Recorriendo las tramas institucionales del cuidado: Investigación colaborativa en torno al cuerpo y el cuidado

Este proyecto representa una profundización en la línea investigativa en torno al cuidado y el cuerpo. Esta vez dirigiendo la mirada hacia las tramas institucionales, viendo cómo se tejen los descuidos, así como el gran potencial de los espacios, propuestas y políticas de cuidado. Es una apuesta a seguir investigando de modo colaborativo, participativo y cuidadoso, en la que quienes sostenemos los procesos investigativos somos parte de la escena en cuestión. Trabajamos inicialmente con el Consejo Provincial del Niño, el Adolescente y la Familia (Copnaf), con trabajadores de tres residencias socio educativas. Más allá de los desafíos que esto implicaba, el atravesamiento innegable de la pandemia COVID-19 nos obligó a repensar acciones y localizaciones. Presentamos lo investigado junto a esos trabajadores y las dificultades en dicho proceso, así como lo investigado en las tramas institucionales del propio equipo universitario. También mantuvimos un espacio de investigación abierto en la Facultad de Trabajo Social de la Universidad Nacional de Entre Ríos (UNER), primero presencial y luego virtual. En este recorrido aparecieron varios tópicos respecto al cómo y a los modos del cuidado, lo que nos llevó a recorrer dimensiones como el amor-amorosidad, la disponibilidad afectiva, la tensegridad de la trama, los gestos y rituales, así como el poder reconocer en el propio espacio de investigación la posibilidad de explorar formas de cuidado. ARK/CAICYT: http://id.caicyt.gov.ar/ark:/s22504559/k2khuf4a

Дифференциация пород домашних свиней c использованием расширенного биоинформатического анализа SNP

Using the methods of bioinformatics, the analysis of data on sequencing of the genomes of individuals of the species Sus scrofa domesticus, which are located in the Sequence Read Archive (NCBI-SRA) database, was carried out. Genotypes were determined in silico for five breeds of domestic pigs – Duroc, Landrace, Pietrain, Large White and Yorkshire using an algorithm developed in the Python programming language. Based on a two-stage bioinformatics analysis, a wide range of SNPs with a high potential for differentiation was identified. The results obtained will be used to create express methods for determining the purity of pigs of these breeds. Extended bioinformatics analysis, which included genotyping by 7451 SNPs for 248 Sus scrofa domesticus genomes, revealed a total of 393 SNPs for all breeds for which there is a significant difference in the frequency of alternative alleles in Duroc, Landrace, Pietrain, Large White and Yorkshire pig breeds. Clusters within chromosomes are indicated, in which the density of SNPs with a high differentiating potential is the highest. For Duroc pigs, we identified 184 SNPs with differentiating potential, 24 of which showed a high differentiating potential, for Landrace pigs – 52 SNPs and 7, for Pietrain pigs – 39 and 9, for Large White pigs – 104 and 22, for Yorkshire pigs – 14 and 5, respectively.С использованием методов биоинформатики проведен анализ данных по секвенированию геномов особей вида Sus scrofa domesticus, которые расположены в базе Sequence Read Archive (NCBI-SRA). Определены in silico генотипы для пяти пород домашних свиней – дюрок, ландрас, пьетрен, крупная белая и йоркшир с помощью алгоритма, разработанного на языке программирования Python. На основании двухстадийного биоинформатического анализа определен широкий перечень SNP c высоким потенциалом для дифференциации. Полученные результаты будут использованы при создании экспресс-методов для определения чистопородности свиней данных пород. Расши ренный биоинформатический анализ, который включал в себя определение генотипа по 7451 SNP для 248 геномов Sus scrofa domesticus, позволил выявить суммарно 393 SNP для всех пород, для которых имеется существенная разница в частоте альтернативных аллелей у пород свиней дюрок, ландрас, пьетрен, крупная белая и йоркшир. Обозначены кластеры в пределах хромосом, в которых плотность SNP с высоким дифференцирующим потенциалом наиболее высока. Для свиней породы дюрок нами выявлены 184 SNP, имеющие дифференцирующий потенциал, для 24 из которых показан высокий дифференцирующий потенциал, для свиней породы ландрас – 52 SNP и 7, для свиней породы пьетрен – 39 и 9, для свиней породы крупная белая – 104 и 22, для свиней породы йоркшир – 14 и 5 соответственно

Анализ полиморфизма генов KDM3A и DBX2 для дифференциации свиней породы дюрок вида Sus scrofa domesticus

Genotyping of individuals of 7 commercial breeds of domestic pigs was carried out: Duroc, Landrace, Belarusian Large White, Belarusian Black-and-White, Belarusian meat, Pietrain and Yorkshire for the KDM3A and DBX2 genes. The high breed-specific potential of polymorphic loci g.58335217A>G (KDM3A gene) and g.75953650G>T (DBX2 gene) for differentiation of Duroc pigs of the species Sus scrofa domesticus was confirmed. A test model for differentiation of Duroc individuals by bioinformatic assessment of a total contribution of two SNPs of the KDM3A and DBX2 genes was proposed. This test model has no analogues in the world, and its estimation accuracy and specificity are 98.76 and 99.68 %, respectively. Using PCR-RFLP, a fast and simple approach has been developed to differentiate the Duroc breed based on the proposed test model. Проведено генотипирование особей 7 коммерческих пород домашних свиней: дюрок, ландрас, белорусская крупная белая, белорусская черно-пестрая, белорусская мясная, пьетрен и йоркшир по генам KDM3A и DBX2. Подтвержден высокий породоспецифичный потенциал полиморфных локусов g.58335217A>G (ген KDM3A) и g.75953650G>T (ген DBX2) для дифференциации свиней породы дюрок вида Sus scrofa domesticus. Предложена тест-модель для дифференциации особей породы дюрок по биоинформатической оценке совокупного вклада двух SNP генов KDM3A и DBX2. Данная тест-модель не имеет мировых аналогов, а точность ее оценки и специфичности составляет 98,76 и 99,68 % соответственно. С использованием ПЦР-ПДРФ разработан быстрый и простой подход для дифференциации породы дюрок на основании предложенной тест-модели.

Биоинформатический анализ геномов коммерческих пород домашних свиней для идентифи- кации породоспецифичных SNP

Determining the purebredity of farm animals in a breeding system is of key importance for the entire livestock industry. Purebred breeding of plant breeds is designed to ensure the production of high-value improving breeding material for commercial livestock breeding. Determination of purebredity of pigs can be carried out using single nucleotide polymorphisms (SNP). The multiplexing technology today has reached a level that makes it possible to characterize tens and hundreds of thousands of polymorphic variants simultaneously for hundreds of animals in one run of the device. For the first time, using bioinformatics methods, an analysis of genome-wide projects was carried out for 264 individuals of the species Sus scrofa located in the Sequence Read Archive (NCBI-SRA). The in silico genotype was determined for 692 SNPs, of which 59 SNPs showed a significant potential for differentiation of four commercial breeds: large white (the most significant SNPs are Chr. 6: g.85845403T> G and Chr.16: g.74053569T> C), duroc (Chr. 4: g.55661608A> G, Chr. 14: g.107689091T> C and Chr. 14: g.107939105T> C), landrace (Chr. 5: g.99925204A> G, Chr. 18: g .40100481A> G and Chr. 18: g.7664624A> G) and pietrain (Chr. 13: g.136017764T> C and Chr.17: g.47595840A> G). For breeds of duroc and pietrain pigs, the accuracy of differentiation was at least 99%, for breeds of large white and landrace pigs - over 80%, however, the sensitivity indicator characterizing the percentage of false positive results of classification was slightly over 65%. Creation of models for molecularand-genetic studies of these breeds will allow for a genetic examination of their purebredity, which will contribute to an increase in their breeding value and preservation of the national gene pool.Определение чистопородности сельскохозяйственных животных в селекционной системе имеет ключевое значение для всей отрасли животноводства. Чистопородное разведение заводских пород призвано обеспечить производство высокоценного улучшающего племенного материала для товарного животноводства. Определение чистопородности свиней может быть проведено с использованием однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Технология мультиплексирования сегодня достигла уровня, который позволяет за один запуск прибора охарактеризовать десятки и сотни тысяч полиморфных вариантов одновременно для сотен животных. Впервые с использованием методов биоинформатики проведен анализ полногеномных проектов для 264 особей вида Sus scrofa, расположенных в базе Sequence Read Archive (NCBI-SRA). Определен in silico генотип для 692 SNP, из которых для 59 SNP показан значительный потенциал для дифференциации четырех коммерческих пород: крупная белая (наиболее значимые SNP – Chr.6:g.85845403T>G и Chr.16:g.74053569T>C), дюрок (Chr.4:g.55661608A>G, Chr.14:g.107689091T>C и Chr.14:g.107939105T>C), ландрас (Chr.5:g.99925204A>G, Chr.18:g.40100481A>G и Chr.18:g.7664624A>G) и пьетрен (Chr.13:g.136017764T>C и Chr.17:g.47595840A>G). Для пород свиней дюрок и пьетрен точность дифференциации была не менее 99 %, для пород свиней крупная белая и ландрас – более 80 %, однако показатель чувствительности, характеризующий процент ложноположительных результатов классификации, был немногим более 65 %. Создание моделей для молекулярно-генетических исследований данных пород позволит проводить генетическую экспертизу их чистопородности, что будет способствовать возрастанию их племенной ценности и сохранению национального генофонда

Inflammatory Rheumatic Disorders and Bone

Inflammatory joint diseases such as rheumatoid arthritis, as well as other rheumatic conditions, such as systemic lupus erythematosus (SLE) and ankylosing spondylitis, comprise a heterogeneous group of joint disorders that are all associated with extra-articular side effects, including bone loss and fractures. The concept of osteoimmunology is based on growing insights into the links between the immune system and bone. The pathogenesis of osteoporosis in these patients is multifactorial. We have, more or less as an example, described this extensively for patients with SLE. High disease activity (inflammation) and immobility are common factors that substantially increase fracture risk in these patients, on top of the background fracture risk based on, among other factors, age, body mass index, and gender. Although no fracture reduction has been shown in intervention studies in patients with inflammatory rheumatic diseases, we present treatment options that might be useful for clinicians who are treating these patients

Генетическая структура популяции карпа (Cyprinus carpio carpio), выращиваемого в аквакультуре в Республике Беларусь

In this study, we presented a panel of 14 microsatellite loci (MFW1, MFW2, MFW6, MFW9, MFW10, MFW11, MFW13, MFW16, MFW20, MFW24, MFW26, MFW28, MFW29 and Cid0909), with which we studied the genetic structure of Cyprinus carpio carpio of the breed “Izobelinsky” in the Republic of Belarus. Four offshoots of carp were included in the study: two mirrory (“Smes’ zerkal’naya”, “Tri prim”) and two scaly (“Smes’ cheshujchataya”, “Stolin XVIII”).As a result, it was found that the carp breed “Izobelinsky” exhibits a high level of in-breed genetic variability. In the studied microsatellite loci, 231 alleles were identified, 62 % of the total number of alleles were rare alleles with a frequency of occurrence of less than 5.0 %. The number of effective alleles (Ne) at the loci ranged from 3.082 (MFW10) to 9.754 (MFW26). The Shannon biodiversity index (I) was 2.082 ± 0.075. The highest value of the expected heterozygosity index (He) was noted for the MFW26 locus (0.897), the lowest – for the MFW10 locus (0.676).The greatest genetic diversity is characteristic of the scaly carp “Smes’ cheshujchataya” and “Stolin XVIII”. The highest total percentage of rare alleles was determined for fishes from “Stolin XVIII”. The minimum values of this parameter were found for specimens of the carp “Smes’ zerkal’naya” and “Tri prim”.The results of this study indicate a fairly high genetic diversity of four offshoots of the carp breed “Izobelinsky”, which was established using the marker loci optimally selected for analysis. This makes it possible to differentiate the layering among themselves.Представлена панель из 14 микросаттелитных локусов (MFW1, MFW2, MFW6, MFW9, MFW10, MFW11, MFW13, MFW16, MFW20, MFW24, MFW26, MFW28, MFW29 и Cid0909), с помощью которых изучена генетическая структура карпа (Cyprinus carpio carpio) породы «Изобелинский», разводимой на территории Республики Беларусь. В исследование включены четыре отводки: две зеркальные («Смесь зеркальная», «Три прим») и две чешуйчатые («Смесь чешуйчатая», «Столин XVIII»).Установлено, что порода карпа «Изобелинский» обнаруживает высокий уровень внутрипородной генетической вариабельности. В исследованных микросателлитных локусах идентифицирован 231 аллель, причем 62 % от общего количества аллелей составляли редкие аллели с частотой встречаемости менее 5,0 %. Число эффективных аллелей (Ne) в локусах варьировало от 3,082 (MFW10) до 9,754 (MFW26). Индекс биоразнообразия Шеннона (I) составил 2,082 ± 0,075. Наибольшее значение показателя ожидаемой гетерозиготности (Hе) отмечено для локуса MFW26 (0,897), наименьшее – для локуса MFW10 (0,676).Обнаружено, что большее генетическое разнообразие характерно для чешуйчатых отводок карпа «Смесь чешуйчатая» и «Столин XVIII». Наибольший суммарный процент редких аллелей определен для особей из отводки «Столин  XVIII». Минимальные значения данного параметра выявлены для особей  зеркального  карпа  отводок «Смесь зеркальная» и «Три прим».Результаты свидетельствуют о достаточно высоком генетическом разнообразии четырех изученных отводок породы карпа «Изобелинский», установленном с помощью оптимально подобранных для анализа маркерных локусов, что дает возможность дифференцировать отводки между собой

Is exposure to formaldehyde in air causally associated with leukemia?—A hypothesis-based weight-of-evidence analysis

Recent scientific debate has focused on the potential for inhaled formaldehyde to cause lymphohematopoietic cancers, particularly leukemias, in humans. The concern stems from certain epidemiology studies reporting an association, although particulars of endpoints and dosimetry are inconsistent across studies and several other studies show no such effects. Animal studies generally report neither hematotoxicity nor leukemia associated with formaldehyde inhalation, and hematotoxicity studies in humans are inconsistent. Formaldehyde's reactivity has been thought to preclude systemic exposure following inhalation, and its apparent inability to reach and affect the target tissues attacked by known leukemogens has, heretofore, led to skepticism regarding its potential to cause human lymphohematopoietic cancers. Recently, however, potential modes of action for formaldehyde leukemogenesis have been hypothesized, and it has been suggested that formaldehyde be identified as a known human leukemogen. In this article, we apply our hypothesis-based weight-of-evidence (HBWoE) approach to evaluate the large body of evidence regarding formaldehyde and leukemogenesis, attending to how human, animal, and mode-of-action results inform one another. We trace the logic of inference within and across all studies, and articulate how one could account for the suite of available observations under the various proposed hypotheses. Upon comparison of alternative proposals regarding what causal processes may have led to the array of observations as we see them, we conclude that the case fora causal association is weak and strains biological plausibility. Instead, apparent association between formaldehyde inhalation and leukemia in some human studies is better interpreted as due to chance or confounding