Studying protein–protein affinity and immobilized ligand–protein affinity interactions using MS-based methods

This review discusses the most important current methods employing mass spectrometry (MS) analysis for the study of protein affinity interactions. The methods are discussed in depth with particular reference to MS-based approaches for analyzing protein–protein and protein–immobilized ligand interactions, analyzed either directly or indirectly. First, we introduce MS methods for the study of intact protein complexes in the gas phase. Next, pull-down methods for affinity-based analysis of protein–protein and protein–immobilized ligand interactions are discussed. Presently, this field of research is often called interactomics or interaction proteomics. A slightly different approach that will be discussed, chemical proteomics, allows one to analyze selectivity profiles of ligands for multiple drug targets and off-targets. Additionally, of particular interest is the use of surface plasmon resonance technologies coupled with MS for the study of protein interactions. The review addresses the principle of each of the methods with a focus on recent developments and the applicability to lead compound generation in drug discovery as well as the elucidation of protein interactions involved in cellular processes. The review focuses on the analysis of bioaffinity interactions of proteins with other proteins and with ligands, where the proteins are considered as the bioactives analyzed by MS

Flyttbara strandbastun

Examensarbetet går ut på att planera och konstruera ett lämpligt övningsprojekt som andra årets studerande kunde utföra i yrkesskolan Inveon på husteknikenheten. Eftersom ett större eget projekt samt kundprojekt inte alltid är möjligt så planerade jag ett mindre projekt som ändå var tillräckligt krävande och som täcker de examensgrunder som finns för andra årets studerande. Examensarbetet inleds med att undersöka vilka olika typer av projekt som kan vara aktuella i detta sammanhang. Arbetet utgår från vilka examensgrunder som är bestämda för utbildningen i husteknik vid Inveon. Från examensgrunderna kunde jag bestämma vilka material samt vilka konstruktionslösningar som skulle användas. Med beställare Niclas Isaksson, enhetschef för husteknik vid Inveon bestämde vi att byggnaderna som jag planerade skulle vara flyttbara, samt att specialtransport skulle undvikas på grund av tilläggskostnader. I examensarbetet undersöker jag också vilka lagar och regler som gäller för denna typ av byggnader, med fokus på olika kommuners byggnadsordningar, markanvändnings- och bygglagen samt vilka regler trafikverket ställer på transporten. I examensarbetet ingick att planera tre olika modeller som yrkesskolan kunde tillverka, viktberäkning gällande transporten samt en kostnadsberäkning för den slutliga produkten.Opinnäytetyö koostuu kouluprojektin suunnittelemisesta sekä kehittämisestä, jota ammattikoulu Inveonin rakennuspuoli voisi käyttää toisen vuoden opiskelijoiden koulutuksessa. Koska oma isompi projekti tai asiakasprojekti ei aina ole mahdollista, niin suunnittelin pienemmän projektin, joka olisi tarpeeksi vaativa sekä kattaisi ne tutkinnon perusteet jotka on asetettu toisen vuoden opiskelijoille. Opinnäytetyössä selvitetään, minkä tyyppiset projektit sopivat toisen asteen koulutukseen. Työ perustuu tutkinnon perusteista, jotka on määrätty Inveonin rakennuspuolen opiskelijoille. Tutkinnon perusteista pystyin päättämään mitä materiaaleja ja suunnitteluratkaisuja tulisi käyttää. Opinnäytetyön tilaajan, Inveon rakennuspuolen yksikön päällikkö Niclas Isakssonin kanssa päätimme, että rakennukset tulisi olla siirrettäviä ja että erikoiskuljetuksia tulisi välttää lisäkustannuksien takia. Opinnäytetyössä tutkin myös lakeja sekä säädöksiä, jotka koskevat tämäntyyppisiä rakennuksia, erityisesti eri kuntien rakennusmääräyksiä, maankäyttö- ja rakennuslakia, sekä liikenneviraston määräyksiä koskien kuljetusta. Opinnäytetyöhön kuului kolmen erilaisen mallin suunnittelu, joita ammattikoulu voisi valmistaa, painolaskelma koskien kuljetusta, sekä kustannuslaskelma lopullisesta tuotteesta.The aim of this thesis is to plan and design an appropriate practical project for second-year students specializing in construction at the vocational school Inveon. Since large school or customer projects are not always available or possible I planned a small, but challenging enough project which meets the national qualification requirements for second-year students. The thesis begins by examining the types of projects that may be relevant in this context. The work is based on the qualification requirements that are defined for the Construction Builder study programme at Inveon. Based on these requirements I could determine what materials and design solutions that would be used. Together with the client Niclas Isaksson, the Head of the Construction Builder programme at Inveon, we decided that the buildings I planned would be removable, and that special transportation would be avoided because of the additional costs. This thesis also investigates the laws and regulations which apply to these types of buildings, focusing especially on different municipal building regulations, land use and construction law, as well as the requirements regarding transportation set by the traffic departments. The thesis includes the planning of three different models which could be produced by the vocational school students, weight calculations regarding transportation, and an estimate of the costs of the final product