Caracterización de la diversidad genética de cultivares comerciales de heliconias en el centro occidente de Colombia

Characterization of the genetic diversity of commercial cultivars of heliconias in The Central Occident of Colombia. The Heliconiaceae family has only one genus, Heliconia L., with approximately 250 species. Due to the color of their bracts, they are widely used for ornamental purposes, presenting an increasing commercialization in the international market, and the production areas in Central and South America countries, providing a greater supply and demand of the product. However, there is confusion in this genus about the number of species and the relationships between them. This improper nomenclature can lead to commercial and scientific problems. In this research carried out during 2014, 44 individuals of the genus Heliconia of commercial importance in central west of Colombia, corresponding to 4 species, and an interspecific hybrid, were characterized by microsatellite markers previously developed for Heliconia bihai and Heliconia caribaea and own microsatellite markers obtained from a genomic enriched library with microsatellites for Heliconia orthotricha. Eighteen markers were selected to perform the characterizations. Direct amplification strategies were used, as well as the transferability of markers. The Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) was broken for some of the markers used in the different species of this study, because they belonged to commercial cultivars with high selection pressure by growers. The marker Hb_C115 presented the linkage with a greater number of markers. Many of the markers are linked to each other, it is not possible to determine their proximity to the chromosome, because they do not have linkage maps for any species of the genus. The transferability of the microsatellites developed for different species of the genus Heliconia is confirmed as a useful tool in the varietal characterization, which could be of great use in the commercialization of flowers and exchange of plant material for asexual propagation.La familia Heliconiaceae tiene un solo género, Heliconia L., con aproximadamente 250 especies. Debido al colorido de sus brácteas son muy usadas para fines ornamentales presentando una creciente comercialización en el mercado internacional, lo que ha incentivado el aumento en el área productiva en los países de Centro y Sur América, al proporcionar una mayor oferta y demanda del producto. Sin embargo, existe en este género, confusión sobre el número de especies y las relaciones entre ellas. Esta inapropiada nomenclatura, puede originar problemas a nivel comercial y científico. En esta investigación realizada durante el 2014, se caracterizaron gené- ticamente 44 individuos del género Heliconia de importancia comercial en el centro occidente de Colombia, que corresponden a 4 especies, y un híbrido interespecífico, por medio de la amplificación de marcadores microsatélites previamente desarrollados para Heliconia bihai y Heliconia caribaea y marcadores microsatélites propios obtenidos del desarrollo de una librería genómica enriquecida con microsatélites para Heliconia orthotricha. Se seleccionaron 18 marcadores para realizar las caracterizaciones. Se utilizaron las estrategias de amplificación directa, así como la transferibilidad de marcadores. El equilibrio Hardy-Weinberg (EHW) se rompió para algunos de los marcadores empleados en las diferentes especies de este estudio, ya que pertenecían a cultivares comerciales con alta presión de selección por parte de los cultivadores. El marcador Hb_C115 presentó el ligamiento con un mayor número de marcadores. Muchos de los marcadores están ligados entre sí y al no poseer mapas de ligamiento para ninguna especie del género no es posible determinar la cercanía de los mismos en los cromosomas. Se confirma la transferibilidad de los microsatélites desarrollados para diferentes especies del género Heliconia, como una herramienta útil en la caracterización varietal, la cual podría ser de gran uso en la comercialización de flores e intercambio de material vegetal para propagación asexual

Estandarizacion de la tecnica citogenetica squash para conteo de cromosomas mitoticos en rubus glaucus Benth

La mora de castilla Rubus glaucus, es tal vez uno de las frutales mas apetecidos en el mercado, su diversidad de usos la han convertido en uno de los cultivos promisorios de la región. A pesar de que la especie ha sido foco de muchas investigaciones encaminadas a su propagación, existe un vacío en la información citogenética que contribuya a su caracterización. Con esta investigación se logró la estandarización de la técnica de aplastado de raíces o �squash� para el conteo de cromosomas en células somáticas. En la fase de pretratamiento se utilizó 8-Hidroxiquinolina por 4 horas a temperatura a ambiente, se fijó con la solución de Farmer por 24 horas a 5ºC; se realizaron dos tipos de hidrólisis: y enzimática y la tinción se llevo a cabo con Acetocarmín. El número de cromosomas encontrado para R. glaucus fue de 28 cromosomas (tetraploide), sin hallar diferencias con respecto a las distintas procedencias cultivadas en el Eje Cafetero

Identificación de la especie de colletotrichum responsable de la antracnosis en la mora de castilla en la región cafetera.

Anthracnose is a disease that affects 53% to 70% of the Andean blackberry (Rubus glaucus) crops grown in Colombia. It is caused by various species of Colletotrichum spp. To generate an integrated control of the disease it is necessary to know the symptoms among crops and to identified and characterized the causal agent of Anthracnose. To obtain the monosporic fungus for culturing, storage and isolation, field samples were collected in Risaralda, Caldas and Quindío departments. The characterization of the seven isolates of Collethotricum was conducted with molecular markers, ITS (Internal Transcribed Spacers), and pathogenicity among isolates was evaluated.La antracnosis, causada por diferentes especies del género Colletotrichum, es una enfermedad que ocasiona pérdidas entre 53% y 70% en cultivos de mora (Rubus glaucus) en Colombia. Para el control de esta enfermedad se requiere conocer la sintomatología en los cultivos e identificar y caracterizar el agente causal. Se llevó a cabo la colecta, cultivo y aislamiento del hongo, obtenido en cultivos de los departamentos de Risaralda, Caldas y Quindío, se inició la caracterización de 7 aislamientos de Colletotrichum spp, mediante la utilización de marcadores ITS (Internal Transcribed Spacers), y la evaluación de la patogénicidad de los aislamientos

Estandarización de la extracción de ADN genómico en Tabebuia rosea (Bertol.) DC. y Cordia alliiodora (Ruiz & Pav.) Okén

Because of their great commercial potential and its role on environmental protection, Cordia alliodora and Tabebuia rosea are among species prioritized by Colombia�s National Reforestation Plan, which is executed by e National Corporation for Forestry Research and Development (CONIF) and the Ministry of Agriculture and Rural Development (MADR). Thanks to the advancement of molecular biology techniques, new tools, that are quite useful in plant breeding, are now available, promoting the fixation of genes involved in the expression of desirable phenotypic traits of commercial and productive interest. This study was aimed to standardize a specific genomic DNA extraction method from fresh and dry leaf tissue as well as from seedlings. Significant differences were observed between both species. In C. alliodora, tissue, type and condition was not a limiting factor for extraction and it only depended on the method used. On the other hand, T. rosea has limitations in DNA extraction and amplification from dry tissue, which was attributed to the high concentration of polysaccharides, polyphenols and other secondary metabolites, also reported in other studies for this species. The extracted DNA was quantified and its quality evaluated by DNA amplification using microsatellites. Data were analyzed by both Principal Component Analysis (PCA) and Multiple Factor Analysis (MFA). Based on the results obtained, a DNA extraction protocol was standardized for each of these species and the optimum leaf tissue for that process was defined.El potencial comercial y el papel que desempeñan en la protección del medio ambiente, Cordia alliodora y Tabebuia rosea las torna relevantes en el Plan Nacional de Reforestación, el cual es ejecutado por la Corporación Nacional de Investigación y Fomento Forestal (CONIF) y el Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural (MADR) de Colombia. El avance de las técnicas de biología molecular, permite la disponibilidad de nuevas herramientas en el mejoramiento genético vegetal, fomentando la fijación de genes involucrados en la expresión de caracteres fenotípicos deseables de interés comercial y productivo. El objetivo fue estandarizar un método de extracción de ADN genómico específico a partir de tejido foliar fresco y seco, al igual que de plántulas. Se encontraron diferencias significativas entre las dos especies. En C. alliodora el tipo y estado del tejido no fue un factor limitante para la extracción, la cual dependió solamente del método empleado. Por el contrario, T. rosea presentó limitaciones en la extracción y amplificación del ADN obtenido a partir de tejido seco, lo cual se atribuyó a la concentración significativa de polisacáridos, polifenoles y otros metabolitos secundarios, también reportados en otras investigaciones para esta especie. Se cuantificó el ADN extraído y se evaluó su calidad mediante la amplificación del ADN utilizando microsatélites. Los datos se sometieron a Análisis de Componentes Principales (ACP) y Análisis Factorial Múltiple (AFM). Con base en los resultados, se estandarizó un protocolo de extracción de ADN para cada especie y se definió el tejido foliar óptimo para dicho proceso

ESTANDARIZACIÓN DE LA EXTRACCIÓN DE ADN GENÓMICO EN Tabebuia rosea (Bertol.) DC. Y Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Okén

Because of their great commercial potential and its role on environmental protection, Cordia alliodora and Tabebuia rosea are among species prioritized by Colombia’s National Reforestation Plan, which is executed by the National Corporation for Forestry Research and Development (CONIF) and the Ministry of Agriculture and Rural Development (MADR). Thanks to the advancement of molecular biology techniques, new tools, that are quite useful in plant breeding, are now available, promoting the fixation of genes involved in the expression of desirable phenotypic traits of commercial and productive interest. This study was aimed to standardize a specific genomic DNA extraction method from fresh and dry leaf tissue as well as from seedlings. Significant differences were observed between both species. In C. alliodora, tissue, type and condition was not a limiting factor for extraction and it only depended on the method used. On the other hand, T. rosea has limitations in DNA extraction and amplification from dry tissue, which was attributed to the high concentration of polysaccharides, polyphenols and other secondary metabolites, also reported in other studies for this species. The extracted DNA was quantified and its quality evaluated by DNA amplification using microsatellites. Data were analyzed by both Principal Component Analysis (PCA) and Multiple Factor Analysis (MFA). Based on the results obtained, a DNA extraction protocol was standardized for each of these species and the optimum leaf tissue for that process was defined