Primeiro registro de um raro peixe parasita Pseudostegophilus paulensis no rio Paranapanema e sua distribuição atual no Brasil

Pseudostegophilus paulensis Miranda Ribeiro 1918 is an endemic parasitic species from the state of São Paulo, southeastern Brazil, with few registered occurrences in databases (15 records). Here, we present the first record of P. paulensis in the middle portion of the Anhumas River, a tributary of the Paranapanema River right bank. Specimens were collected in two environments with different ecological characteristics (lotic water running over gravel sediment and semi-lotic water with silty sediment on the bottom). We also present an updated occurrence map of the species in Brazil. This new record of P. paulensis in the upper Paraná River basin extends the geographic distribution of the species to the South of the state of São Paulo.  Furthermore, important ecological information remains unknown due to the lack of data about this group, such as habitat niches, vertical migration, growth patterns, reproduction, and feeding behavior.Pseudostegophilus paulensis Miranda Ribeiro 1918 é uma espécie de peixe parasita endêmica do estado de São Paulo, sudeste do Brasil, com poucas ocorrências registradas em bancos de dados (15 registros). Aqui, apresentamos o primeiro registro de P. paulensis na porção média do rio Anhumas, afluente da margem direita do rio Paranapanema. Os espécimes foram coletados em dois ambientes com características ecológicas distintas (água lótica correndo sobre sedimento pedregulho e água semilótica com sedimento arenoso no fundo). Apresentamos também um mapa de ocorrência atualizado da espécie no Brasil. Este novo registro de P. paulensis na bacia do alto rio Paraná estende a distribuição geográfica da espécie para o sul do estado de São Paulo. Além disso, informações ecológicas importantes permanecem desconhecidas devido à falta de dados sobre esse grupo, como nichos de habitat, migração vertical, padrões de crescimento, reprodução e comportamento alimentar

Landmark data : a new light on the phylogeny of the Pseudopimelodidae (Teleostei: Siluriformes)

A sistemática de Pseudopimelodidae, Fernández-Yépez & Antón, 1966 passou por análises e revisões acerca de sua posição filogenética e também de seus agrupamentos internos até o reconhecimento do monofiletismo e nível taxonômico atual. As filogenias produzidas até o momento para Pseudopimelodidae são baseadas em caracteres morfológicos e moleculares. Com o avanço de novas técnicas para o uso da morfometria geométrica em sistemática, implementações no programa TNT permitiram incorporar dados quantitativos diretamente em análises cladísticas. Isso possibilita traduzir os dados obtidos da morfometria geométrica em caracteres filogenéticos capazes de refletir homologias na forma das espécies. Afim de encontrar caracteres morfométricos para a família Pseudopimelodidae testamos o LAUP (Análise de Landmark sob Parcimônia) que estabelece estados ancestrais para um caráter que muda em duas ou três dimensões, escolhendo para cada ponto ancestral as posições que minimizam o deslocamento de um marco ao longo de todos os landmarks ancestrais/descendentes. Assim, as posições semelhantes de landmark em diferentes táxons podem ser explicadas por ancestralidade comum. A análise foi baseada em dados de morfologia externa, utilizando quatorze caracteres discretos e três configurações que representam diferentes estruturas. Trinta e oito marcos biologicamente homólogos foram selecionados para cada espécie. Foram testados diferentes alinhamentos e seus efeitos na melhoria da pontuação na árvore e das configurações de landmarks. Nossos dados mostram que a filogenia de Pseudopimelodidae baseada somente em configurações de landmark da morfologia externa não são informativas quando tratadas de forma independente, mas fornecem informações relevantes quando combinadas com dados discretos. Com base na morfologia externa, mostramos que os caracteres de morfometria geométrica podem ser adicionados em análises filogenéticas e fornecem evidências que somadas a outras fontes de caracteres trazem uma nova luz na filogenia de Pseudopimelodidade, como a compreensão da evolução morfológica da família. Esta foi a primeira hipótese filogenética produzida usando LAUP na sistemática de peixes de água doce neotropicais. Além deste estudo, descrevemos uma nova espécie de Microglanis, publicada recentemente na revista Ichthyological Exploration of Freshwaters, Volume 27, Número 3, páginas 193-202 (Apêndice 4). Microglanis nigrolineatus, é descrita de riachos da bacia do rio Bermejo, Argentina e se distingue de congêneres por possuir um padrão único de coloração: uma linha escura fina que se estende longitudinalmente através do meio do corpo e região dorsal da cabeça uniformemente escura sem áreas claras na região da nuca. Apesar dos estudos realizados por diversos autores, à medida que novas espécies vão sendo descobertas e novos táxons vão sendo adicionados à família, novas análises de relações filogenéticas são necessárias para compreender melhor a posição da família com relação as mais próximas, além das relações entre seus gêneros e espécies. Nesse sentido, os caracteres extraídos com esse novo método foram úteis para melhor compreensão da evolução morfológica dos Pseudopimedodidae.The systematics of Pseudopimelodidae Fernández-Yépez & Antón, 1966 has been target by a series of analyses and reviews concerning its phylogenetic position and the relationship of its internal groupings until reaching the current monophyletic and taxonomic status. The phylogenies produced so far, for Pseudopimelodidae, are based on traditional morphology and molecular characters. With the advancement of new techniques for the use of geometric morphometry in systematics, implementations in the TNT program allow the incorporation of quantitative data directly into cladistic analysis. This allows to translate the data obtained from geometric morphometry into phylogenetic characters capable of reflecting homologies in the form of species. To find morphometric characters for the Pseudopimelodidae we have tested LAUP (Landmark Analysis under Parsimony) that establishes ancestral states for a character that changes in two or three dimensions, choosing for each ancestral point the positions that minimize the displacement of landmarks along all ancestral/descendant. That is, the similar landmark positions in different taxa can be explained by common ancestry. The analysis was based on external morphology data, using fourteen discrete characters and three configurations representing different structures. Thirty-eight biologically homologous landmarks were selected for each species. Different alignments and their effects on the improvement of tree punctuation and landmarks configurations were tested. Our data show that the phylogeny of Pseudopimelodidae based only on landmark configurations of external morphology are not informative when treated independently but provide useful information when combined with discrete data. In this sense, landmark data helps support the branches with the new synapomorphies obtained for the family. Morphometric analysis using the body shape as a character, revealed changes of states in the landmarks characters that can be interpreted as synapomorphies and homoplasies. Based on the external morphology, we show that geometric morphometry can be added in phylogenetic analyses and provide evidence that when added to other sources of characters bring a new light in the phylogeny of Pseudopimelodidae, as the understanding of the morphological evolution of the family. This was the first phylogenetic hypothesis produced using LAUP in the systematics of neotropical freshwater fish. In addition to this study, we described a new species of Microglanis, recently published in the journal Ichthyological Exploration of Freshwaters, Volume 27, Number 3, pp. 193-202 (Appendix 4). Microglanis nigrolineatus is described from streams of the Bermejo River basin, Argentina and is distinguished from congeners by having a single-color pattern: a thin dark line that extends longitudinally through the middle of the body and dorsal region of the uniformly dark head without light areas on nuchal region. Despite the studies carried out by several authors, as new species are discovered and new taxa are added to the family, new analyzes of phylogenetic relationships are necessary to better understand the the position of the family with the closest ones, besides the relations between their genera and species. In this sense, the characters extracted with this new method were useful for a better understanding of the morphological evolution of the Pseudopimedodidae

Neogenesis of T and B cells in patients with sickle cell disease treated with different therapeutic modalities

As doenças falciformes (DF) constituem um grupo de doenças hereditárias monogênicas. São doenças extremamente relevantes no contexto de saúde pública no Brasil, portanto diferentes estratégias terapêuticas devem ser avaliadas. As oclusões vasculares afetam praticamente todos os órgãos, inclusive o baço e a medula óssea, porém não existem dados na literatura se estas comprometem também o tecido tímico. Os pacientes apresentam maior suscetibilidade às infecções cujas causas não são ainda totalmente esclarecidas Embora as infecções observadas nos pacientes sejam atribuídas à disfunção esplênica, o quadro inflamatório crônico e possíveis alterações no timo e na medula óssea, também poderiam causar uma disfunção imunológica. O objetivo deste trabalho foi avaliar a neogênese de células T e B e a diversidade do repertório de células T periféricas em pacientes com anemia falciforme (AF) sem tratamento (N = 15), tratados com hidroxiuréia (N = 20) ou transfusão crônica (N = 21) e em pacientes com DF tratados com transplante de células-tronco hematopoéticas (TCTH) alogênico (N = 29). Pacientes sem tratamento apresentaram menores níveis de sjTREC e ?-TREC, e menor taxa de divisão celular intratímica, demonstrando alterações importantes na neogênese das células T. A produção tímica de novas células T naïve foi reestabelecida em um ano pós-transplante, com normalização dos níveis de sjTREC e ?-TREC. O desenvolvimento de doença do enxerto contra o hospedeiro (DECHa) e reativação de citomegalovírus comprometeu a timopoiese nos primeiros seis meses pós-transplante, com diminuição significativa dos níveis de sjTRECs e ?-TRECs. Análises do repertório da cadeia V? dos receptores de células T (TCRs), pelo método TCRBV CDR3 spectratyping, indicaram que os pacientes com AF apresentaram um repertório menos diverso, composto predominantemente de famílias V? com padrão skewed e picos de CDR3 monoclonais, sendo a família V?3 mais frequente. A composição do repertório de células T foi alterada após o transplante, adquirindo um perfil mais policlonal dos picos de CDR3 ao longo do tempo. A família V?22 foi a mais expressa no período pré-transplante e em todos os seguimentos pós-transplante. Os pacientes com DF apresentaram aumento de linfócitos B naive, demonstrado pelos altos níveis de sjKRECs e pela taxa de proliferação homeostática. As análises multivariadas demonstraram que as alterações esplênicas influenciam diretamente os níveis de sjKREC, indicando que a baixa função esplênica leva ao aumento da produção de células B naive pela medula óssea, sugerindo um mecanismo compensatório. Os resultados desse trabalho demonstraram a existência de um desequilíbrio na neogênese de células T e B e consequentemente nesses compartimentos celulares periféricos, que pode conferir aos pacientes com DF uma maior susceptibilidade a infecções. Entre as diferentes modalidades terapêuticas, o TCTH alogênico sobressaiu-se em relação aos tratamentos convencionais, melhorando a neogênese de células T e B a longo prazo.Sickle Cell Disease (SCD) are a group of monogenic hereditary diseases. These are extremely relevant diseases in the context of public health in Brazil, thus, different therapeutic strategies must be studied. Vascular occlusions affect practically all organs, including the spleen and bone marrow. However, there are no literature data about the impact of vaso-occlusions on the thymic tissue. Patients are more susceptible to infections whose causes are not fully elucidated. Although the infections observed in these patients are assigned to splenic dysfunction, the chronic inflammatory state and possible alterations of the thymus and bone marrow could also lead to immune dysfunction. The goal of this work was to evaluate the neogenesis of T and B cells and the diversity of peripheral T cell repertoire in patients with sickle cell anemia (SCA) without treatment (N = 15), treated with hydroxyurea (N = 20) or chronic transfusions (N = 21) and in patients with SCD treated with hematopoietic stem cell transplantation (N = 29) allogeneic. Patients without treatment had lower levels of sjTREC and ?-TREC, and lower rate of intrathymic cell division, demonstrating important alterations in the neogenesis of T cells. The thymic production of new naïve T cells was reestablished at one-year post transplantation, with normalization of sjTREC and ?-TREC levels. The development of graft-versus-host disease (aGVHD) and cytomegalovirus activation compromised thymopoiesis in the first six months post transplantation, with a significant decrease of sjTRECs and ?-TRECs levels. Analysis of the TCR V? chain repertoire by TCRBV CDR3 spectratyping indicate that patients with SCA showed a less diverse repertoire, mainly composed by V? families with a skewed pattern and monoclonal CDR3 peaks, being the V?3 family the most frequent one. The composition of the T-cell repertoire was altered after transplantation, changing over time to more polyclonal profile of the CDR3 peaks. The V?22 family was the more expressed at pre-transplantation and at all follow-up periods. Patients with SCD presented increased numbers of naive B cells, demonstrated by higher levels of sjKRECs and homeostatic proliferation. Multivariate analysis demonstrated that splenic function directly influenced sjKREC levels, indicating that compromised splenic function leads to increase of naive B cell output by the bone marrow, suggesting a compensatory mechanism. The results of this study showed the existence of an imbalanced T and B cell neogenesis and, consequently on these peripheral cell compartments, which may confer to patients with SCD an increased susceptibility to infections. Among different therapeutic modalities, allogeneic HSCT stood out in relation to the conventional treatments, improving long-term T and B cell neogenesis

Description of a new species of Microglanis (Siluriformes: Pseudopimelodidae) from the Amazon basin, Amazonas State, Brazil

The first species of Microglanis from the rio Amazonas, Amazonas State, Brazil is described. This species differs from all congeners by the forked caudal fin, and color pattern of the supraoccipital region consisting of two elliptical and juxtaposed pale spots, besides a combination of morphometrics characters

Description of a new species of Microglanis (Siluriformes: Pseudopimelodidae) from the Amazon basin, Amazonas State, Brazil

The first species of Microglanis from the rio Amazonas, Amazonas State, Brazil is described. This species differs from all congeners by the forked caudal fin, and color pattern of the supraoccipital region consisting of two elliptical and juxtaposed pale spots, besides a combination of morphometrics characters

Ichthyofauna of the rio Araguaia basin, states of Mato Grosso and Goiás, Brazil

This study provides a list of fish species from tributaries of the rio Araguaia basin, in its upper-middle portions in the states of Mato Grosso and Goiás, Brazil. Fish assemblages were sampled in August 2008 using standard ichthyological gear along ten sampling sites. A total of 2246 individuals of 89 species, 21 families and five orders were collected. Most species collected were Characidae, Loricariidae and Cichlidae. The genera Serrapinnus, Hyphessobrycon and Hemigrammus were the most abundant and widely distributed in the total sampled area. The presence of endemic species, undescribed or with undefined taxonomic status requires attention to the knowledge and conservation of the Araguaia river basin ichthyofauna

Fishes (Osteichthyes: Actinopterygii) from igarapés of the rio Acre basin, Brazilian Amazon

This study presents a list of species from igarapés tributaries of the rio Acre, Acre State, Brazil. Fish assemblages were sampled in October 2009, August and October 2010, using standard ichthyological gear, along fifteen sampling sites. A total of 11,395 specimens, distributed in 94 species, 24 families and six orders were collected. The most species-rich orders were Characiformes with 45 species (48.4%) and Siluriformes with 33 species (34.7%); from which Serrapinnus gr. microdon (22.4%), Otocinclus vittatus (20.4%), Phenacogaster pectinatus (10.9%), Brachychalcinus copei (5.8%) and Knodus sp. (5.3%) represented 64.8 % of the specimens captured. The species accumulation curve does not present a stabilization tendency, indicating that, additional sampling can increase the number of species. This study has a high importance for the knowledge of the rio Acre fish fauna composition and adds 52 new records of species to the fish fauna of the rio Purus

Microglanis nigrolineatus, a new species from northwestern Argentina (Ostariophysi: Pseudopimelodidae)

Microglanis nigrolineatus, new species, is described from streams of Bermejo River basin, northwestern Argentina. It is distinguished from all congeners by a combination of characters including a unique coloration pattern: a thin dark line that runs along middle body from vertical line through dorsal-fin origin to end of adipose fin, delimiting two dark-brown areas ending in a dark blotch crossing entire body depth just anterior to caudal-fin origin and dorsal region of head uniformly dark, lacking a paler area on nuchal region. Also, thorn serrae on anterior margin of pectoral-fin spine are short. This is the first species of Microglanis described from Argentina.Fil: Teran, Guillermo Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Ribeirao Jarduli, Lucas. Universidad Estadual de Londrina; BrasilFil: Alonso, Felipe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Museo Argentino de Ciencias Naturales ; ArgentinaFil: Mirande, Juan Marcos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Akio Shibatta, Oscar. Universidad Estadual de Londrina; Brasi