Повернення в Ніжин (корпус документів з епістолярію І.Г. Спаського)

Підготовка до друку та переднє слово Наталії ДМИТРЕНКО (Ніжин), коментарі Сергія ЗОЗУЛІ (Київ–Ніжин): Уперше вводиться до наукового обігу корпус джерел з епістолярію українського та російського радянського історика-нумізмата, музейника І.Г. Спаського. Корпус джерел який містить кореспонденцію, отриману відомим науковцем від кореспондентів-ніжинців, і де, здебільшого, відображена “ніжинська тематика” – проблеми збереження культурної спадщини Ніжина, післявоєнного розвитку міста тощо.Подготовка к печати и предисловие Наталии ДМИТРЕНКО (Нежин), комментарии Сергея ЗОЗУЛИ (Киев–Нежин): Впервые вводится в научный оборот корпус источников из эпистолярия украинского и российского советского историка-нумизмата, музейщика И.Г. Спасского. Корпус источников содержит корреспонденцию, полученную известным ученым от корреспондентов-нежинцев, и в котором преимущественно отображена “нежинская тематика” – проблемы сохранения культурного наследия Нежина, послевоенного развития города и т.п.Preparation to the print and preface of Nataliya DMYTRENKO (Nizhyn), comments of Serhiy ZOZULYA (Kyiv–Nizhyn): The corps of sources from the epistolary legacy of the Ukrainian and Russian soviet historiannumismatist and museum worker I.G. Spas’kiy is entered to the scientific appeal in the first time. This corps of sources contains correspondence got the known scientist from Nizhynians and contains mostly “Nizhyn themes” – problems of protect of Nizhyn’s cultural legacy, post-war development of this town etc

Robust detection of translocations in lymphoma FFPE samples using targeted locus capture-based sequencing

Preservation of cancer biopsies by FFPE introduces DNA fragmentation, hindering analysis of rearrangements. Here the authors introduce FFPE Targeted Locus Capture for identification of translocations in preserved samples.In routine diagnostic pathology, cancer biopsies are preserved by formalin-fixed, paraffin-embedding (FFPE) procedures for examination of (intra-) cellular morphology. Such procedures inadvertently induce DNA fragmentation, which compromises sequencing-based analyses of chromosomal rearrangements. Yet, rearrangements drive many types of hematolymphoid malignancies and solid tumors, and their manifestation is instructive for diagnosis, prognosis, and treatment. Here, we present FFPE-targeted locus capture (FFPE-TLC) for targeted sequencing of proximity-ligation products formed in FFPE tissue blocks, and PLIER, a computational framework that allows automated identification and characterization of rearrangements involving selected, clinically relevant, loci. FFPE-TLC, blindly applied to 149 lymphoma and control FFPE samples, identifies the known and previously uncharacterized rearrangement partners. It outperforms fluorescence in situ hybridization (FISH) in sensitivity and specificity, and shows clear advantages over standard capture-NGS methods, finding rearrangements involving repetitive sequences which they typically miss. FFPE-TLC is therefore a powerful clinical diagnostics tool for accurate targeted rearrangement detection in FFPE specimens.Immunobiology of allogeneic stem cell transplantation and immunotherapy of hematological disease

Regulation of translesion synthesis polymerases during somatic hypermutation and DNA damage tolerance

Ons afweersysteem bestaat uit veel verschillende type cellen, zoals B-cellen, die als doel hebben lichaamsvreemde stoffen (anti-gen) zoals virussen te verwijderen uit ons lichaam. Deze B-cellen herkennen een anti-gen met behulp van een eiwit op de buitenkant van de B-cel, de B-cel receptor. Door mutaties te introduceren in het DNA dat codeert voor deze receptor, kan een B-cel de receptor optimaliseren en de affiniteit voor een antigen vergroten. Peter Krijger onderzocht hoe deze mutaties geïntroduceerd worden. Hij toont aan dat modificatie van het eiwit PCNA essentieel is voor de helft van de mutaties die geïntroduceerd worden tijdens een afweerreactie. Hij concludeert ook dat PCNA-modificatie belangrijk is voor cellen om te kunnen overleven, nadat ze blootgesteld zijn aan stoffen die DNA schade veroorzaken zoals UV-licht

PCNA ubiquitination-independent activation of polymerase eta during somatic hypermutation and DNA damage tolerance

Replication associated mutagenesi