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    Les systèmes d'échantillonnages passifs pour la mesure des micropolluants dans l'eau et leur application dans les eaux usées (rapport bibliographique), délivrable D1 partie B, ANR PRECODD AMPERES

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    Les systèmes d'échantillonnages passifs pour la mesure des micropolluants dans l'eau et leur application dans les eaux usées (rapport bibliographique), délivrable D1 partie B, ANR PRECODD AMPERE

    Les métaux dans le bassin de la Seine, comprendre leur origine pour préserver les milieux

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    Si les habitants du bassin de la Seine utilisent des métaux depuis des siècles, leur usage intensif (zinc, plomb, cuivre, cadmium, mercure, arsenic, nickel notamment) remonte aux XVIIIe et XIXe siècles, lors de la révolution industrielle et du développement de l'agglomération parisienne. Les premières analyses quantitatives de métaux dans l'eau n'ont cependant été réalisées que dans les années 1970, faute de méthode suffisamment sensible. Depuis 1983, la surveillance systématique du bassin et de l'estuaire a été mise en place et cherche à répondre aux exigences de la loi française et européenne. Ce fascicule présente le travail de recherche sur les métaux conduit par le Programme multidisciplinaire de recherche sur la Seine et son bassin, dit PIREN-Seine, initié par le CNRS et la Délégation de Bassin en 1989. Il reprend également les données scientifiques recueillies par une dizaine d'organismes ou d'administrations spécialisés. Grâce à l'utilisation de sédiments déposés sur les berges de la Seine, l'évolution de la contamination métallique du bassin a pu être estimée depuis 1935. On trouvera dans ce fascicule une description méthodique de l'évolution des usages des métaux suivant les époques ainsi qu'une présentation du dispositif de surveillance du bassin et des méthodes employées suivant la nature des échantillons et la forme des métaux recherchés. Un bilan des flux annuels de métaux sur le bassin de la Seine a permis d'identifier, élément par élément, les sources principales de rejets, tant sur les sols que vers les cours d'eau. L'estimation de l'évolution de ces flux métalliques depuis cinquante ans montre que le pic de pollution a probablement été atteint entre 1960 et 1970. La société n'était alors consciente ni de son importance, ni de sa nocivité, et ne cherchait guère à l'enrayer. Depuis, le contexte règlementaire est devenu très contraignant. La Seine, fleuve au débit lent, traversant des sols faiblement érodés et accueillant la forte population de la région parisienne, est structurellement vulnérable à la pollution métallique qu'elle élimine difficilement. Les auteurs suggèrent de nouvelles mesures de surveillance, d'information ou de protection qu'il conviendrait d'adopter. En effet, la directive cadre européenne sur l'eau nous fait obligation de restaurer le " bon état des milieux aquatiques ". Reste à évaluer ce qu'il est possible de faire, techniquement et en matière de coût économique et social

    Combined eukaryotic and bacterial community fingerprinting of natural freshwater biofilms using automated ribosomal intergenic spacer analysis

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    Biofilms are complex communities playing an important role in aquatic ecosystems. Automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA) has been used successfully to explore biofilm bacterial diversity. However, a gap remains to be filled as regards its application to biofilm eukaryotic populations. The aim of this study is to use ARISA to detect eukaryotic population shifts in biofilm. We designed a new set of primers to focus specifically on the ITS1-5.8S-ITS2 region of diatoms and tested it on natural biofilms. Additionally, we tested universal primers, used previously to perform ARISA on fungal communities. Cloning and sequencing showed that the universal primer set amplified various eukaryotes, whereas the new set was diatom specific. The new set amplified a wider variety of diatoms. Therefore, the universal set is appropriate to study the general eukaryotic population shifts in biofilms, whereas the new set is more appropriate to study diatoms specifically. We used both primer sets, along with a bacterial set, to study the population shifts in natural river biofilms. Principal component analysis of the ARISA fingerprints revealed seasonal shifts that did not coincide for bacterial and eukaryotic communities. Therefore, the use of both eukaryotic and bacterial primers provides a useful insight to assess microbial succession in biofilms
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