Estudo morfológico e molecular de Geodia gibberosa Lamarck, 1815 (Astrophorida, Geodiidae)

Geodia gibberosa é uma das espécies que apresentam as maiores distribuições geográfica e batimétrica em comparação com suas congêneres. Com variações significativas na morfologia externa e no conjunto espicular, é considerada uma espécie com alto grau de polimorfismo e, muitas vezes, de difícil identificação. Tais características têm levado diversos pesquisadores a questionar os limites de sua variabilidade e a levantar hipóteses acerca da existência de espécies crípticas. Com o presente estudo, se objetivou avaliar o status taxonômico dessa espécie, aliando informações de morfologia e de biologia molecular, a qual empregou a utilização dos marcadores mitocondriais COI (subunidade I da citocromo c oxidase) e ATP6 (subunidade 6 da ATP sintase). Embora tenham sido observadas variações na morfologia das espículas e registradas categorias de megaescleras nunca vistas no holótipo, não foi possível encontrar nenhum padrão que possibilitasse a separação de G. gibberosa em espécies morfologicamente distintas. Contudo, através das ferramentas moleculares, foi determinada a existência de, pelo menos, três clados fortemente suportados, possibilitando a aceitação da hipótese de que G. gibberosa representa um complexo de espécies. Acrescido a isso, no presente trabalho, é descrita uma nova espécie de Geodia para a costa da Venezuela, com a apresentação de uma chave taxonômica para as 12 espécies nominais agora válidas que ocorrem no Caribe, e registrada a primeira ocorrência de Pachymatisma johnstonia para o oceano Atlântico ocidental

Hidden diversity in Prochilodus nigricans: A new genetic lineage within the Tapajós River basin.

Highly spread through the Amazon River basin, Prochilodus nigricans have had its taxonomic validity recently questioned, when genetic differences between Western and Eastern Amazon populations from the Brazilian shield were detected. This area has been seeing as a region of high ichthyofaunal diversity and endemism, in which the hybrid origin of the Tapajós River basin has been raised. In this paper, we report a new molecular lineage within P. nigricans of Tapajós River, highlighting this region still hides taxonomically significant diversity. Haplotype networks were reconstructed using the mitochondrial COI and ATP6/8 markers, which were also used to calculate genetic distances among clusters. We additionally conducted a delimiting species approach by employing a Generalized Mixed Yule-Coalescent model (GMYC) with COI sequences produced here, and previous ones published for individuals sampled across the Amazon River basin. In addition to the genetic differentiation within P. nigricans, our findings favor the hypothesis of hybrid origin of the Tapajós River basin and reaffirm the importance of studies aiming to investigate hidden diversity to address taxonomic and biogeographic issues, that certainly benefit better biodiversity conservation actions

EFEITOS DA TEMPERATURA DE ARMAZENAMENTO E DO TEMPO NA CONTAGEM DE CÉLULAS SOMÁTICAS NO LEITE DE CABRA

A temperatura e o tempo de armazenamento de amostras de leite de cabra têm sido identificados como possíveis fatores que influenciam na contagem de células somáticas (CCS). Com objetivo de estabelecer o efeito da temperatura e do tempo de armazenamento de amostras de leite de cabra, foram realizadas em 320 alíquotas de amostras de leite de 20 cabras a CCS utilizando o equipamento Somacount 300 (Bentley Instruments). Foi adicionado o conservante bronopol nas amostras de leite e estas mantidas a temperatura de As amostras de leite foram 5º, 10º, 20º e 30ºC e analisadas com 1, 3, 5 e 7 dias após a coleta. A temperatura e tempo de armazenamento não influenciaram significativamente a CCS (P>0,05). Os resultados de CCS em amostras de leite armazenadas a 10º, 20º e 30ºC foram sensivelmente menor em relação as amostras armazenadas a 5ºC. Considerando uma variação menor de 9%, os resultados da CCS em condições experimentais podem ser aceitos para monitoramento da qualidade do leite e saúde da glândula mamária em rebanhos caprinos leiteiros

A novel tuberculosis diagnosis approach using feed-forward neural networks and binary pattern of phase congruency

Tuberculosis is a severe and contagious lung disease that kills more than one million people annually, representing a real public health problem worldwide. Meanwhile, researchers and industry have highlighted the potential of analyzing and classifying chest radiographs (CXR) with artificial intelligence (AI). However, although high-performance industry solutions to aid in diagnosing have become a reality, vulnerable populations and underdeveloped countries have struggled to access them. In this sense, accessible and low-cost alternatives are essential to reach the needs of those populations that rely on public actions and services. Therefore, we propose a method to assist in the screening, diagnosing, and classifying of tuberculosis cases with a low-cost and high-efficiency computational approach. Our method uses a novel feature extraction approach based on binary patterns of phase congruence (BPPC) to describe CXR images that are represented in a feature vector of 1062 values. The extraction strategy maintains and recovers descriptive textural information of the TB, captured in 6 different directions of the CXR image, being invariant in the illumination and contrast of the CXR. The vector is then used to build a feed-forward neural network (FFNN) model capable of identifying and classifying TB cases. Our model experimented with three classification scenarios with CXR images from the TBX11K public dataset, and our results achieved exceptional performance, with greater than 99% accuracy, outperforming models from related work

Leishmaniose tegumentar americana canina em municípios do norte do Estado do Paraná, Brasil Canine American cutaneous leishmaniasis in municipalities of northern Paraná State, Brazil

A leishmaniose tegumentar americana (LTA) é endêmica no norte do Estado do Paraná, Brasil, afetando tanto o homem como os cães. O objetivo deste trabalho foi estudar a ocorrência da doença na população canina em áreas endêmicas de LTA. No período de setembro de 1999 a julho de 2002, foram investigados cães em sete localidades rurais de cinco municípios onde ocorreram casos humanos autóctones da doença, utilizando métodos parasitológicos e sorológicos. Dos 67 cães estudados, 14 (20,9%) tinham lesões sugestivas de LTA, dos quais 3 (21,4%) estavam infectados por Leishmania sp. Trinta e sete (55,2%) cães apresentaram imunofluorescência indireta positiva para Leishmania (Viannia) braziliensis. Os resultados mostram a ocorrência simultânea de leishmaniose humana e canina e indicam a necessidade de estudos adicionais para esclarecer o papel do cão no ciclo de transmissão do parasito nessas áreas.<br>American cutaneous leishmaniasis (ACL) is an endemic disease in northern Paraná State, where it affects humans and dogs. This study aimed to verify the occurrence of the canine disease in ACL endemic areas. From September 1999 to July 2002, dogs were investigated in 7 rural areas of 5 municipalities where autochthonous human cases of ACL had been reported. Parasitological and serological methods were used. Fourteen of 67 dogs studied (20.9%) had lesions suggestive of ACL, of which 3 (21.4%) were infected with Leishmania sp. Indirect immunofluorescence for Leishmania (Viannia) braziliensis was positive in 37 (55.2%) of 67 dogs. The results showed that human and canine ACL occur simultaneously and indicate the need for additional studies to elucidate the role of dogs in the ACL transmission cycle in the area studied

Culicídeos do lago de Itaipu, no rio Paraná, Sul do Brasil Culicidae of Itaipu lake, Paraná River, southern Brazil

De janeiro a dezembro de 1991 foram realizadas capturas mensais de culicídeos, no Município de Guaíra, Estado do Paraná (Brasil), na margem esquerda do lago de Itaipu, ao lado da via de acesso que conduzia aos Saltos das Sete Quedas, usando-se armadilha luminosa de Shannon, e isca humana em área urbanizada. Obtiveram-se informações sobre a fauna culicidiana, as espécies prevalentes, a variação sazonal, o horário de maior densidade e a afinidade dos mosquitos em relação ao hospedeiro humano. Foram identificadas 41 espécies de culicídeos dos gêneros Anopheles, Aedes, Aedomyia, Coquillettidia, Culex, Mansonia, Psorophora e Uranotaenia. Capturaram-se 21.280 mosquitos em armadilha de Shannon e 1.010 em isca humana. As espécies mais freqüentes em armadilha de Shannon - Coquillettidia shannoni, Mansonia humeralis, Anopheles triannulatus, Aedes scapularis e Anopheles albitarsis - perfizeram 82,78% dos mosquitos capturados. Em isca humana Aedes scapularís, Mansonia humeralis e Anopheles albitarsis, somaram 91,21% dos insetos capturados. Em armadilha de Shannon o horário de maior atividade das espécies prevalentes foi entre 19 e 22 h. Em isca humana Aedes scapularis teve maior densidade das 20 às 21 h, enquanto Mansonia humeralis e Anopheles albitarsis prevaleceram das 18 às 19 h. Dentre as espécies prevalentes em armadilha de Shannon, Coquillettidia shannoni, Mansonia humeralis e Anopheles albitarsis tiveram pico de atividade no mês de abril, Anopheles triannulatus em janeiro e Aedes scapularis em fevereiro.<br>Mosquito catches were made in Guaíra county, Paraná State, southern Brazil, in the vicinity of Itaipu dam, from January to December 1991. The catches were made with a Shannon light trap and human bait. The Shannon light trap was installed beside the highway that used, formerly, to lead to the Sete Quedas cataracts and the human bait was used in the urban area. Data about the Culicidae fauna were obtained as to predominant species, seasonal variation, time of highest density and affinity with human host. Forty-one species were identified as belonging to the Anopheles, Aedes, Aedomyia, Coquillettidia, Culex, Mansonia, Psorophora and Uranotaenia genera. With the Shannon light trap 21,280 mosquitoes were caught and with human bait 1,010. In the catches made with the Shannon light trap, Coquillettidia shannoni, Mansonia humeralis, Anopheles trianulatus, Aedes scapularis and Anopheles albitarsis accounted for 82.78% of all mosquitoes taken. In the catches made on human bait the highest densities of these mosquitoes occurred between 7 p.m. and 9 p.m. Aedes scapularis, Mansonia humeralis and Anopheles albitarsis represented 91,21% of all mosquitoes caugth with human bait. The highest densities of Aedes scapularis, on human bait, were found between 8 p.m. and 9 p.m. and those of Mansonia humeralis and Anopheles albitarsis between 6 p.m. and 7 p.m. Among the genera caught with the Shannon ligth trap Coquillettidia shannoni, Mansonia humeralis and Anopheles albitarsis were most frequent in April, Anopheles triannulatus in January and Aedes scapularis in February

Neotropical freshwater fisheries : A dataset of occurrence and abundance of freshwater fishes in the Neotropics

The Neotropical region hosts 4225 freshwater fish species, ranking first among the world's most diverse regions for freshwater fishes. Our NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set is the first to produce a large-scale Neotropical freshwater fish inventory, covering the entire Neotropical region from Mexico and the Caribbean in the north to the southern limits in Argentina, Paraguay, Chile, and Uruguay. We compiled 185,787 distribution records, with unique georeferenced coordinates, for the 4225 species, represented by occurrence and abundance data. The number of species for the most numerous orders are as follows: Characiformes (1289), Siluriformes (1384), Cichliformes (354), Cyprinodontiformes (245), and Gymnotiformes (135). The most recorded species was the characid Astyanax fasciatus (4696 records). We registered 116,802 distribution records for native species, compared to 1802 distribution records for nonnative species. The main aim of the NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set was to make these occurrence and abundance data accessible for international researchers to develop ecological and macroecological studies, from local to regional scales, with focal fish species, families, or orders. We anticipate that the NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set will be valuable for studies on a wide range of ecological processes, such as trophic cascades, fishery pressure, the effects of habitat loss and fragmentation, and the impacts of species invasion and climate change. There are no copyright restrictions on the data, and please cite this data paper when using the data in publications