23 research outputs found
Diversity of endophytic enterobacteria associated with different host plants.
ABSTRACT: Fifty-three endophytic enterobacteria isolates from citrus, cocoa, eucalyptus, soybean, and sugar cane were evaluated for susceptibility to the antibiotics ampicillin and kanamycin, and cellulase production. Susceptibility was found on both tested antibiotics. However, in the case of ampicillin susceptibility changed according to the host plant, while all isolates were susceptible to kanamycin. Cellulase production also changed according to host plants. The diversity of these isolates was estimated by employing BOX-PCR genomic fingerprints and 16S rDNA sequencing. In total, twenty-three distinct operational taxonomic units (OTUs) were identified by employing a criterion of 60% fingerprint similarity as a surrogate for an OTU. The 23 OTUs belong to the Pantoea and Enterobacter genera, while their high diversity could be an indication of paraphyletic classification. Isolates representing nine different OTUs belong to Pantoea agglomerans, P. ananatis, P. stewartii, Enterobacter sp., and E. homaechei. The results of this study suggest that plant species may select endophytic bacterial genotypes. It has also become apparent that a review of the Pantoea/Enterobacter genera may be necessary
Classificação taxonômica das estirpes de rizóbio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro baseada no seqüenciamento do gene 16S rRNA
As culturas da soja [Glycine max (L.) Merrill] e do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) são de grande importância econômica e social para o Brasil e ambas podem ter seu requerimento de nitrogênio suprido pela simbiose com bactérias da ordem Rhizobiales. Para garantir a maximização do processo biológico, deve-se proceder à inoculação de estirpes de rizóbio eficientes e competitivas, recomendadas pela pesquisa. No Brasil, foram comercializados, na safra 2001/2002, 14 milhões de doses de inoculantes, dos quais 99 % para as culturas da soja e do feijoeiro. Neste trabalho, determinou-se a posição taxonômica das estirpes utilizadas em inoculantes comerciais para as duas culturas, pelo seqüenciamento da região do DNA que codifica o gene 16S rRNA, que é suficientemente variável, mas carrega as informações necessárias para permitir a análise filogenética de bactérias. O seqüenciamento permitiu definir que duas das estirpes recomendadas para a cultura da soja, SEMIA 587 e SEMIA 5019 (= 29 w), pertencem à espécie Bradyrhizobium elkanii e as duas outras, SEMIA 5079 (=CPAC 15) e SEMIA 5080 (= CPAC 7), à espécie B. japonicum. Determinou-se, ainda, que a estirpe SEMIA 4080 (=PRF 81), recomendada para o cultura do feijoeiro, pertence à espécie Rhizobium tropici. As seqüências obtidas foram depositadas no banco mundial de genes do National Center for Biotechnology Information
Classificação taxonômica das estirpes de rizóbio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro braseada no sequenciamento do gene 16S rRNA.
As culturas da soja [Glycine max (L.) Merrill] e do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) são de grande importância econômica e social para o Brasil e ambas podem ter seu requerimento de nitrogênio suprido pela simbiose com bactérias da ordem Rhizobiales. Para garantir a maximização do processo biológico, deve-se proceder à inoculação de estirpes de rizóbio eficientes e competitivas, recomendadas pela pesquisa. No Brasil, foram comercializados, na safra 2001/2002, 14 milhões de doses de inoculantes, dos quais 99 % para as culturas da soja e do feijoeiro. Neste trabalho, determinou-se a posição taxonômica das estirpes utilizadas em inoculantes comerciais para as duas culturas, pelo seqüenciamento da região do DNA que codifica o gene 16S rRNA, que é suficientemente variável, mas carrega as informações necessárias para permitir a análise filogenética de bactérias. O seqüenciamento permitiu definir que duas das estirpes recomendadas para a cultura da soja, SEMIA 587 e SEMIA 5019 (= 29 w), pertencem à espécie Bradyrhizobium elkanii e as duas outras, SEMIA 5079 (=CPAC 15) e SEMIA 5080 (= CPAC 7), à espécie B. japonicum. Determinou-se, ainda, que a estirpe SEMIA 4080 (=PRF 81), recomendada para o cultura do feijoeiro, pertence à espécie Rhizobium tropici. As seqüências obtidas foram depositadas no banco mundial de genes do National Center for Biotechnology Information
Classificacao taxonomica, baseada na caracterizacao molecular, das estirpes de rizobio recomendadas para a culturas da soja e do feijoeiro.
As culturas da soja [Glycine max (L.) Merril] e do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) sao de grande importancia economica e social para o Brasil e ambas podem ser capazes de suprir suas necessidades do nutriente nitrogenio pela simbiose com bacterias da familia Rhizobiaceae. Para garantir a maximizacao do processo biologico, porem, deve-se proceder a inoculacao das sementes com estirpes de rizobio eficientes e competitivas, recomendadas pela pesquisa. No Brasil, sao comercializadas, anualmente, cerca de 13 milhoes de doses de inoculantes, sendo 99% destinadas a cultura da soja. Neste trabalho, determinou-se a posicao taxonomica das estirpes de rizobio recomendadas comercialmente para as duas culturas por duas tecnicas, o RFLP-PCR da regiao correspondente ao 16S rRNA (regiao conservada entre bacterias mas suficientemente variavel e carregando informacoes que permitem a determinacao das relacoes filogeneticas entre bacterias) e o sequenciamento parcial dos genes desta regiao. O sequenciamento parcial permitiu definir que duas das estirpes recomendadas para a cultura da soja, SEMIA 587 e SEMIA 5019, pertencem a especie Bradyrhizobium elkanii e as duas outras, SEMIA 5079 e SEMIA 5080, a especie B. japonicum. As duas estirpes recomendadas para a cultura do feijoeiro, SEMIA 4077 e SEMIA 4080, pertencem a especie Rhizobium tropici. As sequencias obtidas para essas estirpes foram depositadas no banco mundial de genes.bitstream/CNPSO/2516/1/bolPesq003.pd
Fungos micorrízicos nativos e Glomus clarun no rendimento de trevo vesiculoso cultivado em condições naturais e modificadas pela calagem e aplicação de fósforo Glomus clarun and native mycorrhizal fungi on yield of Trifolium spp. cultivated under natural and modified soil contitions with addition by phosphorus and liming
Em experimento desenvolvido na casa de vegetação na UFSM-RS, avaliou-se o efeito da introdução de fungos micorrizicos arbusculares (fMA) Glomus clarum e nativos no rendimento de massa seca (MS) e absorção de P pelo trevo vesiculoso (Trifolium spp.) e verificou-se a compatibilidade entre a espécie introduzida e os fMA nativos ocorrentes no solo estudado. Os tratamentos/oram constituídos defatorial 4x2x2 com quatro níveis de fMA: G. clarum, fungos nativos, mistura de ambas as populações e controle sem inoculação de fMA: com dois valores de pH: 4,4 e 5,4 e com dois níveis de fósforo disponível (Mehlich l): 6 e ISmg/kg de solo. A introdução de G. clarum isoladamente ou em conjunto com fMA nativos, na condição de pH 4,4, e em baixa disponibilidade de P, aumentou o rendimento de MS e absorção de P. Em disponibilidade intermediária de P (l5mg/kg de solo) e pH 5,4 não ocorreu diferença entre os tratamentos inoculados com fMA, mas destes ocorreu diferença para o tratamento sem inoculação, evidenciando a dependência do trevo pela micorrizaçâo. Tratamentos inoculados com G. clarum apresentaram maiores rendimentos de MS, absorção de P, colonização micorrizica e esporulação, mostrando que a introdução dessa espécie pode ser viável quando espécies nativas não são eficientes para a cultura ou tornam-se ineficientes quando a fertilidade do solo é modificada por aplicação de P e/ou calagem.<br>The experiment v/as conducted under greenhouse condition at the University of Santa Maria, RS, Brazil. The objectives were to evaluate the introduction of arbuscular mycorrhizalfúngi (AMF) Glomus clarum and natives fungi on the phosphorus uptake and dry matter (DM) production from Trifolium spp. and Io verify lhe compatibilily between introduced specie and lhe nativo AMF occurence in lhe studied soil. The treatments was constituled of 4x2x2 factorial withfour AMF leveis: G. clarum, AMf native, mixture of both populations of AMF andcontrai which was without inocutation of AMF: twopH leveis: 4.4 and 5.4 and two phosphorus leveis by Mehlich I extractor: 6 and l5mg/kg of soil. It was noticed that when G. clarum was introduced isolately or with native AMF with pH of 4.4 and low P availability increased DM production and P accumulation. At medium P availability (15mg/kg of soil) and pH 5.4 there were no diferences between inoculated treatments with AMF but from ones there was observed diferences on the contrai. These differences were due to the mycorrhizal dependence on Trifolium. Inoculated treatments with G. clarum showed higher DM production, Puptake, mycorrhizal colonization and number of spores. It can be concluded that the introduction of G. clariim can be viable when the nativo species are not efficient for the crop or become unefficient when the natural soilferlilily is modified by addition of phosphorus or liming