ATLANTIC EPIPHYTES: a data set of vascular and non-vascular epiphyte plants and lichens from the Atlantic Forest

Epiphytes are hyper-diverse and one of the frequently undervalued life forms in plant surveys and biodiversity inventories. Epiphytes of the Atlantic Forest, one of the most endangered ecosystems in the world, have high endemism and radiated recently in the Pliocene. We aimed to (1) compile an extensive Atlantic Forest data set on vascular, non-vascular plants (including hemiepiphytes), and lichen epiphyte species occurrence and abundance; (2) describe the epiphyte distribution in the Atlantic Forest, in order to indicate future sampling efforts. Our work presents the first epiphyte data set with information on abundance and occurrence of epiphyte phorophyte species. All data compiled here come from three main sources provided by the authors: published sources (comprising peer-reviewed articles, books, and theses), unpublished data, and herbarium data. We compiled a data set composed of 2,095 species, from 89,270 holo/hemiepiphyte records, in the Atlantic Forest of Brazil, Argentina, Paraguay, and Uruguay, recorded from 1824 to early 2018. Most of the records were from qualitative data (occurrence only, 88%), well distributed throughout the Atlantic Forest. For quantitative records, the most common sampling method was individual trees (71%), followed by plot sampling (19%), and transect sampling (10%). Angiosperms (81%) were the most frequently registered group, and Bromeliaceae and Orchidaceae were the families with the greatest number of records (27,272 and 21,945, respectively). Ferns and Lycophytes presented fewer records than Angiosperms, and Polypodiaceae were the most recorded family, and more concentrated in the Southern and Southeastern regions. Data on non-vascular plants and lichens were scarce, with a few disjunct records concentrated in the Northeastern region of the Atlantic Forest. For all non-vascular plant records, Lejeuneaceae, a family of liverworts, was the most recorded family. We hope that our effort to organize scattered epiphyte data help advance the knowledge of epiphyte ecology, as well as our understanding of macroecological and biogeographical patterns in the Atlantic Forest. No copyright restrictions are associated with the data set. Please cite this Ecology Data Paper if the data are used in publication and teaching events. © 2019 The Authors. Ecology © 2019 The Ecological Society of Americ

TRIPLA CO-INFECÇÃO EM UM PACIENTE COM AIDS AVANÇADA: A IMPORTÂNCIA DOS EXAMES POINT-OF-CARE (POC) PARA REDUÇÃO DA MORBI-MORTALIDADE

Introdução: Co-infecções, eventualmente com mais de 1 patógeno oportunista, não são incomuns no contexto da AIDS avançada. Exames point-of-care (PoC) prescindem de infra-estrutura laboratorial complexa, são de fácil execução, possuem bom custo-benefício e podem propiciar diagnóstico ágil e tratamento preciso, diminuindo a morbi-mortalidade associada. Descrição do caso: Masculino, 46 anos, dx HIV em 2008, com perda de seguimento desde 2016. Retorna ao hospital em 21/04/2023, com perda ponderal, febre diária diurna, tosse improdutiva, dispneia progressiva, há 30 dias. Não apresentava linfonodomegalias. LTCD4: 46 cél/mm3 (9%) e carga viral do HIV: 350.788 cp/mL (25/04/2023). Tc de tórax (21/04/23): Opacidades em vidro fosco, difusamente distribuídas pelos pulmões com predomínio nas regiões centrais. Não fornecia escarro espontâneo, tendo sido solicitado escarro induzido com pesquisa de micobactérias, fungos/PCR para pneumocistose. Foi solicitado CrAg no soro. O resultado do CrAg saiu em 1 hora, reagente. Foi realizada TC de crânio (normal), com punção lombar imediata (2 cél, 100% mono, Crag reagente, Tinta da China positivo). Teste molecular (GeneXpert) para M. tuberculosis detectado, sem resistência à RIF e baciloscopia positiva (2 cruzes), Ag urinário galactomanana negativo. Gasometria com hipoxemia. O paciente foi internado em enfermaria para o tratamento das 3 infecções oportunistas, a saber, RHZE (TB), smx-tmp e prednisona (PCP), anfotericina B liposomal com flucitosina (Cripto), com boa tolerância. Resultado de PCR para P. jirovecii no escarro positivo e crescimento de C. neoformans na hemocultura da admissão. Recebeu alta após 17 dias para completar o tratamento ambulatorialmente, com reinício de TARV em 02/06/23 com TDF+3TC, 1 vez ao dia e DTG 50 mg 12/12 h. Em 22/06/2023, paciente assintomático, com CD4: 371 (19%) e carga viral 296 cp/mL. Genotipagem do HIV sem mutações. Comentário: O paciente inicialmente recebeu diagnóstico clínico-radiológico de PCP, e a despeito de imagem não sugestiva de TB e ausência de sintomas neurológicos exuberantes, apresentava TB pulmonar e neurocriptococose, tendo sido possíveis tais diagnósticos rapidamente devido aos testes PoC, com impacto no desfecho. No contexto da neurocriptococose, indica-se a instituição do TARV juntamente com o tratamento de manutenção pelo risco de Síndrome Inflamatória de reconstituição imunológica (IRIS). Reforçamos ainda a importância da genotipagem do HIV em toda PVHA com HIV-TB

Cellulitis in a liver transplant patient as an initial manifestation of disseminated cryptococcal disease

Submitted by Janaína Nascimento ([email protected]) on 2019-02-14T13:07:44Z No. of bitstreams: 1 ve_Sousa_Marcos_etal_INI_2016.pdf: 738427 bytes, checksum: 8414d304d0252a1ba3065846b9ad4123 (MD5)Approved for entry into archive by Janaína Nascimento ([email protected]) on 2019-02-19T13:21:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ve_Sousa_Marcos_etal_INI_2016.pdf: 738427 bytes, checksum: 8414d304d0252a1ba3065846b9ad4123 (MD5)Made available in DSpace on 2019-02-19T13:21:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ve_Sousa_Marcos_etal_INI_2016.pdf: 738427 bytes, checksum: 8414d304d0252a1ba3065846b9ad4123 (MD5) Previous issue date: 2016Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Estácio de Sá. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Santa Casa da Misericórdia do Rio de Janeiro. Instituto de Dermatologia Professor Rubem David Azulay. Rio de Janeiro, RJ, Brasl.Hospital Federal dos Servidores do Estado do Rio de Janeiro. Departamento de Doenças Infecciosas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal Fluminense. Hospital Universitário Antônio Pedro. Departamento de Medicina Interna e Gastrohepatologia. Niterói, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Câncer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Maranhão. São Luís, MA, Brasil.Hospital Federal dos Servidores do Estado do Rio de Janeiro. Departamento de Doenças Infecciosas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.A 50-year-old male underwent liver transplantation due to cryptogenic cirrhosis and was admitted with severe pain in the left leg as well as phlogosis. Amoxicillin/clavulanic acid was prescribed, assuming bullous erysipelas. Among the tests performed, the latex agglutination test for the Cryptococcus sp. antigen was positive, and in both the blood culture and blister culture Cryptococcus sp. was isolated. Daily fluconazole was started. Even though liposomal amphotericin B has been started on the fifth day of hospitalization, the patient progressed to death

Sociodemographic and clinical factors for microcephaly secondary to teratogenic infections in Brazil: an ecological study

Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências da Saúde. Unidade de Pesquisa Clínica e Experimental do Sistema Urogenital. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências da Saúde. Unidade de Pesquisa Clínica e Experimental do Sistema Urogenital. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências da Saúde. Unidade de Pesquisa Clínica e Experimental do Sistema Urogenital. Belém, PA, Brazil.Universidade do Estado do Pará. Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais. Belém, PA, Brazil.Faculdade de Medicina. São José do Rio Preto, SP, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências da Saúde. Unidade de Pesquisa Clínica e Experimental do Sistema Urogenital. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências da Saúde. Unidade de Pesquisa Clínica e Experimental do Sistema Urogenital. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Faculdade de Medicina Ceres. São José do Rio Preto, SP, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências da Saúde. Unidade de Pesquisa Clínica e Experimental do Sistema Urogenital. Belém, PA, Brazil.Microcephaly is a neurological condition characterized by anomalies in the growth of the cranial circumference. This study aims to examine the association between sociodemographic and clinical variables and the occurrence of secondary microcephaly in newborns in Brazil. It also aims to investigate the association between this congenital anomaly and teratogenic infections. This research adopts an observational approach with an ecological, descriptive, and analytical design. The sample includes infants aged ≤28 days and registered in the country’s Live Births Information System from January 2015 to December 2021. Newborns were categorized into G1, consisting of newborns with one of the three infections (Zika, toxoplasmosis, or syphilis), and G2, consisting of newborns with two of the three infections. A total of 1513 samples were analyzed and divided into two groups: one infection (syphilis n = 423; toxoplasmosis n = 295; or Zika n = 739) and two infections (n = 56). The northeastern region of Brazil has the highest prevalence of microcephaly. Regarding the population profile, the Zika virus infection is more common among white mothers, while the syphilis infection is more common among black mothers. Among newborns with microcephaly, boys have a lower prevalence of toxoplasmosis infection, while girls have a lower prevalence of Zika virus infection. This study provides pertinent information on each infection and contributes to the epidemiologic understanding of the association between teratogenic infections and microcephaly

Sociodemographic and Clinical Factors for Microcephaly Secondary to Teratogenic Infections in Brazil: An Ecological Study

Microcephaly is a neurological condition characterized by anomalies in the growth of the cranial circumference. This study aims to examine the association between sociodemographic and clinical variables and the occurrence of secondary microcephaly in newborns in Brazil. It also aims to investigate the association between this congenital anomaly and teratogenic infections. This research adopts an observational approach with an ecological, descriptive, and analytical design. The sample includes infants aged ≤28 days and registered in the country’s Live Births Information System from January 2015 to December 2021. Newborns were categorized into G1, consisting of newborns with one of the three infections (Zika, toxoplasmosis, or syphilis), and G2, consisting of newborns with two of the three infections. A total of 1513 samples were analyzed and divided into two groups: one infection (syphilis n = 423; toxoplasmosis n = 295; or Zika n = 739) and two infections (n = 56). The northeastern region of Brazil has the highest prevalence of microcephaly. Regarding the population profile, the Zika virus infection is more common among white mothers, while the syphilis infection is more common among black mothers. Among newborns with microcephaly, boys have a lower prevalence of toxoplasmosis infection, while girls have a lower prevalence of Zika virus infection. This study provides pertinent information on each infection and contributes to the epidemiologic understanding of the association between teratogenic infections and microcephaly

ALTA PREVALÊNCIA DE SÍFILIS RECENTE EM PVHA RECÉM DIAGNOSTICADAS VIRGENS DE TRATAMENTO ANTIRRETROVIRAL EM UM HOSPITAL UNIVERSITÁRIO FEDERAL DO RIO DE JANEIRO NO PERÍODO DE 2019 A 2021

Introdução/Objetivo: Determinamos a prevalência de sífilis e descrevemos os aspectos clínicos e sociodemográficos de uma população de pessoas que vivem com HIV/AIDS (PVHA), virgens de tratamento antirretroviral (TARV), iniciando o tratamento de 1ª linha adotado no Brasil. Métodos: Estudo transversal, descritivo, com PVHA incluídas de forma consecutiva, assistidos no Hospital Universitário Graffrée e Guinle (HUGG) - Rio de Janeiro (RJ), de 2019 a 2021. O diagnóstico de sífilis foi realizado com base na história médica, exame físico e laboratorial (TR - treponêmico e VDRL - não treponêmico). Todos os pacientes incluídos assinaram TCLE. Resultados: Foram incluídos 149 PVHA no período. A prevalência global de sífilis foi de 26,2%, com 29,6% entre os homens e 8,3% entre as mulheres. Dentre os pacientes diagnosticados com sífilis, 89,7% obtiveram diagnóstico no HUGG, de modo que 42,8% já haviam sido diagnosticados com sífilis antes de iniciar TARV e 8,5% foram diagnosticados com sífilis após o diagnóstico de HIV. A concomitância dos diagnósticos de sífilis e HIV foi de 48,5% e, dentre esses, três se re-infectaram. Quatro pacientes foram diagnosticados em outros centros especializados. As formas clínicas ao diagnóstico foram primária (22,2%), secundária (33,3%), latente recente (13,8%), latente tardia (25%) e latente sem certeza de duração (8,3%), considerando dois pacientes diagnosticados com as formas secundária e latente tardia em momentos distintos e um paciente com as formas primária e secundária, também em momentos distintos. Em 7,7% dos pacientes não foi possível classificar a forma clínica. A média de idade dos coinfectados foi de 36,8 anos (24-59), 94,8% do sexo masculino e 87,1% solteiros. Quanto à escolaridade, 56,4% possuíam ensino médio, 35,9%, ensino superior e 2,56% apenas ensino fundamental. A maioria (89,7%) era composta por homens que fazem sexo com homens - HSH. A média do CD4 ao diagnóstico foi 402 cél/mm3, sendo 48,7% com CD4 < 350. Com relação ao tratamento, 79,4% foram tratados com penicilina benzina e 5,1% com doxiciclina. Sem informações para 15,4% sobre o tratamento. Conclusão: O estudo corrobora a sífilis como um importante evento sentinela para o diagnóstico do HIV e a importância da PrEP neste cenário. A conscientização sobre a coinfecção precisa aumentar e os serviços de saúde devem fornecer uma abordagem integrada para o diagnóstico precoce, tratamento adequado, estratégias de prevenção e acompanhamento dessas infecções