Caught in the act: In situ visualization of bacterial secretion systems by cryo‐electron tomography

International audienceBacterial secretion systems, such as the type 3, 4, and 6 are multiprotein nanomachines expressed at the surface of pathogens with Gram‐negative like envelopes. They are known to be crucial for virulence and to translocate bacteria‐encoded effector proteins into host cells to manipulate cellular functions. This facilitates either pathogen attachment or invasion of the targeted cell. Effector proteins also promote evasion of host immune recognition. Imaging by cryo‐electron microscopy in combination with structure determination has become a powerful approach to understand how these nanomachines work. Still, questions on their assembly, the precise secretion mechanisms, and their direct involvement in pathogenicity remain unsolved. Here, we present an overview of the recent developments in in situ cryo‐electron microscopy. We discuss its potential for the investigation of the role of bacterial secretion systems during the host‐bacterial crosstalk at the molecular level. These in situ studies open new perspectives for our understanding of secretion system structure and function

Table Ronde. Recherche & Conchyliculture #1 2022

Les coquillages vivent au contact de l’eau et des sédiments, dans lesquels ils trouvent leur nourriture (plancton, matières en suspension). En filtrant l’eau, ils peuvent concentrer dans leurs tissus des micro-organismes (bactéries, virus), mais également du phytoplancton toxique ainsi que des contaminants chimiques. Ces contaminants, qui peuvent être naturellement présents dans le milieu ou apportés par les bassins-versants, génèrent potentiellement des risques microbiologiques, phycotoxiniques et chimiques pour la santé des consommateurs. Dès 1913, à la suite d’intoxications alimentaires, des restaurateurs parisiens ont organisé les premiers contrôles sanitaires. Progressivement, plusieurs réseaux ont été mis en place pour assurer la surveillance des différentes sources de risque (bactérie, toxines, chimie, etc.), évoluant au cours du temps et de la réglementation. Dès les années 1920, l’Office scientifique et technique des pêches maritimes (OSTPM), devenu aujourd’hui l’IFREMER, s’empare de la surveillance. Même si la cartographie des réseaux de surveillance sanitaire semble complexe, chacun a sa spécificité : - Le REMI assure la surveillance microbiologique : son objectif est d’évaluer la qualité des zones de production de coquillages et de détecter et suivre les épisodes inhabituels de contamination. Les résultats permettent une gestion de la zone par les services de l’État (fermetures quand il y a contamination par exemple). - Le REPHY Sanitaire surveille la présence du phytoplancton toxique dans le milieu - Le REPHYTOX recherche dans les coquillages les phycotoxines produites par ce phytoplancton - Le ROCCH suit les contaminants chimiques dans le milieu Au-delà de l’aspect sanitaire (et alerte éventuelle), ces réseaux de surveillance apportent des connaissances importantes pour comprendre le fonctionnement et l’évolution des écosystèmes littoraux (REPHY et ROCCH), nourrissant de nombreux travaux de recherche. Enfin, grâce au réseau SIPEN et aux missions du Cépralmar effectuées dans le cadre du Réseau d’Observation Lagunaire (ROL), la performance (mortalité, croissance, taux de remplissage) des coquillages d’élevage est également suivie

Development of a single-stranded DNA-binding protein fluorescent fusion toolbox

© The Author(s) 2020. Published by Oxford University Press on behalf of Nucleic Acids Research. Bacterial single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) bind single-stranded DNA and help to recruit heterologous proteins to their sites of action. SSBs perform these essential functions through a modular structural architecture: the N-terminal domain comprises a DNA binding/tetramerization element whereas the C-terminus forms an intrinsically disordered linker (IDL) capped by a protein-interacting SSB-Ct motif. Here we examine the activities of SSB-IDL fusion proteins in which fluorescent domains are inserted within the IDL of Escherichia coli SSB. The SSB-IDL fusions maintain DNA and protein binding activities in vitro, although cooperative DNA binding is impaired. In contrast, an SSB variant with a fluorescent protein attached directly to the C-terminus that is similar to fusions used in previous studies displayed dysfunctional protein interaction activity. The SSB-IDL fusions are readily visualized in single-molecule DNA replication reactions. Escherichia coli strains in which wildtype SSB is replaced by SSB-IDL fusions are viable and display normal growth rates and fitness. The SSB-IDL fusions form detectible SSB foci in cells with frequencies mirroring previously examined fluorescent DNA replication fusion proteins. Cells expressing SSB-IDL fusions are sensitized to some DNA damaging agents. The results highlight the utility of SSB-IDL fusions for biochemical and cellular studies of genome maintenance reactions

Cardiac inflammatory CD11b/c cells exert a protective role in hypertrophied cardiomyocyte by promoting TNFR2- and Orai3- dependent signaling

International audienceAbstract Early adaptive cardiac hypertrophy (EACH) is initially a compensatory process to optimize pump function. We reported the emergence of Orai3 activity during EACH. This study aimed to characterize how inflammation regulates store-independent activation of Orai3-calcium influx and to evaluate the functional role of this influx. Isoproterenol infusion or abdominal aortic banding triggered EACH. TNFα or conditioned medium from cardiac CD11b/c cells activated either in vivo [isolated from rats displaying EACH], or in vitro [isolated from normal rats and activated with lipopolysaccharide], were added to adult cardiomyocytes before measuring calcium entry, cell hypertrophy and cell injury. Using intramyocardial injection of siRNA, Orai3 was in vivo knockdown during EACH to evaluate its protective activity in heart failure. Inflammatory CD11b/c cells trigger a store-independent calcium influx in hypertrophied cardiomyocytes, that is mimicked by TNFα. Pharmacological or molecular (siRNA) approaches demonstrate that this calcium influx, depends on TNFR 2 , is Orai3-driven, and elicits cardiomyocyte hypertrophy and resistance to oxidative stress. Neutralization of Orai3 inhibits protective GSK3β phosphorylation, impairs EACH and accelerates heart failure. Orai3 exerts a pathophysiological protective impact in EACH promoting hypertrophy and resistance to oxidative stress. We highlight inflammation arising from CD11b/c cells as a potential trigger of TNFR 2 - and Orai3-dependent signaling pathways

Cardiac inflammatory CD11b/c cells exert a protective role in hypertrophied cardiomyocyte by promoting TNFR2- and Orai3- dependent signaling

Abstract Early adaptive cardiac hypertrophy (EACH) is initially a compensatory process to optimize pump function. We reported the emergence of Orai3 activity during EACH. This study aimed to characterize how inflammation regulates store-independent activation of Orai3-calcium influx and to evaluate the functional role of this influx. Isoproterenol infusion or abdominal aortic banding triggered EACH. TNFα or conditioned medium from cardiac CD11b/c cells activated either in vivo [isolated from rats displaying EACH], or in vitro [isolated from normal rats and activated with lipopolysaccharide], were added to adult cardiomyocytes before measuring calcium entry, cell hypertrophy and cell injury. Using intramyocardial injection of siRNA, Orai3 was in vivo knockdown during EACH to evaluate its protective activity in heart failure. Inflammatory CD11b/c cells trigger a store-independent calcium influx in hypertrophied cardiomyocytes, that is mimicked by TNFα. Pharmacological or molecular (siRNA) approaches demonstrate that this calcium influx, depends on TNFR2, is Orai3-driven, and elicits cardiomyocyte hypertrophy and resistance to oxidative stress. Neutralization of Orai3 inhibits protective GSK3β phosphorylation, impairs EACH and accelerates heart failure. Orai3 exerts a pathophysiological protective impact in EACH promoting hypertrophy and resistance to oxidative stress. We highlight inflammation arising from CD11b/c cells as a potential trigger of TNFR2- and Orai3-dependent signaling pathways

Écrits philosophiques

Première édition critique de l'oeuvre de BergsonDistincts de ses livres, jalonnant les intervalles entre ses livres, édités comme ses livres dont il faut toujours repartir mais philosophiques aussi en eux-mêmes, riches d'une variété et de surprises innombrables (de la thèse latine aux messages ultimes en passant par essais et discours), tissés de rencontres singulières et de relations suivies (ainsi avec James, Jankélévitch ou Péguy) tels sont les Écrits philosophiques de Bergson réunis dans ce volume nouveau. Celui-ci achève donc l'édition critique de ses Œuvres, y renvoie de mille façons, et l'ouvre sur son moment comme sur le nôtre, aujourd'hui. Le présent volume s'inscrit dans le cadre de la première édition critique des œuvres de Bergson dont il reprend le double principe : offrir d'abord le texte intégral de référence des écrits de Bergson, ici répartis chronologiquement autour des dates de parution de ses livres, le compléter ensuite par un dossier comportant des présentations, des notes historiques et philosophiques ainsi que les variantes éventuelles, une anthologie de " lectures ", une bibliographi

Sur le vif. Photographie et anthropologie

L’histoire de l’anthropologie et celle de la photographie sont étroitement liées depuis leur apparition quasi simultanée au XIXe siècle. Mais force est de constater la relative absence de travaux portant sur les pratiques, les usages et plus généralement l’histoire des « images » de l’anthropologie dans l’entre-deux-guerres, période pendant laquelle l’institutionnalisation de la discipline va de pair avec l’essor d’une modernité photographique. Or, les archives d’ethnologues montrent aujourd’hui l’importance de la pratique photographique sur le terrain, l’apparition d’appareils légers comme le Leica et celle du genre du photoreportage, les ayant influencés et séduits. Leurs carnets de l’époque contiennent souvent de nombreuses photos, des collections muséales se constituent et des réseaux de diffusion visuels variés débordent le cadre strictement scientifique. Par ailleurs, la réutilisation de la photographie de « types » physiques, encore très courante, illustre la tension entre la permanence de schèmes visuels hérités de l’anthropologie physique du XIXe siècle et la volonté d’une science moderne de remettre en question l’existence des races. Ce numéro interroge aussi les enjeux techniques et financiers de conservation, de classement et d’archivage ainsi que le traitement éditorial des images parfois révélateur de tensions entre les logiques scientifique, économique et esthétique. Il fait le point sur les enjeux que présente la photographie en anthropologie dans l’entre-deux-guerres, en abordant différentes traditions nationales et aires géographiques et propose de questionner le geste photographique en tant que geste scientifique, car les images font partie intégrante de l’histoire de la discipline, à l’instar des grands textes classiques