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    Características físicas, químicas e anatômicas da madeira de Pinus merkusii.

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    bitstream/CNPF-2009-09/30407/1/com_tec65.pd

    Teste sorológico de imunofluorescência indireta para o diagnóstico da neosporose em bovinos.

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    Diagnóstico da neosporose. Métodos de diagnóstico sorológico. Reação de imunofluorescência indireta para Neospora caninum.bitstream/item/139526/1/COT-86.pdfCNPGC

    Influência dos atributos do solo sobre a produtividade de Pinus taeda.

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    O presente trabalho analisou os efeitos dos atributos do solo sobre a produtividade de Pinus taeda, em áreas da Klabin, em Telêmaco Borba, PR. Foram analisados oito sítios com árvores de 12 anos de idade, os quais foram selecionados pelo tipo de solo, textura e vegetação primária. Para a caracterização dos sítios foram realizadas coletas de amostras em três profundidades, sendo coletadas amostras indeformadas e amostras compostas, analisando-se as seguintes variáveis no solo: densidade global, porosidade total, macroporosidade, disponibilidade de água, fertilidade e granulometria. Selecionaram-se cinco árvores médias por sítio, nas quais foram medidas altura total, altura comercial e DAP. Os resultados foram: solos de textura argilosa, independentemente da classe a que pertencem, os quais propiciaram maiores produtividades do Pinus taeda. Percebeu-se, de maneira geral, que essa produtividade é afetada pelas alterações geradas nos atributos físicos e químicos do solo, o que contraria vários estudos, que confirmaram que os atributos químicos do solo só apresentavam efeitos sobre a produtividade quando considerados em conjunto

    Monitoramento na Reserva Florestal da Embrapa/Epagri (RFEE) em Caçador, SC.

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    bitstream/CNPF-2009-09/42645/1/Doc158.pdfTambém disponível em CD-ROM

    In silico analyses of maleidride biosynthetic gene clusters

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    Maleidrides are a family of structurally related fungal natural products, many of which possess diverse, potent bioactivities. Previous identification of several maleidride biosynthetic gene clusters, and subsequent experimental work, has determined the ‘core’ set of genes required to construct the characteristic medium-sized alicyclic ring with maleic anhydride moieties. Through genome mining, this work has used these core genes to discover ten entirely novel putative maleidride biosynthetic gene clusters, amongst both publicly available genomes, and encoded within the genome of the previously un-sequenced epiheveadride producer Wicklowia aquatica CBS 125634. We have undertaken phylogenetic analyses and comparative bioinformatics on all known and putative maleidride biosynthetic gene clusters to gain further insights regarding these unique biosynthetic pathways. SUPPLEMENTARY INFORMATION: The online version contains supplementary material available at 10.1186/s40694-022-00132-z

    Uncertainty-Aware Organ Classification for Surgical Data Science Applications in Laparoscopy

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    Objective: Surgical data science is evolving into a research field that aims to observe everything occurring within and around the treatment process to provide situation-aware data-driven assistance. In the context of endoscopic video analysis, the accurate classification of organs in the field of view of the camera proffers a technical challenge. Herein, we propose a new approach to anatomical structure classification and image tagging that features an intrinsic measure of confidence to estimate its own performance with high reliability and which can be applied to both RGB and multispectral imaging (MI) data. Methods: Organ recognition is performed using a superpixel classification strategy based on textural and reflectance information. Classification confidence is estimated by analyzing the dispersion of class probabilities. Assessment of the proposed technology is performed through a comprehensive in vivo study with seven pigs. Results: When applied to image tagging, mean accuracy in our experiments increased from 65% (RGB) and 80% (MI) to 90% (RGB) and 96% (MI) with the confidence measure. Conclusion: Results showed that the confidence measure had a significant influence on the classification accuracy, and MI data are better suited for anatomical structure labeling than RGB data. Significance: This work significantly enhances the state of art in automatic labeling of endoscopic videos by introducing the use of the confidence metric, and by being the first study to use MI data for in vivo laparoscopic tissue classification. The data of our experiments will be released as the first in vivo MI dataset upon publication of this paper.Comment: 7 pages, 6 images, 2 table

    Identificação e controle com antibióticos de bactérias endofíticas contaminantes em explantes de batata micropropagados.

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    Este trabalho teve por objetivos isolar, caracterizar e identificar bactérias endofíticas contaminantes encontradas em tecidos de batata durante a micropropagação e selecionar antibióticos para o controle in vitro desses microrganismos por meio da determinação da concentração bactericida mínima inibitória. Brotações de batata apresentando contaminação bacteriana durante a etapa de multiplicação in vitro, foram superficialmente esterilizadas e os internódios transferidos para placas de Petri com ágar nutriente, onde permaneceram incubadas a 28°C por até cinco dias. Após purificação, as bactérias foram caracterizadas e identificadas por testes taxonômicos. Um total de oito estirpes bacterianas foram isoladas e identificadas como pertencentes às famílias Acetobacteriaceae (1) e Enterobacteriaceae (2) e aos gêneros Corynebacterium (3), Pseudomonas (1) e Xanthomonas (1). Os melhores resultados para a inibição do crescimento bacteriano foram obtidos com os antibióticos ampicilina, cloranfenicol, estreptomicina e tetraciclina em concentrações que variaram de 32 a 256 mg L-1
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