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Evolution of the core and pan-genome of Streptococcus: positive selection, recombination, and genome composition
Comparative evolutionary analyses of 26 Streptococcus genomes show that recombination and positive selection have both had important roles in the adaptation of different species to different hosts
Mots et choses, maux et causes berbÚres : ethnologie, philologie, linguistique
Claude LefĂ©bure, chargĂ© de recherche au CNRS La littĂ©rature orale dans les parlers berbĂšres du Maroc a sustentĂ© la plupart des sĂ©ances. Avec dâabord, pour rappeler dâemblĂ©e lâune des tonalitĂ©s du programme, lâanalyse proprement textuelle dâun poĂšme chantĂ© chleuh, le wayyaho des modernes Ammouri Mbark et Hajjaji Ahmed, puis lâexplicitation du sens quâacquiĂšrent ces rĂ©miniscences agrestes par le fait de la performance musicale. Car celle-ci entraĂźne invariablement des auditoires citadins en mal..
Ătudes des interdĂ©pendances gĂ©ographiques entre rĂ©seaux de support Ă la vie
RĂSUMĂ
Nos sociétés modernes, de plus en plus performantes technologiquement, sont aussi de plus en
plus vulnérables aux défaillances des réseaux de support à la vie (RSV), comme les réseaux
dâĂ©lectricitĂ©, de gaz naturel, dâeau potable, de tĂ©lĂ©communications, de transports, etc. En effet,
dâune part, elles sont devenues de plus en plus dĂ©pendantes Ă ces RSV et dâautre part, ces RSV
eux-mĂȘmes sont devenus fortement interdĂ©pendants. Ainsi, la dĂ©faillance dâun RSV est capable
dâentraĂźner des rĂ©actions en chaĂźne sur les autres rĂ©seaux, responsables de graves consĂ©quences.
De plus, Ă cause dâune proximitĂ© toujours plus Ă©troite entre les infrastructures des RSV en milieu
urbain, des liens dâinterdĂ©pendances gĂ©ographiques peuvent se crĂ©er. En effet, la propagation non
maĂźtrisĂ©e dâune matiĂšre dâun RSV peut avoir des effets, dans une zone dâimpact, capables
dâentraĂźner des consĂ©quences sur dâautres RSV.
Le besoin de développer des outils opérationnels, simples à mettre en place et à utiliser, dans un
contexte oĂč peu dâĂ©tudes conduisant Ă des rĂ©sultats tangibles ont Ă©tĂ© menĂ©es, justifie la nĂ©cessitĂ©
dâune telle Ă©tude sur les interdĂ©pendances gĂ©ographiques.
Les travaux de recherche présentés dans ce mémoire proposent donc une méthodologie
permettant dâidentifier, de caractĂ©riser et dâĂ©valuer les interdĂ©pendances gĂ©ographiques entre
RSV, lâobjectif final Ă©tant de permettre la mise en place de mesures dâattĂ©nuation dans des
secteurs critiques. Elle conduit Ă la crĂ©ation dâoutils permettant dâĂ©valuer la vulnĂ©rabilitĂ© des
secteurs face aux interdépendances géographiques et de déterminer leur degré de criticité, grùce,
notamment, aux tableaux de vulnérabilité et aux cartes de criticité des secteurs. Par ailleurs, ces
outils sont capables de sâintĂ©grer Ă un systĂšme expert en fournissant des analyses supplĂ©mentaires
pour identifier et prioriser des mesures dâattĂ©nuation face aux risques gĂ©nĂ©rĂ©s par les
interdépendances géographiques. Cette méthodologie a été appliquée sur la ville de Montréal et a
conduit Ă une Ă©valuation de ses utilisations auprĂšs des professionnels de la gestion des risques des
RSV.----------ABSTRACT
Our modern societies, ever more technologically efficient, are also increasingly vulnerable to
failures in lifeline networks (LN), like electricity grids, natural gas, water, telecommunications,
transportation, etc. Indeed, on the one hand, they have become increasingly dependent on these
LN and on the other hand, these LN themselves have become highly interdependent. Thus, the
failure of a LN can cause a chain reaction on other networks, causing unprecedented disasters.
Moreover, because of the increasingly close proximity between the LNâs infrastructures in urban
areas, geographic interdependencies have appeared. Indeed, the uncontrolled spread of a LNâs
dangerous substance may have effects in an impact area that can have consequences on other LN.
In a context where few studies leading to tangible results have been carried out, the need to
develop operational tools, easy to implement and to use, justifies such a study on geographic
interdependencies.
Therefore, the research presented in this paper proposes a methodology to identify, characterize
and evaluate geographic interdependencies between LN. The ultimate objective was to enable the
implementation of mitigation measures in critical areas. It led to the creation of tools in order to
assess the vulnerability of sectors in terms of geographic interdependences and determine their
criticality degree, thanks to vulnerability tables and sectors criticality maps. Moreover, these tools
are able to integrate an expert system by providing additional analysis to identify and prioritize
mitigation measures against risks generated by geographic interdependencies. This methodology
has been applied to the city of Montreal and led to a discussion of its applications by the LNâs
risk management professionals
Mots et choses, maux et causes berbÚres : ethnologie, philologie, linguistique
Claude LefĂ©bure, chargĂ© de recherche au CNRS Mâavisant, face aux attentes et cursus diversifiĂ©s des auditeurs, de lâavantage quâil y avait Ă renverser lâordre des deux volets du programme annoncĂ©, jâai retardĂ©, au profit de lâimmersion dans certains de mes travaux, le repĂ©rage externe de ce que cette confĂ©rence entend circonscrire et promouvoir : la synergie de lâethnologie et de la linguistique relativement Ă lâinterprĂ©tation des structures et des dynamiques sociales agissant les communautĂ©s..
Genome characterization and population genetic structure of the zoonotic pathogen, streptococcus canis
Background - Streptococcus canis is an important opportunistic pathogen of dogs and cats that can also infect a wide range of additional mammals including cows where it can cause mastitis. It is also an emerging human pathogen.
Results - Here we provide characterization of the first genome sequence for this species, strain FSL S3-227 (milk isolate from a cow with an intra-mammary infection). A diverse array of putative virulence factors was encoded by the S. canis FSL S3-227 genome. Approximately 75% of these gene sequences were homologous to known Streptococcal virulence factors involved in invasion, evasion, and colonization. Present in the genome are multiple potentially mobile genetic elements (MGEs) [plasmid, phage, integrative conjugative element (ICE)] and comparison to other species provided convincing evidence for lateral gene transfer (LGT) between S. canis and two additional bovine mastitis causing pathogens (Streptococcus agalactiae, and Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae), with this transfer possibly contributing to host adaptation. Population structure among isolates obtained from Europe and USA [bovineâ=â56, canineâ=â26, and felineâ=â1] was explored. Ribotyping of all isolates and multi locus sequence typing (MLST) of a subset of the isolates (nâ=â45) detected significant differentiation between bovine and canine isolates (Fisher exact test: Pâ=â0.0000 [ribotypes], Pâ=â0.0030 [sequence types]), suggesting possible host adaptation of some genotypes. Concurrently, the ancestral clonal complex (54% of isolates) occurred in many tissue types, all hosts, and all geographic locations suggesting the possibility of a wide and diverse niche.
Conclusion - This study provides evidence highlighting the importance of LGT in the evolution of the bacteria S. canis, specifically, its possible role in host adaptation and acquisition of virulence factors. Furthermore, recent LGT detected between S. canis and human bacteria (Streptococcus urinalis) is cause for concern, as it highlights the possibility for continued acquisition of human virulence factors for this emerging zoonotic pathogen
Linguistique et technologie culturelle : Lâexemple du mĂ©tier Ă tisser vertical berbĂšre
Le propos de cette contribution est de montrer, sur lâexemple du mĂ©tier Ă tisser vertical utilisĂ© par les femmes berbĂ©rophones dâAfrique du Nord, lâintĂ©rĂȘt de lâenquĂȘte lexicographique et des analyses linguistiques pour les Ă©tudes de technologie culturelle. Il a dĂ©jĂ Ă©tĂ© posĂ© quâentre autres critĂšres susceptibles de justifier le dĂ©coupage en sĂ©quences dâune chaĂźne opĂ©ratoire pouvait figurer la rĂ©fĂ©rence Ă un changement de terme vernaculaire (Cresswell 1976 : 13). Lâimportance du discours des ..
« Câest totalement ridicule » : stratĂ©gie et contenu dâune communication nĂ©gative dissimulĂ©e lors de la campagne prĂ©sidentielle française de 2017
Durant la campagne prĂ©sidentielle française de 2017, le dispositif « Ridicule TV » se prĂ©sente comme un projet dâhumour sur lâactualitĂ© politique sur les rĂ©seaux sociaux numĂ©riques (Twitter, Facebook, Youtube) et diffuse une soixantaine de courtes vidĂ©os. En rĂ©alitĂ©, il sâagit dâune action dissimulĂ©e de communication politique nĂ©gative contre Emmanuel Macron Ă©laborĂ©e et gĂ©rĂ©e par des membres de la campagne de lâun de ses adversaires, François Fillon. Nous discutons comment le dispositif, puisqu'il ne se donne pas Ă connaĂźtre pour ce quâil est, limite sa rĂ©ussite en matiĂšre de gain Ă©lectoral, tout en sâajustant Ă des contraintes contextuelles. Pour Ă©lucider lâapparent paradoxe entre la fin et les moyens de cette action de nĂ©gativitĂ©, lâarticle en Ă©tudie thĂ©oriquement et empiriquement la pertinence avec une double perspective de sociologie de la communication politique et dâanalyse stratĂ©gique de la communication. Puis, lâanalyse de contenu des vidĂ©os en termes de mise en rĂ©cit et de procĂ©dĂ©s discursifs, en opĂ©rant notamment la distinction entre moquerie et dĂ©nonciation, permet dâĂ©valuer Ă quel degrĂ© les discours sont conformes au projet stratĂ©gique. Lâanalyse rĂ©vĂšle un important travail de recherche des contenus et de mise en rĂ©cit politique, ainsi que la primautĂ© dâun objectif stratĂ©gique â dĂ©nigrer lâadversaire â sur un autre, la dissimulation.In the 2017 French presidential campaign, the âRidicule TVâ device appears as a humoristic project about politics on social media (Twitter, Facebook, Youtube) and publishes 60 short videos. Yet it is a hidden tool of negative campaigning against the centre free-market candidate Emmanuel Macron designed and managed by members of the rightwing François Fillon campaign. We discuss why such a cover up limits its ability to improve electoral results as well as it adapts to contextual constraints. In order to explain the apparent paradox between the end and the means of this negativity, our article studies theoretically and empirically its use through an approach combining the sociology of political communication and the strategic analysis of communication. Then, we conduct a content analysis of the videos in terms of narrative analysis and discursive processes with special regard to the differences between mockery and criticism in order to assess to what extent the discourse is consistent with the project. We show the staff of Ridicule TV achieved a high degree of political sourcing and politicization of the narrative, and prioritized the strategic goal of criticizing the opponent over the strategic goal of hiding the purpose of the device
Retour sur « Linguistique et technologie culturelle »
En ouverture, le signe typographique reprĂ©sentĂ© est une esperluette âligature de la conjonction et ; celle-ci fut conçue dans les annĂ©es 70 par Claude LefĂ©bure qui offrit ainsi un logotype Ă lâĂ©quipe de la revue Techniques & culture dans sa belle genĂšse. Concentrer ce texte de plus de trente ans dâĂąge aux fins dâintĂ©resser une nouvelle gĂ©nĂ©ration de chercheurs, et tirer quelque leçon de son sillage dans la carriĂšre, câest pour moi se souvenir dâabord dâune intentionnalitĂ© collective. Sous la ..
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