An outbreak of trichomonosis in European greenfinches Chloris chloris and European goldfinches Carduelis carduelis wintering in Northern France

Avian trichomonosis is a common and widespread disease, traditionally affecting columbids and raptors, and recently emerging among finch populations mainly in Europe. Across Europe, finch trichomonosis is caused by a single clonal strain of Trichomonas gallinae and negatively impacts finch populations. Here, we report an outbreak of finch trichomonosis in the wintering populations of Chloris chloris (European greenfinch) and Carduelis carduelis (European goldfinch) from the Boulonnais, in northern France. The outbreak was detected and monitored by bird ringers during their wintering bird ringing protocols. A total of 105 records from 12 sites were collected during the first quarter of 2017, with 46 and 59 concerning dead and diseased birds, respectively. Fourteen carcasses from two locations were necropsied and screened for multiple pathogens; the only causative agent identified was T. gallinae. Genetic characterization was performed by four markers (small subunit ribosomal RNA, hydrogenosomal iron-hydrogenase, and RNA polymerase II subunit 1 genes, and the internal transcribed spacers (ITS) region) and confirmed the T. gallinae strain to be A1, which affects the finch populations of Europe. This was also confirmed by an ITS-based phylogenetic analysis which further illustrated the diversity of the Trichomonas infecting birds. Preliminary data on the survival and dispersion of infected birds were obtained from ring-returns of diseased individuals. The anthropogenic spread of diseases through bird feeding practices is highlighted and some suggestions to prevent pathogen transmission via backyard supplementary feeders for garden birds are given

Leucocytozoon cariamae n. sp. and Haemoproteus pulcher coinfection in Cariama cristata (Aves: Cariamiformes): first mitochondrial genome analysis and morphological description of a leucocytozoid in Brazil

The distribution of avian haemosporidians of the genus Leucocytozoon in the Neotropics remains poorly understood. Recent studies confirmed their presence in the region using molecular techniques alone, but evidence for gametocytes and data on putative competent hosts for Leucocytozoon are still lacking outside highland areas. We combined morphological and molecular data to characterize a new Leucocytozoon species infecting a non-migratory red-legged seriema (Cariama cristata), the first report of a competent host for Leucocytozoon in Brazil. Leucocytozoon cariamae n. sp. is distinguished from the Leucocytozoon fringillinarum group by its microgametocytes that are not strongly appressed to the host cell nucleus. The bird studied was coinfected with Haemoproteus pulcher, and we present a Bayesian phylogenetic analysis based on nearly complete mitochondrial genomes of these 2 parasites. Leucocytozoon cariamae n. sp. morphology is consistent with our phylogenetic analysis indicating that it does not share a recent common ancestor with the L. fringillinarum group. Haemoproteus pulcher and Haemoproteus catharti form a monophyletic group with Haemocystidium parasites of Reptilia, supporting the polyphyly of the genus Haemoproteus. We also discussed the hypothesis that H. pulcher and H. catharti may be avian Haemocystidium, highlighting the need to study non-passerine parasites to untangle the systematics of Haemosporida

Description d’

Hepatocystis bainae n. sp. parasite du Microchiroptère de Malaisie, Hipposideros galeritus (Cantor) est décrit et différencié morphologiquement de H. rodhaini. Il est caractérisé par des microgamétocytes de type « diffus », des schizontes hépatiques de petite taille et la répartition de la colloïde

Plasmodium et autres hématozoaires d oiseaux en France ( morphologie, spéciation et données préliminaires de biologie moléculaire)

Notre travail porte sur les Plasmodium de 3 oiseaux sauvages: la pie (P. pica) dont les prélèvements ont été effectués dans plusieurs localités: 2 parcs périurbains parisiens et le zoo de La Palmyre, l alouette des champs (A. arvensis) en migration postnuptiale dans les Landes et la corneille noire (C. corone) également au zoo de La Palmyre. L étude morphologique a révélé un polyparasitisme important par des Plasmodium chez les pies et les alouettes et a permis la description de nouvelles espèces chez les pies (11) et les alouettes (6). Chez les Corvidae ces infections étaient parfois concomitantes avec d autres genres d hématozoaires. Pour expliquer une telle diversité en Plasmodium, nous proposons l hypothèse selon laquelle des spéciations multiples s effectuent chez les vecteurs qui, dans les biotopes favorables, sont abondants et variés. La différence de prévalence de l infection entre pies et alouettes pourrait s expliquer par la biologie des oiseaux et des vecteurs. Le séquençage du gène ARNr 18S des parasites de certains Corvidae, a été réalisé afin de bâtir une phylogénie et de la corréler aux observations morphologiques. Nous avons isolé huit nouveaux types différents parmi ces parasites qui présentent une divergence génétique suffisante pour correspondre à des espèces distinctes. Ce résultat est conforté par la bonne corrélation entre nombre de types et nombre d espèces observées le même jour. De plus, nous avons recherché une infection plasmodiale chez des manchots du Cap (S. demersus) au zoo de La Palmyre, ce qui a permis dépister une infection latente par un Plasmodium d un type identique à l un de ceux mis en évidence dans les Corvidae du même site.PARIS-BIUSJ-Thèses (751052125) / SudocPARIS-BIUSJ-Physique recherche (751052113) / SudocSudocFranceF

<i>Plasmodium</i> (Apicomplexa) de l’alouette des champs (<i>Alauda arvensis</i>)

Trente alouettes (Alauda arvensis) dont certaines étaient porteuses de Plasmodium ont été capturées dans le département des Landes au cours de leur migration postnuptiale. La prévalence est faible (6/30) et la diversité intra-spécifique importante (14 espèces). Cinq espèces sont morphologiquement indistinguables de celles de la pie de la région parisienne : Plasmodium dorsti, P. bioccai, P. ghadiriani, P. dherteae, P. relictum quentini n. subsp. ; deux sont connues d’autres oiseaux : P. rouxi et P. hexamerium. Plasmodium alaudae (Celli &amp; Sanfelice, 1891), est redéfini ici. Enfin, cinq espèces sont nouvelles : P. reniai n. sp., P. coluzzii n. sp., P. caloti n. sp., P. ginsburgi n. sp., P. jeanriouxi n. sp. et une Plasmodium sp. est décrite non nommée. Le parasitisme de l’alouette, oiseau grégaire et migrateur, est comparé à celui de la pie, oiseau solitaire et sédentaire.Plasmodium parasites were sought in 30 skylarks (Alauda arvensis) captured in the Département des Landes (France) during the post-mating migration. Parasite prevalence was low (6/30) while intra-specific diversity was high (14 species). Five species were morphologically indistinguishable from those found in the magpie (Pica pica) from the Paris region: Plasmodium dorsti, P. bioccai, P. ghadiriani, P. dherteae, and P. relictum quentini n. subsp. Two species had been described in other birds: P. rouxi and P. hexamerium. The species Plasmodium alaudae (Celli &amp; Sanfelice, 1891) is redefined in this article. Finally, five new species are described and named: P. reniai n. sp., P. coluzzii n. sp., P. caloti n. sp., P. ginsburgi n. sp. and P. jeanriouxi n. sp., and one, Plasmodium sp. is described but not named. The pattern of infection in the skylark, a migratory gregarious bird, is compared to that of the magpie, a solitary sedentary bird.</p

Description d&#039;une nouvelle espèce d&#039;&lt;i&gt;Eimeria&lt;/i&gt; (Coccidia, Eimeridea) chez le lapin de garenne &lt;i&gt;Oryctolagus cuniculus&lt;/i&gt; en France

Eimeria roobroucki n. sp. a été découverte au cours d’une enquête épidémiologique menée en France, dans six sites différents et pendant une année, sur les coccidies du lapin de garenne. L’espèce a été observée dans cinq sites d’étude : Arjuzanx (Landes), Donzère-Mondragon (Drôme), Massereau (Loire-Atlantique), Gerstheim (Bas-Rhin), île de Béniguet (Archipel de Molène). Les prévalences faibles, variant de 4 à 14 %, sont plus élevées en hiver. Les intensités d’infection sont faibles, variant de 2 à 33 oocystes/g de fèces et sont plus élevées au printemps. L’espèce a des oocystes de grande taille (55 +/- 2,7 x 33,7 +/- 1,3 um) dépourvus de corps résiduel dans l’oocyste et contenant des corps résiduels volumineux dans les sporocystes. Elle se différencie de toutes les autres espèces d’Eimeria Schneider, 1875 d’Oryctolagus Lillejeborg, 1873 et de la plupart des Eimeria de Lepus Linné, 1758 par sa grande taille. Seule E. stefanskii Pastuszko, 1961, parasite de lièvres, est plus grande qu’E. roobroucki n. sp. mais contrairement à celle-ci l’oocyste contient un corps résiduel.Eimeria roobroucki n. sp. was discovered during the course of an epidemiological survey of wild rabbit coccidia performed during one year, in six different study sites in France. The species was found in five areas: Arjuzanx (Landes), Donzère-Mondragon (Drôme), Massereau (Loire-Atlantique), Gerstheim (Bas-Rhin), island of Beniguet (Molène archipelago). Prevalences were low, varying from 4 to 14%, and were maximum during winter. Infection intensities were also low, varying from 2 to 33 oocysts/g of faeces and were maximum during spring. Oocysts are big (55 +/- 2,7 x 33,7 +/- 1,3 um), devoid of residual body and contain large residual bodies inside the sporocysts. E. roobroucki n. sp. differs from all other Eimeria Schneider, 1875 species from Oryctolagus Lillejeborg, 1873 and from most species from Lepus Linné, 1758 by the larger size of its oocysts. E. stefanskii Pastuszko, 1961 from hares is the only species bigger than E. roobroucki n. sp.; however, in contrast with the latter it contains an oocyst residual body.</p

Les &lt;i&gt;Plasmodium&lt;/i&gt; de &lt;i&gt;Lophura&lt;/i&gt; (Phasianidae) : redescription de &lt;i&gt;P. lophurae&lt;/i&gt; Coggeshall, 1938 et description de deux nouvelles espèces

Un nouvel examen des frottis sanguins de Lophura, de Poulets et de Dindons, appartenant aux collections E. Brumpt et P.C.C. Garnham montre la présence de trois espèces distinctes qui avaient été désignées précédemment sous le seul nom de Plasmodium lophurae Coggeshall, 1938. Le travail comprend la redescription de P. lophurae et la description de P. coggeshalli n.sp. et de P. papernai n.sp. Les caractères différentiels reposent essentiellement sur les modifications de la cellule-hôte (déplacement du noyau de la cellule-hôte et/ou déformation de celle-ci), le contour amiboïde ou arrondi du parasite, la présence ou l\u27absence de nombreuses vacuoles cytoplasmiques, le nombre de mérozoïtes des schizontes mûrs, la forme des gamétocytes (ronds ou allongés), la taille, l\u27abondance et la disposition du pigment. Les trois espèces, faciles à différencier par leur morphologie, appartiennent à trois sous-genres différents : P. lophurae appartient au sous-genre Giovannolaia; P. coggeshalli au sous-genre Haemamoeba; P. papernai au sous-genre Novyella.A new examination of blood smears from Lophura and from chickens and turkeys of two collections kept at the Muséum national d\u27Histoire naturelle in Paris (the Brumpt and Garnham collections) was performed. Three different species of Plasmodium which had been previously identified as Plasmodium lophurae Coggeshall, 1938 were detected. P. lophurae was redescribed from this old material and two new species were described and named P. coggeshalli n.sp. and P. papernai n.sp. The three species were separated according to the following main differential morphological characteristics : modifications of the host cell (displacement of the host cell nucleus and/or distortion of the host cell), the amoeboid or smooth outline of the parasite, the presence or absence of numerous cytoplasmic vacuoles, the number of merozoites of mature schizonts, the shape of gametocytes (round or elongate), the size, the abundance and the disposition of the pigment. The three species which can be easily differentiated on morphological grounds belong to three different sub-genera: P. lophurae to subgenus Giovannolaia, P . coggeshalli to subgenus Haemamoeba, P. papernai to subgenus Novyella.</p

Description d'une nouvelle espèce d'Eimeria (Coccidia, Eimeridea) chez le lapin de garenne Oryctolagus cuniculus en France

Grès, Virginie, Marchandeau, Stéphane, Landau, Irène (2002): Description d'une nouvelle espèce d'Eimeria (Coccidia, Eimeridea) chez le lapin de garenne Oryctolagus cuniculus en France. Zoosystema 24 (2): 203-207, DOI: 10.5281/zenodo.539989

Les différents types de gamétocytes chez les Hémosporidies de Mammifères. Corrélations avec la morphologie des schizontes tissulaires. Hypothèses sur l’évolution du groupe

En se fondant sur la morphologie des gamétocytes, les Hémosporidies de Mammifères sont classées en 3 groupes : 1) « vivax », avec Hepatocystis et un premier groupe de Plasmodium ; 2) « malariae », avec Nycteria et un deuxième groupe de Plasmodium ; 3) « falciparum », avec uniquement un troisième groupe de Plasmodium. Dans chaque ensemble, il existe une corrélation entre la morphologie des gamétocytes et celle des schizontes, exo-érythrocytaires. L’hypothèse d’un polyphylétisme des Plasmodium de Mammifères est proposée et discutée en fonction du spectre d’hôtes et de la comparaison entre les cycles des Hémosporidies d’Oiseaux, de Reptiles et de Mammifères