Architecture génétique de la qualité de la graine chez Arabidopsis et le colza

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Study of an UBX gene sub-family that is preferentially expressed in pollen: functional genes or pseudogenes ?

Study of an UBX gene sub-family that is preferentially expressed in pollen: functional genes or pseudogenes ?. 7. Colloque national de la SFB

Modèle d'écrêtage à résidu d'indicatrice adapté aux gisements à fortes teneurs

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High throughput analysis of Arabidopsis seed lipid, protein, carbon and nitrogen content by Near-Infrared Reflectance Spectroscopy in four recombinant inbred line populations

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The Mitogen-Activated Protein Kinase 12 is involved in Arabidopsis seed filling

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Modèle d'écrêtage à résidu d'indicatrice adapté aux gisements à fortes teneurs

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Natural variation in seed very long chain fatty acid content is controlled by a new isoform of KCS18 in Arabidopsis thaliana

Oil from oleaginous seeds is mainly composed of triacylglycerols. Very long chain fatty acids (VLCFAs) are major constituents of triacylglycerols in many seed oils and represent valuable feedstock for industrial purposes. To identify genetic factors governing natural variability in VLCFA biosynthesis, a quantitative trait loci (QTL) analysis using a recombinant inbred line population derived from a cross between accessions Bay-0 and Shahdara was performed in Arabidopsis thaliana. Two fatty acid chain length ratio (CLR) QTL were identified, with one major locus, CLR. 2, accounting for 77% of the observed phenotypic variation. A fine mapping and candidate gene approach showed that a key enzyme of the fatty acid elongation pathway, the beta-ketoacyl-CoA synthase 18 (KCS18), was responsible for the CLR. 2 QTL detected between Bay-0 and Shahdara. Association genetics and heterologous expression in yeast cells identified a single point mutation associated with an alteration of KCS18 activity, uncovering the molecular bases for the modulation of VLCFA content in these two natural populations of Arabidopsis. Identification of this kcs18 mutant with altered activity opens new perspectives for the modulation of oil composition in crop plants. Citation: Jasinski S, Lecureuil A, Miquel M, Loudet O, Raffaele S, et al. (2012) Natural Variation in Seed Very Long Chain Fatty Acid Content Is Controlled by a New Isoform of KCS18 in Arabidopsis thaliana. PLoS ONE 7(11): e49261. doi:10.1371/journal.pone.004926

Genetic architecture of seed quality in Brassicaceae seeds

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Lien entre composition en protéines de réserve et teneurs en glucosinolates dans la graine de colza : vers l’identification de déterminants génétiques et moléculaires

National audienceIn rapeseed, the seed storage proteins are cruciferins (12S globulins) and napins (2S albumins) which represent more than 70% of the total proteins. As napins are richer in sulfur and aromatic residues than cruciferins, they are of greater nutritional interest. However, several studies show that in modern varieties '00' (no erucic acid and low glucosinolates), the napins content is lower than in old varieties '++' (high erucic acid and glucosinolates). The aim of our study is to identify the genetic and molecular bases of the relationship between the glucosinolate and 2S contents in rapeseed.Association genetic analysis identified eight genomic regions controlling both napin and glucosinolate contents. These regions cover nearly 650 genes, seven are described involved in sulfur metabolism pathways and were targeted in this study. In particular, the MYB28 gene, located on chromosome C09, shows a 4-bp insertion polymorphism between the '00' and '++' varieties. Furthermore, MYB28 insertion mutants in Arabidopsis produce seeds with significantly reduced sulfur, glucosinolates and napins contents. These results could provide clues for improving the reserve protein composition of rapeseed.Chez le colza, les protéines de réserve de la graine sont les cruciférines (globulines 12S) et les napines (albumines 2S) qui représentent plus de 70% des protéines totales. Les napines étant plus riches en résidus soufrés et aromatiques que les cruciférines, elles présentent un intérêt supérieur sur le plan nutritionnel. Cependant plusieurs études montrent que chez les variétés modernes de colza, ‘00’, dont les graines sont dépourvues en acide érucique et pauvres en glucosinolates, la teneur en napines est plus faible que chez les variétés anciennes ‘++’. L’objectif de notre étude est d’identifier les bases génétiques et moléculaires de la relation entre la teneur en glucosinolates et en napines dans la graine de colza.Une analyse par génétique d’association a permis d’identifier huit régions génomiques contrôlant à la fois les teneurs en napines et en glucosinolates. Ces régions couvrent près de 650 gènes dont sept sont décrits comme étant impliqués dans les voies du métabolisme soufré et ont été ciblés pour la suite de cette étude. En particulier, le gène MYB28, localisé sur le chromosome C09, montre un polymorphisme d’insertion de 4 pb entre les variétés ‘00’ et ‘++’. Par ailleurs, des mutants d’insertion MYB28 chez Arabidopsis produisent des graines dont les teneurs en soufre, glucosinolates et napines sont significativement réduites. Ces résultats pourraient fournir des pistes pour améliorer la composition en protéines de réserve de la graine de colza

The Arabidopsis proteasome RPT5 subunits are essential for gametophyte development

The Arabidopsis proteasome RPT5 subunits are essential for gametophyte development. Annual Meeting of the Society-for-Experimental-Biolog