Epigenetics, bioelectricity and laterality of breast cancer

Epigenetics, Bioelectricity and Laterality of Breast CancerIn previous studies we found unexpectedly in patients that left-right (L-R) breast cancers (BC) differed in their methylation profiles (DM). We opened a new research line in which we hypothesize that, given the L-R environments of breast glands are non-identical: i. the bioelectric communication of the tumor with the L-R context differs, and ii. epigenetics has a crucial role in these differences. Our results, so far, are promising. We found in-silico that the top genes with L-R DM were involved in development, embryogenesis, and neural differentiation. We confirmed the same processes, by developing a MDA-MB231-Nod Scid Gama xenographt model and compared L-R tumoral methylation patterns by RRBS. With focus on ion channels, we found that depolarizing channels were more methylated R. This was suggesting that right sided tumors had a more polarized state as compared to left tumors. We setup an in-vitro model to treat MDA-MB231 cells with L-R conditioned extracts from normal human mammary glands and measured Ca2+ and Δψp with fluorescent probes. Cytometry assays confirmed bioelectric differences in the same direction: a more polarized state of right-treated cells. When deepening on epigenetic regulators, we found in-vitro a subtle increase of DNMT3 (de-novo methyltransferase) in left-treated cells, and confirmed it in-silico. Our studies support a non-explored epigenetic-bioelectric-laterality hypothesis for BC, which could serve as proof-of-principle for other bilateral tumors.Fil: Masuelli, Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Real, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Campoy, Emanuel Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Marzese, Diego Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Saint John’s Cancer Institute; Estados UnidosFil: Salomon, Matt. University of Southern California; Estados UnidosFil: de Blas, Gerardo Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Arias, Rodolfo José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Roque Moreno, Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaBuenos Aires Breast Cancer SymposiumCiudad Autónoma de Buenos AiresArgentinaConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y NeurocienciasConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina ExperimentalCentro de Educación Médica e Investigaciones ClínicasConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Medicina TraslacionalConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Nanosistema

Perfil de metilación tumoral como biomarcador para cáncer de mama: Dossier Premio Fundación Florencio Fiorini 2008.

El cáncer es una enfermedad heterogénea y la genética clásica no alcanza para explicar las diferentes manisfestaciones de la enfermedad ni el impacto del medio ambiente sobre la carcinogénesis. Los procesos que regulan la expresión de genes sin alterar la secuencia de los mismos son denominados procesos epigenéticos. En las células mamíferas los cambios epigenéticos son heredables, consisten en la metilación del carbono de la posición 5 de citosinas presentes en dinucleótidos CG (llamados islas CpG) y se encuentran concentrados en promotores de genes. La metilación aberrante de genes supresores tumorales (GST) provoca un descontrol del ciclo celular, así como la metilación aberrante de genes inhibidores de metástasis, facilita el escape de la célula tumoral. Entre los GST metilados en cáncer se encuentran RASSF1-A, E-Caderina, APC, GSTP1, p16, BRCA1, p14, hMLH1, p52, RB y VHL. Basados en estos datos planteamos que la determinación de alteraciones epigenéticas específicas de un tumor permitiría identificar etapas del proceso carcinogénico, como también establecer el grado o estadío de la enfermedad y que podría aportar información para proponer tratamientos más personalizados. Por otro lado, analizamos la posibilidad de detectar células tumorales en la circulación sanguínea, ya que el perfil de metilación de las células sanguíneas normales no interfiere en la detección del perfil encontrado en el tumor. Se analizó el perfil de metilación de 14 carcinomas mamarios, 4 ganglios con metástasis, 6 tejidos no neoplásicos del límite de seguridad quirúrgica y 2 tumores mamarios benignos. Los patrones de metilación y cambios de número de copias de todas las regiones fueron estudiados mediante la metodología molecular MS-MLPA (Methyl Specific-Multiplex Ligation dependent Probe Amplification).Fil: Marzese, Diego Matías. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Gago, Francisco. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Orozco, Javier Dario. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Tello, Olga. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Odontologia; ArgentinaFil: Vargas Roig, Laura Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Roqué, María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentin

Aberrant DNA methylation of cancer-related genes in giant breast fibroadenoma: A case report

Introduction. Giant fibroadenoma is an uncommon variant of benign breast lesions. Aberrant methylation of CpG islands in promoter regions is known to be involved in the silencing of genes (for example, tumor-suppressor genes) and appears to be an early event in the etiology of breast carcinogenesis. Only hypermethylation of p16INK4a has been reported in non-giant breast fibroadenoma. In this particular case, there are no previously published data on epigenetic alterations in giant fibroadenomas. Our previous results, based on the analysis of 49 cancer-related CpG islands have confirmed that the aberrant methylation is specific to malignant breast tumors and that it is completely absent in normal breast tissue and breast fibroadenomas. Case presentation. A 13-year-old Hispanic girl was referred after she had noted a progressive development of a mass in her left breast. On physical examination, a 10 × 10 cm lump was detected and axillary lymph nodes were not enlarged. After surgical removal the lump was diagnosed as a giant fibroadenoma. Because of the high growth rate of this benign tumor, we decided to analyze the methylation status of 49 CpG islands related to cell growth control. We have identified the methylation of five cancer-related CpG islands in the giant fibroadenoma tissue: ESR1, MGMT, WT-1, BRCA2 and CD44. Conclusion: In this case report we show for the first time the methylation analysis of a giant fibroadenoma. The detection of methylation of these five cancer-related regions indicates substantial epigenomic differences with non-giant fibroadenomas. Epigenetic alterations could explain the higher growth rate of this tumor. Our data contribute to the growing knowledge of aberrant methylation in breast diseases. In this particular case, there exist no previous data regarding the role of methylation in giant fibroadenomas, considered by definition as a benign breast lesion.Fil: Marzese, Diego Matías. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Gago, Francisco. Instituto Gineco-Mamario; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Orozco, Javier I.. Instituto Gineco-Mamario; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Tello, Olga. Instituto Gineco-Mamario; ArgentinaFil: Roque Moreno, Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Vargas Roig, Laura Maria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; Argentin

Asymptomatic Becker muscular dystrophy in a family with a multiexon deletion

We report a Becker muscular dystrophy (BMD) family with one 5-year-old affected patient and a 69-year-old asymptomatic grandfather. Dystrophin gene multiplex polymerase chain reaction and multiplex ligation-dependant probe amplification analysis showed that both males carried an in-frame deletion of exons 45-55. Segregation analysis revealed two additional asymptomatic boys in this family. Our finding supports previous predictions that exons 45-55 are the optimal multiexon skipping target in antisense gene therapy to transform the severe Duchenne muscular dystrophy into the milder BMD, or even asymptomatic, phenotype.Fil: Ferreiro, Verónica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Giliberto, Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; ArgentinaFil: Muñiz García, María Noelia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Francipane, Liliana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Marzese, Diego Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad del Aconcagua. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Mampel, Alejandra. Universidad del Aconcagua. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Roqué, María. Universidad del Aconcagua. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Frechtel, Gustavo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Szijan, Irena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentin

Epigenetic variations in breast cancer progression to lymph node metastasis

Breast cancer is a heterogeneous disease characterized by the accumulation of genetic and epigenetic alterations that contribute to the development of regional and distant metastases. Lymph node metastasis (LNM) status is the single most important prognostic factor. Metastatic cancer cells share common molecular alterations with those of the primary tumor, but in addition, they develop distinct changes that allow the cancer to progress. There is an urgent need for molecular studies which focus on identifying genomic and epigenomic markers that can predict the progression to metastasis. The objective of this study was to identify epigenetic similarities and differences between paired primary breast tumor (PBT) and LNM. We employed Methylation-Specific-MLPA (Multiplex ligation-dependent probe amplification) to assess the methylation status of 33 cancer-related genes in a cohort of 50 paired PBT and LNM specimens. We found that the methylation index, which represents the degree of aberrantly methylated genes in a specimen, was maintained during the progression to LNM. However, some genes presented differential methylation profiles. Interestingly, PAX6 presented a significant negative correlation between paired PBT and LNM (p = 0.03), which indicated a switch from methylated to unmethylated status in the progression from PBT to LNM. We further identified that the methylation status of PAX6 on the identified CpG site functionally affected the expression of PAX6 at the mRNA level. Our study unraveled significant epigenetic changes during the progression from PBT to LNM, which may contribute to improved prognosis, prediction and therapeutic management of metastatic breast cancer patients.Fil: Urrutia, Guillermo Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Laurito, Sergio Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Marzese, Diego Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Gago, Francisco. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Orozco, Javier. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Tello, Olga. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Branham, Maria Teresita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Campoy, Emanuel Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Roque Moreno, Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentin

Mitochondrial stress triggers a pro-survival response through epigenetic modifications of nuclear DNA

Mitochondrial dysfunction represents an important cellular stressor and when intense and persistent cells must unleash an adaptive response to prevent their extinction. Furthermore, mitochondria can induce nuclear transcriptional changes and DNA methylation can modulate cellular responses to stress. We hypothesized that mitochondrial dysfunction could trigger an epigenetically mediated adaptive response through a distinct DNA methylation patterning. We studied cellular stress responses (i.e., apoptosis and autophagy) in mitochondrial dysfunction models. In addition, we explored nuclear DNA methylation in response to this stressor and its relevance in cell survival. Experiments in cultured human myoblasts revealed that intense mitochondrial dysfunction triggered a methylation-dependent pro-survival response. Assays done on mitochondrial disease patient tissues showed increased autophagy and enhanced DNA methylation of tumor suppressor genes and pathways involved in cell survival regulation. In conclusion, mitochondrial dysfunction leads to a “pro-survival” adaptive state that seems to be triggered by the differential methylation of nuclear genes.Fil: Mayorga, Lía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Salassa, Betiana Nebaí. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Odontologia; ArgentinaFil: Marzese, Diego Matías. John Wayne Cancer Institute; Estados UnidosFil: Loos, Mariana. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Eiroa, Hernán D.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Lubieniecki, Fabiana. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Garcia Samartino, Clara. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Romano, Patricia Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Roque Moreno, Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentin

DNA methylation index and methylation profile of invasive ductal breast tumors

Breast carcinogenesis is a multistep process that involves both genetic and epigenetic alterations. Identification of aberrantly methylated genes in breast tumors and their relation to clinical parameters can contribute to improved diagnostic, prognostic, and therapeutic decision making. Our objective in the present study was to identify the methylation status of 34 cancer-involved genes in invasive ductal carcinomas (IDC). Each of the 70 IDC cases analyzed had a unique methylation profile. The highest methylation frequency was detected in the WT1 (95.7%) and RASSF1 (71.4%) genes. Hierarchical cluster analysis revealed three clusters with different distribution of the prognostic factors tumor grade, lymph node metastasis, and proliferation rate. Methylation of TP73 was associated with high histological grade and high proliferation rate; methylation of RARB was associated with lymph node metastasis. Concurrent methylation of TP73 and RARB was associated with high histological grade, high proliferation rate, increased tumor size, and lymph node metastasis. Patients with more than six methylated genes had higher rates of relapse events and cancer deaths. In multivariate analysis, TP73 methylation and the methylation index were associated with disease outcome. Our results indicate that methylation index and methylation of TP73 and/or RARB are related to unfavorable prognostic factors in patients with IDC. These epigenetic markers should be validated in further studies to improve breast cancer management. © 2012 American Society for Investigative Pathology and the Association for Molecular Pathology.Fil: Marzese, Diego Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Hoon, Dave S.B.. Saint John's Health Center; Estados UnidosFil: Chong, Kelly K.. Saint John's Health Center; Estados UnidosFil: Gago, Francisco E.. Universidad Nacional de Cuyo; Argentina. Centro Médico de Mendoza; ArgentinaFil: Orozco, Javier Dario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo; Argentina. Centro Médico de Mendoza; ArgentinaFil: Tello, Olga M.. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Vargas Roig, Laura Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Roque Moreno, Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo; Argentin

DNA methylation and gene deletion analysisof brain metastases in melanoma patients identifies mutually exclusive molecular alterations

Background: The brain is a common target of metastases for melanoma patients. Little is known about the genetic and epigenetic alterations in melanoma brain metastases (MBMs). Unraveling these molecular alterations is a key step in understanding their aggressive nature and identifying novel therapeutic targets. Methods: Genome-wide DNA methylation analyses of MBMs (n = 15) and normal brain tissues (n = 91) and simultaneous multigene DNA methylation and gene deletion analyses of metastatic melanoma tissues (99 MBMs and 43 extracranial metastases) were performed. BRAF and NRAS mutations were evaluated in MBMs by targeted sequencing. Results: MBMs showed significant epigenetic heterogeneity. RARB, RASSF1, ESR1, APC, PTEN, and CDH13 genes were frequently hypermethylated. Deletions were frequently detected in the CDKN2A/B locus. Of MBMs, 46.1% and 28.8% had BRAF and NRAS missense mutations, respectively. Compared with lung and liver metastases, MBMs exhibited higher frequency of CDH13 hypermethylation and CDKN2A/B locus deletion. Mutual exclusivity between hypermethylated genes and CDKN2A/B locus deletion identified 2 clinically relevant molecular subtypes of MBMs. CDKN2A/B deletions were associated with multiple MBMs and frequently hypermethylated genes with shorter time to brain metastasis. Conclusions: Melanoma cells that colonize the brain harbor numerous genetically and epigenetically altered genes. This study presents an integrated genomic and epigenomic analysis that reveals MBM-specific molecular alterations and mutually exclusive molecular subtypes.Fil: Marzese, Diego Matías. John Wayne Cancer Institute. Department of Molecular Oncology; Estados UnidosFil: Scolyer, Richard A.. Melanoma Institute Australia; Australia. Royal Prince Alfred Hospital; Australia. University of Sydney; AustraliaFil: Roque Moreno, Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Cienicas Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Vargas Roig, Laura Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Huynh, Jamie L.. John Wayne Cancer Institute. Department of Molecular Oncology; Estados UnidosFil: Wilmott, James S.. University of Sydney; Australia. Melanoma Institute Australia; AustraliaFil: Murali, Rajmohan. Memorial Sloan-Kettering Cancer Center; Estados UnidosFil: Buckland, Michael E.. University of Sydney; Australia. Royal Prince Alfred Hospital; AustraliaFil: Barkhoudarian, Garni. Saint John's Health Center; Estados UnidosFil: Thompson, John F.. Royal Prince Alfred Hospital; Australia. University of Sydney; AustraliaFil: Morton, Donald L.. John Wayne Cancer Institute. Department of Molecular Oncology; Estados UnidosFil: Kelly, Daniel F.. Saint John's Health Center; Estados UnidosFil: Hoon, Dave S. B.. John Wayne Cancer Institute. Department of Molecular Oncology; Estados Unido

When left does not seem right: epigenetic and bioelectric differences between left- and right-sided breast cancer

Background: During embryogenesis lateral symmetry is broken, giving rise to Left/Right (L/R) breast tissues with distinct identity. L/R-sided breast tumors exhibit consistently-biased incidence, gene expression, and DNA methylation. We postulate that a differential L/R tumor-microenvironment crosstalk generates different tumorigenesis mechanisms. Methods: We performed in-silico analyses on breast tumors of public datasets, developed xenografted tumors, and conditioned MDA-MB-231 cells with L/R mammary extracts. Results: We found L/R differential DNA methylation involved in embryogenic and neuron-like functions. Focusing on ion-channels, we discovered significant L/R epigenetic and bioelectric differences. Specifically, L-sided cells presented increased methylation of hyperpolarizing ion channel genes and increased Ca2+ concentration and depolarized membrane potential, compared to R-ones. Functional consequences were associated with increased proliferation in left tumors, assessed by KI67 expression and mitotic count. Conclusions: Our findings reveal considerable L/R asymmetry in cancer processes, and suggest specific L/R epigenetic and bioelectric differences as future targets for cancer therapeutic approaches in the breast and many other paired organs.Fil: Masuelli, Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Real Varela, Sebastián Martín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Campoy, Emanuel Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Branham, Maria Teresita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad de Mendoza. Facultad de Ciencias de la Salud.; ArgentinaFil: Marzese, Diego Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Health Research Institute of the Balearic Islands; EspañaFil: Salomon, Matthew. University of Southern California; Estados UnidosFil: de Blas, Gerardo Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Arias, Rodolfo José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Levin, Michael. Tufts University; Estados UnidosFil: Roqué, Carmen María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentin

TP73 DNA methylation and upregulation of ΔNp73 are associated with an adverse prognosis in breast cancer

Aim: Accumulated evidence suggests that aberrant methylation of the TP73 gene and increased levels of ΔNp73 in primary tumours correlate with poor prognosis. However, little is known regarding the transcriptional and functional regulation of the TP73 gene in breast cancer. The aim of the present study was to determine the expression of the ΔNp73 isoform, its relationship with DNA methylation of TP73 and their clinical prognostic significance in breast cancer patients. Methods: TP73 gene methylation was studied in TCGA datasets and in 70 invasive ductal breast carcinomas (IDCs). The expression of p73 isoforms was evaluated by immunohistochemistry (IHC) and Western blot and correlated with clinicopathological variables and clinical outcome. Results: We observed that the methylation of diverse CpG islands of TP73 differed significantly between molecular subtypes. An inverse correlation was found between p73 protein expression and the methylation status of the TP73 gene. The expression of exon 3′ of p73 (only expressed in ΔNp73) was significantly higher in patients with wild-type p53. Immunohistochemical analysis revealed that all p73 isoforms were localised in both the nuclear and cytoplasmic compartments. We confirmed a positive association between the expression of ΔNp73 and high histological grade. Conclusions: Our findings suggest that high expression of ΔNp73 could be used to determine the aggressiveness of IDCs and could be incorporated in the pathologist's report.Fil: Gomez, Laura Constanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Sottile Fleury, Mayra Lis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Guerrero Gimenez, Martin Eduardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Zoppino, Felipe Carlos Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Redondo, Analia Lourdes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Gago, Francisco E.. Instituto Gineco-mamario; ArgentinaFil: Orozco, Javier I.. Ginecomamario Institute, Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina. John Wayne Cancer Institute at Providence Saint John’s Health Center; Estados UnidosFil: Tello, Olga M.. Ginecomamario Institute, Mendoza; ArgentinaFil: Roqué, María. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Nadin, Silvina Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Marzese, Diego Matías. John Wayne Cancer Institute; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Vargas Roig, Laura Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; Argentin