n = 2) and E. canadensis (G7) in pigs (n = 7). We reported for the first time the presence of E. ortleppi (G5) and E. canadensis (G6) in humans from San Juan and Catamarca Argentinean provinces and E. canadensis (G7) in pigs from Cordoba Argentinean province. In this work, we widened molecular epidemiology studies of E. granulosus s. l. in South America by an- alyzing several isolates from definitive and intermediate hosts, including humans from endemic regions were such information was scarce or unavailable. The presence of different species/genotypes in the same region and host species reinforce the need of rapid and specific techniques for accurate determination of Echinococcus species such as the ones proposed in this work.Fil: Avila, Héctor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. Centro de Investigaciones en Zoonosis; ArgentinaFil: Santos, Guilherme B.. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Cucher, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Macchiaroli, Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Pérez, Matías Gastón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Baldi, Germán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de San Luis; ArgentinaFil: Jensen, Oscar. Centro de Investigaciones en Zoonosis; ArgentinaFil: Pérez, Matías Gastón. División Zoonosis; ArgentinaFil: López, Raúl. Departamento de Zoonosis Provincial; ArgentinaFil: Negro, Perla Susana. Cátedra de Parasitología y Enfermedades Parasitarias; ArgentinaFil: Scialfa, Exequiel Alejandro. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; ArgentinaFil: Zaha, Arnaldo. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Ferreira, Henrique B.. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Rosenzvit, Mara Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Kamenetzky, Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin

    Presentation of the final prototype to the "Chem-E-Car" Competition at the 10th World Congress of Chemical Engineering

    No full text
    El proyecto consistió en la presentación del prototipo Chem-E-Car desarrollado en la UCM en la competición mundial que se celebró durante el transcurso del Congreso Mundial de Ingeniería Química (Barcelona, 30 septiembre-2 de octubre de 2017).The project consisted of the presentation of the Chem-E-Car prototype developed at the UCM in the world competition held during the World Congress of Chemical Engineering (Barcelona, September 30-October 2, 2017).Depto. de Ingeniería Química y de MaterialesFac. de Ciencias QuímicasFALSEsubmitte
    corecore