Production of polycolonal antibody against domain 2-4 of protective antigen of Bacillus anthracis in laboratory animals

زمینه و هدف: آنتراکس که مسبب آن باکتری باسیلوس آنتراسیس می‌باشد یک بیماری عفونی حاد است و اغلب در گیاه‌خواران و انسان اتفاق می‌افتد. فرم رویشی باسیلوس آنتراسیس یک اگزوتوکسین سه جزیی شامل آنتی ژن حفاظت کننده (Protective Antigen=PA)، فاکتور کشنده (Lethal Factor=LF) و فاکتور ادم (Edema Factor=EF) می‌باشد. آنتی ژن حفاظت کننده به عنوان یک ایمونوژن اولیه برای توسعه ایمنی حمایتی بر علیه آنتراکس بررسی شده است. این مطالعه با هدف تولید آنتی بادی علیه ناحیه 4-2 آنتی ژن حفاظت کننده این باکتری در حیوانات آزمایشگاهی طراحی و اجرا شده است. روش بررسی: در این مطالعه تجربی ناحیه 4-2 ژن PA از پلاسمید pXOI با جایگاه های آنزیمی BamHI و HindIII به روش PCR تکثیر و در وکتورها کلون و ساب کلون شد. وکتور (pET28a(+ در باکتری اشرشیاکلی سویه BL21(DE3) ترانسفورم گردید. بعد از القاء با IPTG، بیان پروتئین ژن PA مشاهده شد. پروتئین تخلیص شده در 4 نوبت به موش و خرگوش تزریق شد؛ سپس آنتی بادی تولید شده از سرم موش و خرگوش جداسازی و توسط آزمون الایزا تایید گردید. یافته ها: ناحیه 4-2 ژن PAکلون شده در وکتور بیانی pET28a(+) به وسیله ی توالی یابی، PCR، آنالیز آنزیمی، الکتروفورز در ژل پلی اکریل آمید و لکه گذاری وسترن مورد تأیید قرار گرفت. افزایش تیتر آنتی بادی در خون موش و خرگوش توسط آزمون الایزا تایید گردید. نتیجه گیری: با توجه به ایمونوژن بودن پروتئین PA، می‌توان از آن در طراحی واکسن و همچنین به عنوان ادجوانت قوی سیستم مخاطی استفاده نمود

Resveratrol is a promising agent for colorectal cancer prevention and treatment: Focus on molecular mechanisms

Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer and one of the main causes of cancer death entire the world. Environmental, dietary, and lifestyle factors including red meat consumption, cigarette smoking, alcohol intake and family history are the most important risk factors of CRC. Multiple pathways including inflammation, oxidative stress, and apoptosis are involved in its incidence and progression. Resveratrol, a polyphenolic compound, has different pharmacologic functions including anti-inflammation, cancer prevention, lipid-lowering effect, and hypoglycemic effect. Many studies have proved that resveratrol might also represent a chemo preventive effect on CRC. Thus, the aim of the current review is to depict the role of resveratrol in treatment of CRC in a molecular manner. © 2019 The Author(s)

Design, construction, sequence analysis and bioinformatics study of RTB-ipaD gene cassette: A new way in generation of Shigellosis vaccine

زمینه و هدف: شیگلا شایع ترین عامل اسهال می‌باشد. آنتی‌ژن پلاسمیدی IpaD برای تهاجم باکتری به درون سلول میزبان ضروری می‌باشد. یکی از چالش‌ها در باره واکسن مخاطی علیه شیگلا بر پایه پروتئین IpaD قدرت پایین آن می‌باشد. به نظر می‌رسد که با متصل کردن IpaD به یک ناقل و ادجوانت مناسب همچون زیر واحد B سم ریسین، می‌توان پروتئین IpaD را بسیار ایمنوژنیک نمود. این مطالعه به منظور تولید وکتور بیانی نوترکیب دارای کاست ژنی RTB-ipaD، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی آن انجام گرفته است. روش بررسی: در این مطالعه ژن های RTB و (163-483) ipaD در وکتور pGEM-T همسانه‌سازی شدند. ژن ipaD به روش برش آنزیمی با ژن RTB به همراه لینکر کد کننده GPGP در وکتور pGEM متصل شد. سپس قطعه کایمریک RTB-ipaD در وکتور بیانی pET28a(+) زیر همسانه‌سازی گردید. در پایان آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنی انجام گرفت. یافته‌ها: صحت ساخت کاست ژنی RTB-ipaD در وکتور بیانی pET28a(+) با واکنش PCR و هضم آنزیمی مورد تایید قرار گرفت. نتایج حاصل از تعیین توالی کاست ژنی مطابق با توالی ذخیره شده در بانک ژنی بود. مطالعات بیوانفورماتیکی بر مبنای شاخص سازگاری کدون نشان داد این کاست قابلیت بیان در گیاه ترانس ژن و برخی سویه های باکتری اشرشیاکلی را دارد. نتیجه‌گیری: اتصال RTB به عنوان ناقل و ادجوانت به آنتی‌ژن IpaD رویکردی نوین و مطلوب در جهت تولید واکسن مخاطی شیگلوزیس می‌باش

Holographic dark energy with time varying c2c^2 parameter

We consider the holographic dark energy model in which the model parameter $c^2$ evolves slowly with time. First we calculate the evolution of EoS parameter as well as the deceleration parameter in this generalized version of holographic dark energy (GHDE). Depending on the parameter $c^2$, the phantom regime can be achieved earlier or later compare with original version of holographic dark energy. The evolution of energy density of GHDE model is investigated in terms of parameter $c^2$. We also show that the time-dependency of $c^2$ can effect on the transition epoch from decelerated phase to accelerated expansion. Finally, we perform the statefinder diagnostic for GHDE model and show that the evolutionary trajectories of the model in $s-r$ plane are strongly depend on the parameter $c^2$.Comment: 16 pages, 4 figures, accepted by Astrophys Space Sc

Comparison of HYDRUS-3D soil moisture simulations of subsurface drip irrigation with experimental observations in the South of France

International audienceThe purpose of the present research, was evaluating the performance of HYDRUS-3D model for simulating soil moisture under field conditions for corn and durum wheat in a Mediterranean climate. Furthermore, the PILOTE model was also used for accounting root water extraction. Soil moisture at different depths was measured by a neutron probe before irrigation. Observed soil moisture values were compared with simulated data using statistical indices i.e., the root mean square error (RMSE) and the normalized root mean square error (NRMSE). The ranges of water content NRMSE were between 6.3 and 7.5%. The performance of the model based on calculated NRMSE values have been placed in the excellent category for simulation of the soil water content. Ranges of RMSE were obtained between 0.0174 and 0.0190 cm3 cm-3, though the values are very low. The results of these two statistical indices indicated the high ability of the model in simulating soil water content