Essais cristallographiques de deux protéines impliquées dans la transduction du signal par les intégrines (ICAP- 1a et CIB)

L'épimérase à diaminopimélate est une cible de choix pour le développement d'antibiotiques, puisque l'inhibition de cet enzyme bloquerait la synthèse de lysine chez de nombreuses bactéries, les rendant vulnérables face au système immunitaire de l'hôte. Cet enzyme catalyse la réaction réversible du meso-DAP en LL-DAP, mais non en DD-DAP, suggérant un degré de stéréospécificité supérieur à celui des enzymes de type racémase. Le site actif, composé de deux cystéines, agirait tel un couple acide-base et ôterait un proton d'un côté du carbone asymétrique pour en placer un de l'autre côté. Nous avons déterminé la structure de cet enzyme à la résolution de 2.4 Å par cristallographie aux rayons x. L'analyse de la structure indique une forme réduite qui semble correspondre à une conformation active de l'enzyme. Son activité a été mesurée et nous avons également déterminé un inhibiteur de cet enzyme, la lanthionine ; cette découverte nous laisse entrevoir de nombreuses autres expériences, telles que la résolution de la structure d'un complexe qui mimerait l'interaction avec le substrat. Aussi, la structure de la lanthionine étant catégoriquement différente de celles des inhibiteurs précédemment synthétisés, nous proposons ainsi une approche nouvelle pour le développement d'antibiotiques alternatifs.GRENOBLE1-BU Sciences (384212103) / SudocSudocFranceF

Structural differences between the ready and unready oxidized states of [NiFe] hydrogenases

International audience[NiFe] hydrogenases catalyze the reversible heterolytic cleavage of molecular hydrogen. Several oxidized, inactive states of these enzymes are known that are distinguishable by their very different activation properties. So far, the structural basis for this difference has not been understood because of lack of relevant crystallographic data. Here, we present the crystal structure of the ready Ni-B state of Desulfovibrio fructosovorans [NiFe] hydrogenase and show it to have a putative μ-hydroxo Ni–Fe bridging ligand at the active site. On the other hand, a new, improved refinement procedure of the X-ray diffraction data obtained for putative unready Ni-A/Ni-SU states resulted in a more elongated electron density for the bridging ligand, suggesting that it is a diatomic species. The slow activation of the Ni-A state, compared with the rapid activation of the Ni-B state, is therefore proposed to result from the different chemical nature of the ligands in the two oxidized species. Our results along with very recent electrochemical studies suggest that the diatomic ligand could be hydro–peroxide