CA3-Classification de l’hépatoblastome par l'étude en microarray du profil d’expression génétique

L'hépatoblastome (HB) est la tumeur hépatique la plus fréquente chez l'enfant, mais c'est une tumeur très rare (environ 10 cas/an en France). L'étiologie de l'HB diffère de celle du carcinome hépatocellulaire par l'absence d'hépatite virale ou de cirrhose, et l'association avec certains syndromes congénitaux comme celui de Beckwith-Wiedermann. L'hépatoblastome se caractérise par la prolifération de cellules épithéliales hépatiques immatures (hépatoblastes embryonnaires ou foetaux), souvent associées à des composants d'origine mésenchymateuse (ostéoïde, chondroïde, adipocytaire) ou même occasionnellement tératoïdes. Cette tumeur pourrait donc trouver son origine à un stade très précoce de la différenciation hépatique. Les traitements actuels (chimiothérapie puis résection chirurgicale) permettent de traiter 75 % de ces cancers. La présence de mutations de la ß-caténine ou de l'axine conduit à l'activation de la voie Wnt dans une large majorité des cas. Notre projet vise à mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la pathogenèse de l'hépatoblastome, en particulier le rôle de l'activation de la voie Wnt/ß-caténine, ainsi qu'à identifier des marqueurs pour le diagnostic et le traitement des tumeurs de mauvais pronostic. Dans ce but, nous avons réuni des échantillons congelés de tumeurs et métastases et les annotations cliniques de 80 malades opérés dans 12 centres français depuis 10 ans. Le profil d'expression génique a été étudié dans 35 échantillons sur puces Affymetrix. L'analyse non supervisée des données a permis une classification hiérarchique des tumeurs en deux groupes : (A) tumeurs localisées d'histologie épithéliale fétale, et (B) tumeurs invasives moins différenciées, de mauvais pronostic. Bien que les mutations de la ß-caténine, présentes dans 75 % des échantillons, ne soient pas corrélées avec les paramètres clinico-pathologiques, les profils d'expression des gènes cibles de la ß-caténine sont remarquablement différents dans les deux classes de tumeurs. Les gènes impliqués dans le métabolisme des acides gras et des acides aminés sont préférentiellement activés dans le groupe A, tandis que les gènes impliqués dans le cycle cellulaire et la prolifération sont surexprimés dans le groupe B. L'étude d'une seconde série de tumeurs par QRT-PCR devrait permettre de valider les signatures moléculaires associées à l'activation de la voie Wnt/ß-caténine, à la réponse à la chimiothérapie, et au pronostic de l'hépatoblastome

Assessing How and Where Biomass Valorisation Can Prevent Fires Starts and Mitigate Hase (Sumatra)

International audienc

Small rover exploration capabilities

International audienc

Implementation of husbandry practices improving quality and sustainability: a living lab approach

International audienceThe living lab approach to innovation is receiving increasing attention also in the agricultural sector in view of thecurrent environmental, economic, and social challenges. This contribution presents some preliminary results ofINTAQT project (EU Horizon 2020), which aims to perform an in- depth multi-criteria assessment of the relationshipsbetween animal husbandry and qualities of products. In specific, this research aims to identify and implement on-farmchanges in the production processes (e.g. feeding regimes, outdoor access, herd management), which are expectedto improve intrinsic quality traits of the products and/or sustainability traits of the farms. A participatory approachwas used to establish farmer field-groups (living labs) representative of the different geographic regions and of themain production systems involved in the project. Each farmer field group involves from 5 to 8 farms. The groups areestablished considering different husbandry systems according to a gradient of intensification (extensive vs intensivesystems): 3 groups for dairy farms (Ireland, northern Italy and France); two groups for beef farms (Switzerland andnorthern Italy); two groups for poultry (France and Italy). The methodological approach is based on 5 steps: (1) tartinganalytical phase: a critical analysis of trade-offs / synergies between sustainability and quality traits for each farmfield group; (2) decision phase: development of practices to improve the identified synergies / mitigate trade-offs; (3)implementation phase: implementation of practices for at least one year. During this time, 2-3 meetings of the wholefarmers group on farms allow farmers discussions about their experiences, successes and drawbacks; (4) concludinganalytical phase: the aim is to analyse the effects of the implementation of the practices during a last meeting in thefarmer’s groups and presentation of the analysis results; (5) scientific data analysis and interpretation. The first resultsof this approach will be presented and discussed. The ambition is to establish a network of living labs usable as pilotand demonstration enterprises regarding practice improvements for better food quality and sustainabilit

A plant-based diet differentially affects the global hepatic methylome in rainbow trout depending on genetic background

Replacing fish meal and oil in trout diets with plant-derived ingredients is a contemporary challenge to move towards more sustainable aquaculture practices. However, such dietary replacement causes hepatic metabolic changes that have not yet been elucidated. Here, we aimed to decipher the effect of a 100% plant-based diet on the hepatic global DNA methylation landscape in trout and assess whether changes depend on fish genetic background. We analysed the global methylome and the expression of DNA (de)methylation-related genes of three isogenic lines that exhibit similar growth when fed a marine resource-based diet (M diet), but differ in their responses to a plant-based diet (V diet). Our results revealed that the V diet induced a decrease in 5-cytosine combined with an increase in 5-hydroxymethylcytosine in two of the three analysed lines. For one of these 2 affected lines, when fed the M diet but at the same feed intake of the V diet (MR), no methylome differences were highlighted between M and MR or between MR and V-fed trout whereas for the other affected line, M fed trout displayed a divergent methylome profile from MR and V fed fish. DNA (de)methylation-related genes were also affected by the V or MR diets. Our findings showed that the global hepatic methylome of trout is affected by a V diet, depending on genetic background. This latter effect seems to be due to either a decreased feed intake alone or combined with the effect of the dietary composition per se

CA3-Classification de l’hépatoblastome par l'étude en microarray du profil d’expression génétique

L'hépatoblastome (HB) est la tumeur hépatique la plus fréquente chez l'enfant, mais c'est une tumeur très rare (environ 10 cas/an en France). L'étiologie de l'HB diffère de celle du carcinome hépatocellulaire par l'absence d'hépatite virale ou de cirrhose, et l'association avec certains syndromes congénitaux comme celui de Beckwith-Wiedermann. L'hépatoblastome se caractérise par la prolifération de cellules épithéliales hépatiques immatures (hépatoblastes embryonnaires ou foetaux), souvent associées à des composants d'origine mésenchymateuse (ostéoïde, chondroïde, adipocytaire) ou même occasionnellement tératoïdes. Cette tumeur pourrait donc trouver son origine à un stade très précoce de la différenciation hépatique. Les traitements actuels (chimiothérapie puis résection chirurgicale) permettent de traiter 75 % de ces cancers. La présence de mutations de la ß-caténine ou de l'axine conduit à l'activation de la voie Wnt dans une large majorité des cas. Notre projet vise à mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la pathogenèse de l'hépatoblastome, en particulier le rôle de l'activation de la voie Wnt/ß-caténine, ainsi qu'à identifier des marqueurs pour le diagnostic et le traitement des tumeurs de mauvais pronostic. Dans ce but, nous avons réuni des échantillons congelés de tumeurs et métastases et les annotations cliniques de 80 malades opérés dans 12 centres français depuis 10 ans. Le profil d'expression génique a été étudié dans 35 échantillons sur puces Affymetrix. L'analyse non supervisée des données a permis une classification hiérarchique des tumeurs en deux groupes : (A) tumeurs localisées d'histologie épithéliale fétale, et (B) tumeurs invasives moins différenciées, de mauvais pronostic. Bien que les mutations de la ß-caténine, présentes dans 75 % des échantillons, ne soient pas corrélées avec les paramètres clinico-pathologiques, les profils d'expression des gènes cibles de la ß-caténine sont remarquablement différents dans les deux classes de tumeurs. Les gènes impliqués dans le métabolisme des acides gras et des acides aminés sont préférentiellement activés dans le groupe A, tandis que les gènes impliqués dans le cycle cellulaire et la prolifération sont surexprimés dans le groupe B. L'étude d'une seconde série de tumeurs par QRT-PCR devrait permettre de valider les signatures moléculaires associées à l'activation de la voie Wnt/ß-caténine, à la réponse à la chimiothérapie, et au pronostic de l'hépatoblastome