Identification of moaA3 gene in patient isolates of Mycobacterium tuberculosis in Kerala, which is absent in M. tuberculosis H37Rv and H37Ra

BACKGROUND: Tuberculosis is endemic to developing countries like India. Though the whole genome sequences of the type strain M. tuberculosis H37Rv and the clinical strain M. tuberculosis CDC1551 are available, the clinical isolates from India have not been studied extensively at the genome level. This study was carried out in order to have a better understanding of isolates from Kerala, a state in southern India. RESULTS: A PCR based strategy was followed making use of the deletion region primers to understand the genome level differences between the type strain H37Rv and the clinical isolates of M. tuberculosis from Kerala. PCR analysis of patient isolates using RD1 region primers revealed the amplification of a 386 bp region, in addition to the expected 652 bp amplicon. Southern hybridization of genomic DNA with the 386 bp amplicon confirmed the presence of this new region in a majority of the patient isolates from Kerala. Sequence comparison of this amplicon showed close homology with the moaA3 gene of M. bovis. In M. bovis this gene is present in the RvD5 region, an IS6110 mediated deletion that is absent in M. tuberculosis H37Rv. CONCLUSION: This study demonstrates the presence of moaA3 gene, that is absent in M. tuberculosis H37Rv and H37Ra, in a large number of local isolates. Whether the moaA3 gene provides any specific advantage to the field isolates of the pathogen is unclear. Field strains from Kerala have fewer IS6110 sequences and therefore are likely to have fewer IS6110 dependent rearrangements. But as deletions and insertions account for much of the genomic diversity of M. tuberculosis, the mechanisms of formation of sequence polymorphisms in the local isolates should be further examined. These results suggest that studies should focus on strains from endemic areas to understand the complexities of this pathogen

Downregulation of vimentin in macrophages infected with live Mycobacterium tuberculosis is mediated by Reactive Oxygen Species

Bevezetés: A serdülőkor az egyik legmeghatározóbb életszakasz a megfelelő egészségmagatartás kialakulásának szempontjából. Az egészségmagatartás feltérképezése hatékony egészségnevelési és egészségfejlesztési stratégiák kialakításához és azok módszertani fejlesztéséhez elengedhetetlen. Célkitűzés: Jelen kutatás célja felmérni egy hazai és egy határon túli intézményben az 5., 7., és 9. osztályos tanulók egészségmagatartását különös tekintettel az egészséges táplálkozásra, a fizikai aktivitásra valamint az egészséggel kapcsolatos információforrásukra. Módszer: A vizsgálatban összesen 206 fő (Tiszafüred: 116 fő; Nagyvárad: 90 fő) vett rész. A kérdőív szocio-demográfíai adatokra, táplálkozási szokásokra, fizikai aktivitásra, és egészséggel kapcsolatos információforrásra vonatkozó kérdéseket tartalmazott. A folytonos változók átlagos pontszámai közötti eltéréseket Kruskal-Wallis tesztekkel, a kategorikus változók gyakoriságbeli eltéréseit pedig Fisher-féle egzakt próbák segítségével értékeltem. Eredmények: Mindkét intézményben a fiatalok egészségmagatartása tekintetében vannak fejlesztésre szorul területek, elsősorban az egészséges táplálkozás vonatkozásában. A két intézmény összehasonlítsa során kapott eredmények alapján elmondható, hogy az iskolán kívül végzett fizikai aktivitás (p=0,304), valamint a testmozgásról alkotott vélemény (p=0,267) tekintetében a két intézmény tanulói között nincs szignifikáns különbség. A tiszafüredi gimnázium tanulói (átlag: 3,95, szórás: 1,60) a nagyváradi gimnázium tanulóihoz (átlag: 3,32, szórás: 1,77) képest szignifikánsan gyakrabban ebédelnek rendszeresen (p=0,013). A tiszafüredi tanulók ritkábban fogyasztanak gyorséttermi ételeket (p<0,001), kávét (p=0,003), és energiaitalt (p<0,001) a nagyváradi tanulókhoz képest. Ugyanakkor körükben gyakoribb a rostos üdítőital fogyasztása (p<0,001). Következtetések: Mind a hazai mind pedig a határon túli intézményben javasolt lenne az egészségtudatosság javítása, az egészségmagatartás fejlesztése a különféle egészségnevelési és egészségfejlesztési programok fejlesztését célzó intézkedések révén.BSc/BAegészségügyi gondozás és prevenció – védőnőmagyarnappal

A Novel Site of Insertion of IS6110 in the moaB3 Gene of a Clinical Isolate of Mycobacterium tuberculosis

In Mycobacterium tuberculosis, genomic variation is generated mainly by insertions and deletions rather than by point mutations. RvD5 is one such deletion in M. tuberculosis H37Rv. Previous studies from our laboratory have shown the presence of moaA3 gene in the RvD5 region in a large number of clinical isolates, that is absent in M. tuberculosis H37Rv and H37Ra. The present study was aimed at investigating the RvD5 locus of the clinical isolates by a detailed PCR analysis. Here we report a new point of insertion of the mobile genetic element, IS6110 in the genome of one clinical isolate of M. tuberculosis. The insertion has disrupted the moaB3 gene, one of the ORFs in the RvD5 region, which is involved in the molybdopterin biosynthetic pathway. This insertion of IS6110 in the moaB3 of the clinical isolate is different when compared to the insertion in the moaB3 gene of M. tuberculosis H37Rv where 4kb RvD5 region has been lost by homologous recombination and only a truncated form of the gene is present. This finding is of relevance since IS6110 is a major element determining the genome plasticity of M. tuberculosis and its numerical and positional polymorphism has always been of special interest

Drinking Water Associated Pathology

© 2012 by World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd. All rights reserved. There are over 100 different types of pathogens that can be found in contaminated water. Contaminated drinking water due to inadequate and unsanitary disposal of sewage and excreta continue to pose a threat to the health in many communities in developing countries. Groundwaters, surface waters, and distribution systems are at risk. Waterborne disease outbreaks are rising due to increasing vulnerable populations, politcal upheaval, and high numbers of refugees in developing countries. Natural disasters such as flooding and droughts due to climatic changes may also be affecting global water quality. As we move into the next century, it will be important to arm drinking water utility personnel with current and comprehensive information regarding waterborne pathogens and the importance of maintaining vigilance in their control

Efficient discrimination by MIRU-VNTRs of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates belonging to the predominant SIT11/EAI3-IND ancestral genotypic lineage in Kerala, India

The present study evaluated the ability of MIRU–VNTRs to discriminate Mycobacterium tuberculosis (MTB) clinical isolates belonging to the SIT11/EAI3-IND ancestral genotypic lineage, which is highly prevalent in Kerala, India. Starting from 168 MTB clinical isolates, spoligotyping (discriminatory index of 0.9113) differentiated the strains into 68 distinct patterns, the biggest cluster being SIT11/48 SIT11 (n = 48). The present study shows that 12-loci MIRUs and 3 ETRs allowed an efficient discrimination of these isolates (discriminatory indexes of 0.7819 and 0.5523, respectively)

Presence of Region of Difference 1 among Clinical Isolates of Mycobacterium tuberculosis from India▿

This article does not have an abstract

Mycobacterium tuberculosis in Wild Asian Elephants, Southern India

We tested wild Asian elephants (Elephas maximus) in southern India and confirmed infection in 3 animals with Mycobacterium tuberculosis, an obligate human pathogen, by PCR and genetic sequencing. Our results indicate that tuberculosis may be spilling over from humans (reverse zoonosis) and emerging in wild elephants