CARACTERIZAÇÃO DE SURTOS HOSPITALARES CAUSADOS POR ACINETOBACTER BAUMANNII PRODUTOR DE CARBAPENEMASE

Objective: to evaluate the profile of hospital outbreaks caused by carbapenemase-producing A. baumannii, in hospitals in the state of Goiás, to describe the main types of clinical samples from which the pathogen was isolated and to identify the genes that confer the production of carbapenemase encoding strains of A. baumannii of hospital outbreaks. Method: observational cross-sectional study, based on the results of bacterial isolates from hospital outbreaks caused by carbapenemase-producing A. baumannii from January 2015 to December 2020. Results: results of isolates from three hospitals were analyzed and nine outbreaks were confirmed and the resistance gene identified was blaOXA-23. Conclusion: the tracheal aspirate sample was the most frequent among hospital outbreaks and the blaOXA-23 resistance gene was identified in seven outbreaks. The characterization of the outbreaks highlights the threat posed by the spread of pathogens harboring genes encoding resistance.Objetivo: evaluar el perfil de los brotes hospitalarios causados ​​por A. baumannii productora de carbapenemasas, en hospitales del estado de Goiás, describir los principales tipos de muestras clínicas de las que se aisló el patógeno e identificar los genes que confieren la producción de codificación de carbapenemasas cepas de A. baumannii de brotes hospitalarios. Método: estudio transversal observacional, basado en los resultados de aislamientos bacterianos de brotes hospitalarios causados ​​por A. baumannii productora de carbapenemasas desde enero de 2015 hasta diciembre de 2020. Resultados: Se analizaron los resultados de aislamientos de tres hospitales y se confirmaron nueve brotes y el gen de resistencia identificado fue blaOXA-23. Conclusión: la muestra de aspirado traqueal fue la más frecuente entre los brotes hospitalarios y se identificó el gen de resistencia blaOXA-23 en siete brotes. La caracterización de los brotes destaca la amenaza que representa la propagación de patógenos que albergan genes que codifican resistencia.RESUMO Objetivo: avaliar o perfil de surtos hospitalares causados por A. baumannii produtores de carbapenemase, em hospitais do estado de Goiás; descrever os principais tipos de amostras clínicas das quais foram isolados o patógeno e identificar os genes que conferem a produção de codificadores de carbapenemase das cepas de A. baumanni dos surtos hospitalares. Método: estudo observacional do tipo transversal, realizado a partir dos resultados de isolados bacterianos de surtos hospitalares causados por A. baumannii produtores de carbapenemase do período de janeiro de 2015 a dezembro de 2020. Resultados: foram analisados resultados dos isolados de três hospitais e confirmaram-se nove surtos e o gene de resistência identificado foi blaOXA-23. Conclusão: a amostra de aspirado traqueal foi a mais frequente entre os surtos hospitalares e o gene de resistência blaOXA-23 identificado em sete surtos. A caracterização dos surtos destaca a ameaça que representa a disseminação de patógenos albergando genes codificadores de resistência.Objetivo: avaliar o perfil de surtos hospitalares causados por A. baumannii produtores de carbapenemase, em hospitais do estado de Goiás, descrever os principais tipos de amostras clínicas que foram isolados o patógeno e identificar os genes que conferem a produção de codificadores de carbapenemase das cepas de A. baumanni dos surtos hospitalares. Método: estudo observacional do tipo transversal, realizado a partir dos resultados de isolados bacterianos de surtos hospitalares causados por A. baumannii produtores de carbapenemase do período de janeiro de 2015 a dezembro de 2020. Resultados: foram analisados resultados dos isolados de três hospitais e confirmou-se nove surtos e o gene de resistência identificado foi blaOXA-23. Conclusão: a amostra de aspirado traqueal foi a mais frequente entre os surtos hospitalares e o gene de resistência blaOXA-23 identificado em sete surtos. A caracterização dos surtos destaca a ameaça que representa a disseminação de patógenos albergando genes codificadores de resistência

Haemophilus influenzae and Haemophilus haemolyticus isolates from children who attend day care centers in Goiânia-GO: prevalence, risk factors and molecular characterization of antimicrobial resistance

Submitted by Luciana Ferreira ([email protected]) on 2018-01-11T10:54:50Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Robmary Matias de Almeida - 2017.pdf: 3556874 bytes, checksum: 27db72af224144cb18266e9f23af2021 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)Approved for entry into archive by Luciana Ferreira ([email protected]) on 2018-01-11T10:55:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Robmary Matias de Almeida - 2017.pdf: 3556874 bytes, checksum: 27db72af224144cb18266e9f23af2021 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)Made available in DSpace on 2018-01-11T10:55:38Z (GMT). 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The objective of this study was to estimate the prevalence of Hi and Hhae in children under five years of age attending public day care centers in the city of Goiânia-GO, to determine the circulating serotypes, to analyze the risk factors associated with the nasopharyngeal carrige, as well as to characterize the antimicrobial resistance of Hi. Were analyzed 1.188 nasopharynx swabs from healthy children between 36 and 59 months of age from October to December 2010. The samples were submitted to bacterial culture for the isolation of Haemophilus spp. For the identification of the species, the Real-Time Polymerase Chain Reaction (TR-PCR) was used. Serotyping, as well as detection of the bla TEM-1 and bla ROB-1 resistance genes, was performed through the conventional Polymerase Chain Reaction. Phenotypic detection for β-lactamase production was performed by the chromogenic cephalosporin test. The database was constructed with the statistical software SPSS (Chicago, IL, USA) version 18.0. Risk factors, children aged 3 years, low maternal schooling and three or more children under 10 years of age living in the same household of the child recruited in the study were evaluated by multivariate Poisson regression. The prevalence of Hi carriers was 54.4% (646 / 1.188), 0.9% (n = 11) of the serotype e, 0.9% (n = 11) of serotype f, 0.2% (n = 2) serotype a, 0.08% (n = 1) serotype d, 0.0% (n = 0) serotype b and c and 52.3% (621 / 1.188) of HiNT. The prevalence of Hhae was 1.2% (14 / 1.188). Among the encapsulated Hi, the prevalence of the bla TEM-1 gene was 4.0% (1/25) and the bla ROB-1 gene was 4.0% (1/25). Among the 20% (124/621) of HiNT analysed, the prevalence of the bla TEM-1 gene was 13,7% (17/124) and the prevalence of the bla TEM-1 gene was 1,6% (2/124). Continuous surveillance of Haemophilus spp. as a colonizer, is necessary to evaluate its transmission and dissemination in the population where there is a higher risk of invasive disease, to control Hib re-emergence after the vaccinacion and to continue to monitor antimicrobial resistance.Haemophilus influenzae (Hi) e Haemophilus haemolyticus (Hhae) são importantes microrganismos presentes na colonização nasofaríngea humana, com taxas que variam de acordo com a localidade, frequência de amostragem, fatores individuais e sociais. O Hi é um agente patológico causador de doenças como meningite, pneumonia, sepse e otite média que se apresenta sob as formas capsuladas com seis sorotipos a, b, c, d, e, f, e não capsuladas ounão tipáveis (HiNT). O Hhae é comensal nasofaríngeo e raramente causa doenças invasivas. O objetivo do estudo foi estimar a prevalência de Hi e Hhae em crianças menores de cinco anos de idade que frequentam creches públicas no município de Goiânia-GO, determinar os sorotipos circulantes, analisar os fatores de risco associados ao portador nasofaríngeo, bem como caracterizar a resistência antimicrobiana dos Hi. Foram analisados 1.188 swabs de nasofaringe de crianças saudáveis entre 36 e 59 meses de idade, no período de outubro a dezembro de 2010. As amostras foram submetidas à cultura bacteriana para o isolamento do Haemophilus spp. Para identificação da espécie foi utilizada a Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real (PCR-TR). A sorotipagem, assim como a detecção dos genes de resistência bla TEM-1 e bla ROB-1 , foi realizada através da Reação em Cadeia da Polimerase convencional. A detecção fenotípica para produção da β-lactamase foi executada pelo teste da cefalosporina cromogênica. A base de dados foi construída com o programa estatístico SPSS (Chicago, IL, USA) versão 18.0. Os fatores de risco, crianças com idade de 3 anos, baixa escolaridade da mãe e três ou mais crianças menores de 10 anos de idade convivendo no mesmo domicilio da criança recrutada no estudo, foram avaliados por regressão de Poisson multivariada. A prevalência de portador do Hi foi de 54,4% (646/1.188) sendo 0,9% (n=11) do sorotipo e, 0,9% (n=11) do sorotipo f, 0,2% (n=2) do sorotipo a, 0,08%(n=1) do sorotipo d, 0,0% (n=0) dos sorotipos b e c e 52,3% (621/1.188) de HiNT. A prevalência do Hhae foi de 1,2% (14/1.188). Entre os Hi encapsulados a prevalência do gene bla TEM-1 foi de 4,0% (1/25) e do gene bla ROB-1 foi de 4,0% (1/25). Em 20% (124/621) dos HiNT, a prevalência do gene bla TEM-1 foi de 13,7% (17/124) e do gene bla ROB-1 de 1,6% (2/124). A vigilância contínua do Haemophilus spp. como colonizador, se faz necessária para avaliar sua transmissão e disseminação na população onde há maior risco de incidência de doenças invasivas, controlar a re-emergência do Hib após a vacinação e continuar monitorando a resistência antimicrobiana