Equipamentos hospitalares de diagnóstico por imagem, seu estudo, projeto e implementação

Neste trabalho foi desenvolvido um estudo detalhado dos equipamentos de imagiologia médica, que recorrem ao uso de radiação-X, bem como da ressonância magnética. No seguimento deste estudo foram realizadas diversas atividades com equipamentos reais, desde instalações, reparações, manutenções, até ao seu desmantelamento. Este tipo de atividade permitiu ter uma melhor perceção do funcionamento de cada equipamento e o tipo de trabalho que é realizado por um engenheiro eletrotécnico na PHILIPS no sector healthcare. Durante estas atividades foi possível fazer um estudo da qualidade de imagem, em termos de fatores geométricos, em que foi estudada a distorção, a ampliação e a penumbra de uma imagem. Todos estes parâmetros foram alvos de estudo de forma a poder obter imagens com grande qualidade, mas sem que seja comprometida a saúde do doente, devido à elevada exposição de radiação que corpo humano pode absorver. Este estudo tem como intuito perceber como é que a variação de certos parâmetros irá alterar a qualidade da imagem. Desta forma pretende-se perceber como podem ser calibrados os equipamentos de diagnóstico por imagem, para que o técnico de diagnóstico e terapêutica apenas tenha de indicar qual a parte do corpo humano a radiografar, sendo que a máquina se coloca automaticamente nos parâmetros pré-definidos sem qualquer intervenção humana.In this work was developed a detailed study of medical imaging equipment, which resort to the use of X-radiation and magnetic resonance imaging. Following this study, were carried out various activities with real equipment from installations, repairs, maintenance, until their decommissioning. This type of activity has allowed a better understanding of the operation of each device and the type of work that is performed by an electrical engineer in PHILIPS. During these activities was possible to make a study of image quality in terms of geometric factors, it was studied the dispersion, expansion and shadows of an image. All of these parameters are study targets to obtain high quality images, but without being compromised patient's health due to the high amount of radiation absorbed by the human body. This study has the intention to understand how the variation of certain parameters will change the quality of an image. In this way it is intended to realize how diagnostic imaging equipment can be calibrated, so that the diagnostic and therapeutical technician only have to indicate which part of the human body to X-ray, and the machine automatically puts the preset parameters without any human intervention

Modelos experimentais em oncologia: O contributo da cultura de células para o conhecimento da biologia do cancro Experimental models in oncology: Contribution of cell culture on understanding the biology of cancer

A cultura de tecidos surgiu no século xx (Harrison, 1907) para estudar o comportamento das células animais em ambiente homeostático e em situações de stress. A capacidade de estudar as células a nível molecular relaciona-se com a forma como as células podem crescer e ser manipuladas em laboratório. A cultura de células in vitro permitiu estudar crescimento, diferenciação e morte celular e efectuar manipulações genéticas necessárias ao perfeito conhecimento da estrutura e funções dos genes. A cultura de células estaminais humanas veio colmatar algumas limitações inerentes aos restantes modelos de cultura. Ao que parece, as células estaminais cancerígenas mantêm-se quiescentes nos locais metastáticos até serem activadas por sinais apropriados do microambiente. Vários estudos revelaram que diferentes tipos de cancros podem surgir da transformação maligna de células estaminais. A eliminação destas células progenitoras tumorais é essencial para o desenvolvimento de novas abordagens terapêuticas mais eficazes em cancros agressivos. Por outro lado, a utilização de células dendríticas modificadas em cultura poderá contribuir para a produção de uma potencial vacina terapêutica eficaz para obter a regressão tumoral.In the beginning of the 20th century, tissue culture was started with the aim of studying the behaviour of animal cells in normal and stress conditions. The cell study at molecular level depends on their capacity of growing and how they can be manipulated in laboratory. In vitro cell culture allows us the possibility of studying biological key processes, such as growth, differentiation and cell death, and also to do genetic manipulations essential to the knowledge of structure and genes function. Human stem cells culture provides strategies to circumvent other models’ deficiencies. It seems that cancer stem cells remain quiescent until activation by appropriated micro-environmental stimulation. Several studies reveal that different cancer types could be due to stem cell malignant transformations. Removal of these cells is essential to the development of more effective cancer therapies for advanced disease. On the other hand, dendritic cells modified in culture may be used as a therapeutic vaccine in order to induce tumour withraw

Modelos experimentais em oncologia: O contributo da cultura de células para o conhecimento da biologia do cancro

Resumo: A cultura de tecidos surgiu no século xx (Harrison, 1907) para estudar o comportamento das células animais em ambiente homeostático e em situações de stress.A capacidade de estudar as células a nível molecular relaciona-se com a forma como as células podem crescer e ser manipuladas em laboratório. A cultura de células in vitro permitiu estudar crescimento, diferenciação e morte celular e efectuar manipulações genéticas necessárias ao perfeito conhecimento da estrutura e funções dos genes.A cultura de células estaminais humanas veio colmatar algumas limitações inerentes aos restantes modelos de cultura. Ao que parece, as células estaminais cancerígenas mantêm-se quiescentes nos locais metastáticos até serem activadas por sinais apropriados do microambiente.Vários estudos revelaram que diferentes tipos de cancros podem surgir da transformação maligna de células estaminais. A eliminação destas células progenitoras tumorais é essencial para o desenvolvimento de novas abordagens terapêuticas mais eficazes em cancros agressivos. Por outro lado, a utilização de células dendríticas modificadas em cultura poderá contribuir para a produção de uma potencial vacina terapêutica eficaz para obter a regressão tumoral.Rev Port Pneumol 2009; XV (4): 669-682 Abstract: In the beginning of the 20th century, tissue culture was started with the aim of studying the behaviour of animal cells in normal and stress conditions.The cell study at molecular level depends on their capacity of growing and how they can be manipulated in laboratory. In vitro cell culture allows us the possibility of studying biological key processes, such as growth, differentiation and cell death, and also to do genetic manipulations essential to the knowledge of structure and genes function.Human stem cells culture provides strategies to circumvent other modelsâ deficiencies.It seems that cancer stem cells remain quiescent until activation by appropriated micro-environmental stimulation.Several studies reveal that different cancer types could be due to stem cell malignant transformations. Removal of these cells is essential to the development of more effective cancer therapies for advanced disease. On the other hand, dendritic cells modified in culture may be used as a therapeutic vaccine in order to induce tumour withraw.Rev Port Pneumol 2009; XV (4): 669-682 Palavras-chave: Cultura de células, oncologia, células dendríticas, terapêutica, Key-words: Cell culture, oncology, dendritic cells, therap

Multiomics approaches to study ageing and age-related diseases in research model organisms and in humans

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The genomics facility of iBiMED: bioinformatics lab

The Genomics facility of iBiMED (iBiGEN), provides genomics services, including bioinformatics and statistical analysis to iBiMED researchers, and to external users. Since our start, in 2018, the bioinformatic lab have carried out 52 studies at a genomic scale, including de novo genome sequencing with variant detection (SNPs, indels, CNVs, LOH), whole exome or gene panel sequencing, RNA sequencing analysis (total RNA, mRNA, small RNA, LncRNA), as well as DNA microarrays for cohort genotyping in populational studies and gene expression assessment. During the COVID-19 pandemics, iBiGEN joined the national effort to monitor SARS-COV2 genomic variants and have analyzed 1121 samples through genome sequencing and variant detection. As part of iBiGEN, the Bioinformatics laboratory is equipped with 16 desktops (for resident and temporary users), one server and one cluster for storage and high-level processing. It gathers a team composed of one senior bioinformatician, one bioinformatic technician, two PostDocs and five PhD students. The data-analysis workflows implemented use open-source programs automatized with housemade scripts of several coding languages (bash, Python and R). The workflows are based on state-of-the-art methods and support different data types, formats, origins, and reference organisms.Not Publishe