Uso de marcadores SSR para identificaci\uf3n de germoplasma de papa en el programa de mejoramiento de INIA de Chile

Molecular markers based on Simple Sequence Repeats (SSR) are a very efficient tool for potato ( Solanum tuberosum L. ) genotype identification and can be very useful for germplasm conservation and management. With the purpose of incorporate this technology into the potato breeding program of the National Institute of Agricultural Research (INIA) Chile, a set of 26 SSR markers was evaluated on a sample of 71 potato genotypes. Each marker was characterized for number and combinations of alleles, scoring quality, polymorphic information content (PIC) and discrimination power (D). From the total, only 21 SSR markers showed up scoreable products and the allele number ranged between 2 and 17. The observed allelic combinations among the different potato genotypes ranged from 2 to 47; however, unique genotypes detected by each SSR marker ranged from 0 to 38. The observed (Do) and expected (Dj) discriminatory power ranged from 0.23 to 0.98 and from 0.43 to 0.92, respectively. The seven SSR markers which showed the highest Do scores were STM1009 (0.98), STM1020 (0.97), STM0031 (0.97), STM2013 (0.96), STM1008 (0.94), STM1052 (0.93) and STM0019 (0.91). The STM1009, STM1020 and STM1008 markers are multi-loci SSR, where each one amplifies more than one locus of the potato genome. The utilization of the multi-loci type of marker, or combinations of several SSR markers in either PCR-multiplex or pseudo-multiplex reactions, are good options to increase the speed and reduce the cost of SSR markers application.Los marcadores moleculares basados en Secuencias Simples Repetidas (SSR) constituyen una herramienta altamente eficaz para la identificaci\uf3n de genotipos de papa ( Solanum tuberosum L. ) y pueden ser de gran utilidad en la conservaci\uf3n y manejo de germoplasma. Con el prop\uf3sito de incorporar esta tecnolog\ueda al Programa de Mejoramiento de Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA) de Chile, se evalu\uf3 un grupo de 26 marcadores SSR sobre una muestra de 71 genotipos de papa. Cada marcador se caracteriz\uf3 seg\ufan su n\ufamero de alelos y sus respectivas combinaciones, calidad de lectura, contenido de informaci\uf3n polim\uf3rfica (PIC) y poder discriminatorio (D). Del total s\uf3lo 21 marcadores SSR mostraron productos legibles con un n\ufamero de alelos que vari\uf3 entre 2 y 17. Las combinaciones al\ue9licas observadas variaron desde 2 a 47; sin embargo, los genotipos \ufanicos detectados por cada marcador fueron desde 0 a 38. El poder discriminatorio observado (Do) y esperado (Dj) estuvo entre 0,23 a 0,98 y entre 0,43 a 0,92, respectivamente. Los siete marcadores que presentaron mayor Do fueron STM1009 (0,98), STM1020 (0.97), STM0031 (0,97), STM2013 (0,96), STM1008 (0,94), STM1052 (0,93) y STM0019 (0,91). Los marcadores STM1009, STM1020 y STM1008 corresponden a SSR multi-loci, donde cada uno amplifica m\ue1s de un locus desde distintas regiones del genoma de la papa. La utilizaci\uf3n de este tipo de marcadores multi-loci, o de combinaciones de varios SSR en reacciones de PCR-m\ufaltiplex o pseudos-m\ufaltiplex son una buena alternativa para aumentar rapidez y disminuir costo en la aplicaci\uf3n de marcadores SSR

Efectividad de distintas dosis de feromona sexual de Phthorimaea operculella (Zeller) (Lepidoptera: Gelechiidae) en la captura de machos de polilla de la papa

Potato tuber moth (PTM), Phthorimaea operculella (Zeller), widely world distributed, is one of the most serious insect pest attacking potatoes ( Solanum tuberosum L.). Larvae develop in foliage and tubers of potato causing direct losses of edible product. Chemicals treatment to control this pest have shown limited efficacy, especially when larvae is under the soil. The utilization of synthetic pheromones as a tool that interferes with insects mating had been widely demonstrated in numerous moth and others insects species. With the objective to evaluate the efficacy of different doses of pheromone per trap in PTM males captures for its future utilization as a mass trapping technique, two experiments in a complete randomized blocks design, were carried out at Valle del Elqui, Coquimbo ,egi\uf3n, Chile, during the summer season 2003-2004, and spring 2004. Doses of 0.2, 0.5, 1, 2 and 5 mg and 0.05, 0.1, 0.2, and 0.5 mg of PTM sex pheromone mixture (E4-Z7 Tridecadienil acetate, and E4-Z7-Z10 Tridecatrienil acetate at rate 1:1.5) per trap were evaluated. Results showed that pheromone\ub4s dispensers loaded with the rates of 0.2 and 0.5 mg, captured the larger numbers of PTM males per trap. With the optimization of the pheromone rate per trap, studies will continue to propose PTM mass trapping technique, a non chemical method of control, environmentally safe.La polilla de la papa, Phthorimaea operculella (Zeller) (Lepidoptera: Gelechiidae), es uno de los insectos plaga m\ue1s importantes que atacan al cultivo de la papa ( Solanum tuberosum L.). Las larvas se desarrollan en el follaje y tub\ue9rculos de papa causando p\ue9rdidas directas del producto a comercializar. Los tratamientos qu\uedmicos para el control de esta plaga han mostrado eficiencia limitada, especialmente cuando la larva est\ue1 bajo el suelo. La utilizaci\uf3n de feromonas sint\ue9ticas como una herramienta que interfiere con el apareamiento, ha sido ampliamente demostrada en innumerables especies de polillas y otros insectos. Con el fin de evaluar la efectividad de diferentes dosis de feromona en la captura de machos de P. operculella, para su futura utilizaci\uf3ncomo t\ue9cnica de trampeo masivo, se realizaron dos ensayos en un dise\uf1o de bloques completos al azar, durante las temporadas verano 2003-2004, y primavera 2004, en el Valle del Elqui, IV Regi\uf3n, Chile. Dosis de 0,2; 0,5; 1; 2 y 5 mg y 0,05; 0,1; 0,2 y 0,5 mg de la mezcla de las feromonas sexuales sint\ue9ticas de la polilla de la papa (E4-Z7 Tridecadienil acetate, and E4-Z7-Z10 Tridecatrienil acetate, en tasa de 1:1,5) por trampa. Los resultados obtenidos indican que la mayor captura de machos ocurre con dosis de 0,2 y 0,5 mg de feromona por trampa. Con la optimizaci\uf3n de la dosis de feromona por trampa, los estudios continuar\ue1n para proponer la t\ue9cnica de capturas masivas de polilla de la papa, como un m\ue9todo de control no qu\uedmico y ambientalmente seguro

Uso de marcadores SSR para identificación de germoplasma de papa en el programa de mejoramiento de INIA de Chile

Molecular markers based on Simple Sequence Repeats (SSR) are a very efficient tool for potato (Solanum tuberosum L.) genotype identification and can be very useful for germplasm conservation and management. With the purpose of incorporate this technology into the potato breeding program of the National Institute of Agricultural Research (INIA) Chile, a set of 26 SSR markers was evaluated on a sample of 71 potato genotypes. Each marker was characterized for number and combinations of alleles, scoring quality, polymorphic information content (PIC) and discrimination power (D). From the total, only 21 SSR markers showed up scoreable products and the allele number ranged between 2 and 17. The observed allelic combinations among the different potato genotypes ranged from 2 to 47; however, unique genotypes detected by each SSR marker ranged from 0 to 38. The observed (Do) and expected (Dj) discriminatory power ranged from 0.23 to 0.98 and from 0.43 to 0.92, respectively. The seven SSR markers which showed the highest Do scores were STM1009 (0.98), STM1020 (0.97), STM0031 (0.97), STM2013 (0.96), STM1008 (0.94), STM1052 (0.93) and STM0019 (0.91). The STM1009, STM1020 and STM1008 markers are multi-loci SSR, where each one amplifies more than one locus of the potato genome. The utilization of the multi-loci type of marker, or combinations of several SSR markers in either PCR-multiplex or pseudo-multiplex reactions, are good options to increase the speed and reduce the cost of SSR markers applicationLos marcadores moleculares basados en Secuencias Simples Repetidas (SSR) constituyen una herramienta altamente eficaz para la identificación de genotipos de papa (Solanum tuberosum L.) y pueden ser de gran utilidad en la conservación y manejo de germoplasma. Con el propósito de incorporar esta tecnología al Programa de Mejoramiento de Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA) de Chile, se evaluó un grupo de 26 marcadores SSR sobre una muestra de 71 genotipos de papa. Cada marcador se caracterizó según su número de alelos y sus respectivas combinaciones, calidad de lectura, contenido de información polimórfica (PIC) y poder discriminatorio (D). Del total sólo 21 marcadores SSR mostraron productos legibles con un número de alelos que varió entre 2 y 17. Las combinaciones alélicas observadas variaron desde 2 a 47; sin embargo, los genotipos únicos detectados por cada marcador fueron desde 0 a 38. El poder discriminatorio observado (Do) y esperado (Dj) estuvo entre 0,23 a 0,98 y entre 0,43 a 0,92, respectivamente. Los siete marcadores que presentaron mayor Do fueron STM1009 (0,98), STM1020 (0.97), STM0031 (0,97), STM2013 (0,96), STM1008 (0,94), STM1052 (0,93) y STM0019 (0,91). Los marcadores STM1009, STM1020 y STM1008 corresponden a SSR multi-loci, donde cada uno amplifica más de un locus desde distintas regiones del genoma de la papa. La utilización de este tipo de marcadores multi-loci, o de combinaciones de varios SSR en reacciones de PCR-múltiplex o pseudos-múltiplex son una buena alternativa para aumentar rapidez y disminuir costo en la aplicación de marcadores SSR

Uso de marcadores SSR para identificación de germoplasma de papa en el programa de mejoramiento de INIA de Chile

Molecular markers based on Simple Sequence Repeats (SSR) are a very efficient tool for potato ( Solanum tuberosum L. ) genotype identification and can be very useful for germplasm conservation and management. With the purpose of incorporate this technology into the potato breeding program of the National Institute of Agricultural Research (INIA) Chile, a set of 26 SSR markers was evaluated on a sample of 71 potato genotypes. Each marker was characterized for number and combinations of alleles, scoring quality, polymorphic information content (PIC) and discrimination power (D). From the total, only 21 SSR markers showed up scoreable products and the allele number ranged between 2 and 17. The observed allelic combinations among the different potato genotypes ranged from 2 to 47; however, unique genotypes detected by each SSR marker ranged from 0 to 38. The observed (Do) and expected (Dj) discriminatory power ranged from 0.23 to 0.98 and from 0.43 to 0.92, respectively. The seven SSR markers which showed the highest Do scores were STM1009 (0.98), STM1020 (0.97), STM0031 (0.97), STM2013 (0.96), STM1008 (0.94), STM1052 (0.93) and STM0019 (0.91). The STM1009, STM1020 and STM1008 markers are multi-loci SSR, where each one amplifies more than one locus of the potato genome. The utilization of the multi-loci type of marker, or combinations of several SSR markers in either PCR-multiplex or pseudo-multiplex reactions, are good options to increase the speed and reduce the cost of SSR markers application.Los marcadores moleculares basados en Secuencias Simples Repetidas (SSR) constituyen una herramienta altamente eficaz para la identificación de genotipos de papa ( Solanum tuberosum L. ) y pueden ser de gran utilidad en la conservación y manejo de germoplasma. Con el propósito de incorporar esta tecnología al Programa de Mejoramiento de Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA) de Chile, se evaluó un grupo de 26 marcadores SSR sobre una muestra de 71 genotipos de papa. Cada marcador se caracterizó según su número de alelos y sus respectivas combinaciones, calidad de lectura, contenido de información polimórfica (PIC) y poder discriminatorio (D). Del total sólo 21 marcadores SSR mostraron productos legibles con un número de alelos que varió entre 2 y 17. Las combinaciones alélicas observadas variaron desde 2 a 47; sin embargo, los genotipos únicos detectados por cada marcador fueron desde 0 a 38. El poder discriminatorio observado (Do) y esperado (Dj) estuvo entre 0,23 a 0,98 y entre 0,43 a 0,92, respectivamente. Los siete marcadores que presentaron mayor Do fueron STM1009 (0,98), STM1020 (0.97), STM0031 (0,97), STM2013 (0,96), STM1008 (0,94), STM1052 (0,93) y STM0019 (0,91). Los marcadores STM1009, STM1020 y STM1008 corresponden a SSR multi-loci, donde cada uno amplifica más de un locus desde distintas regiones del genoma de la papa. La utilización de este tipo de marcadores multi-loci, o de combinaciones de varios SSR en reacciones de PCR-múltiplex o pseudos-múltiplex son una buena alternativa para aumentar rapidez y disminuir costo en la aplicación de marcadores SSR

Efectividad de distintas dosis de feromona sexual de Phthorimaea operculella (Zeller) (Lepidoptera: Gelechiidae) en la captura de machos de polilla de la papa

Potato tuber moth (PTM), Phthorimaea operculella (Zeller), widely world distributed, is one of the most serious insect pest attacking potatoes ( Solanum tuberosum L.). Larvae develop in foliage and tubers of potato causing direct losses of edible product. Chemicals treatment to control this pest have shown limited efficacy, especially when larvae is under the soil. The utilization of synthetic pheromones as a tool that interferes with insects mating had been widely demonstrated in numerous moth and others insects species. With the objective to evaluate the efficacy of different doses of pheromone per trap in PTM males captures for its future utilization as a mass trapping technique, two experiments in a complete randomized blocks design, were carried out at Valle del Elqui, Coquimbo ,egión, Chile, during the summer season 2003-2004, and spring 2004. Doses of 0.2, 0.5, 1, 2 and 5 mg and 0.05, 0.1, 0.2, and 0.5 mg of PTM sex pheromone mixture (E4-Z7 Tridecadienil acetate, and E4-Z7-Z10 Tridecatrienil acetate at rate 1:1.5) per trap were evaluated. Results showed that pheromone´s dispensers loaded with the rates of 0.2 and 0.5 mg, captured the larger numbers of PTM males per trap. With the optimization of the pheromone rate per trap, studies will continue to propose PTM mass trapping technique, a non chemical method of control, environmentally safe.La polilla de la papa, Phthorimaea operculella (Zeller) (Lepidoptera: Gelechiidae), es uno de los insectos plaga más importantes que atacan al cultivo de la papa ( Solanum tuberosum L.). Las larvas se desarrollan en el follaje y tubérculos de papa causando pérdidas directas del producto a comercializar. Los tratamientos químicos para el control de esta plaga han mostrado eficiencia limitada, especialmente cuando la larva está bajo el suelo. La utilización de feromonas sintéticas como una herramienta que interfiere con el apareamiento, ha sido ampliamente demostrada en innumerables especies de polillas y otros insectos. Con el fin de evaluar la efectividad de diferentes dosis de feromona en la captura de machos de P. operculella, para su futura utilizacióncomo técnica de trampeo masivo, se realizaron dos ensayos en un diseño de bloques completos al azar, durante las temporadas verano 2003-2004, y primavera 2004, en el Valle del Elqui, IV Región, Chile. Dosis de 0,2; 0,5; 1; 2 y 5 mg y 0,05; 0,1; 0,2 y 0,5 mg de la mezcla de las feromonas sexuales sintéticas de la polilla de la papa (E4-Z7 Tridecadienil acetate, and E4-Z7-Z10 Tridecatrienil acetate, en tasa de 1:1,5) por trampa. Los resultados obtenidos indican que la mayor captura de machos ocurre con dosis de 0,2 y 0,5 mg de feromona por trampa. Con la optimización de la dosis de feromona por trampa, los estudios continuarán para proponer la técnica de capturas masivas de polilla de la papa, como un método de control no químico y ambientalmente seguro

Evaluación de un Marcador SCAR RYSC3 del Gen Ryadg para Seleccionar Genotipos Resistentes al Virus Y de la papa (PVY) en el Programa de Mejoramiento Genético de Papa del INIA

The Potato virus Y (PVY) is distributed worldwide and is one of the most damaging viruses in terms of yield reduction in the potato ( Solanum tuberosum L.) crop with losses sometimes reaching 80%. To reduce its impact, there is great interest in obtaining varieties carrying the Ryadg gene that provides extreme resistance to this virus. This could be facilitated with SCAR (sequence characterized amplified region) RYSC3 by molecular marker-assisted selection (MAS). This study compared the effectiveness of the RYSC3 marker in the detection of the Ryadg gene vs. biological tests on populations of the Potato Breeding Program of the Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Chile. Within the group of 71 progenitors, 30 plants had some kind of resistance to the virus, of which 17 were carriers of the RYSC3 marker. These genotypes came from Cornell University, Centro Internacional de la Papa (CIP), Peru, and INIA. The analysis of 460 progenies which came from three different crosses showed that 299 individuals amplified the RYSC3 marker and had the resistant phenotype, with the exception of one plant. Within the group of non-RYSC3 carrier plants, a significant percentage (22.5%) showed a resistant phenotype, indicating that these progenies segregate other R genes (e.g., hypersensitivity) that reduce biological test effectiveness. This high effectiveness (99.7%) in the detection of the Ryadg gene in both parents and segregating progenies, showed that this marker is appropriate in assisting selection of genotypes with extreme PVY-resistance in the potato breeding programs.El Virus Y de la papa (PVY), distribuido mundialmente, es uno de los más dañinos en términos de reducción del rendimiento del cultivo de la papa ( Solanum tuberosum L.); llegando a producir pérdidas de hasta 80%. Para reducir su impacto, existe gran interés por obtener variedades portadoras del gen Ryadg que confiere resistencia extrema a este virus. Esto se podría facilitar con la utilización del SCAR RYSC3, mediante selección asistida por marcadores moleculares (mas). En este estudio se comparó la eficacia del marcador RYSC3 en la detección del gen Ryadg vs. pruebas biológicas, sobre poblaciones del Programa de Mejoramiento Genético de Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Chile. De un grupo de 71 progenitores analizados, 30 plantas presentaron algún tipo de resistencia al virus, de las cuales 17 son portadores del marcador RYSC3. Estos genotipos provienen de la Universidad de Cornell (EE.UU.), del Centro Internacional de la Papa (CIP, Perú) y del INIA. Del análisis de 460 progenies, provenientes de tres cruzamientos distintos, 299 individuos amplificaron el marcador RYSC3 y presentaron el fenotipo resistente, con la excepción de una planta. En el grupo de plantas no portadoras de RYSC3, un porcentaje significativo (22,5%) presentó un fenotipo resistente, lo que sugiere que en estas progenies segregan otros genes R (ej. hipersensibilidad) que reducen la eficacia de las pruebas biológicas. Estos resultados de alta eficacia (99,7%) en la detección del gen Ryadg, tanto en progenitores como progenies segregantes, muestran la conveniencia de utilizar RYSC3 en la selección de genotipos portadores del gen Ryadg en los programas de mejoramiento genético de papa

Karu-INIA, new potato cultivar for Chile

Karu-INIA is a new potato (Solanum tuberosum   L.) cultivar, created from a cross between the cultivars Yagana-INIA x Fanfare by the Potato Breeding Program of the National Agricultural Research Institue (INIA), at the Remehue Regional Research Center, Osorno, Chile, in 1989. It is a semi-erect plant, with vigorous growth, a medium to large size, long oval-shaped tuber, red skin and clear yellow flesh. It is a high yielding cultivar and adapts well to the majority of the potato production areas and crop seasons in Chile. It is preferred for fresh consumption, although it has fairly good frying quality, similar to Yagana-INIA

Karu-INIA, nuevo cultivar de papa para Chile

Karu-INIA es un nuevo cultivar de papa (Solanum tuberosum L.) creado a partir del cruzamiento Yagana-INIA x Fanfare, por el Programa de Mejoramiento Genético de la Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), en el Centro Regional de Investigación Remehue, Osorno, el año 1989. Es una planta semi erecta, de buen vigor, con tubérculos de tamaño medio a grande, uniformes, de forma oval alargada, piel roja y pulpa amarilla clara. Posee altos rendimientos y se adapta bien a la mayoría de las zonas y épocas de cultivo de la papa en Chile. Su uso preferente es para consumo fresco, aunque produce una fritura de calidad altamente aceptable, similar a Yagana-INIA

Karu-INIA, nuevo cultivar de papa para Chile

Karu-INIA is a new potato ( Solanum tuberosum L.) cultivar, created from a cross between the cultivars Yagana-INIA x Fanfare by the Potato Breeding Program of the National Agricultural Research Institue (INIA), at the Remehue Regional Research Center, Osorno, Chile, in 1989. It is a semi-erect plant, with vigorous growth, a medium to large size, long oval-shaped tuber, red skin and clear yellow flesh. It is a high yielding cultivar and adapts well to the majority of the potato production areas and crop seasons in Chile. It is preferred for fresh consumption, although it has fairly good frying quality, similar to Yagana-INIA.Karu-INIA es un nuevo cultivar de papa ( Solanum tuberosum L.) creado a partir del cruzamiento Yagana-INIA x Fanfare, por el Programa de Mejoramiento Gen\ue9tico de la Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), en el Centro Regional de Investigaci\uf3n Remehue, Osorno, el a\uf1o 1989. Es una planta semi erecta, de buen vigor, con tub\ue9rculos de tama\uf1o medio a grande, uniformes, de forma oval alargada, piel roja y pulpa amarilla clara. Posee altos rendimientos y se adapta bien a la mayor\ueda de las zonas y \ue9pocas de cultivo de la papa en Chile. Su uso preferente es para consumo fresco, aunque produce una fritura de calidad altamente aceptable, similar a Yagana-INIA