A recent duplication revisited: phylogenetic analysis reveals an ancestral duplication highly-conserved throughout the Oryza genus and beyond

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The role of gene duplication in the structural and functional evolution of genomes has been well documented. Analysis of complete rice (<it>Oryza sativa</it>) genome sequences suggested an ancient whole genome duplication, common to all the grasses, some 50-70 million years ago and a more conserved segmental duplication between the distal regions of the short arms of chromosomes 11 and 12, whose evolutionary history is controversial.</p> <p>Results</p> <p>We have carried out a comparative analysis of this duplication within the wild species of the genus <it>Oryza</it>, using a phylogenetic approach to specify its origin and evolutionary dynamics. Paralogous pairs were isolated for nine genes selected throughout the region in all <it>Oryza </it>genome types, as well as in two outgroup species, <it>Leersia perrieri </it>and <it>Potamophila parviflora</it>. All <it>Oryza </it>species display the same global evolutionary dynamics but some lineage-specific features appear towards the proximal end of the duplicated region. The same level of conservation is observed between the redundant copies of the tetraploid species <it>Oryza minuta</it>. The presence of orthologous duplicated blocks in the genome of the more distantly-related species, <it>Brachypodium distachyon</it>, strongly suggests that this duplication between chromosomes 11 and 12 was formed as part of the whole genome duplication common to all Poaceae.</p> <p>Conclusion</p> <p>Our observations suggest that recurrent but heterogeneous concerted evolution throughout the <it>Oryza </it>genus and in related species has led specifically to the extremely high sequence conservation occurring in this region of more than 2 Mbp.</p

MIEUX VAUT PREVENIR QUE GUERIR : LA RESISTANCE VARIETALE, UN LEVIER A ACTIONNER

La lutte contre les maladies en agriculture biologique passe par des mesures préventives, et notamment par un choix de variétés présentant des résistances à un large panel de maladies. Depuis plusieurs années, un réseau d’essais de variétés de céréales bio est mis en place par les organismes de recherches wallons (CPL-VEGEMAR,CARAH, CEB, CRA-W). Ces essais permettent d’évaluer d’une part le potentiel des variétés en termes de rendement et de qualités technologiques et d’autre part, leur comportement face aux maladies. Dans la plupart des cas, plus une variété est sensible aux maladies, plus grand est le risque de voir son rendement diminuer. Les essais réalisés mettent en évidence quelques variétés résistantes à la plupart des maladies et d’autres, au contraire, qu’il est préférable d’éviter en bio

Analysis of carbon sequestration sensitivity to recent changes in land use patterns over Belgium using a combination of models and remote sensing techniques

Changes in land use/land cover (LU/LC) practices are critical to determine and this is one of the crucial driving forces of terrestrial ecosystem productivity and carbon sink variability. However, relatively few studies have quantified the impact of LU/LC change on the terrestrial carbon cycle. In the present study, we developed a workflow for quantifying and assessing changes in terrestrial carbon stocks due to land use change using a dynamic vegetation model. The main objectives are to assess status and variation in carbon stocks across land covers, towards the quantification of spatial distribution and dynamic variation of terrestrial carbon sinks in response to LU/LCchange. Here, with the CARAIB dynamic vegetation model, we perform simulations using several sets of LU/LC data to analyse the sensitivity of the carbon sink. Here we propose a new method of using satellite – and machine learning-based observation to reconstruct historical LU/LC change and compare it with static data from the cadastral map and dynamic data from an agent-based model coupled with CARAIB. It will quantify the spatial and temporal variability of land use during the 2000-2019 period over Belgium at high resolution. This study will give the space to analyse past information and hence calibrate the dynamic vegetation model to minimize uncertainty in the future projection (until 2035). Overall, this study allows us to understand the effect of changing land use pattern and identify the input dataset, which minimizes the uncertainty in model estimation

Congenital hydrocephalus : new Mendelian mutations and evidence for oligogenic inheritance

Peer reviewe

Cent scientifiques répliquent à SEA (Suppression des Expériences sur l’Animal vivant) et dénoncent sa désinformation

La lutte contre la maltraitance animale est sans conteste une cause moralement juste. Mais elle ne justifie en rien la désinformation à laquelle certaines associations qui s’en réclament ont recours pour remettre en question l’usage de l’expérimentation animale en recherche

Impact de la gamification sur la qualité de l’apprentissage de l’entrepreneuriat : Une mesure à travers l’outil « carte mentale »

Cette communication présente une recherche menée par une équipe d’enseignants chercheurs visant à étudier le niveau d’apprentissage d’un concept-seuil, l’empathie, chez des étudiants placés dans une expérience de cours gamifiée. Pour mesurer l’évolution de l’apprentissage suite à cette expérience, les auteurs ont analysé les cartes mentales de signification du terme « entrepreneuriat » réalisées à trois reprises par les étudiants (en début, milieu et fin de formation). Il en résulte que seule une très faible proportion des étudiants ayant réalisé les trois cartes successives semble avoir intégré, de façon profonde, le concept d’empathie. Assimilant cette expérimentation à un « espace liminal » dans lequel les étudiants ont été amenés à naviguer pour développer l’apprentissage du concept-seuil d’empathie (Irving et al., 2019), les auteurs épinglent des éléments de temporalité (expérience trop courte), d’intensité (peu d’émotions négatives intenses) et de perspective (trop peu de réflexivité auto-critique) pour tenter de comprendre ce résultat. Par ailleurs, les cartes mentales dévoilent la présence d’une pression isomorphique des outils mobilisés par les enseignants et des découpages qu’ils ont faits de la matière enseignée sur les représentations de ce qu’est l’entrepreneuriat chez certains étudiants

Can we re-enchant learning with games ? Analysis through the prism of threshold concepts

If some students discover the distinction between risk and uncertainty (Knight, 1921) in a book or a tweet, will they be able to grasp its meaning? Without having experienced their implications for entrepreneurial action, will they engage in a mental effort to integrate these two new concepts? Uncertainty or risk, isn’t it the same thing? Why bother making the effort to grasp it? Our teaching team decided to use games in its entrepreneurship elective because we thought it would motivate students and stimulate their commitment to learning in our entrepreneurship classes. We diverted existing games (video games, role plays, storytelling) and used them for unveiling key – but often troublesome – concepts in entrepreneurship, i.e. threshold concepts (Meyer and Land, 2005). Through games, learners would discover key entrepreneurial concepts - not in an abstract way and out of touch with reality - but in action