35 research outputs found

    Víztakarékos öntözéstechnikával termeszthető rizsfajtákra jellemző génexpressziós mintázatok = Gene expression profiles characteristic to rice varieties cultivated under water-saver irrigation regime

    Get PDF
    Eltérő vízigényű rizsfajták (''szárazrizsek'' és hagyományos fajták) növekedési, termesztési paramétereit határoztuk meg árasztásos ill csak kiegészítő öntözéses körülmények között annak érdekében, hogy a korlátozott vízellátáshoz jól adaptálódó fajtákra jellemző tulajdonságokat megállapíthassuk. Kidolgoztunk egy olyan kísérleti rendszert, melyben ezeknek a fajtáknak a gyökérnövekedését vizsgálhatjuk, illetve génexpressziós vizsgálatokhoz mintát gyűjthetünk. Transzkript profilok microarray hibridizációs felvételével megállapítottuk, hogy a mélyrehatoló, erőteljes gyökérzet meghatározó jellemzője a száraz körülmények között is jól teljesítő fajtáknak, és több száz olyan gént találtunk, melynek transzkript-szintje vízellátástól függő napszakos változásokat mutat a legnagyobb tűrőképességű Sandora fajta gyökérzetében. Valósidejű kvantitatív PCR-rel ellenőriztük számos gén expressziós mintázatát, ez döntő többségében megerősítette a microarray hibridizációval kapottakat, egyúttal más aszályérzékenységű rizsfajtákban is meghatároztuk ezen gének expressziós mintázatát. | Rice cultivars featuring different water demand (upland and traditional cultivars) were studied in this project. Growth and harvest parameters of these cultivars were determined under flooding and limited sprinkle irrigation in order to find features characteristic to genotypes adapting well to water limitation. An experimental system was established that allows studies of root growth as well as collection of samples for gene expression experiments. Microarray hybridizations revealed the transcript profile of Sandora cultivar that develops strong and deep root system which is an important component of good yield performance under drought stress. Several hundred genes were found which showed water supply dependent transcript level changes in the roots of this cultivar on a daily manner. Microarray results were confirmed by quantitative real-time PCR for several genes. The expression patterns of these genes were also checked in cultivars being less drought tolerant

    A szociális viselkedés és az egyedek közötti rokonság kapcsolatának vizsgálata házi verebeken = The effects of relatedness on the social behaviour of house sparrows

    Get PDF
    A kutatásban három kérdésre kerestük a választ: (1) milyen rokonsági szerkezet jellemzi a házi verebek (Passer domesticus) téli csapatait, (2) azonosítják-e a madarak rokonaikat a csapatokban, és (3) befolyásolja-e a rokonság szociális viselkedésüket. Szabadon élő madarak molekuláris genetikai vizsgálatával kimutattuk, hogy a verébcsapatokra nem jellemző a rokon egyedek koncentrált előfordulása, azonban a legtöbb egyednek van legalább kisszámú közeli rokona a csapatokban. Fogságban tartott madarak vizsgálataiban azt találtuk, hogy a rokonság befolyásolja a madarak szociális viselkedését: a rokonok csapaton belül gyakrabban követik egymást; csapatos táplálkozásnál a tojók gyakrabban és többet potyáznak rokonaiktól; valamint a testvérek gyakrabban, de kisebb intenzitással verekednek egymással, mint nem rokon madarakkal. Eredményeink azt mutatják, hogy elsősorban az ismert rokonok (pl. testvérek) irányában viselkednek eltérően a madarak, azonban esetenként távolabbi (nem ismert) rokonokkal szembeni magatartásuk is különbözött a nem-rokonokkal szembeni viselkedéstől (pl. potyázás gyakorisága). Eredményeink elsőként igazolták, hogy a házi verebek felismerik közeli rokonaikat a csapattársak között, és hogy egyes szociális interakcióikat befolyásolja a csapattárshoz fűződő rokonság. | The project had three major questions: (1) how are birds related to each other in wild house sparrow (Passer domesticus) flocks, (2) are sparrows able to recognize their kin, and (3) does relatedness between flock-mates influence their social behavior? In a molecular genetic study of free-living birds, we found no evidence for concentrated occurrence of relatives in sparrow flocks. However, most birds had at least a few close relatives among their flock-mates. Studies on captive birds showed that their social behavior is affected by relatedness: relatives followed each other more often within the flocks than unrelated birds; females scrounged more often and more food from relatives than from unrelated birds; and siblings fought more often but less violently with each other than with unrelated flock-mates. Our results suggest that birds perform differential social behavior mainly towards familiar relatives (e.g. siblings), although we also observed some differential behaviors towards unfamiliar kin (e.g. frequent scrounging from non-sib and non-parent relatives). These results support that house sparrows are able to recognize their close kin in flocks, and that relatedness plays a role in their non-reproductive social interactions

    Experimental system for studying long-term drought stress adaptation of wheat cultivars

    Get PDF
    Water limitation is a well-known problem for plants. Lack of water affects their biomass, their yield that is the most conspicuous in case of crops causing severe uncertainty of agricultural productivity. Under drought stress, plants generally display many physiological responses such as stomata closure, decreased/stopped photosynthetic activity, increased root/shoot ratio, reduced growth of vegetative parts. Many of the physiological changes are caused by underlying transcriptional alterations of high number of genes in many cases. One of the most studied phenomenon is the accumulation of proline as an osmoprotectant. Proline biosynthesis is increased by water deficit due to increased expression of the key enzyme, namely Δ1-pyrroline-5-carboxylate synthetase (P5CS). In our experiments, we applied P5CS as a positive control to evaluate our new experimental system, which will allow to follow transcriptional changes in shoots, as well as in roots during drought adaptation. Our alternative approach allows greenhouse or growth chamber experiments that are more similar to natural conditions than the widely used experimental systems based on osmotic agents such as polyethylene glycol (PEG)

    Narrative Language as an Expression of Individual and Group Identity

    Get PDF
    Scientific Narrative Psychology integrates quantitative methodologies into the study of identity. Its methodology, Narrative Categorical Analysis, and its toolkit, NarrCat, were both originally developed by the Hungarian Narrative Psychology Group. NarrCat is for machine-made transformation of sentences in self-narratives into psychologically relevant, statistically processable narrative categories. The main body of this flexible and comprehensive system is formed by Psycho-Thematic modules, such as Agency, Evaluation, Emotion, Cognition, Spatiality, and Temporality. The Relational Modules include Social References, Semantic Role Labeling (SRL), and Negation. Certain elements can be combined into Hypermodules, such as Psychological Perspective and Spatio-Temporal Perspective, which allow for even more complex, higher level exploration of composite psychological processes. Using up-to-date developments of corpus linguistics and Natural Language Processing (NLP), a unique feature of NarrCat is its capacity of SRL. The structure of NarrCat, as well as the empirical results in group identity research, is discussed

    Mikroszerkezet karakterizációja röntgen vonalprofil analízis alapján = Characterization of microstructure by X-ray line profile analysis

    Get PDF
    A "" Mikroszerkezet karakterizációja röntgen vonalprofil analízis alapján"" c. T-046990, OTKA pályázat rövid szakmai összefoglalója, zárójelentés A deformációs anizotrópia jelenségét kihasználva részletes elméleti és kísérletes kutatásokat végeztünk a mikroszerkezet kvalitatív és kvantitatív karakterizációjára vonatkozóan köbös, hexagonális és ortorombos kristályrendszerekben a röntgen vonalprofil analízis módszerével. A földkéregben mintegy 100 km-es mélységben fekvő ortorombos MgSiO3 perovszkitokat szimuláló mintát állítottunk elő magas hőmérsékletű nagynyomású présben. Megállapítottuk, hogy csak és Burgers vektorú diszlokációk jönnek létre. 700 és 1000 K közötti hőmérsékleteken összenyomással deformált Ge egykristályokban helyfüggő mikrodiffrakcióval megállapítottuk, hogy a mikroszerkezet jelentős fluktuációkat mutat. [001], [011] és [111] textúrájú NiAl emlékező ötvözet mintákban meghatároztuk a különböző textúra komponensekhez tartozó kemény illetve puha krisztallit populációkban az aktív Burgers vektor típusokat valamint diszlokációsűrűségeket. Golyósmalomban őrölt alkáli földfém fluoridok krisztallitméret és diszlokációsűrűség meghatározása során felfedeztük, hogy pormintákban is létrejön röntgen optikai interferencia. Módszert dolgoztunk ki Burgers vektor típusok meghatározására hcp kristályokban. Kidolgoztuk a rétegződési hibák és ikerhatárok gyakoriságának meghatározási módszerét köbös kristályokban. A módszert számos esetben sikeresen alkalmaztuk. | ""Characterization of microstructure by X-ray line profile analysis"" Short summary of the T-046990, OTKA project, final report On the basis strain anisotropy detailed theoretical and experimental work has been carried out for the characterization of the microstructure in cubic, hexagonal and orthorhombic crystal structures by using the method of X-ray line profile analysis. A synthetic orthorhombic MgSiO3 perovskite was prepared the high temperature and pressure. We have found that only and type Burgers vectors are present in the deformed crystals. Ge single crystals were deformed by compression between 700 and 1000 K. Position sensitive microdiffraction has revealed that the deformed microstructure is strongly fluctuating on different length scales. NiAl shape memory alloys with [001], [011] and [111] textures were deformed by compression. We have determined the active Burgers vector types and dislocation densities in the different texture components for different grain orientation populations. Alkali-halide fluorides were ball milled to different extent. We have shown that X-ray optical interference can occur in nanocrystalline powder specimens. A method has been worked out to determine active Burgers vector types in hexagonal crystal systems, and the frequency of stacking faults and twin boundaries in cubic crystals. The methods have been applied successfully in several different cases

    Numerical classification of oak forests on loess in Hungary, Croatia and Serbia

    Get PDF
    Oak forests on loess are floristically one of the richest types of broadleaved forests and are among the most threatened types of natural habitats in the Carpathian Basin. They are classified in several communities in Hungary, Croatia and Serbia. These syntaxa are distinguished mostly on the basis of traditional phytosociological methods without comparison across a larger geographical scale. The recognition of some of these local syntaxa in the field, therefore, can be difficult, and the application of their names to communities in other areas may be questionable. The goal of this study was to develop an international typology for oak forests on loess based on a numerical analysis. A data set of 437 phytosociological relevés (stands of 12 associations from three countries) was stratified and 270 relevés were analysed using multivariate statistical methods. Six types were distinguished: Primula vulgaris type (xero-mesic to mesic sub-Mediterranean closed-canopy oak forests); Ruscus aculeatus type (xeric to xero-mesic sub-Mediterranean type); Vinca herbacea type (xeric continental open-canopywoodlands); Pulmonaria mollis type (xeric to mesic continental closed-canopy forests); Corydalis cava type (mesic closed-canopy oak forests in nutrient-rich habitats); and Stellaria media type (xeric to mesic oak forests in nutrient-rich habitats). The vegetation types identified are related to syntaxa traditionally recognized by phytosociologists. Our analysis did not support the distinction of some associations with local distributions. The geographical distributions of the two main forest types exhibited a gradient-like pattern in a north-east–south-west direction. The dry continental forest steppe woodland is mainly distributed in the north-eastern part of Hungary, whereas the xero-mesic sub-Mediterranean forests are restricted to the southwestern and southern part of our study area. This pattern corresponds to a climatic gradient from the North Hungarian Mts to north-eastern Croatia and northern Serbia

    Csúszási rendszerek, Burgers vektor és rétegződési hibák meghatározás köbös, ortorhombos és hexagonális rendszerekben a röntgen vonalprofil analízis módszere alapján = Active slip-systems, Burgers vectors and twinning in hexagonal, cubic and ortorhombic systems determined by X-ray line profile analysis

    Get PDF
    Polikristályos Ti mintában, krisztallitonként kiértékelve a szinkrotronos diffrakciós vonalprofilokat, meghatároztuk az egyes krisztallitokban a legvalószínűbb csúszási rendszereket. Krisztallitonként meghatároztuk a legvalószínűbb diszlokációkat az MgGeO3 poszt-perovszkitban. A mintát gyémánt cellában 90 GPa nyomással melegítés közben vittük a poszt-perovszkit fázisba. A Co-Ti és Co-Zr ötvözeteken méréseket végeztünk a Chicago-i APS szinkrtorton mellett az 1-ID szinkrotron nyalábbal. Ezzel áttörést sikerült elérni az itt fejlesztett egykristály-diffrakció polikristályos-aggregátumon módszerben. Az Co-Ti és Co-Zr ötvözet rendszerek eredményeinek mind a végső kiértékelése mind a publikálása túlmutatnak a jelen OTKA projekt keretein és jelenleg még folyamatban vannak. Új módszert dolgoztunk ki erőteljesen textúrált mintákban a különböző textúra komponensek mikroszerkezetének kísérletes meghatározására. Erőteljesen textúrált Cu-Nb nanokristályos multirétegekben meghatároztuk a diszlokáció és ikerhatár sűrűséget a rétegvastagság és a hengerlés függvényében. Nanokristályos Cu vékonyrétegben meghatároztuk a diszlokáció sűrűségeket és a nanoikerhatár távolságokat a porlasztott és a hengerelt állapotokban. Meghatároztuk különböző textúrájú Ni vékonyrétegek diszlokáció és ikerhatár sűrűségét a különböző textúra komponensekben. Meghatároztuk egy extrudált Mg ötvözetben a diszlokáció sűrűségeket a különböző textúra komponensekben. Az OTKA szám feltüntetésével 27 cikket publikáltunk. | We determined the most likely slip systems in the individual grains of polycrystalline Ti and MgGeO3 post-perovskite from line profiles measured in polycrystalline aggregates at the ESRF synchrotron in Grenoble. The post-perovskite phase was attained in a diamond-anvil-cell during heating. We did synchrotron measurements on the Co-Ti and Co-Zr alloys at the 1-ID beamline at the APS in Chicago. With the evaluation of these data we could achieve a breakthrough in the processing of the complex and several tens of gigabit data of such experiments. We developed a novel method to evaluate the substructure in the different texture components of strongly textured materials. This we applied to extruded Mg, to Ni thin films and several different types of multilayers of Cu-Nb and thin films with nanotwins. We worked out the procedure for the determination of twinning on the pyramidal and prismatic planes in hexagonal materials from X-ray line broadening. We published 27 research papers with indicating the OTKA-71594 number

    The tricyclic antidepressant desipramine inhibited the neurotoxic, kainate-induced [Ca] increases in CA1 pyramidal cells in acute hippocampal slices.

    Get PDF
    Kainate (KA), used for modelling neurodegenerative diseases, evokes excitotoxicity. However, the precise mechanism of KA-evoked [Ca2+]i increase is unexplored, especially in acute brain slice preparations. We used [Ca2+]i imaging and patch clamp electrophysiology to decipher the mechanism of KA-evoked [Ca2+]i rise and its inhibition by the tricyclic antidepressant desipramine (DMI) in CA1 pyramidal cells in rat hippocampal slices and in cultured hippocampal cells. The effect of KA was dose-dependent and relied totally on extracellular Ca2+. The lack of effect of dl-2-amino-5-phosphonopentanoic acid (AP-5) and abolishment of the response by 6-cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione (CNQX) suggested the involvement of non-N-methyl-d-aspartate receptors (non-NMDARs). The predominant role of the Ca2+-impermeable alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionate receptors (AMPARs) in the initiation of the Ca2+ response was supported by the inhibitory effect of the selective AMPAR antagonist GYKI 53655 and the ineffectiveness of 1-naphthyl acetylspermine (NASPM), an inhibitor of the Ca2+-permeable AMPARs. The voltage-gated Ca2+ channels (VGCC), blocked by omega-Conotoxin MVIIC+nifedipine+NiCl2, contributed to the [Ca2+]i rise. VGCCs were also involved, similarly to AMPAR current, in the KA-evoked depolarisation. Inhibition of voltage-gated Na+ channels (VGSCs; tetrodotoxin, TTX) did not affect the depolarisation of pyramidal cells but blocked the depolarisation-evoked action potential bursts and reduced the Ca2+ response. The tricyclic antidepressant DMI inhibited the KA-evoked [Ca2+]i rise in a dose-dependent manner. It directly attenuated the AMPA-/KAR current, but its more potent inhibition on the Ca2+ response supports additional effect on VGCCs, VGSCs and Na+/Ca2+ exchangers. The multitarget action on decisive players of excitotoxicity holds out more promise in clinical therapy of neurodegenerative diseases
    corecore