TriloMorph: una base de datos dinámica y colaborativa de información morfogeométrica de los trilobites

Two files are attached, one related to the first version of TriloMorph (Stable_release_1.0), and another containing the codes and files related to the script, such as information of Devonian occurrence of trilobites from the PBDB and R codes (TriloMorph_Serra et al.).Se adjuntan dos archivos, uno relacionado a la primera versión estable de TriloMorph (TriloMorph v.1.0), y otro que contiene archivos relacionados al manuscrito, como ser los códigos de R y la base de datos de ocurrencia de los trilobites Devónicos de la PBDB (TriloMorph_Serra et al.).Fil: Serra, Fernanda. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; ArgentinaFil: Serra, Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Balseiro, Diego. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Balseiro, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Monnet, Claude. Universidad de Lille. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia.Fil: Randolfe, Enrique. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Randolfe, Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Bignon, Arnaud. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Bignon, Arnaud. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Rustán, Juan J. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Rustán, Juan J. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Bault, Valentín. Universidad de Lille. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia.Fil: Muñoz, Diego F. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Muñoz, Diego F. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Vaccari, N. Emilio. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Vaccari, N. Emilio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Martinetto, Malena. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Crônier, Catherine. Universidad de Lille. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia.Fil: Waisfeld, Beatriz G. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Modern morphometric-based approaches provide valuable metrics to quantify and understand macroevolutionary and macroecological patterns and processes. However, very few large scale morphological datasets are currently available for Life and Earth Sciences, including Palaeontology. Here we describe TriloMorph, an openly accessible database for morpho-geometric information of trilobites, the main Palaeozoic group of marine arthropods, together with a landmark acquisition protocol. In addition to morphological traits, the database contains contextual data on chronostratigraphic age, geographic location, taxonomic information and lithology of landmarked specimens. In this first version, the dataset has broad taxonomic and temporal coverage and comprises more than 55% of all trilobite genera and 85% of families recorded in the Paleobiology Database (PBDB) through Devonian geological stages. We provide a release of geometric morphometric data of 277 specimens (generic level) linked to published references. This is the first attempt of such an online morphometric repository. By bringing this information into a single open database we enhance the possibility of performing global paleobiological research, providing a major complement to the PBDB.Los enfoques modernos basados en morfometría proporcionan métricas valiosas para cuantificar y comprender patrones y procesos macroevolutivos y macroecológicos. Sin embargo, actualmente hay muy pocos conjuntos de datos morfológicos a gran escala disponibles para las ciencias de la vida y de la tierra, incluida la paleontología. Aquí describimos TriloMorph, una base de datos de acceso abierto para información morfo-geométrica de trilobites, el principal grupo de artrópodos marinos del Paleozoico, junto con un protocolo de adquisición de landmarks. Además de los datos morfológicos, la base de datos contiene datos sobre la edad cronoestratigráfica, la ubicación geográfica, la información taxonómica y la litología de los especímenes landmarkeados. En esta primera versión, el conjunto de datos tiene una amplia cobertura taxonómica y temporal y comprende más del 55 % de todos los géneros de trilobites y el 85 % de las familias registradas en Paleobiology Database (PBDB) del Devónico. En esta primera versión proporcionamos datos morfo-geométrica de 277 especímenes (a nivel genérico) vinculados a publicaciones específicas. Esta es la primera aproximación de un repositorio morfométrico de este tipo, que al reunir esta información en una sola base de datos abierta, posibilita la realización de investigaciones paleobiológicas globales, proporcionando un importante complemento a la PBDB.Fil: Serra, Fernanda. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; ArgentinaFil: Serra, Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Balseiro, Diego. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Balseiro, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Monnet, Claude. Universidad de Lille. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia.Fil: Randolfe, Enrique. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Randolfe, Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Bignon, Arnaud. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Bignon, Arnaud. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Rustán, Juan J. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Rustán, Juan J. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Bault, Valentín. Universidad de Lille. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia.Fil: Muñoz, Diego F. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Muñoz, Diego F. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Vaccari, N. Emilio. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Vaccari, N. Emilio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina.Fil: Martinetto, Malena. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina.Fil: Crônier, Catherine. Universidad de Lille. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia.Fil: Waisfeld, Beatriz G. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Córdoba; Argentina

A dynamic and collaborative database for morphogeometric information of trilobites

Abstract Modern morphometric-based approaches provide valuable metrics to quantify and understand macroevolutionary and macroecological patterns and processes. Here we describe TriloMorph, an openly accessible database for morpho-geometric information of trilobites, together with a landmark acquisition protocol. In addition to morphological traits, the database contains contextual data on chronostratigraphic age, geographic location, taxonomic information and lithology of landmarked specimens. In this first version, the dataset has broad taxonomic and temporal coverage and comprises more than 55% of all trilobite genera and 85% of families recorded in the Paleobiology Database through the Devonian. We provide a release of geometric morphometric data of 277 specimens linked to published references. Additionally, we established a Github repository for constant input of morphometric data by multiple contributors and present R functions that help with data retrieval and analysis. This is the first attempt of an online, dynamic and collaborative morphometric repository. By bringing this information into a single open database we enhance the possibility of performing global palaeobiological research, providing a major complement to current occurrence-based databases

TriloMorph: a dynamic and collaborative database for morphogeometric information of trilobites

Modern morphometric-based approaches provide valuable metrics to quantify and understand macroevolutionary and macroecological patterns and processes. However, very few large scale morphological datasets are currently available for Life and Earth Sciences, including Palaeontology. Here we describe TriloMorph, an openly accessible database for morpho-geometric information of trilobites, the main Palaeozoic group of marine arthropods, together with a landmark acquisition protocol. In addition to morphological traits, the database contains contextual data on chronostratigraphic age, geographic location, taxonomic information and lithology of landmarked specimens. In this first version, the dataset has broad taxonomic and temporal coverage and comprises more than 55% of all trilobite genera and 85% of families recorded in the Paleobiology Database (PBDB) through Devonian geological stages. We provide a release of geometric morphometric data of 277 specimens (generic level) linked to published references. This is the first attempt of such an online morphometric repository. By bringing this information into a single open database we enhance the possibility of performing global paleobiological research, providing a major complement to the PBDB. Los enfoques modernos basados en morfometría proporcionan métricas valiosas para cuantificar y comprender patrones y procesos macroevolutivos y macroecológicos. Sin embargo, actualmente hay muy pocos conjuntos de datos morfológicos a gran escala disponibles para las ciencias de la vida y de la tierra, incluida la paleontología. Aquí describimos TriloMorph, una base de datos de acceso abierto para información morfo-geométrica de trilobites, el principal grupo de artrópodos marinos del Paleozoico, junto con un protocolo de adquisición de landmarks. Además de los datos morfológicos, la base de datos contiene datos sobre la edad cronoestratigráfica, la ubicación geográfica, la información taxonómica y la litología de los especímenes landmarkeados. En esta primera versión, el conjunto de datos tiene una amplia cobertura taxonómica y temporal y comprende más del 55 % de todos los géneros de trilobites y el 85 % de las familias registradas en Paleobiology Database (PBDB) del Devónico. En esta primera versión proporcionamos datos morfo-geométrica de 277 especímenes (a nivel genérico) vinculados a publicaciones específicas. Esta es la primera aproximación de un repositorio morfométrico de este tipo, que al reunir esta información en una sola base de datos abierta, posibilita la realización de investigaciones paleobiológicas globales, proporcionando un importante complemento a la PBDB.Fil: Serra, Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Balseiro, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Monnet, Claude. University Of Lille.; FranciaFil: Randolfe, Enrique Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Bignon, Arnaud Marcel Jacques. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Rustán, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Bault, Valentin. University Of Lille.; Francia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Muñoz, Diego Fernando. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Geología de Costas y del Cuaternario. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto de Geología de Costas y del Cuaternario; ArgentinaFil: Vaccari, Norberto Emilio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Martinetto, Malena. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; ArgentinaFil: Cronier, Catherine. University Of Lille.; FranciaFil: Waisfeld, Beatriz Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentin