Widespread, long-term admixture between grey wolves and domestic dogs across Eurasia and its implications for the conservation status of hybrids

Hybridisation between a domesticated species and its wild ancestor is an important conservation problem, especially if it results in the introgression of domestic gene variants into wild species. Nevertheless, the legal status of hybrids remains unregulated, partially because of the limited understanding of the hybridisation process and its consequences. The occurrence of hybridisation between grey wolves and domestic dogs is well-documented from different parts of the wolf geographic range, but little is known about the frequency of hybridisation events, their causes and the genetic impact on wolf populations. We analysed 61K SNPs spanning the canid genome in wolves from across Eurasia and North America and compared that data to similar data from dogs to identify signatures of admixture. The haplotype block analysis, which included 38 autosomes and the X chromosome, indicated the presence of individuals of mixed wolf-dog ancestry in most Eurasian wolf populations, but less admixture was present in North American populations. We found evidence for male-biased introgression of dog alleles into wolf populations, but also identified a first-generation hybrid resulting from mating between a female dog and a male wolf. We found small blocks of dog ancestry in the genomes of 62% Eurasian wolves studied and melanistic individuals with no signs of recent admixed ancestry, but with a dog-derived allele at a locus linked to melanism. Consequently, these results suggest that hybridisation has been occurring in different parts of Eurasia on multiple timescales and is not solely a recent phenomenon. Nevertheless, wolf populations have maintained genetic differentiation from dogs, suggesting that hybridisation at a low frequency does not diminish distinctiveness of the wolf gene pool. However, increased hybridisation frequency may be detrimental for wolf populations, stressing the need for genetic monitoring to assess the frequency and distribution of individuals resulting from recent admixture

Monitoring of species' genetic diversity in Europe varies greatly and overlooks potential climate change impacts.

Genetic monitoring of populations currently attracts interest in the context of the Convention on Biological Diversity but needs long-term planning and investments. However, genetic diversity has been largely neglected in biodiversity monitoring, and when addressed, it is treated separately, detached from other conservation issues, such as habitat alteration due to climate change. We report an accounting of efforts to monitor population genetic diversity in Europe (genetic monitoring effort, GME), the evaluation of which can help guide future capacity building and collaboration towards areas most in need of expanded monitoring. Overlaying GME with areas where the ranges of selected species of conservation interest approach current and future climate niche limits helps identify whether GME coincides with anticipated climate change effects on biodiversity. Our analysis suggests that country area, financial resources and conservation policy influence GME, high values of which only partially match species' joint patterns of limits to suitable climatic conditions. Populations at trailing climatic niche margins probably hold genetic diversity that is important for adaptation to changing climate. Our results illuminate the need in Europe for expanded investment in genetic monitoring across climate gradients occupied by focal species, a need arguably greatest in southeastern European countries. This need could be met in part by expanding the European Union's Birds and Habitats Directives to fully address the conservation and monitoring of genetic diversity

Monitoring of species’ genetic diversity in Europe varies greatly and overlooks potential climate change impacts

Genetic monitoring of populations currently attracts interest in the context of the Convention on Biological Diversity but needs long-term planning and investments. However, genetic diversity has been largely neglected in biodiversity monitoring, and when addressed, it is treated separately, detached from other conservation issues, such as habitat alteration due to climate change. We report an accounting of efforts to monitor population genetic diversity in Europe (genetic monitoring effort, GME), the evaluation of which can help guide future capacity building and collaboration towards areas most in need of expanded monitoring. Overlaying GME with areas where the ranges of selected species of conservation interest approach current and future climate niche limits helps identify whether GME coincides with anticipated climate change effects on biodiversity. Our analysis suggests that country area, financial resources and conservation policy influence GME, high values of which only partially match species’ joint patterns of limits to suitable climatic conditions. Populations at trailing climatic niche margins probably hold genetic diversity that is important for adaptation to changing climate. Our results illuminate the need in Europe for expanded investment in genetic monitoring across climate gradients occupied by focal species, a need arguably greatest in southeastern European countries. This need could be met in part by expanding the European Union’s Birds and Habitats Directives to fully address the conservation and monitoring of genetic diversity

Wpływ roślin międzyplonowych i zróżnicowanej uprawy roli na plon i wartość odżywczą korzeni skorzonery (Scorzonera hispanica L.)

Intensification in plant growing is a direct reason for deteriorating soil properties, as well as conditions of plant growth and development. Aiming at improvement of soil fertility and structure, conservation tillage, limiting the processes of soil environment degradation, is introduced into garden crop production techniques. Field experiments were conducted in the years 2006–2008, on grey brown podzolic soil of impermanent structure. The experimental plant was scorzonera (Scorzonera hispanica L.) of ‘Duplex’ cultivar. Three intercrop plants were considered in the studies: common vetch (Vicia sativa L.), phacelia (Phacelia tanacetifolia B.) and oats (Avena sativa L.). There were also two ways of pre-sowing soil tillage: a) complex of pre-sowing practices, sowing of intercrop plant (2nd decade of August), pre-winter ploughing and putting green matter into soil, b) complex of pre-sowing practices, sowing of intercrop plant (2nd decade of August), spring ploughing and putting plant matter into soil, as well as two plant growing methods: on ridges and on flat soil. Significantly advantageous effects of spring putting intercrops into soil, growing of scorzonera on ridges and ploughing the soil with oats upon the total root yield were demonstrated. The examined experiment factors, however, did not significantly affect inulin, protein and dry matter contents in scorzonera roots. The most favorable tillage combination, as to inulin productivity was growing of scorzonera on ridges after spring ploughing oats with soil.Intensyfikacja upraw roślinnych jest bezpośrednim powodem pogorszenia właściwości gleb oraz warunków wzrostu i rozwoju roślin. W trosce o poprawę żyzności i struktury gleby do agrotechniki roślin ogrodniczych wprowadza się uprawę konserwującą, która ogranicza procesy degradacji środowiska glebowego. Doświadczenia polowe przeprowadzono w latach 2006–2008, na glebie płowej o nietrwałej strukturze. Rośliną doświadczalną była skorzonera (Scorzonera hispanica L.) odmiany ‘Duplex’. W badaniach uwzględniono trzy rośliny międzyplonowe: wykę siewną, facelię błękitną i owies; dwa sposoby przedsiewnej uprawy roli: a) zespół uprawek przedsiewnych, siew roślin międzyplonowych (II dekada sierpnia), orka przedzimowa i wymieszanie zielonej masy z glebą, b) zespół uprawek przedsiewnych, siew roślin międzyplonowych (II dekada sierpnia), orka wiosenna i wymieszanie masy roślinnej z glebą oraz dwie metody uprawy roślin: na redlinach i na płask. Wykazano istotnie korzystny wpływ wiosennego wymieszania międzyplonów z glebą, uprawy skorzonery na redlinach i mulczowania gleby owsem na plon korzeni ogółem. Badane czynniki doświadczenia nie miały natomiast istotnego wpływu na zawartość inuliny, białka i suchej masy w korzeniu skorzonery. Najkorzystniejszą kombinacją uprawową pod względem produktywności inuliny była uprawa skorzonery na redlinach po wiosennym wymieszaniu z glebą mulczu z owsa

Wplyw roślin międzyplonowych i zróżnicowanej uprawy roli na plon i wartość odżywczą korzeni salsefii (Tragopogon porrifolius L.)

The field experiment was carried out in 2006–2008 on lessive soil developed from medium dusty loams. Salsify (Tragopogon porrifolius L.) of ‘Mamut’ cv. was the experimental species. The experimental design included three intercrop plants: common vetch, lace phacelia, and oats; two soil tillage ways: a) set of pre-sowing tillage operations, sowing the intercrop plants (mid of August), pre-winter ploughing, mixing the green matter with soil, b) set of pre-sowing tillage operations, sowing the intercrop plants (mid of August), spring ploughing, mixing the plant matter with soil; as well as two plant cultivation manners: on ridges and on flat soil. It was found that spring ploughing made to mix the intercrop biomass with the soil as well as cultivation of plants on ridges significantly increased the total salsify root yields. Significantly positive influence of intercrop plants on salsify root yields, inulin content, inulin yield, and dry matter content was also recorded. Considering the roots yield and their nutritional value, plants cultivated on ridges after spring ploughing and mulching with lace phacelia appeared to be the most beneficial salsify cultivation combination.Doświadczenie polowe przeprowadzono w latach 2006–2008, na glebie płowej wytworzonej z gliny średniej pylastej. Rośliną doświadczalną była salsefia (Tragopogon porrifolius L.) odmiany ‘Mamut’. W schemacie doświadczenia uwzględniono trzy rośliny międzyplonowe: wykę siewną, facelię błękitną i owies; dwa sposoby uprawy roli: a) zespół uprawek przedsiewnych, siew roślin międzyplonowych (II dekada sierpnia), orka przedzimowa, wymieszanie zielonej masy z glebą, b) zespół uprawek przedsiewnych, siew roślin międzyplonowych (II dekada sierpnia), orka wiosenna, wymieszanie masy roślinnej z glebą; dwie metody uprawy roślin: na redlinach i na płask. Stwierdzono, że orka wiosenna wykonana w celu wymieszania biomasy międzyplonów z glebą oraz uprawa roślin na redlinach istotnie zwiększały plon korzeni ogółem salsefii. Wykazano również istotnie korzystny wpływ roślin międzyplonowych na plon korzeni, zawartość inuliny oraz jej produktywność z jednostki powierzchni, a także na zawartość suchej masy w korzeniu. Najkorzystniejszą kombinacją uprawową pod względem plonowania i wartości odżywczej roślin była uprawa salsefii na redlinach, po orce wiosennej i ściółkowaniu gleby facelią błękitną

Szkodliwość grzybów odglebowych dla cykorii korzeniowej (Cichorium intybus L. var. sativum Bisch.) uprawianej z zastosowaniem roślin okrywowych

Chicory is a herbaceans plant, belonging to the family of Asteracae. This plant is a rich source of polysaccharides, vitamins, acids and mineral salts. The studies concerned the harmfulness of soil-borne fungi towards root chicory – a high-inulin plant, with considerable pro-health values – cultivated with the use of such cover crops as oats, tansy phacelia and spring vetch. Among the mulching plants, oats had the most positive effect on the number and healthiness of the seedlings and roots of chicory. The most harmful towards the seedlings proved to be the following: Altenaria alternata, A. cichorii, Fusarium oxysporum, Pythium irregulare, Rhizoctonia solani and Sclerotinia sclerotiorum. The roots of older chicory plants were also infected by A. tenuissima, Botrytis cinerea, F. culmorum, F. solani, Phoma cichoracearum, Phytophthora sp., Ramularia cichorii, Sclerotium rolfsii, Thielaviopsis basicola and Verticilium dahliae.Cykoria jest rośliną zielną, należącą do rodziny Asteracae. Roślina ta jest bogatym źródłem polisacharydów, witamin, kwasów i soli mineralnych. Badania dotyczyły szkodliwości grzybów odglebowych dla cykorii korzeniowej, wysokoinulinowej rośliny o dużych walorach prozdrowotnych, uprawianej z zastosowaniem takich roślin okrywowych jak owies, facelia i wyka siewna. Spośród roślin mulczujących, owies wpłyną najkorzystniej na liczebność i zdrowotność siewek oraz korzeni cykorii. Najbardziej szkodliwymi dla siewek okazały się Alternaria alternata, A. cichorii, Fusarium oxysporum, Pythium irregulare, Rhizoctonia solani i Sclerotinia sclerotiorum. Korzenie starszych roślin cykorii porażane były ponadto przez A. tenuissima, Botrytis cinerea, F. culmorum, F. solani, Phoma cichoracearum, Phytophthora sp., Ramularia cichorii, Sclerotium rolfsii, Thielaviopsis basicola, Verticilium dahliae

Rośliny okrywowe a grzyby glebowe zagrażające uprawie salsefii (Tragopogon porrifolius var. sativus (Gaterau) Br.)

Salsify has a remarkable taste and nutritious values. It is a rich source of inulin – a glycoside which has a positive effect on human and animal organisms. The paper presents studies on the species composition of soil-borne fungi infecting the roots of Tragopogon porrifolius var. sativus cultivated with the use of oats, tansy phacelia and spring vetch as cover crops. In a field experiment the cover crops formed abundant green mass before winter and it constituted a natural mulch on the surface of the plough land. It was managed in two ways: 1) mixed with the soil as a result of spring ploughing, or 2) mixed with the soil as a result of pre-winter ploughing. The conventional cultivation of salsify, i.e. without cover crops, constituted the control. The studies established the number and health status of four-week-old salsify seedlings and roots with necrotic signs. A laboratory mycological analysis made it possible to determine the quantitative and qualitative composition of fungi infecting the underground parts of Tragopogon porrifolius var. sativus. The emergences and the proportion of infected salsify seedlings varied and depended on the species of the mulching plant. The smallest number of infected seedlings was obtained after the mulch with oats, slightly more after the application of spring vetch or tansy phacelia as cover crops, and the most in the control. Regardless of the species of the mulching plant, the following were frequently isolated from the diseased seedlings and roots of salsify: Alternaria alternata, Fusarium culmorum, Fusarium oxysporum, Penicillium spp., Rhizoctonia solani and Sclerotinia sclerotiorum. Rhizoctonia solani and Sclerotinia sclerotiorum proved to be the most harmful towards the roots of salsify. The system of cultivation, i.e. performing spring or pre-winter ploughing, had no significant effect on the total population of fungi.Salsefia posiada duże walory smakowe i odżywcze. Jest bogatym źródłem inuliny – glikozydu korzystnie oddziałującego na organizmy ludzi i zwierząt. Praca przedstawia badania dotyczące składu gatunkowego grzybów glebowych porażających korzenie Tragopogon porrifolius var. sativus uprawianej z zastosowaniem owsa, facelii i wyki siewnej, jako roślin okrywowych. W doświadczeniu polowym rośliny okrywowe wytworzyły przed zimą obfity plon zielonej masy, stanowiącej naturalny mulcz na powierzchni roli, który był zagospodarowany w dwojaki sposób: 1) wymieszany z glebą w wyniku orki wiosennej lub 2) wymieszany z glebą w wyniku orki przedzimowej. Kontrolę stanowiła tradycyjna uprawa salsefii, tj. bez roślin okrywowych. W badaniach określono liczebność i zdrowotność czterotygodniowych siewek salsefii oraz korzeni z objawami nekrozy. Laboratoryjna analiza mikologiczna pozwoliła na określenie składu ilościowego i jakościowego grzybów porażających organy podziemne Tragopogon porrifolius var. sativus. Wschody oraz udział porażonych siewek salsefii były różne i zależały od gatunku rośliny mulczującej. Najmniej porażonych siewek uzyskano po mulczowaniu gleby owsem. Nieco więcej po zastosowaniu wyki siewnej lub facelii, jako roślin okrywowych, a najwięcej w kontroli. Bez względu na gatunek rośliny mulczującej, z chorych siewek oraz korzeni salsefii często izolowano Alternaria alternata, Fusarium culmorum, Fusarium oxysporum, Penicillium spp., Rhizoctonia solani i Sclerotinia sclerotiorum. Najbardziej szkodliwymi dla badanych korzeni salsefii okazały się R. solani i S. sclerotiorum. System uprawy, tj. wykonanie orki wiosennej lub przedzimowej, nie miał istotnego wpływu na liczebność grzybów izolowanych z roślin salsefii

Rola owsa, wyki siewnej i facelii błękitnej jako roślin okrywowych w kształtowaniu się zbiorowisk mikroorganizmów w glebie spod uprawy cykorii korzeniowej (Cichorium intybus L. var. sativum Bisch.) i salsefii [Tragopogon porrifolius var. sativus (Gaterau) Br.]

The composition of microorganisms in the cultivation environment is extremely important since it affects the healthiness and hence the yielding of plants. The purpose of the present studies was to determine the effect of oats, common vetch and tansy phacelia as intercrop cover plants on the formation of microorganisms communities in the soil under the cultivation of root chicory and salsify. Before winter, cover plants formed an abundant green mass, which constituted the natural mulch on the surface of the land managed in two ways: 1) pre-winter ploughing, or 2) spring ploughing. The control was the conventional cultivation of these vegetables, i.e. without any cover plants. The microbiological analysis of the soil showed that regardless of the species of the studied vegetable, the total population of bacteria and the population of bacteria Bacillus spp. and Pseudomonas spp. were the highest when the soil was mulched with oats. A little fewer of those microorganisms occurred after using the mulch of common vetch or phacelia. On the other hand, the fewest bacteria were obtained as a result of the traditional cultivation of those vegetables. The total population of fungi in the soil mulched with oats was the lowest, whereas the most of fungi occurred in the control. The cultivation system, i.e. performing the spring or pre-winter ploughing, rather had no significant effect on the population of the studied microorganisms in the soil. Among the studied vegetables, the following were most frequently isolated: Alternaria alternata, Fusarium culmorum, Fusarium oxysporum, Pythium irregulare, Rhizoctonia solani, Sclerotinia sclerotiorum and Gliocladium spp., Penicillium spp. and Trichoderma spp. Laboratory tests showed that both the cultivation of root chicory and salsify which included cover crops promoted the development of antagonistic bacteria (Bacillus spp. and Pseudomonas spp.) and fungi (Gliocladium spp., Penicillium spp. and Trichoderma spp.) better than the traditional cultivation of those vegetables.Skład mikroorganizmów w środowisku uprawnym jest niezmiernie ważny, oddziałuje on bowiem na zdrowotność, a tym samym na plonowanie roślin. Celem prezentowanych badań było określenie wpływu owsa, wyki siewnej i facelii, jako międzyplonowych roślin okrywowych, na kształtowanie się populacji mikroorganizmów w glebie spod uprawy cykorii korzeniowej i salsefii. Rośliny okrywowe wytworzyły przed zimą obfitą zieloną masę, stanowiącą naturalny mulcz na powierzchni roli, który zagospodarowano w dwojaki sposób: 1) orką przedzimową lub 2) orką wiosenną. Kontrolę stanowiła tradycyjna uprawa tych warzyw, tj. bez roślin okrywowych. Analiza mikrobiologiczna gleby wykazała, że bez względu na gatunek badanego warzywa ogólna liczebność bakterii oraz liczebność bakterii Bacillus spp. i Pseudomonas spp. była największa wówczas, gdy glebę mulczowano owsem. Nieco mniej tych mikroorganizmów wystąpiło po zastosowaniu mulczu z wyki siewnej lub facelii. Natomiast najmniej bakterii uzyskano w wyniku tradycyjnej uprawy tych warzyw. Ogólna liczebność grzybów w glebie mulczowanej owsem była najmniejsza, natomiast najwięcej grzybów wystąpiło w kontroli. System uprawy, tj. wykonanie orki wiosennej lub przedzimowej, nie miał raczej istotnego wpływu na liczebność badanych mikroorganizmów w glebie. Spod uprawy badanych warzyw najczęściej izolowano Alternaria alternata, Fusarium culmorum, Fusarium oxysporum, Pythium irregulare, Rhizoctonia solani, Sclerotinia sclerotiorum oraz Gliocladium spp., Penicillium spp. i Trichoderma spp. Testy laboratoryjne wykazały, że zarówno uprawa cykorii korzeniowej, jak i salsefii z uwzględnieniem roślin okrywowych bardziej sprzyjała rozwojowi antagonistycznych bakterii (Bacillus spp. i Pseudomonas spp.) i grzybów (Gliocladium spp., Penicillium spp. i Trichoderma spp.) niż tradycyjna uprawa tych warzyw

Wpływ metody uprawy i dokarmiania pozakorzeniowego Cu i Mn na plon i wartość biologiczną korzeni skorzonery (Scorzonera hispanica L.)

Root crops are particularly sensitive towards growth conditions, while simplifications recommended at present in agricultural technology exert diverse effects on reactions of cultivated plants. The study aimed at evaluating the impact of varied tillage systems and plant cultivation as well as foliar cooper and manganese nutrition on root yields of scorzonera and some of their qualitative traits. The field experiments were carried out in 2005–2007 on lessive soil developed from loess formations covering the chalky marls. Scorzonera of Duplex cv. was the testing plant. The experimental pattern included the following factors: two plant cultivation methods (on flat soil and on ridges), two pre-sowing tillage systems (harrowing, rototiller), as well as foliar nutrition with copper and manganese. The highest total and marketable yields of scorzonera roots at the lowest share of non-commercial roots in total yield, was achieved due to cultivation in ridges, after presowing tillage using rototiller, and manganese foliar nutrition. The positive influence of scorzonera cultivation on ridges on dry matter content in roots was recorded. Diverse tillage systems and plant foliar nutrition had no significant effects on inulin content in scorzonera roots; however the increasing tendency of the component concentration at plants cultivated on ridges after shallow spring tillage procedures, was observed. Studied experimental factors did not exert any considerable influence on protein contents in scorzonera roots.Rośliny korzeniowe są szczególnie wrażliwe na warunki wzrostu, natomiast zalecane uproszczenia w agrotechnice wywołują zróżnicowaną reakcję uprawianych roślin. Celem badań było określenie wpływu zróżnicowanych metod uprawy roli i roślin oraz dolistnego dokarmiania roślin miedzią i manganem na plon korzeni skorzonery i niektóre ich cechy jakościowe. Doświadczenie polowe przeprowadzono w latach 2005–2007 na glebie płowej wytworzonej z utworów lessowych zalegających na marglach kredowych. Rośliną doświadczalną była skorzonera odmiany Duplex. W schemacie doświadczenia uwzględniono następujące czynniki: dwie metody uprawy roślin (uprawa na płask i na redlinach), dwa sposoby przedsiewnej uprawy roli (bronowanie, uprawa glebogryzarką) oraz dokarmianie pozakorzeniowe roślin (miedzią i manganem). Największy plon ogólny i handlowy korzeni, przy najniższym udziale korzeni niehandlowych w plonie ogólnym uzyskano w wyniku uprawy skorzonery na redlinach, po przedsiewnej uprawie roli glebogryzarką i dokarmianiu roślin manganem. Stwierdzono korzystny wpływ uprawy skorzonery na redlinach na zawartość suchej masy w korzeniach. Zróżnicowane systemy uprawy roli oraz dokarmianie dolistne roślin nie miały istotnego wpływu na zawartość inuliny w korzeniach badanych roślin, wykazano jedynie tendencję wzrostową zawartości tego składnika w roślinach uprawianych na redlinach po spłyconej wiosennej uprawie roli. Badane czynniki doświadczenia nie wywierały istotnego wpływu na zawartość białka w korzeniach

Grzyby zagrażające uprawie skorzonery (Skorzonera hispanica L.) z zastosowaniem mulczów roslinnych

Scorzonera hispanica is a rich source of inulin – a glycoside which has a positive effect on human and animal organisms. The paper presents studies on fungi threatening the cultivation of scorzonera. Soil mulching with intercrop cover crops such as oats, tansy phacelia and spring vetch had a positive effect on the population and healthiness of the seedlings and the roots of the studied plant. The following fungi were most frequently isolated from the infected underground organs of scorzonera: Alternaria alternata, A. scorzonerae, Botrytis cinerea, Cylindrocarpon didymum, Fusarium culmorum, F. oxysporum, F. solani, Rhizoctonia solani, Phytophthora sp. and Sclerotinia sclerotiorum. Among the applied mulching plants, oats proved to be the most effective in inhibiting the occurrence of the enumerated fungi species.Scorzonera hispanica jest bogatym źródłem inuliny – glikozydu, który ma pozytywny wpływ na organizm człowieka i zwierząt. Praca przedstawia badania dotyczące grzybów zagrażających uprawie skorzonery. Mulczowanie gleby międzyplonowymi roślinami okrywowymi, takimi jak owies, facelia i wyka siewna, wpłynęło korzystnie na liczebność i zdrowotność siewek oraz korzeni badanej rośliny. Z porażonych organów podziemnych skorzonery najczęściej izolowano takie grzyby jak: Alternaria alternata, A. scorzonerae, Botrytis cinerea, Cylindrocarpon didymum, Fusarium culmorum, F. oxysporum, F. solani, Rhizoctonia solani, Phytophthora sp. i Sclerotinia sclerotiorum. Spośród zastosowanych roślin mulczujących owies okazał się najskuteczniejszy w ograniczeniu występowania wymienionych gatunków grzybów