Исследование сывороточной микроРНК-122 при гепатите С и ассоциированной с ним гепатоцеллюлярной карциноме

BACKGROUND: The discovery of a cluster of short non-coding RNAs called microRNAs (miRNAs) has become an important event in molecular biology. One of its representatives, miR-122 plays a large role in regulating the expression of genes involved in carbohydrate, lipid metabolism, and iron metabolism in the body. In experimental studies it was shown that in addition to regulatory functions, miR-122 is involved in the pathogenesis of hepatitis C, providing the life cycle of the virus in the cell. The shift of emphasis in the study of miR-122 from basic research into clinical medicine seems to be a promising area of personalized medicine. AIMS: to determine the clinical significance of miR-122 in acute and chronic hepatitis C and associated hepatocellular carcinoma. MATERIALS AND METHODS: A total of 407 people were examined, including 17 patients with acute hepatitis C (AHC), 158 patients with chronic hepatitis C (CHC) and 62 patients with HCC associated with hepatitis C. Comparison groups consisted of 84 healthy individuals and 62 patients with clinically pronounced cirrhosis of a non-infectious etiology. In each cohort, the relative miR-122 level was determined in the blood of patients. The analysis was performed in PCR using the Qubit microRNA Assay Kit -100 for the quantitative determination of microRNAs (Thermo Fisher Scientific, USA). Relative miR-122 expression values were calculated by the formula 2 -CT using U6 snRNA as a reference RNA. RESULTS: The highest miR-122 level in serum was found in patients with AHC at the height of the icteric period. The level of miR-122 showed a direct correlation with the activity of hepatic transaminases in patients with AHC (r = 0.72) and CHC (r = 0.44). An analysis of miR-122 level relative to the degree of liver fibrosis in patients with chronic hepatitis C showed that, as liver fibrosis progresses, the level of miR-122 expression decreases. The decrease in miR-122 expression in patients with severe fibrosis was universal and did not depend on the etiology of the disease. The development of HCC in the presence of chronic hepatitis C was accompanied by a decrease in the level of miR-122 by 10 times on average compared to patients with chronic hepatitis C. CONCLUSIONS: The determination of the expression level of miR-122 in serum can be used in laboratory monitoring of the management of patients with HC as an indicator of the severity of liver damage in AHC and the rate of formation of liver fibrosis in CHC. Evaluation of possibility of using miR-122 as a predictor of the development of HCC in the outcome of HC requires additional studies of the specificity and sensitivity of the test and comparison of the obtained data with the results of using generally accepted protein tumor markers.Обоснование. Открытие кластера коротких некодирующих РНК, получивших название микроРНК (miRNAs), стало важным событием в молекулярной биологии. Один из его представителей ― miR-122 ― играет большую роль в регуляции экспрессии генов, задействованных в углеводном, липидном обмене и метаболизме железа в организме. В экспериментальных исследованиях показано, что помимо регуляторных функций miR-122 участвует в патогенезе гепатита С, обеспечивая жизненный цикл вируса в клетке. Смещение акцентов в изучении miR-122 с фундаментальных исследований в русло клинической медицины представляется перспективным направлением персонализированной медицины. Цель исследования ― определить клиническое значение miR-122 при остром и хроническом течении гепатита С и ассоциированной с ним гепатоцеллюлярной карциноме. Методы. Всего было обследовано 407 человек, в том числе 17 больных острым гепатитом С, 158 ― хроническим гепатитом С и 62 ― гепатоцеллюлярной карциномой, ассоциированной с гепатитом С. Группы сравнения составили 84 практически здоровых человека и 62 больных с клинически выраженным циррозом печени неинфекционной этиологии. В каждой когорте в крови больных было проведено определение относительного уровня miR-122. Анализ осуществляли методом полимеразной цепной реакции с использованием набора реактивов Qubit microRNA Assay Kit-100 для количественного определения микроРНК (Thermo Fisher Scientific, США). Относительные значения экспрессии miR-122 были рассчитаны по формуле 2 -CT с использованием U6 snRNA в качестве референсной РНК. Результаты. Наиболее высокий уровень miR-122 в плазме крови был обнаружен у больных острым гепатитом С в разгар желтушного периода. Уровень miR-122 в крови коррелировал с активностью печеночных трансаминаз у больных острым (r = 0,72) и хроническим (r = 0,44) гепатитом С. Анализ уровня miR-122 относительно степени фиброза печени у больных хроническим гепатитом С показал, что по мере прогрессирования фиброза печени снижается уровень экспрессии miR-122. Снижение экспрессии miR-122 у больных с выраженным фиброзом ― циррозом печени ― носило универсальный характер и не зависело от этиологии заболевания. Развитие гепатоцеллюлярной карциномы сопровождалось падением уровня miR-122 в среднем в 10 раз по сравнению с группой больных хроническим гепатитом С. Заключение. Определение уровня экспрессии miR-122 в крови может использоваться в лабораторном мониторинге ведения больных гепатитом С как показатель тяжести поражения печени при остром течении и скорости прогрессирования фиброза печени при хронических формах. Оценка возможности использования miR-122 в качестве предиктора развития гепатоцеллюлярной карциномы в исходе гепатита С требует проведения дополнительных исследований специфичности и чувствительности теста и сопоставления полученных данных с известными онкомаркерами протеиновой природы

Reaction of parasitoids of social paper wasp Polistes dominula (Christ, 1791) on the mite infestation of the host

In 2003, 2005, 2011–2012 extensiveness and intensity of mite infestation of Sphexicozela connivens Mahunka, 1970 (Acari: Winterschmidtiidae) of social wasp Polistes dominula (Christ, 1791) pupae and adult sexual generation on colonies not infected and infected by parasitoids Latibulus argiolus (Rossi, 1790) (Hymenoptera: Ichneumonidae) and Elasmus schmitti Ruschka, 1920 (Hymenoptera: Eulophidae) were analyzed. It is shown that under the conditions of the Black Sea Biosphere Reserve (Southern Ukraine) the intensity of mite infestation in P. dominula colonies infected by Elasmus schmitti was lower than that in uninfected wasp colonies or colonies with L. argiolus. A negative correlation between intensity and extensiveness of mite infestation and the number (share) of wasp nest cells containing infected E.  schmitti brood was revealed. Mites on the host pupae containing E.  schmitti larvae were not recorded. Such correlations were not revealed in case of L. argiolus. Mites live both on host larvae and parasitoid larvae. Laboratory experiments have shown that E.  schmitti females, unlike L.  argiolus, leave heavily infected by mites wasp nest if they were there by accident. Parasitoids selectivity in regard to mite infestation of wasp host is considered in connection with their biology peculiarities

Charcoal and wood remains for radiocarbon dating Upper Pleistocene loess sequences in Eastern Europe and Central Siberia

The present paper concerns long Upper Pleistocene loess sequences from Eastern Europe with multiple Upper Palaeolithic occupations, rich in charcoal, as well as loess sequences from Central Siberia with abundant wood remains. These complementary records have allowed establishing a high-resolution climatic sequence integrating 24 interstadial episodes between ca 42.5 and 10 kyr BP. Here, we discuss the methodology of dating used to fix the chronological framework of this climatic sequence, based on a set of 240 available radiocarbon dates, mainly produced on charcoal and wood remains. Special attention is paid to the strategy of sampling charcoal and wood material in strict accordance with stratigraphy, as well as to the preparation process in the laboratory for extraction, cleaning, identification and selection of the best fragments to date. Careful stratigraphic drawing and detailed positioning of the samples for each geological layer are also considered in order to clarify the relationship of the obtained dates with respect to any sedimentary, pedological or archaeological event to be dated. The reliability and accuracy of the dates obtained from loess sequences are further controlled by the internal consistency with regard to stratigraphy. Palaeoenvironmental implications are also discussed.