Genetic similarity between quince cultivars evaluated by AFLP markers

O objetivo deste trabalho foi determinar as relações genéticas de 21 cultivares de marmeleiro com base no marcador “amplified fragment length polymorphism” (AFLP), para melhoramento e conservação de recursos genéticos da espécie na região sul do Rio Grande do Sul. O DNA das cultivares foi extraído pelo método CTAB, e as reações de AFLP foram realizadas com os iniciadores EcoRI/MseI. Foram identificados dois grupos entre as 21 cultivares de marmeleiro, um com quatro e outro com sete cultivares geneticamente mais relacionadas. As cultivares de marmeleiro apresentam alta variabilidade genética, com máximo de 43% de similaridade.The objective of this work was to determine the genetic relationships of 21 quince cultivars based on the amplified fragment length polymorphism (AFLP) marker, for breeding and conservation of genetic resources of the specie in the south of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The DNA from the cultivars was extracted using the CTAB method, and the AFLP reactions were performed with the primers EcoRI/MseI. Two groups were identified among the 21 quince cultivars, one with four and the other with seven cultivars more genetically related. The quince cultivars show high genetic variability, with maximum of 43% similarity

Phenotypic variation in root associated characters in rice (Oryza sativa L.)

The genetic distance between genotypes is one of the most important pieces of information for a breeding program. This is important at the time of selecting the parental genotypes that will generate the segregating populations. For the phenotypic analysis, 200 rice genotypes were chosen. The experimental design consisted of randomized blocks with three replications. Seeds were germinated in growth chamber at 28 ºC for 72 h and seedlings transferred to a plastic pot containing hydroponic solution, in which they remained until the second leaf emerged. The following characters were evaluated: main root length, secondary root length, 1st and 2nd leaf lengths, coleoptile s length, plant height, shoot and root dry weight. From the results obtained, it can be inferred that there is a correlation between the genotypes of three subspecies evaluated for root related characters and the remaining characters studied. It was also possible to identify contrasting genotypes for root related characters, such as Ligeirão and Farroupilha which are good parental candidates of a mapping population.A distância genética entre genótipos é um dos mais importantes elementos de informação para um programa de melhoramento. Isto é importante na hora de selecionar os genótipos parentais que irão gerar as populações segregantes. Para a análise fenotípica, foram avaliados 200 genótipos de arroz (Oryza sativa L.). O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados com três repetições. As sementes foram levadas para câmara de crescimento a 28 º C por 72 h. As plântulas foram transferidas para um pote plástico contendo solução hidropônica onde permaneceram até o surgimento da segunda folha. Foram avaliados os seguintes caracteres: comprimento da raiz principal, comprimento da raiz secundária, número de raízes, comprimento da 1ª e 2ª folha, inserção da 1ª folha, comprimento do coleóptilo, estatura da plântula, peso seco da parte área e radicular. A partir dos resultados obtidos pode-se inferir que houve variabilidade entre os genótipos das três subespécies avaliadas, que existe correlação entre os caracteres avaliados para o sistema de raízes com os demais caracteres de plântulas. E também foi possível identificar genótipos contrastantes, como Ligeirão e Farroupilha, que são bons candidatos a genitores de uma população de mapeamento para caracteres associados ao sistema de raízes

Characterization of genetic resources of Butia odorata in Pampa Biome

Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick is one of 266 palm species that occur in Brazil. The plants produces fruits that are used for food, both fresh and processed (as jellies, ice creams, juices and liqueurs). It has high potential as energy source due to the oils cointained in the seeds. The leaves are rich in fibers, and are used in the crafting of decorative and utilitarian objects. However, natural populations suffer intense human activity, mainly as a result of land use for agriculture and urban expansion. Moreover, even in certain areas remaining, pressure by grazing cattle has restricted the regeneration, leaving only adult plants. With the aim of contributing to the knowledge related to genetic resources of B. odorata in Pampa Biome, field activities were developed at São Miguel Farm (Tapes, RS), morphological and molecular analyzes were done in Genetic Resources and Molecular Biology labs of Embrapa Temperate Agriculture (Pelotas, RS), and a morphological descriptors minimum list was developed at Bioversity International (Rome / Maccarese, Italy). The results are presented in four articles. The first article aimed to evaluate the implementation of microsatellite markers developed for coconut in the butiá. A total of 50 primer pairs in 30 individuals of butiá collected in three separate areas were tested in a natural population. Among 50 primer pairs evaluated, 28 amplified, and eight of them showed unspecific bands and were not considered in the statistical analysis. The transferability of primers tested was 40%, indicating that these microsatellite markers developed for the coconut genome can be successfully used for genetic analysis in pindo palm. The objective of the second article was to evaluate the genetic structure of a natural population of B. odorata. We evaluated 303 plants using 20 pairs of SSR primers. High genetic variability was observed, with higher molecular variation among individuals within each area than among those from different areas. The observed heterozygosity was lower than expected, indicating the occurrence of inbreeding. The third area of plants have genetic structure due to the action of gene flow and / or genetic drift. The third article discusses the variability of B. odorata based on comparisons between scientific and popular. As morphological descriptors important for the characterization of germplasm were the following characteristics: habit of the leaves, stem circumference, leaf color, color of male flowers, number of bunches per plant, mature fruit color, fruit shape, presence of fibers in the pulp, fruit diameter, flowering and fruiting time. In turn, farmers use usually a lower number of traits to distinguish different plants: fruit size, number of bunches per plant, presence of fibers in the pulp, flavor and color of the fruit. The results presented in the third article were used for the preparation of the fourth article, which is the minimum list of morphological descriptors for the characterization of germplasm of B. odorata.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESButia odorata (Barb. Rodr.) Noblick é uma das 266 espécies de palmeiras que ocorrem no Brasil. Produz frutos que são utilizados na alimentação, tanto in natura como processados (na forma de geleias, sorvetes, sucos e licores). Apresentam elevado potencial energético, devido aos óleos existentes nas sementes. As folhas da planta, ricas em fibras, são usadas no artesanato para a confecção de objetos decorativos e utilitários. Contudo, as populações naturais sofrem intensa ação antrópica, principalmente em consequência do uso das terras para a agricultura e a expansão urbana. Além disso, mesmo em algumas áreas remanescentes, a pressão de pastoreio do gado restringe de modo expressivo a regeneração, restando somente indivíduos adultos. Com o objetivo geral de contribuir para o conhecimento relacionado aos recursos genéticos de B. odorata no Bioma Pampa, foram desenvolvidas atividades de campo na Fazenda São Miguel (Tapes, RS), análises morfológicas análises moleculares nos laboratórios de Recursos Genéticos e de Biologia Molecular da Embrapa Clima Temperado (Pelotas, RS), sistematização dos descritores morfológicos mínimos no Bioversity International (Roma/Maccarese, Itália). Os resultados são apresentados em quatro artigos. No primeiro artigo, com o objetivo de avaliar a transposição de marcadores microssatélites desenvolvidos para o genoma de coco em butiá, foram testados 50 pares de primers desenvolvidos para coco em 30 indivíduos de butiá coletados em três áreas distintas em uma população natural. Dos 50 pares de primers avaliados, 28 amplificaram, sendo que oito deles apresentaram bandas inespecíficas e não foram considerados na análise estatística. A transferibilidade dos primers testados foi de 40%, indicando que esses marcadores microssatélites desenvolvidos para o genoma de coco podem ser utilizados com sucesso para análises genéticas em butiá. No segundo artigo, com objetivo de avaliar a estrutura genética de uma população natural de B. odorata, foram avaliados 303 indivíduos, utilizando 20 pares de primers SSR. Foi constatada grande variabilidade genética, com maior variação molecular entre os indivíduos dentro de cada área do que entre aqueles de áreas distintas. A heterozigosidade observada, menor do que a esperada, indica a ocorrência de endogamia. As plantas da terceira área avaliada apresentam estruturação genética, devido à ação de fluxo gênico e/ou de deriva genética. O terceiro artigo discute a variabilidade de B.odorata com base em comparações entre o conhecimento científico e o conhecimento popular. Foram elencados como descritores morfológicos importantes para a caracterização do germoplasma as seguintes características: hábito das folhas, circunferência do caule, cor da folha, cor das flores masculinas, número de cachos por planta, cor do fruto maduro, formato do fruto, presença de fibras na polpa, diâmetro do fruto, época de floração e frutificação. Por sua vez, os agricultores costumam usar um menor número de características para distinguir as plantas: tamanho do fruto, número de cachos por planta, presença de fibras na polpa, sabor e cor dos frutos. Os resultados obtidos no terceiro artigo foram utilizados para a elaboração do quarto artigo, que consiste na lista dos descritores morfológicos mínimos para a caracterização do germoplasma de B. odorata

Caracterização morfológica de variedades crioulas de abóboras (Cucurbita maxima) do sul do Brasil

RESUMO O objetivo deste trabalho foi caracterizar morfologicamente variedades crioulas de Cucurbita maxima do sul do Brasil. Nove variedades crioulas de C. maxima foram caracterizadas com sete descritores quantitativos e 13 descritores qualitativos. As sementes foram cultivadas em casa de vegetação, em sacos de poliestireno preto, preenchidos com substrato. Quando as plantas apresentavam no mínimo duas folhas definitivas, 20 mudas de cada variedade foram transplantadas para o campo experimental, em delineamento completamente casualizado. Os dados quantitativos foram submetidos à análise de variância e foi utilizado o teste de Tukey para a comparação de médias, com o programa SAS 9.2. Os dados de caracteres quantitativos foram submetidos à análise de componentes principais, com o programa R. Para os caracteres qualitativos, a caracterização foi expressa pela moda de cada acesso, para cada descritor. Os caracteres qualitativos foram analisados como variáveis multicategóricas. A matriz de similaridade foi gerada no programa computacional GENES e foi construído um dendrograma, pelo método UPGMA, com o programa NTSYS. Ficou evidenciada a variabilidade genética para os caracteres quantitativos e qualitativos avaliados. A análise de variância evidenciou diferenças significativas entre as médias. Peso, formato, cor do fruto, espessura da casca e número de sementes por fruto são caracteres relevantes para a indicação de variedades crioulas promissoras para o melhoramento genético, com potencial para uso como fontes de genes e desenvolvimento de cultivares

O encanto das hastes florais das gramíneas.

Os campos naturais e a biodiversidade é uma riqueza que merece ser valorizada no Bioma Pampa. Associar a conservação dessa biodiversidade com seu uso inovador é uma estratégia importante para o desenvolvimento sustentável

Similaridade genética entre cultivares de marmeleiro avaliadas por marcadores AFLP

O objetivo deste trabalho foi determinar as relações genéticas de 21 cultivares de marmeleiro com base no marcador "amplified fragment length polymorphism" (AFLP), para melhoramento e conservação de recursos genéticos da espécie na região sul do Rio Grande do Sul. O DNA das cultivares foi extraído pelo método CTAB, e as reações de AFLP foram realizadas com os iniciadores EcoRI/MseI. Foram identificados dois grupos entre as 21 cultivares de marmeleiro, um com quatro e outro com sete cultivares geneticamente mais relacionadas. As cultivares de marmeleiro apresentam alta variabilidade genética, com máximo de 43% de similaridade

Characterization of bioactive compounds, antioxidant activity and minerals in landraces of pumpkin (Cucurbita moschata) cultivated in Southern Brazil

Abstract The objective of this work was to evaluate the genetic variability for the synthesis of bioactive compounds and minerals in pumpkin (Cucurbita moschata) landraces. Total phenolic compounds, carotenoids, antioxidant activity and minerals were evaluated in 10 accessions of Cucurbita moschata landraces from the Genebank of Embrapa Temperate Agriculture (Pelotas - RS, Brazil). Twenty plants of each accession were cultivated in the field during the spring/summer of 2013/2014. After harvesting of mature fruits, the seeds were discarded and opposite longitudinal portions of the pulp were manually prepared for analysis of the bioactive compounds. For the determination of minerals, pumpkin samples were frozen in plastic bags, and after freeze-dried and milled. All analysis were performed in triplicate. The data obtained showed high genetic variability for the synthesis of phenolic compounds, carotenoids, antioxidant activity and minerals. The accessions C52, C81, C267 e C389 showed high levels of antioxidants and minerals, being recommended for use in pumpkin breeding programs. The accessions C52 and C389 are promising, especially because they present the highest levels of total carotenoids