Evolutionary history of hepatitis C virus genotype 5a in France, a multicenter ANRS study

The epidemic history of HCV genotype 5a is poorly documented in France, where its prevalence is very low, except in a small central area, where it accounts for 14.2% of chronic hepatitis C cases. A Bayesian coalescent phylogenetic investigation based on the E1 envelope gene and a non-structural genomic segment (NS3/4) was carried out to trace the origin of this epidemic using a large sample of genotype 5a isolates collected throughout France. The dates of documented transmissions by blood transfusion were used to calibrate five nodes in the phylogeny. The results of the E1 gene analysis showed that the best-fitting population dynamic model was the expansion growth model under a relaxed molecular clock. The rate of nucleotide substitutions and time to the most recent common ancestors (tMRCA) of genotype 5a isolates were estimated. The divergence of all the French HCV genotype 5a strains included in this study was dated to 1939 [95% HPD: 1921–1956], and the tMRCA of isolates from central France was dated to 1954 [1942–1967], which is in agreement with epidemiological data. NS3/4 analysis provided similar estimates with strongly overlapping HPD values. Phylodynamic analyses give a plausible reconstruction of the evolutionary history of HCV genotype 5a in France, suggesting the concomitant roles of transfusion, iatrogenic route and intra-familial transmission in viral diffusion

Autoantibodies against type I IFNs in patients with critical influenza pneumonia

In an international cohort of 279 patients with hypoxemic influenza pneumonia, we identified 13 patients (4.6%) with autoantibodies neutralizing IFN-alpha and/or -omega, which were previously reported to underlie 15% cases of life-threatening COVID-19 pneumonia and one third of severe adverse reactions to live-attenuated yellow fever vaccine. Autoantibodies neutralizing type I interferons (IFNs) can underlie critical COVID-19 pneumonia and yellow fever vaccine disease. We report here on 13 patients harboring autoantibodies neutralizing IFN-alpha 2 alone (five patients) or with IFN-omega (eight patients) from a cohort of 279 patients (4.7%) aged 6-73 yr with critical influenza pneumonia. Nine and four patients had antibodies neutralizing high and low concentrations, respectively, of IFN-alpha 2, and six and two patients had antibodies neutralizing high and low concentrations, respectively, of IFN-omega. The patients' autoantibodies increased influenza A virus replication in both A549 cells and reconstituted human airway epithelia. The prevalence of these antibodies was significantly higher than that in the general population for patients 70 yr of age (3.1 vs. 4.4%, P = 0.68). The risk of critical influenza was highest in patients with antibodies neutralizing high concentrations of both IFN-alpha 2 and IFN-omega (OR = 11.7, P = 1.3 x 10(-5)), especially those <70 yr old (OR = 139.9, P = 3.1 x 10(-10)). We also identified 10 patients in additional influenza patient cohorts. Autoantibodies neutralizing type I IFNs account for similar to 5% of cases of life-threatening influenza pneumonia in patients <70 yr old

Bibliographie du sondeur français à diffusion incohérente (1962-1982)

Depuis les premières publications montrant les possibilités d'étude de l'ionosphère par diffusion "incohérente" et l'application de cette théorie au Sondeur Ionosphérique à Diffusion Incohérente (S.I.D.I.) réalisé en France par le CNET, un nombre important de travaux ont été publiés par les différentes équipes concernées. Au fil des années, grâce aux résultats obtenus l'orientation des thèmes de recherche a évolué, l'appareillage a également été modifié. Il a paru intéressant de réunir l'ensemble des travaux publiés depuis 1962. Cette bibliographie a pour but, non seulement de retrouver les caractéristiques techniques de l'instrument mais aussi de suivre l'évolution des thèmes abordés ainsi que de permettre une identification et une utilisation aisées des résultats scientifiques obtenus. A l'origine bistatique, cet instrument, destiné à l'étude de l'ionosphère à moyenne latitude, est devenu quadristatique en 1973 (voir coordonnées des stations en fin de volume). Depuis quelques mois il fonctionne en coordination avec EISCAT (European Incoherent SCATter), sondeur européen quadristatique destiné à l'étude des phénomènes ionosphériques et magnétosphériques à haute latitude. D'autre part, une étude de la mésosphère est également en cours de développement. Cette étude a nécessité la réalisation d'un nouveau système d'émission-réception par codage en phase. Nous présentons les publications sous forme de photocopie de la première page qui comporte le titre de la revue, le résumé de l'article et le ou les noms des auteurs. Chacune des rubriques respecte l'ordre chronologique de publication. Malgré toutes les recherches entreprises, cette bibliographie n'est certainement pas exhaustive ; nous prions donc les lecteurs de bien vouloir nous signaler les oublis, bien entendu involontaires

CARACTERISATION OPTIQUE DE DIFFERENTS TYPES DE NEIGE. EXTINCTION DE LA LUMIERE DANS LA NEIGE

La complexité des particules qui constituent le matériau neige ne permet pas un calcul rigoureux de ses paramètres optiques pour lesquels il est donc nécessaire de recourir à l'expérience. L'extinction de la lumière a été mesurée pour différents types de neige, dont le givre de profondeur, et pour des bandes spectrales allant du visible au proche infra-rouge. Les données expérimentales montrent une nette dépendance envers la taille des cristaux (D) en D-½ et révèlent l'effet de la pollution.The complex ice texture of the snow medium unables an exact calculation of its optical parameters, thus making measurements necessary. Flux extinction has been measured for various snow types, among which depth hoar, and for near infra-red and visible wavelengths. The data collected are strongly depending on grain size (D) as D-½ and on impurity content