7 research outputs found
ChemBoost: A Chemical Language Based Approach for Protein â Ligand Binding Affinity Prediction
- Author
- Publication venue
- 'Wiley'
- Publication date
- Field of study
No full textAmyand and de Garengeotâ hernias
- Author
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
No full textRaynaud's phenomenon as initial manifestation of cutaneous polyarteritis nodosa.
- Author
- Publication venue
- 'BMJ'
- Publication date
- Field of study
No full textCycloPs : generating virtual libraries of cyclized and constrained peptides including nonnatural amino acids
- Author
- Anthony J. Chubb
- Arbor S.
- Borgia J. A.
- Bray B. L.
- Brennan M. P.
- Burns V. A.
- Coin I.
- Convard T.
- Dalby A.
- Denis C. Shields
- Eckert H.
- Elise Bernard
- Fergal J. Duffy
- Hanessian S.
- Hruby V. J.
- Irwin J. J.
- Klopman G.
- Ladner R. C.
- Landrum G.
- Lipinski C. A.
- Marc Devocelle
- MĂ©lanie Verniere
- Nam N. H.
- Vagner J.
- Warren G. L.
- Weininger D.
- Weininger D.
- Willett P.
- Yang S.-Y.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- 24/03/2011
- Field of study
Get PDFWe introduce CycloPs, software for the generation of virtual libraries of
constrained peptides including natural and nonnatural commercially available amino acids.
The software is written in the cross-platform Python programming language, and features include
generating virtual libraries in one-dimensional SMILES and three-dimensional SDF formats,
suitable for virtual screening. The stand-alone software is capable of filtering the virtual libraries
using empirical measurements, including peptide synthesizability by standard peptide synthesis
techniques, stability, and the druglike properties of the peptide. The software and accompanying
Web interface is designed to enable the rapid generation of large, structurally diverse,
synthesizable virtual libraries of constrained peptides quickly and conveniently, for use in virtual
screening experiments. The stand-alone software, and the Web interface for evaluating these empirical properties of a single peptide,
are available at http://bioware.ucd.ie.Science Foundation Ireland12M embargo until 24/03/2012 - AV 17/06/201
ADME Evaluation in Drug Discovery. 2. Prediction of Partition Coefficient by Atom-Additive Approach Based on Atom-Weighted Solvent Accessible Surface Areas
- Author
- Abraham D. J.
- Broto P.
- Convard T.
- Debolt S. E.
- Eksterowicz J. E.
- Fujita T.
- Furet P.
- Gaillard P.
- Ghose A. K.
- Ghose A. K.
- Ghose A. K.
- Gombar V. K.
- Halgren T. A
- Hopfinger A. J.
- Hou T. J.
- Hou T. J.
- Hou T. J.
- Hou T. J.
- Kellogg G. E.
- Klopman G.
- Leo A
- Leo A.
- Leo A.
- Mannhold R.
- Meylan W. M.
- Nys G. G.
- Nys G. G.
- Sanner M. F.
- Suzuki T.
- Tafazzoli M.
- Wang R. X.
- Wildman S. A.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textQuantitative Structure-Activity Relationships and Crystallography in Industrial Drug Design
- Author
- A Avdeef
- A Avdeef
- AJ Leo
- AK Ghose
- AK Ghose
- BP Morgan
- C Hansch
- C Hansch
- C Hansch
- C Hansch
- C Silipo
- CD Selassie
- DB Boyd
- EM Parker
- F Gualtieri
- GJ Hatheway
- GR Marshall
- H Kubinyi
- H Kubinyi
- H Kubinyi
- H Kubinyi
- H Kubinyi
- H Kubinyi
- H König
- H-D Höltje
- H-D Höltje
- H-D Höltje
- H-D Höltje
- H-J Böhm
- H-J Böhm
- H-J Böhm
- H-J Böhm
- HEJ Bernard
- J-P Clozel
- JA Montgomery
- JA Montgomery
- JG Topliss
- JL Sussman
- JP Akbaraly
- MA Navia
- P Gund
- PA Bartlett
- PBMWM Timmermans
- PBMWM Timmermans
- RA Scherrer
- RF Rekker
- RF Rekker
- S Borman
- SH Reich
- T Convard
- T Fujita
- T Suzuki
- T Suzuki
- TJ Rydel
- TJ Rydel
- W Seidel
- WR Kester
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- 01/01/1995
- Field of study
No full textTheoretical Methods for the Description of the Solvent Effect in Biomolecular Systems
- Author
- Abagyan R.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham R. J.
- Adolf M.
- Aguilar M. A.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Aleman C.
- Aleman C.
- AlemĂĄn C.
- AlemĂĄn C.
- AlemĂĄn C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alkorta I.
- Allen M. P.
- Allinger N. L.
- Allinson S. A.
- Amara P.
- Amos A. T.
- Amovilli C.
- Andersen H. C.
- Anderson C. F.
- Andzelm J.
- Angyan J. G.
- Angyan J. G.
- Antes I.
- Antonczak S.
- Antosiewicz J.
- Applequist J.
- Applequist J.
- Aqvist J.
- Arad D.
- Aranud R.
- Assfeld X.
- Auffinger P.
- Augspurger J. D.
- Ayori M.
- Bachs M.
- Badawi H. M.
- Bakowies D.
- Bakowies D.
- Baldwin R. L.
- Banks J. L.
- Barone V.
- Barone V.
- Barril X.
- Barron L. D.
- Barrows S. E.
- Bash P. A.
- Bash P. A.
- Bash P. A.
- Bashford
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bask S. C.
- Bayliss N. S.
- Bayliss N. S.
- Baysal C.
- Bell R. L.
- Bell R. P.
- Ben-Naim A.
- Ben-Naim A.
- Benjamin I.
- Bentzien J.
- Berendsen H. J. C.
- Berendsen H. J. C.
- Bergethon P. R.
- Berman H. M.
- Beroza P.
- Beroza P.
- Bersuker I. B.
- Besley N. A.
- Besley N. A.
- Best S. A.
- Beveridge D. L.
- Beveridge D. L.
- Binder K.
- Biswas R.
- Blaney J. M.
- Bodor N.
- Bonaccorsi R.
- Bonaccorsi R.
- Bonaccorsi R.
- Bonaccorsi R.
- Born M.
- Bowie J. U.
- Brilliantov N. V.
- Broo A.
- Brooks B. R.
- Brooks C. L.
- Bryce R. A.
- Bryce R. A.
- BrÀuer M.
- Buchwold P.
- Burgi T.
- Böttcher C. J.
- Cabani S.
- Caldwell J.
- Calladine C. R.
- Calvo-Losada S.
- Cammi R.
- Cammi R.
- Cao X.
- Car R.
- Carlson H.
- Carlson H. A.
- Carrea G.
- Cartier A.
- Casari G.
- Castejon H.
- Catalan J.
- Chambers C. C.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandra A.
- Chang
- Chang T. M.
- Chang T. M.
- Cheng H. P.
- Cheng Y.-K.
- Chipot C.
- Chipot C.
- Chothia C.
- Chudinov G. E.
- Cieplak P.
- Cieplak P.
- Claverie
- Coitiño E. L.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colonna-Cesari F.
- Combined Quantum Mechanical
- Computer Simulation
- Constanciel R.
- Constanciel R.
- Contreras R.
- Convard T.
- Cornell W. D.
- Cossi M.
- Cossio F. P.
- Coulson C. A.
- Coutinho K.
- Cox C.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cubero E.
- Cubero E.
- Cubero E.
- Cukier R. I.
- Cummings P. J.
- Cummings P. J.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Curtiss L. A.
- Dagget V.
- Daggett V.
- Daleare D.
- Dang L. X.
- Dao-Pin X.
- Darden T. A.
- Dauber-Osguthorpe P.
- Daura X.
- Davis M. E.
- Davis M. E.
- Davis M. E.
- Davis M. E.
- Day P. N.
- De Bolt E.
- De Vries A. H.
- de Winter H.
- DeBolt S. E.
- den Otter W. K.
- Dewar M. J. S.
- Dickerson R. E.
- Dill K. A.
- Dillet V.
- Dillet V.
- Dimitrova Y.
- Dinner A. R.
- Diraison M.
- Dobson C. M.
- Dobson C. M.
- Doig A. J.
- Domingo L. R.
- Dominy B. N.
- Dong C. F.
- Drummond M. L.
- Drummond M. L.
- Duan Y.
- Edinger S.
- Edmonds D. T.
- Eisenberg D.
- Eksterowicz J. E.
- El-Nahas A. M.
- Elcock A. H.
- Elcock A. H.
- Essex J. W.
- Essmann U.
- Eurenius K. P.
- Fauchere J.
- Fawcet W. R.
- Ferenczy G. G.
- Fersht A. R.
- Field M.
- Field M. J.
- Fischer M.
- Fixman M.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Floris F.
- Floris F.
- Floris F. M.
- Foloppe N.
- Ford G. P.
- Forés M.
- Fraczhiewicz R.
- Francl M. M.
- Frecer V.
- Freindorf M.
- Friederichs M.
- Friedman H. L.
- Fujita T.
- Fuoss R.
- Furlani T. R.
- Furuki T.
- Gallego J.
- Gao
- Gao D.
- Gao D.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Ghose A. K.
- Gibson K. D.
- Giesen D. J.
- Giesen D. J.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Godzik
- Goldman S.
- Gong X.
- Gonzalez C.
- Goodsell D. S.
- Goodsell D. S.
- Gorb L. B.
- Gratias R.
- Greengard L.
- Gregoire F.
- Gregory J. K.
- Griffiths-Jones S. R.
- Grochowski P.
- Grote R. F.
- Grozema F. C.
- Gu J.
- Gueron M.
- Guven A.
- Halgren T. A.
- Hansch C.
- Hansch C.
- Hansch C.
- Hansen J. P.
- Hansson T.
- Harrison M. J.
- Harvey S. C.
- Hashimoto K.
- Hawkins G. D.
- Hawkins G. D.
- Hawkins G. D.
- Hawkins G. D.
- Head M. S.
- Hehre W. J.
- Heller H.
- Hendsch Z. S.
- Hermans J.
- HernĂĄndez B.
- HernĂĄndez B.
- Hingerty B.
- Hirata F.
- Hirata F.
- Hirata F.
- Ho L. L.
- Hobza P.
- Hobza P.
- Hockney R. W.
- Hodes Z. I.
- Hoffner E.
- Honig B.
- Honig B.
- Honig B.
- Hopfinger A.
- Horvath A. L.
- Hoshi H.
- Hoshi H.
- Howard A.
- Hulten J.
- Humphreys D. D.
- Huron M. J.
- Huron M. J.
- Huron M. J.
- Hutter M. C.
- Huuskonen J. J.
- Hwang J.-K.
- Hwang J.-K.
- Hwang J.-K.
- Hynes J. T.
- HĂŒnenberger P. H.
- HĂŒnenberger P. H.
- Ilich P.
- Ishida T.
- Ishiki H. M.
- Jackson J. D.
- Janssen R. H. C.
- Janssen R. H. C.
- Jarayam B.
- Jayaram B.
- Jayaram B.
- Jayaram B.
- Jayaram B.
- Jayaram J.
- Jean-Charles A.
- Jeffrey G. A.
- Jenson C.
- Jhon J. S.
- Jolibois F.
- Jones-Hertzog B. K.
- Jorgensen W.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Juwajima S.
- Kallies B.
- Kaminski G. A.
- Kamlet M. J.
- Kamlet M. J.
- Kang Y. K.
- Kang Y. K.
- Karplus M.
- Karplus M.
- Karplus M.
- Kawata M.
- Kawata M.
- Kawata M.
- Kikuchi O.
- Kim H.
- Kim Y.
- King G.
- King G.
- Kinoshita M.
- Kinoshita M.
- Kinoshita M.
- Kirkwood J.
- Kirkwood J. G.
- Kirkwood J. G.
- Klamt A.
- Klamt A.
- Klamt A.
- Klapper I.
- Klibanov A. M.
- Klopman G.
- Koehl P.
- Kollman P. A.
- Kollman P. A.
- Kollman P. A.
- Kollman P. A.
- Koneshan S.
- Kopka M. L.
- Kovalenko A.
- Kozaki T.
- Kozaki T.
- Kumar S.
- Kuntz I. D.
- Kuntz I. D.
- Kuntz I. D.
- Kurnikova M. G.
- Lagalante A. F.
- Lagalante A. F.
- Lamb M.
- Lapinski L.
- Lau K. F.
- Laughlan G.
- Laughton C.
- Laurence C.
- Lazaridis T.
- Lazaridis T.
- Lazaridis T.
- Lee F. S.
- Lee I.
- Lee S.
- Leo A.
- Levinthal C.
- Li A.
- Li G.
- Li J.
- Li J.
- Lias S. G.
- Lim J. H.
- Linder B.
- Liotard D. A.
- Liu H.
- Liu H.
- Liu K.
- Liu Q.
- Liu Y.-P.
- Loncharich R. J.
- Lopez X.
- Lovas F. J.
- Luo R.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luty B. A.
- Luzhkov V.
- Luzhkov V.
- Lyne P. D.
- Ma B.
- MacKerell A. D.
- MacKerell A. D.
- Madan B.
- Madura J. D.
- Majeux N.
- Mannhold R.
- Manning G. S.
- Marcus Y.
- Marcus Y.
- Marcus Y.
- Marcus Y.
- Marrone T. J.
- Martin M. G.
- Martin M. G.
- Martin Y. C.
- MartĂnez J. M.
- MartĂnez J. M.
- Masamura M.
- Maseras F.
- Massova I.
- Masuda T.
- Matsuoka O.
- Matthew J. B.
- Mavri J.
- Maw S. A.
- McCammon J. A.
- McCammon J. A.
- McCammon J. A.
- McCammon J. A.
- Mehler E. L.
- Mendoza M. L. S.
- Meng E. C.
- Mennucci B.
- Mente S.
- Meot-Ner M.
- Mestres J.
- Metropolis N.
- Meylan W. M.
- Mezei M.
- Miertus S.
- Miertus S.
- Miertus S.
- Miertus S.
- Miller K. J.
- Mills S. G.
- Misra V. K.
- Misra V. K.
- Moliner V.
- Moliner V.
- Momany F. A.
- Monard G.
- Monard G.
- Montagnani R.
- Montagnani R.
- Morao I.
- Morris G. M.
- Morris G. M.
- Moult J.
- Muegge I.
- Muller R. P.
- Nagan M. N.
- Nakamura E.
- Nandi P. K.
- Neuman M.
- Ni X.
- Nicholls A.
- Nilsson L.
- Nora-DĂez N.
- Northrip S. H.
- Novak M.
- Novoa J. J.
- Nozaki Y.
- Nyss G. C.
- Okuno Y.
- Olivares del Valle F. J.
- Olivares del Valle F. J.
- Onsager L.
- Ooi T.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orttung W. H.
- Orttung W. H.
- Orttung W. H.
- Orttung W. H.
- Palmer K. A.
- Pang Y. P.
- Parrinello M.
- Parsons D. F.
- Paulsen M.
- Pearson R. G.
- Perakyla M.
- Perkyns J. S.
- Perkyns J. S.
- Pettitt B. M.
- Pettitt B. M.
- Phillipe
- Pickersgill R. W.
- Pierotti R. A.
- Pierotti R. A.
- Pitarch J.
- Pitarch J.
- Pomelli C. S.
- Postman J. P. M.
- Prabhu N. V.
- Pranovo H. D.
- Pratt L. R.
- Price D. J.
- Purisima E. O.
- Purisima E. O.
- Qiu D.
- Quantitative Treatments
- Rablen P. R.
- Rablen P. R.
- Rajsekaran E.
- Rak J.
- Ramstein J.
- RamĂrez F. J.
- Rees D.
- Reichardt C.
- Reichardt C.
- Reiss H.
- Rekker R. F.
- Richard J. P.
- Rick S. W.
- Rick S. W.
- Rick S. W.
- Ridder L.
- Rinaldi D.
- Rivail J. L.
- Rivail J. L.
- Rivail J. L.
- Rockwell G. D.
- Rogers N. K.
- Rogers N. K.
- Romano S.
- Ross W. S.
- Rossky P. J.
- Rubin Y. V.
- Ruelle P.
- Ruelle P.
- Ruiz-LĂłpez M. F.
- Rullman J. A. C.
- Rullmann A.C.
- Rupley J. A.
- Russell S. T.
- Russell S. T.
- RĂos M. A.
- Safi B.
- Sagui C.
- Salvatella L.
- Sanchez M. L.
- Sato H.
- Sato H.
- Scarsi M.
- Schaefer M.
- Schaefer M.
- Scheraga H. A.
- Schlitter J.
- Scholes G. D.
- SchĂŒĂŒrmann
- SchĂŒĂŒrmann G.
- SchĂŒĂŒrmann G.
- Scott W. R. P.
- Scrocco E.
- Scrocco E.
- Scrocco E.
- Searle M. S.
- Searle M. S.
- Shao L.
- Sharp K.
- Sherer E. C.
- Shields G.
- Shields G.
- Shire S. J.
- Simonson T.
- Simonson T.
- Sines J. J.
- Singer S. J.
- Singh U. C.
- Singh U. C.
- Sinha R.
- Sitkoff D.
- Sitkoff D.
- Skolnick
- Smith B. J.
- Smith J.
- Smith M. A.
- Smith P. E.
- Smith P. E.
- Smith P. E.
- Smith R. H.
- Soliva R.
- Soliva R.
- Solntsev K. M.
- Spackova N.
- Spackova N.
- Sponer J.
- Sponer J.
- Sponer J.
- Srinavasan J.
- Srinivasa A.
- Srinivasan J.
- Srinivasan J.
- Staib A.
- Stanton R. V.
- Stanton R. V.
- Stanton R. V.
- Stefanovich J. B.
- Stern H. A.
- Stern H. A.
- Stewart J. J. P.
- Stewart J. J. P.
- Stewart J. J. P.
- Still W. C.
- Stillinger F.H.
- Stillinger F.H.
- Stofer E.
- Stone A.
- Stone A.
- Storer J. W.
- Straatsma T. P.
- Strajbl M.
- Strnad M.
- Stuart S. J.
- Sundaralingham M.
- Suzuki Y.
- SuĂĄrez D.
- Svensson M.
- Swiss K. A.
- Takano M.
- Takasu R.
- Takeuchi Y.
- Tanford C.
- Tanford C.
- Tanford C.
- Tanford C.
- Tanford G.
- Tapia
- Tapia
- Tapia O.
- Tapia O.
- Tapia O.
- Tara S.
- Tawa G. J.
- Tember B. L.
- Ten
- Ten
- Thole B. T.
- Thompson M. A.
- Thompson M. A.
- Thompson M. A.
- Thompson W. H.
- Théry V.
- Tirado-Rives J.
- Tirado-Rives J.
- Tirado-Rives J.
- Toba S.
- Toba S.
- Tomasi
- Tomasi J.
- Tomasi J.
- Tomasi J.
- Tongraar A.
- Tongraar A.
- Topol I. A.
- Tran V.
- Trout B. L.
- Truhlar D. G.
- Truhlar D. G.
- Truong T. N.
- Truong T. N.
- Truong T. N.
- Truong T. N.
- Tsantili-Kakoulidou A.
- Tsentalovich Y. P.
- Tu Y.
- Tuckerman B. J.
- Tuñón I.
- Tuñón I.
- van Belle D.
- van Belle D.
- van der Spoolel D.
- van der Waterbeemd H.
- van Duijnen P.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W.F.
- van Hoorn W. P.
- van Mourik T.
- Varnek A. A.
- Vasylyev V. V.
- Venkateswarlu D.
- Via J.
- Vincent M. A.
- Viswadadhan V. N.
- Voth G. A.
- Wang B.
- Wang L.
- Wang R.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warwicker J.
- Webb S. P.
- Wei D.
- Weiner S. J.
- Weiser J.
- Weiser J.
- Weiser J.
- Wesolowski T.
- Wesolowski T.
- Wesolowski T.
- Westheimer H. F. H.
- Westhof E.
- Whitlow M.
- Williams D. E.
- Wlodek S. T.
- Wolfenden R.
- Wolynes P. G.
- Yadav A.
- Yang A. S.
- Yang A. S.
- Yang A. S.
- You T. J.
- Young M. A.
- Yu H. A.
- Yu H. A.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zhang Y.
- Zhanpeisov N. U.
- Zhanpeisov N. U.
- Zhanpeisov N. U.
- Zheng C.
- Zhou R.
- Zhou Y.
- Zichi D. A.
- Zienkiewicz O.C.
- Zipse H.
- Zou X.
- Zwanzig R. W.
- Ă qvist J.
- Ă qvist J.
- Ă qvist J.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full text
