Penetrating Crohn’s disease – adult vs pediatric patients

Crohn’s disease (CD) is increasing in prevalence worldwide, especially with young people. Magnetic resonance enterography (MRE) differs from routine magnetic resonance imaging (MRI) by oral administration of neutral fluid contrast before scanning. It allows for recognising and monitoring changes during therapy as well as assessing complications, which makes it valuable diagnostic modality

First-line ultrasound assessment of penetrating Crohn’s disease in pediatric patients

Introduction: Crohn’s disease is classified as chronic inflammatory bowel disease. The incidence in Europe ranges from 1 to almost 11.4 per 100,000 population per year. Ultrasound examination plays an important role in imaging diagnostics of inflammatory bowel lesions. It allows for assessing response to therapy as well as recognizing possible penetrating complications of the disease, i.e. fistula or abscess

Comparison of Magnetic Resonance Enterography Findings and Clinical Index of the Disease Activity Score in Crohn\u27s Disease

Introduction Crohn\u27s disease (CD) is a chronic inflammatory disease of the gastrointestinal tract. It usually affects younger people, with the peak of illness between the age of 15 and 25. MR enterography (MRE) is a proven and reliable modality in the evaluation of the lesion extent within this group of patients

Obtaining aza-BODIPY derivatives by the reaction of phthalonitriles with a Grignard reagent

Pierwsze wzmianki o barwnikach aza-BODIPY pojawiły się w literaturze prawie 75 lat temu. Struktura aza-BODIPY składa się z dwóch pierścieni pirolowych połączonych mostkiem aza-metinowym (-N=) oraz cząsteczki difluoroboru (BF2) umiejscowionej we wnęce wiążącej ligandu. Związki z grupy aza-BODPIY są przedmiotem zainteresowania naukowców ze względu na mnogość zastosowań i ciekawe własności fotofizyczne. W niniejszej pracy przedstawiono wyniki badań dotyczące próby otrzymania związku z grupy aza-BODIPY w reakcji ftalonitrylu z odczynnikiem Grignarda, a następnie reakcji otrzymanej aza-dipiryny z trifluorkiem boru. Przeprowadzono charakterystykę spektroskopową zarówno produktu pośredniego, jak i docelowego produktu. Zbadano właściwości spektroskopowe takie jak: widma fluorescencji oraz molowe współczynniki absorpcji. Przeprowadzone eksperymenty wykazały, że reakcja ftalonitryli z odczynnikiem Grignarda nie jest wydajną metodą otrzymywania aza-BODIPY.The first mention of the aza-BODIPY days already appeared in literature almost 75 years ago. The structure of aza-BODIPY consists of two pyrrole rings connected by the aza-metin bridge (-N=) and BF2 molecule placed in ligand-binding niche. Aza-BODIPY compounds are a object of interest to scientists because of the number of possible uses and interesting photophysical properties. This bachelor project presents the research results of trying to acquire a compound from the aza-BODIPY group from a reaction of phthalonitrile with grignard reagent, and then from reaction of synthesized aza-dipyrrin and boron trifluoride. Spectroscopic characteristics were performedperformed for intermediate and main product. The spectroscopic properties, such as absorption and emission spectra and molar absorption coefficients, had been tested. The conducted experiments showed, that the reaction of phtalonitriles and Grignard reagent isnt’t an efficient method of obtainingaza-BODIPY

The influence of chemotherapeutic bestatin on biofilm formation by Staphylococcus aureus

Staphylococccus aureus jest bakterią, najczęściej kolonizującą skórę i jamę noso-gardzieli. Gronkowiec zaliczany jest do bakterii intensywnie patogennych, powodujących wiele chorób u osób z obniżoną odpornością organizmu. Jedną z taktyk wirulencji tego gatunku jest zdolność do tworzenia biofilmów, przestrzennych struktur wielokomórkowych, w których bakterie pozostają niewrażliwe zarówno na działanie mechanizmów obronnych gospodarza, jak i na działanie antybiotyków. Dlatego bardzo ważne jest poszukiwanie sposobów eliminacji bakterii wchodzących w skład tych struktur.W niniejszej pracy sprawdzano bakteriobójczy wpływ chemioterapeutyku - bestatyny na S. aureus oraz jej wpływ na zdolność do tworzenia biofilmu przez ten gatunek bakterii. Pomiary przeprowadzono również z zastosowaniem gentamycyny, która jest antybiotykiem bakteriobójczym, posiadającym szerokie spektrum działania wobec zakażeń wywołanych bakteriami Gram-dodatnimi, takimi jak S. aureus. Wykonane pomiary wykazały, iż gentamycyna w dawce 6,25 μg/ml nie eliminuje biofilmu, ale zabija bakterie planktoniczne. Wyższe stężenie gentamycyny (100 μg/ml) nie tylko zabija bakterie planktoniczne, ale również redukuje tworzący się biofilm. Badania prowadzone z użyciem bestatyny wykazały brak bakteriobójczego wpływu tego związku na S. aureus. Uzyskane wyniki wykazały, że niskie dawki bestatyny (4 μg/ml, 20 μg/ml, 100 μg/ml) dla dwóch czasów inkubacji (24h i 48h) nie redukują biofilmu, natomiast zabijają bakterie planktoniczne znajdujące się w pożywce hodowlanej. Wysokie dawki bestatyny (500 μg/ml, 1000 μg/ml) po inkubacji 24h redukują biofilm. Inkubacja 48h wysokich dawek bestatyny z zawiesiną komórek nie hamuje tworzenia biofilmu. Wysokie stężenia bestatyny w obu czasach inkubacji zabijają bakterie planktoniczne.Staphylococcus aureus is a bacteria that often infest skin, nasal and throat. Staphylococcus belongs to the family of opportunistic pathogens that can cause many diseases with patients having weak immunity. One of the virulence strategies that staphylococci apply is creating biofilm, a multicellular space structure in which bacteria stay invisible against the defensive mechanisms of the host and also for the antibiotics. That is why it is so important to find a way to eliminate those bacteria that are part of these structures. In this research, we explored the germicidal influence of chemotherapeutic substance called bestatin on S. aureus and its influence on the bacteria’s capability to create biofilm. Gentamicin, which also part of the germicidal antibiotic group, was selected for this study as it consists a large spectrum activity against infections created by gram positive bacteria such as S. aureus. Our research has revealed that gentamicin with the dosage of 6,25 μg/ml does not eliminate biofilm, but it kills planktonic bacteria. Higher dosage of this substance (100 μg/ml) does not only kill those bacteria but also reduce the biofilm creation. Conducted research with the usage of bestatin showed that there is no germicidal influence of this substance on S. aureus. Obtained results revealed that low dosage of bestatin (4 μg/ml, 20 μg/ml, 100 μg/ml) for both incubation times (24h and 48h) do not reduce biofilm while killing planktonic bacteria that are placed in culture medium. A reduction of biofilm was observed after 24h incubation with high dosage of bestatin (500 μg/ml, 1000 μg/ml), whilst 48h of incubation with high dosage of this substance with cell suspension does not reduce the creation of the biofilm. Taken together, high concentration of bestatin at both incubation time (24h and 48h) kills planktonic bacteria

Adsorption of proteins on the surface of polymers with different tactics

Zjawisko adsorpcji protein do powierzchni ciał stałych jest bardzo istotnym procesem z perspektywy wielu dziedzin nauki, natomiast kontrola pozycjonowania molekuł na powierzchni cienkich warstw polimerowych przyczynia się dla rozwoju testów immunologicznych, biosensorów czy biomateriałów.Na proces adsorpcji białek niewątpliwy wpływ mają własności podłoża, do którego białko zostaje zaadsorbowane. Własności te można zmieniać poprzez zmianę taktyczności polimeru, czyli przestrzennego usytuowania grup bocznych względem łańcucha głównego, do którego białko zostaje zaadsorbowane. Można wyróżnić trzy typy taktyczności polimerów: ataktyczny, izotaktyczny oraz syndiotaktyczny. Polimer izotaktyczny charakteryzuje jednakowe rozmieszczenie grup bocznych w cząsteczce. Polimer syndiotaktyczny charakteryzuje się naprzemiennym usytuowaniem grup bocznych, po obu stronach płaszczyzny łańcucha głównego, natomiast polimer ataktyczny nie posiada regularności w rozmieszczeniu grup bocznych względem łańcucha głównego.W niniejszej pracy sprawdzano wpływ taktyczności polimeru Poly (metakrylanu tert –butylu) (PtBMA) na proces adsorpcji białek jak również na ich orientacje. Praca ta ma na celu sprawdzenie możliwości selektywnego osłabiania lub wzmacniania adsorpcji białek do powierzchni poprzez zmianę taktyczności polimeru, a także sprawdzenie wpływu taktyczności na orientacje zaadsorbowanych molekuł.W celu określenia wpływu taktyczności polimeru na ilość zaadsorbowanego białka w pierwszej kolejności sprawdzono właściwości powierzchni polimeru za pomocą mikroskopii sił atomowych (AFM), pomiaru kąta zwilżania wody, spektrometrii masowej jonów wtórnych (TOF-SIMS) oraz spektroskopii fotoelektronów (XPS). Następnie sprawdzono różnice w zaadsorbowanym białku za pomocą mikroskopii sił atomowych (AFM) oraz spektrometrii masowej jonów wtórnych (TOF-SIMS). Ilość zaadsorbowanego białka zbadano za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej oraz spektroskopii fotoelektronów (XPS). Orientacja białka (IgG) zaadsorbowanego do polimeru o równej taktyczności została sprawdzona za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej i przeprowadzonej geometrii całkowej oraz za pomocą spektrometrii masowej jonów wtórnych (TOF-SIMS), a wyodrębnienie różnic było możliwe dzięki zastosowaniu analizy głównych składowych PCA.The phenomenon of protein adsorption to the solid surface is a very important process from the perspective of many fields of science, while the control of the positioning of molecules on the surface of thin polymer films contributes to the development of immunoassays, biosensors or biomaterials.The process of protein's adsorption undoubtedly depends on substratum's features to which the protein is being adsorbed. These properties can be modified by changing the tacticity of the polymer, i.e. the spatial positioning of the side groups relative to the main chain into which the protein is adsorbed. Three types of polymers' tacticity can be distinguished: atactic, isotactic and syndiotactic. The isotactic polymer is characterized by the same arrangement of side groups in the molecule. The syndiotactic polymer is characterized by an alternate positioning of the side groups on both sides of the main chain plane, whereas the atactic polymer does not have regularity in the arrangement of side groups relative to the main chain.In this work, the impact of Poly (tert-butyl methacrylate) tacticity (PtBMA) on the protein adsorption process as well as their orientation was verified to check the possibility of selective weakening or enhancing protein adsorption to the surface by changing the tacticity of the polymer. In addition, the effect of tacticity to orientations of adsorbed molecules was studied.In order to determine the effect of polymer tacticity on the amount of adsorbed protein, the properties of the polymer surface were first examined by atomic force microscopy (AFM), water contact angle measurement, secondary ion mass spectroscopy (TOF-SIMS) and photoelectron spectroscopy (XPS). Next, the differences in the adsorbed protein were checked using atomic force microscopy (AFM) and secondary ion mass spectrometry (TOF-SIMS). The amount of adsorbed protein was examined by fluorescence microscopy and photoelectron spectroscopy (XPS). The orientation of the protein (IgG) adsorbed to the polymer of different tacticity was checked by means of fluorescence microscopy and integral geometry as well as by secondary ion mass spectroscopy (TOF-SIMS) combined with principal component analysis (PCA)

Synthesis and study of fluorescent properties of bromine pyrroloquinoxalines derivatives

W ramach Pracy Magisterskiej pomyślnie zsyntezowano siedem nowych, nieopisanych w literaturze bromowych pochodnych pirolo[2,3-b] chinoksaliny. Związki te zostały otrzymane w reakcji odpowiednich pochodnych 4-benzoilopirolidyno-2,3,5-trionu z 1,2-diaminami aromatycznymi. Otrzymano pochodne z bardzo dobrymi wydajnościami, w granicach 70-80%. Zarówno prekursory – trzy nowe bromowe pochodne pirolidynotrionu, jak i odpowiednie siedem pochodnych pirolo[2,3-b]chinoksaliny scharakteryzowano metodami spektroskopowymi, rejestrując widma: 1H NMR, 13C NMR, ATR-IR, UV-Vis, TLC-MS oraz wykonano dla nich analizę elementarną. Pochodne pirolochinoksaliny charakteryzują się dużymi molowymi współczynnikami absorpcji (od 10 000 do 40 000 M-1cm-1) oraz stosunkowo niskimi wydajnościami kwantowymi fluorescencji (najwyższa i najniższa – 3,6% oraz 0,18%). Zarówno widma absorpcji jak i fluorescencji składają się z trzech pasm i wykazują przesunięcie Stokesa w granicach 3400-3550 cm-1.In the Master Thesis, seven new bromine derivatives of pyrrolo[2,3-b]quinoxaline have been successfully synthesized. These compounds were obtained in the reaction of corresponding pyrrolidinetrione derivatives with aromatic 1,2-diamines. The derivatives were obtained with very good yields, in the range of 70-80%. Both precursors - three new bromine derivatives of pyrrolidinetrione and the corresponding seven pyrrolo[2,3-b]quinoxaline derivatives were characterized by spectroscopic methods: 1H NMR, 13C NMR, ATR-IR, UV-Vis, TLC-MS and elemental analysis. Pyrroloquinoxaline derivatives are characterized by high molar absorption coefficients (from 10 000 to 40,000 M-1cm-1) and relatively low quantum yields of fluorescence (highest and lowest – 3,6 % and 0,18%). Absorption and the fluorescence spectra consist of three bands. The Stokes shift for the synthesized compounds is in the range of 3400-3550 cm-1

Application of Photo Texture Analysis and Weather Data in Assessment of Air Quality in Terms of Airborne PM10 and PM2.5 Particulate Matter

The study was undertaken in Krakow, which is situated in Lesser Poland Voivodeship, where bad PM10 air-quality indicators occurred on more than 100 days in the years 2010–2019. Krakow has continuous air quality measurement in seven locations that are run by the Province Environmental Protection Inspectorate. The research aimed to create regression and classification models for PM10 and PM2.5 estimation based on sky photos and basic weather data. For this research, one short video with a resolution of 1920 × 1080 px was captured each day. From each film, only five frames were used, the information from which was averaged. Then, texture analysis was performed on each averaged photo frame. The results of the texture analysis were used in the regression and classification models. The regression models’ quality for the test datasets equals 0.85 and 0.73 for PM10 and 0.63 for PM2.5. The quality of each classification model differs (0.86 and 0.73 for PM10, and 0.80 for PM2.5). The obtained results show that the created classification models could be used in PM10 and PM2.5 air quality assessment. Moreover, the character of the obtained regression models indicates that their quality could be enhanced; thus, improved results could be obtained

The quality of life of people with slow-healing wounds is strengthened through the introduction of therapeutic and nursing activities administered in long-term homecare nursing, as based on case studies

The quality of life of people with slow-healing wounds is a multi-faceted concept which focuses on the functioning of patients in many spheres of life.Two characteristics of patients qualified for long-term homecare nursing are multi-morbidities and senior age. The coexistence of several chronic diseases, including atherosclerosis, is associated with the presence of a number of healing and caring problems, for example, slow-healing wounds. The social security in Poland in the domain of long-term homecare nursing is at a very low level, as reported by the Central Statistical Office in 2015, with only 4 out of 1000 people using  long-term nursing care in a home environment.</p