Purification and characterization of UEF3, a novel factor involved in the regulation of the urokinase and other AP-1 controlled promoters.

Basal as well as induced transcription from the human urokinase-type plasminogen activator gene requires an enhancer containing two elements, a combined PEA3/AP-1 and a consensus AP-1 site. The integrity of each of these binding sites as well as their cooperation is required for activating transcription. The two elements are separated by a 74-base pair cooperation mediating (COM) region required for the cooperation between the transactivating sites. The COM region contains binding sites for four different unidentified urokinase-type plasminogen activator enhancer factors (UEF 1 to 4), all four required for correct COM activity. We have purified UEF3 from HeLa nuclear extracts by several chromatographic steps including DNA affinity purification. Purification and UV cross-linking data showed that UEF3 is a complex of three polypeptides (p40, p50, and p64). Amino acid sequence from one peptide of p64 was obtained, which showed no homology to other known proteins. Both crude and purified UEF3 specifically bound to the sequence TGACAG as shown by electrophoretic mobility shifts and methylation interference studies. DNA-binding specificity of purified UEF3 was identical to that of NIP, a non-characterized factor binding and regulating multiple AP-1-regulated promoters like stromelysin and interleukin-3. Thus UEF3 appears to be a general DNA-binding factor involved in modulating the transcriptional response of AP-1 containing promoters

KULTURENS NYE ANSIGTER - Forestillinger om en ny personlighedsstruktur i en ny verdenskultur

Når samfundets hovedfunktioner ændres, ændres kulturen. Og når kulturen ændres, ændres menneskenes muligheder og selvopfattelse også – og med den vore forestillinger om den menneskelige psyke og de psykologiske teorier. Krav til det enkelte menneskes arbejdsindsats og almindelige livsvilkår ændres i disse år hastigt. Vil det være nødvendigt at udvikle en ny personlighedsstruktur, hvis mennesket ikke skal løbes overende af en ny verdenskultur? Artiklen nærmer sig problematikken ved at sætte fokus på tre generationers personlighedsstruktur og samfundsmæssige baggrund: Mellemkrigsgenerationen, 68-generationen og unge i dag. Træk ved ungdommen peger på nye måder at opfatte og håndtere sig selv og omverdenen på, der kan varsle et paradigmeskift. Artiklen tegner omridset af en ny personlighedsstruktur i det socialt-autonome menneske, hvor skellet mellem system og individ svækkes, og den sociale relation i kontakt- og handlerum bliver betydningsfuld som formende kraft

VIDEN, TRO OG OVERTRO. Det spirituelle - globaliseringens nye udfordring til psykologien

Artiklen argumenterer for nødvendigheden af at acceptere nye forståelsesformer ved overgangen fra industrisamfund til kommunikationssamfund. Gamle dogmer, som bygger på en re lativt overskuelig, stabil og kontrollerbar verden, kommer til kort i globaliseringens hyperkomplekse verdensbillede. Mennesker, der er opvokset med realitetstestning i forhold til dualismens opsplittede opfattelser, må arbejde sig igennem dilemmaet mellem det gamle og det nye for at kunne acceptere og integrere nye tænke- og handlemåder. Artiklen søger efter tegn på det nye – og anderledes. Der er tegn på, at psykologistuderende bruger teori på en anden måde, tegn på at de store psykologiske teorier mister betydning, og tegn på, at erfarne psykologer interesserer sig for overskridende tænkning. Der er også mange tegn på, at unge har ganske andre mål, fremgangsmåder og selvforståelse end deres forældre. Viden, tro og overtro ses nu som ressourcer, der ikke mere er klart adskilte. Det spirituelle er ved at blive stuerent. Mit projekt drejer sig om at undersøge muligheder for at inddrage spirituelle arbejdsformer i den etablerede psykologi. Det kræver, at jeg som undersøger forholder mig åben og udogmatisk og gennem deltagerobservation søger at lære den fremmede verden at kende. Gennem induktive kvalitative undersøgelsesmetoder og grounded theory tilstræber jeg at opstille hypoteser og nye alternativer. Det sker blandt andet gennem interview, egen deltagelse i clairvoyance, gennemgang af teori om ‘den åndelige verdener’ og deltagelse på kursus. Ved at være åben og opmærksom på tegnene undervejs mener jeg at kunne konstatere, at der findes andre professionelle, der har alternative indgange til det menneskelige følelsesliv, der kan bryde gængse psykologiske forforståelser, give psykologien nye ressourcer og forbedre mulighederne for at virke i interkulturelle situationer. DET ER VÆSENTLIGT AT KUNNE VÆRE TIL STEDE OG KUNNE ARBEJDE PÅ LAVERE BEVIDSTHEDSNIVEAUER PÅ EN IKKE-KOGNITIV MÅDE er min konklusion. I artiklen søger jeg at beskrive min rejse mod det ukendte med sympatiserende besøg hos mennesker, der beskæftiger sig med transcendente oplevelser og metafysiske konstruktioner. Artiklen beskriver således de første skridt i en tilegnelse af en mere rummelig forståelse af mennesker, samt udvikling af nye kompetencer og arbejdsformer, som bygger på fællesmenneskelige opfattelser, som kan benyttes ved tilpasning til globalisering og transkulturelle forståelser

DILEMMAETS ÅBENBARINGER OG DET ONDE. Kan dilemmasituationen bidrage til at afdække ‘det ondes funktion’ i industrisamfundet og måske være ubevidst ressource i fremtidens kommunikationssamfund?

På tærsklen til en ny tid stilles vi over for krav om omstilling til nye måder at fungere på i arbejds- og privatliv. Vi stilles ofte i dilemma mellem at opnå nye goder og svigte vore idealer – eller at sakke bagud. I artiklen præsenteres en model for personlig udvikling og ændring gennem dilemmasituationer. I stedet for kun at være en ubehagelig konflikt kan dilemmaet opfattes som udfordring og en genvej til skift i tilgange – approaches, diskurser, paradigmer. Det onde opfattes i artiklen som en samfundsskabt konstruktion og tilpasningsmekanisme til den industrielle produktion. Det uacceptable og utilladelige er blevet defineret som det onde og derfor blevet benægtet og fortrængt. Ved kulturskift kan det vise sig, at mennesker i dilemmaets afmagtssituation kan møde og udnytte ‘det onde’ i form af de fortrængte ressourcer og herigennem frigøre sig fra dualismens enten-eller og nærme sig et mere rummeligt både-og

BLANDT DE BLINDE ER DEN ENØJEDE KONGE – eller HVORFOR ENGAGERE SIG – DET GÅR JO GODT

Psykologien har gennem det sidste århundrede udviklet sig til en selvstændig videnskabelig disciplin. Ved at koncentrere sig om det enkelte individ har den medvirket til at bibringe samfundet en større menneskelighed, men er upåagtet kommet til at isolere mennesket fra samfundet. I den aktuelle overgang fra en samfundsform til en anden kan psykologien få en vigtig funktion som vogter af demokrati og menneskerettigheder. Det indebærer, at psykologien må revurderes med henblik på anvendelse i fremtidens samfundsformer. Først og fremmest må psykologien sættes i relation til overordnede samfundsfunktioner. Ved at bruge kulturbegrebet som bindeled kan menneskets personlighed ses i samspil med samfundsforandringer. Men hvordan? Når man søger at udvikle nye forståelser, er det vigtigt at bestræbe sig for at frigøre sig fra sine forankringer. Det kan ske ved at forholde sig spørgende og søgende frem for konstaterende og dokumenterende. Artiklen er sådant et forsøg på at søge anderledes steder for at samle brikker til et nyt mønster. Artiklen tager udgangspunkt i, at kulturskift historisk set har været længe på vej, men at forskningen har vanskeligt ved at opfange forandringerne og opstille scenarier, der bygger på nye fremtidsrettede paradigmer. Folkekarakteren har også ændret sig gennem tiderne og synes nu at have sluppet dybe kulturtræk som nøjsomhed og ‘sund skepsis’. Positivismen og konstruktivismen er utilstrækkelige til at forudse de forandringer, der synes at være aktive i den nye generation, som trænger til støtte til at kunne forholde sig til det postmoderne samfunds styringsmekanismer. Den politiske magt, den økonomiske magt og definitionsmagten er mere uigennemskuelig og populistisk. Det er lettere at blive blind, træffe ensidige valg eller undgå at involvere sig, og det gør det lettere for den enøjede at tage magten – næsten uden man opdager det

Characterization of UEF-4, a DNA-binding Protein Required for Transcriptional Synergism between Two AP-1 Sites in the Human Urokinase Enhancer

Abstract The enhancer of the inducible urokinase gene depends on three essential but not sufficient transactivating elements, an upstream PEA3/AP-1A and a downstream AP-1B site. Enhancer activity also requires the interposed 74-base pair-long cooperation mediator (COM) region that allows transcriptional synergism between the transactivating sites. The 5′-half of COM (uCOM) forms four retarded complexes with HeLa or Hep-G2 nuclear proteins (UEF-1–4). We have identified the binding sequence for UEF-4 and generated uCOM elements uniquely mutated in the UEF-4-binding site or uniquely binding UEF-4. Introduction of these and other mutations in the context of the urokinase enhancer showed that all uCOM sites are important for enhancer activity but that UEF-4 and UEF-1 plus UEF-2/3 can substitute for each other, suggesting functional redundancy of urokinase enhancer factors. UEF-4 was purified from HeLa nuclear extract by affinity chromatography and shown to contain two polypeptides of 105 and 65 kDa, respectively, of which at least the former was endowed with DNA binding activity

Cooperative Interactions between PBX, PREP, and HOX Proteins Modulate the Activity of the α2(V) Collagen (COL5A2) Promoter

Cell type-specific expression of the human alpha2(V) collagen (COL5A2) gene depends on a cis-acting element that consists of two contiguous protein binding sites (FPA and FPB) located between nucleotides -149 and -95, relative to the transcription start site. The present study focused on the characterization of the FPB-bound complex. DNA binding assays and cell transfection experiments revealed that the bipartite core sequence of FPB (5'-ATCAATCA-3') binds the PBX1/2, PREP1, and HOXB1 proteins, and this in turn leads to promoter transactivation. In the presence of all three nuclear factors, cooperative interactions between recombinant PBX1 and PREP1 or PBX1 and HOXB1 result in binding of the heterodimers to FPB in vitro. Similarly, overexpression of different combinations of PBX1, PREP1, and HOXB1 transactivates FPB-driven transcription. In contrast to the composition of the FPB complex purified from COL5A2-positive cells, the FPB complex from COL5A2-negative cells contains PBX2 and PREP1 but lacks PBX1. However, PBX1 exogenously introduced into COL5A2-negative cells cannot stimulate FPB-driven transcription unless co-expressed with PREP1. Within the intrinsic limitations of the experimental model, our results indicate that combinatorial interactions among PBX and PREP or HOX proteins are involved in regulating tissue-specific production of collagen V

RootPainter3D: Interactive-machine-learning enables rapid and accurate contouring for radiotherapy

Organ-at-risk contouring is still a bottleneck in radiotherapy, with many deep learning methods falling short of promised results when evaluated on clinical data. We investigate the accuracy and time-savings resulting from the use of an interactive-machine-learning method for an organ-at-risk contouring task. We compare the method to the Eclipse contouring software and find strong agreement with manual delineations, with a dice score of 0.95. The annotations created using corrective-annotation also take less time to create as more images are annotated, resulting in substantial time savings compared to manual methods, with hearts that take 2 minutes and 2 seconds to delineate on average, after 923 images have been delineated, compared to 7 minutes and 1 seconds when delineating manually. Our experiment demonstrates that interactive-machine-learning with corrective-annotation provides a fast and accessible way for non computer-scientists to train deep-learning models to segment their own structures of interest as part of routine clinical workflows. Source code is available at \href{https://github.com/Abe404/RootPainter3D}{this HTTPS URL}