Evidencias del origen de una posible nueva entidad de Dioscorea (Dioscoreaceae) de las Sierras de Calilegua, Jujuy (Argentina). Un enfoque morfo-anatómico

En las Sierras de Calilegua reconocimos siete especies de Dioscorea como parte de su flora y una octava entidad que denominamos Dioscorea sp., la cual evidenció algunos caracteres morfológicos similares a D. glomerulata y D. haumanii, posibles progeni- tores de ésta, dado que comparten el área de distribución en zonas propicias para el fenómeno de hibridación. El objetivo del presente trabajo fue analizar la morfología floral y la morfoanatomía foliar de D. glomerulata, D. haumanii y Dioscorea sp. Se tra- bajó con material fresco y herborizado al que se aplicaron técnicas convencionales. Los resultados evidenciaron que los caracteres morfoanatómicos de Dioscorea sp. no son intermedios a los de sus probables progenitores. El análisis de componentes principales permitió agrupar a los individuos de cada entidad por separado. Por esta razón, podemos concluir que este estudio posiciona a Dioscorea sp. en un lugar estable e independiente

Estudio de la morfología polínica en especies de Berberis (Berberidaceae) del noroeste de Argentina

García, María E.; Nora J. F. Reyes; María L. Espeche; Eva Bulacio; Hugo Ayarde. 2016. “Estudio de la morfología polínica en especies de Berberis (Berberidaceae) del noroeste de Argentina”. Lilloa 53 (1). Se analizó la morfología polínica de cinco especies que habitan las Sierras de Calilegua (Jujuy, Argentina): B. argentinensis Hosseus, B. calilehua Ayarde & Bulacio, B. commutata Eichler, B. jobii Orsi y B. lilloana Job. Las muestras provie- nen de material fresco y fueron procesadas según las técnicas convencionales de acetólisis y polen natural. Se tomaron fotos con microscopio óptico (MO) y microscopio electrónico de barrido (MEB). Los granos son asimétricos, apolares, de ámbito más o menos circular, ta- maño grande (42 a 56 ?m), espiroaperturados, bordes de los colpos irregulares. En algunas especies los colpos dividen a la superficie en placas más o menos poligonales o circulares. En base a estas diferencias se pueden considerar tres grupos: 1) B. argentinensis y B. jobii predominan los granos espiroaperturados, psilados, escasamente perforados, fosulados. 2) B. commutata se manifiestan los dos tipos de aberturas, pero prevalecen los que presentan placas poligonales. La superficie es psilada pero densamente perforada fosulada y 3) B. lilloa- na y en B. calilehua sobresalen los granos que presentan placas poligonales y la superficie es levemente rugulada, densamente fosulada perforada

Multiclass classification of microarray data samples with a reduced number of genes

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Multiclass classification of microarray data samples with a reduced number of genes is a rich and challenging problem in Bioinformatics research. The problem gets harder as the number of classes is increased. In addition, the performance of most classifiers is tightly linked to the effectiveness of mandatory gene selection methods. Critical to gene selection is the availability of estimates about the maximum number of genes that can be handled by any classification algorithm. Lack of such estimates may lead to either computationally demanding explorations of a search space with thousands of dimensions or classification models based on gene sets of unrestricted size. In the former case, unbiased but possibly overfitted classification models may arise. In the latter case, biased classification models unable to support statistically significant findings may be obtained.</p> <p>Results</p> <p>A novel bound on the maximum number of genes that can be handled by binary classifiers in binary mediated multiclass classification algorithms of microarray data samples is presented. The bound suggests that high-dimensional binary output domains might favor the existence of accurate and sparse binary mediated multiclass classifiers for microarray data samples.</p> <p>Conclusions</p> <p>A comprehensive experimental work shows that the bound is indeed useful to induce accurate and sparse multiclass classifiers for microarray data samples.</p

Sélection de systèmes incluant plusieurs classifieurs

Selective multiclassifier systems are proposed for the effective combination of a given population of non specialized classifiers. Their design is based on the introduction of a greedy and error adaptive selection process, which aims to discover a good subset of cooperative classifiers for posterior combination on a parallel form. Without loss of generality, the fuzzy integral combination rule is considered. Experimental results on bench- mark UCI and real data show the feasibility of our approach.Nous proposons une méthode pour sélectionner les classifieurs suivant leur aptitude à coopérer, parmi une population de décideurs non spécialisés. La sélection est basée sur la performance de chacun des individus et sur celle de leur combinaison. La méthode est appliquée sur des jeux de données test (UCI) ainsi que sur nos propres données. Pour ce faire, l'intégrale floue a été choisie comme outil de combinaison. Toute autre technique reste utilisable

Sélection de systèmes incluant plusieurs classifieurs

Selective multiclassifier systems are proposed for the effective combination of a given population of non specialized classifiers. Their design is based on the introduction of a greedy and error adaptive selection process, which aims to discover a good subset of cooperative classifiers for posterior combination on a parallel form. Without loss of generality, the fuzzy integral combination rule is considered. Experimental results on bench- mark UCI and real data show the feasibility of our approach.Nous proposons une méthode pour sélectionner les classifieurs suivant leur aptitude à coopérer, parmi une population de décideurs non spécialisés. La sélection est basée sur la performance de chacun des individus et sur celle de leur combinaison. La méthode est appliquée sur des jeux de données test (UCI) ainsi que sur nos propres données. Pour ce faire, l'intégrale floue a été choisie comme outil de combinaison. Toute autre technique reste utilisable

Comparación de diferentes métodos para la identificación de especies del género Candida Comparison of different methods for species identification of genus Candida

Las diferentes especies del género Candida producen una variedad de enfermedades, desde infecciones mucocutáneas leves a formas diseminadas graves. Tradicionalmente, la taxonomía de las levaduras se ha llevado a cabo en base a estudios morfológicos y fisiológicos, pero éstos dependen de las condiciones de cultivo de las cepas, por lo que se han observado diversas dificultades. Por tal motivo, recientemente, se han probado técnicas de biología molecular. El objetivo de este trabajo es correlacionar los estudios taxonómicos de las especies correspondientes a las principales patógenas: C. albicans, C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis y C. glabrata, realizados por técnicas fenotípicas tradicionales, métodos comerciales y por PCR fingerprinting. Al comparar las técnicas que identifican Candida albicans, agar harina de maíz y formación de tubos germinativos, estadísticamente se observa que no existen diferencias significativas entre ambos métodos (valor de la estadística X2 = 0,5 p = 0,4795). Comparando los métodos que discriminan especies de Candida: pruebas fisiológicas, CHROMagar, API20C y PCR fingerprinting se observó que no existen diferencias significativas en las proporciones de resultados que identifican cualquier Candida entre las pruebas fisiológicas, API20C y PCR fingerprinting. La proporción de resultados definitivos es mayor a la obtenida usando el método CHROMagar (pDifferent species of genus Candida can cause a wide range of pathologies, since mucocutaneous trivial infections to disseminated serious forms. Traditionally, taxonomy of yeast has been performed taking into account morphologic and physiologic studies, but they depend on the culture conditions of strains, what cause certain difficulties. Thus, recently, molecular biology methods have been tried. The aim of this work is to correlate taxonomic studies of most important pathogenic species -C. albicans, C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis and C. glabrata- all of them performed by phenotypic traditional methods, commercial ones, and by a molecular method, PCR fingerprinting. Comparing useful methods for C. albicans identification, corn flour agar and germinative tube formation, no statistical differences between them are observed (X2 =0.5, p=0.4795). By comparison between methods to discriminate different Candida species, physiological tests, CHROMagar, API 20C and PCR fingerprinting we observed no significative differences in proportion of accurate results, in test that can identify any Candida species, such as physiological assays, API 20C and PCR fingerprinting. The proportion of unequivocal results is greater than the obtained performing the CHROMagar culture method (p< 0.001)

Empleo de blanco de calcoflúor para el estudio de las especies de Malassezia por microscopía directa The use of calcofluor white for identification of Malassezia species

Las especies del género Malassezia integran la flora habitual del ser humano, pero en ocasiones, causan diversas afecciones. Durante mucho tiempo, el diagnóstico temprano se vio demorado por la dificultad de obtener los cultivos de estos hongos. El objetivo de este trabajo es evaluar las ventajas del empleo de la microscopía de fluorescencia con blanco de calcoflúor para la observación de especies de Malassezia, tanto de material extraído de los pacientes, como de los cultivos. La técnica de fluorescencia ofrece, en comparación con la coloración tradicional de azul de lactofenol, la ventaja de facilitar además de la observación de los elementos fúngicos, observar el patrón de brotación de estos organismos, útil para la identificación. El análisis de materiales clínicos con la coloración de blanco de calcoflúor y posterior observación con microscopio de fluorescencia, resulta entonces un método sencillo y rápido para la identificación presuntiva y contribuye, por lo tanto, al diagnóstico temprano.Fungi of Malassezia genus are known as normal flora in human beings. However, different pathologies due to Malassezia, have been described. Traditionally, early diagnosis was delayed because of the difficulties in culture isolation of these organisms. The aim of this work, is to evaluate the technique of observation microscopy with calcofluor, for identification of Malassezia in both, clinical samples and isolates. In comparison to traditional method of direct examination with lactophenol-blue, calcofluor method offers an advantage because it turns easier the observation of fungal elements and its budding pattern. This technique contributes then, to identify species of Malassezia. The analysis of clinical specimens with calcofluor followed by observation under fluorescence microscopy is a simple and rapid method for the identification, and contribute therefore to the early diagnosis