Transcriptional responses of Burkholderia cenocepacia to polymyxin B in isogenic strains with diverse polymyxin B resistance phenotypes

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p><it>Burkholderia cenocepacia </it>is a Gram-negative opportunistic pathogen displaying high resistance to antimicrobial peptides and polymyxins. We identified mechanisms of resistance by analyzing transcriptional changes to polymyxin B treatment in three isogenic <it>B. cenocepacia </it>strains with diverse polymyxin B resistance phenotypes: the polymyxin B-resistant parental strain K56-2, a polymyxin B-sensitive K56-2 mutant strain with heptoseless lipopolysaccharide (LPS) (RSF34), and a derivative of RSF34 (RSF34 4000B) isolated through multiple rounds of selection in polymyxin B that despite having a heptoseless LPS is highly polymyxin B-resistant.</p> <p>Results</p> <p>A heptoseless LPS mutant of <it>B. cenocepacia </it>was passaged through multiple rounds of selection to regain high levels of polymyxin B-resistance. This process resulted in various phenotypic changes in the isolate that could contribute to polymyxin B resistance and are consistent with LPS-independent changes in the outer membrane. The transcriptional response of three <it>B. cenocepacia </it>strains to subinhibitory concentrations of polymyxin B was analyzed using microarray analysis and validated by quantitative Real Time-PCR. There were numerous baseline changes in expression between the three strains in the absence of polymyxin B. In both K56-2 and RSF34, similar transcriptional changes upon treatment with polymyxin B were found and included upregulation of various genes that may be involved in polymyxin B resistance and downregulation of genes required for the synthesis and operation of flagella. This last result was validated phenotypically as both swimming and swarming motility were impaired in the presence of polymyxin B. RSF34 4000B had altered the expression in a larger number of genes upon treatment with polymyxin B than either K56-2 or RSF34, but the relative fold-changes in expression were lower.</p> <p>Conclusions</p> <p>It is possible to generate polymyxin B-resistant isolates from polymyxin B-sensitive mutant strains of <it>B. cenocepacia</it>, likely due to the multifactorial nature of polymyxin B resistance of this bacterium. Microarray analysis showed that <it>B. cenocepacia </it>mounts multiple transcriptional responses following exposure to polymyxin B. Polymyxin B-regulated genes identified in this study may be required for polymyxin B resistance, which must be tested experimentally. Exposure to polymyxin B also decreases expression of flagellar genes resulting in reduced swimming and swarming motility.</p

GND4C x LEO-BW = GND-Agentur "LEO-BW-Regional"

Vortrag beim 21. MusIS-Nutzertreffen im virtuellen Raum, 24. März 2021 INHALT: 1. Status quo DFG-Projekt "GND für Kulturdaten" (GND4C) 2. Einführung "LEO-BW" 3. Vorstellung der GND-Agentur "LEO-BW-Regional

Sammlungen vernetzen und sichtbar machen II – praktisches Arbeiten mit der Gemeinsamen Normdatei im Museum

(Veranstaltung im Rahmen der Museumsakademie Baden-Württemberg am 16. April 2024) Die Gemeinsame Normdatei (kurz: GND) ist die größte Normdatenressource im deutschsprachigen Raum, die vermehrt im gesamten Kulturbereich genutzt wird. Damit ermöglicht sie es, die eigenen Bestände über den Museumskontext hinaus mit anderen Datenbeständen zu verknüpfen. Sie enthält Normdatensätze u.a. zu Personen, Körperschaften, Sachbegriffen und Geografika und kann somit in Ergänzung zu den Museums-Thesauri genutzt werden. Wie genau man mit der GND arbeitet – sei es passiv mit einem Abgleich oder aktiv mit dem Einbringen neuer Daten – und für welche Anwendungsfälle sich das besonders lohnt, stellt Ihnen die GND-Agentur LEO-BW-Regional vor. Themenblöcke: 1. Nutzungsmöglichkeiten der Gemeinsamen Normdatei / Recherche nach GND IDs 2. Erfassung von Personen/Körperschaften über das GND-Webformular 3. OpenRefine als Werkzeug zur Anreicherung der eigenen Metadaten mit Normdate

Sammlungen vernetzen und sichtbar machen I – eine Einführung zu Normdaten im Museum

(Veranstaltung im Rahmen der Museumsakademie Baden-Württemberg am 27. Februar 2024) Bei der digitalen Erfassung von Museumsobjekten spielen Normdaten eine wichtige Rolle; sie ermöglichen das Vernetzen und leichtere (Wieder-)Auffinden von Daten. Aber was genau sind Normdaten? Und welche Normdaten brauche ich im Museum? Die GND-Agentur "LEO-BW-Regional" stellt ihre Arbeit vor und informiert über die Einsatzmöglichkeiten von Normdaten, die nicht nur großen, sondern auch kleineren Museen zugutekommen. Zusätzlich zu dieser Infoveranstaltung bietet die Agentur am 16. April 2024 einen Online-Workshop an, der in das praktische Arbeiten mit der Gemeinsamen Normdatei im Museum einführt. Beide Veranstaltungen können aber auch unabhängig voneinander besucht werden

Umwelt-Survey. Bd. 3b: Wohn-Innenraum Trinkwasser

SIGLEAvailable from TIB Hannover: RO2237(1991,3) / FIZ - Fachinformationszzentrum Karlsruhe / TIB - Technische InformationsbibliothekDEGerman

Poly(2-isopropenyl-2-oxazoline) – a structural analogue to poly(vinyl azlactone) with Orthogonal Reactivity

In this study, we report a straightforward method to orthogonally functionalise (co)polymers of two independently addressable reactive monomers – the structural analogues 2-isopropenyl-2-oxazoline (iPOx) and 2-vinyl-4,4-dimethyl-5-oxazolone (VDM). Homopolymers were used to identify suitable reaction conditions for their selective post-polymerization modification (PPM) with a range of functional compounds, i.e. thiols, amines, and carboxylic acids, without the addition of any catalysts. Under these optimised conditions, well-defined statistical and block copolymers of iPOx and VDM were orthogonally modified, as confirmed by proton nuclear magnetic resonance spectroscopy, Fourier-transform infrared (FT-IR) and size exclusion chromatography (SEC) measurements. Critically important was the order of functionalisation, with the PPM of the VDM moiety required first to avoid side-reactions. Extending this approach to selective PPM of block copolymers facilitated the preparation of amphiphilic block copolymers consisting of a hydrophilic poly(ethylene glycol) brush block and a hydrophobic terephthalic acid modified block. These modified block polymers were shown to form defined nanostructures in physiological phosphate buffered saline (PBS) solution. Due to its reactivity towards various functional groups available in the majority of natural and synthetic compounds, this copolymer platform provides access to functional polymer libraries with tailored properties

Umwelt-Survey. Bd. 3c Wohn-Innenraum: Raumluft

SIGLEAvailable from TIB Hannover: RO 2237(4) / FIZ - Fachinformationszzentrum Karlsruhe / TIB - Technische InformationsbibliothekDEGerman