Dispersal and population structure at different spatial scales in the subterranean rodent Ctenomys australis

This study was funded by grants from Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET, PIP5838), Agencia de Promoción Científica y Tecnológica de la Argentina (PICTO1-423, BID-1728/OC-AR), and the programme ECOS-Sud France/Argentina (A05B01).Background: The population genetic structure of subterranean rodent species is strongly affected by demographic (e.g. rates of dispersal and social structure) and stochastic factors (e.g. random genetic drift among subpopulations and habitat fragmentation). In particular, gene flow estimates at different spatial scales are essential to understand genetic differentiation among populations of a species living in a highly fragmented landscape. Ctenomys australis (the sand dune tuco-tuco) is a territorial subterranean rodent that inhabits a relatively secure, permanently sealed burrow system, occurring in sand dune habitats on the coastal landscape in the south-east of Buenos Aires province, Argentina. Currently, this habitat is threatened by urban development and forestry and, therefore, the survival of this endemic species is at risk. Here, we assess population genetic structure and patterns of dispersal among individuals of this species at different spatial scales using 8 polymorphic microsatellite loci. Furthermore, we evaluate the relative importance of sex and habitat configuration in modulating the dispersal patterns at these geographical scales. Results: Our results show that dispersal in C. australis is not restricted at regional spatial scales (similar to 4 km). Assignment tests revealed significant population substructure within the study area, providing support for the presence of two subpopulations from three original sampling sites. Finally, male-biased dispersal was found in the Western side of our study area, but in the Eastern side no apparent philopatric pattern was found, suggesting that in a more continuous habitat males might move longer distances than females. Conclusions: Overall, the assignment-based approaches were able to detect population substructure at fine geographical scales. Additionally, the maintenance of a significant genetic structure at regional (similar to 4 km) and small (less than 1 km) spatial scales despite apparently moderate to high levels of gene flow between local sampling sites could not be explained simply by the linear distance among them. On the whole, our results support the hypothesis that males disperse more frequently than females; however they do not provide support for strict philopatry within females.Publisher PDFPeer reviewe

On the use of a multiple view interactive environment for MATLAB and octave program comprehension

WOS:000364988500049 (Nº de Acesso Web of Science)MATLAB or GNU/Octave programs can become very large and complex and therefore difficult to understand and maintain. The objective of this paper is presenting an approach to mitigate this problem, based upon a multiple view interactive environment (MVIE) called OctMiner. The latter provides visual resources to support program comprehension, namely the selection and configuration of several views to meet developers’ needs. For validation purposes, the authors conducted two case studies to characterize the use of OctMiner in the context of software comprehension activities. The results provided initial evidences of its effectiveness to support the comprehension of programs written in the aforementioned languages

A concern visualization approach for improving MATLAB and octave program comprehension

The literature has pointed out the need for focusing efforts to better support comprehension of MATLAB and Octave programs. Despite being largely used in the industry and academia in the engineering domain, programs and routines written in those languages still require efforts to propose approaches and tools for its understanding. Considering the use of crosscutting concerns (CCCs) to support the comprehension of object-oriented programs, there is room of its use in the context of MATLAB and Octave programs. The literature has purpose and examples in this direction. Considering this scenario, we propose the use of visualization enriched with CCCs representation to support the comprehension of such programs. This paper discusses the use of a multiple view interactive environment called OctMiner in the context of two case studies to characterize how collected information relating to crosscutting concerns can foster the comprehension of MATLAB and GNU/Octave programs. As a result of the conducted case studies, we propose strategies based on OctMiner and tailored to support different comprehension activities of programs written in MATLAB and Octave.info:eu-repo/semantics/acceptedVersio

Características agronômicas de genótipos de bananeira em três ciclos de produção em Rio Branco, AC.

O objetivo deste trabalho foi avaliar características agronômicas de genótipos de bananeira, em três ciclos de produção. O experimento foi realizado em blocos ao acaso, com parcelas subdivididas e cinco repetições, em Rio Branco, AC. Os genótipos Preciosa, Japira, Pacovan Ken, Pacovan, PA42-44, Prata-anã, ST12-31, FHIA 02, Nanicão, Grande Naine, Calipso, Ambrósia e Bucaneiro foram avaliados quanto aos caracteres: altura da planta; diâmetro do pseudocaule; número de folhas vivas na floração e na colheita; ciclo de formação do cacho da floração à colheita; número de pencas por cacho; massa do fruto e do cacho; e produtividade. As cultivares Preciosa e Pacovan Ken apresentaram as maiores alturas, e os híbridos PA42-44 e FHIA 02, e as cultivares Prata-anã, Nanicão e Grande Naine, o porte mais baixo. As cultivares Nanicão, Ambrósia, Bucaneiro, Pacovan, Prata-anã e Grande Naine e o híbrido ST12-31 apresentaram os menores números de folhas vivas na colheita. A cultivar Preciosa e o híbrido FHIA 02 foram os mais produtivos. Os híbridos PA42-44 e FHIA 02 apresentam características agronômicas promissoras e podem ser incorporados ao sistema produtivo, assim como os híbridos de Pacovan, já adaptados e recomendados para o cultivo no Estado do Acre

Características vegetativas e seus efeitos sobre a produção de bananeira em três ciclos.

A produtividade em bananeira é um caráter complexo que resulta da associação de diferentes fatores, influenciados pelo ambiente. Este trabalho teve por objetivo estudar os efeitos diretos e indiretos de características vegetativas sobre a produção de bananeira em três ciclos. O trabalho foi conduzido no campo experimental da Embrapa Acre, em Rio Branco, Acre, entre os anos de 2003 e 2006. Foram avaliados 13 genótipos de bananeira (Preciosa, Japira, Pacovan-Ken, Pacovan, BRS Platina, Prata-Anã, ST12-31, Nanicão, Grande Naine, Calipso, Ambrosia, Bucaneiro e FHIA-02), no espaçamento de 3 m x 2 m, no esquema de blocos ao acaso, com cinco repetições. Determinaram-se a altura de plantas, diâmetro do pseudocaule, número de folhas na floração e na colheita, peso do cacho e número de pencas no cacho. Realizou-se a análise de variância para cada ciclo e estimaram-se os coeficientes de correlação fenotípicos e os coeficientes de trilha. Adotou-se como variável básica o peso do cacho, e as demais, como variáveis explicativas. O estudo dos efeitos diretos e indiretos evidenciou que o caráter produção é bastante influenciado pelo ambiente no primeiro ciclo, e, nos ciclos seguintes, a produção é muito influenciada pelas características vegetativas, principalmente número de folhas na colheita

Correlação fenotípica em acessos diploides (AA) melhorados de bananeira.

A bananicultura destaca-se como uma atividade de grande importância econômica e social. No Brasil, verifica-se o cultivo da bananeira em todas as regiões geográficas, da faixa litorânea aos planaltos do interior. Os problemas enfrentados pela cultura são vários, abrangendo desde produtividade e qualidade dos frutos inadequadas, a questões mais específicas, como resistência a pragas (SILVA et al., 2005; CORDEIRO et al., 2005)

Variabilidade entre diploides (AA) de bananeira do banco ativo de germoplasma da Embrapa Mandioca e Fruticultura.

Dentre as frutíferas, a banana ocupa a segunda posição na produção mundial, sendo superada apenas pela melancia, com 100,7 milhões de toneladas. A produção brasileira de banana está distribuída por todo o território nacional, sendo a região Nordeste a maior produtora (34%), seguida das Regiões Norte (FAO, junho de 2011). Destacando-se os Estados da Bahia, Ceará, Pernambuco e Rio Grande do Norte. Nestes Estados, a produção de banana acontece principalmente nos polos de fruticultura irrigada. (SENA et al.,2011).1 CD-ROM

Correlações fenotípicas e análise de cultivares de bananeira em diferentes ambientes.

A cultura da banana assume destaque como atividade de grande importância econômica e social em diversos países. No Brasil, a bananeira e cultivada em todas as regiões. Á área plantada com banana no Brasil é a segunda maior do mundo (487 mil ha), estando atrás apenas da Índia (844 mil ha), porém, a produção nacional de bananas, é a quinta maior (6,9 milhões de t), perdendo para Índia (31,8 milhões de t), China (9,8 milhões de t), Filipinas (9,1 milhões de ton.) e Equador (7,9 milhões de t) conforme dados da FAO (2012)

Seleção de híbridos diplóides (AA) de bananeira com base em três índices não paramétricos.

Objetivou-se selecionar híbridos diplóides (AA) de bananeira com base em três índices não paramétricos, a fim de orientar a seleção e aumentar o aproveitamento da variabilidade existente no Banco de Germoplasma de Bananeira da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Foram avaliados 11 híbridos, no delineamento de blocos ao acaso, com quatro repetições. As parcelas constituíram-se de seis plantas, espaçadas de 2,5 m x 2,5 m, tendo na bordadura plantas da cultivar Pacovan. Tomaram-se dados dos seguintes caracteres: altura da planta, diâmetro do pseudocaule, número de filhos na floração, número de folhas na floração, ciclo da planta do plantio à emissão do cacho, presença de pólen, número de pencas, número de frutos, comprimento do fruto e resistência à Sigatoka-amarela. As médias desses 10 caracteres foram empregadas no cálculo dos índices multiplicativos, de soma de classificação e da distância genótipo-ideótipo. Os dois híbridos de melhor desempenho geral, o SH3263 e o 1318-01, foram classificados, respectivamente, em primeiro e segundo lugares pelos índices multiplicativos e de soma de classificação, enquanto o índice da distância genótipo-ideótipo os classificou em primeiro e quarto lugares respectivamente. Embora os três índices tenham demonstrado uma boa correspondência entre o desempenho geral dos híbridos e a sua classificação, os índices multiplicativo e de soma de classificação propiciaram classificação mais adequada desses híbridos

Desempenho fisiológico de mudas de bananeira na fase inicial de crescimento.

Com a finalidade de avaliar o crescimento de mudas de bananeira das cultivares Prata Anã e Grande Naine, foi instalado um experimento no viveiro de produção de mudas da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, no delineamento inteiramente casualizado. As duas cultivares representaram as parcelas e as épocas de avaliação (aos 30, 60, 90, 120 e 150 dias após o transplantio), as subparcelas, utilizando três repetições. Avaliou-se as seguintes características: altura de plantas, diâmetro do pseudocaule, número de folhas, área foliar, massa seca das folhas, massa seca do pseudocaule, massa seca da raiz, taxa de crescimento absoluto, taxa de crescimento relativo, taxa assimilatória líquida e razão de área foliar. A cultivar Grande Naine apresenta maior velocidade de crescimento inicial, com maior acúmulo de massa seca total (35,11g) que a Prata Anã (28,54 g) aos 150 dias após o transplantio. Os índices fisiológicos de crescimento constituem ferramentas apropriadas para identificar e comparar o desenvolvimento vegetal das diferentes cultivares