13 research outputs found
Distribution des biotopes principaux de la colonne dâeau. Sous-rĂ©gion marine MĂ©diterranĂ©e occidentale. Evaluation initiale DCSMM.
Distribution des biotopes principaux de la colonne dâeau. Sous-rĂ©gion marine Golfe de Gascogne. Evaluation initiale DCSMM.
Distribution des biotopes principaux de la colonne dâeau. Sous-rĂ©gion marine Mers celtiques. Evaluation initiale DCSMM.
Distribution des biotopes principaux de la colonne dâeau. Sous-rĂ©gion marine Manche - Mer du Nord. Evaluation initiale DCSMM.
Traitement des donnĂ©es phytoplanctoniques et pigmentaires disponibles dans les DOMs. Analyse complĂ©mentaire des nouvelles donnĂ©es acquises et proposition de nouvelles acquisitions et approches complĂ©mentaires. Livrable 1 : premiĂšres mĂ©triques et seuils pour les DOMs Ă partir des donnĂ©es bancarisĂ©es dans QuadrigeÂČ. Examen des donnĂ©es non bancarisĂ©es en vue de dĂ©finir leur qualitĂ©, de proposer des mĂ©triques et des seuils
Par son rÎle essentiel dans le fonctionnement des écosystÚmes aquatiques, le phytoplancton apparaßt comme un indicateur pertinent de la qualité des milieux marins.
En mĂ©tropole, diffĂ©rents groupes de masses dâeau ont Ă©tĂ© dĂ©finis, et les grilles qui sâappliquent aux diffĂ©rents indices (biomasse/ chlorophylle a, abondance / proportion de blooms) et qui permettent de classer chaque masse dâeau, sont propres Ă chaque groupe de masses dâeau.
Les trois dĂ©partements français dâoutre-mer Ă©tudiĂ©s ici (Martinique, Guadeloupe, et La RĂ©union) se caractĂ©risent par de fortes spĂ©cificitĂ©s environnementales. De maniĂšre gĂ©nĂ©rale, si les connaissances existantes tĂ©moignent du caractĂšre oligotrophe des eaux tropicales, les Ă©tudes localisĂ©es permettant de dĂ©crire les spĂ©cificitĂ©s des eaux cĂŽtiĂšres de Martinique, Guadeloupe et RĂ©union sont rares voire inexistantes. Dans ce contexte, les Ă©tudes et suivis initiĂ©s dans le cadre de la DCE revĂȘtent un caractĂšre particuliĂšrement important pour lâacquisition de connaissances sur le phytoplancton dans ces rĂ©gions.
Plusieurs rapports prĂ©sentent une synthĂšse des travaux rĂ©alisĂ©s dans les dĂ©partements français d'Outre-Mer ( eg., Caffier et Artigas, 2010b ; Buchet, 2008) dans le contexte de la mise en Ćuvre de la DCE. Une grande partie des donnĂ©es acquises dans le cadre de la DCE pour le phytoplancton et les mesures physico-chimiques associĂ©es, en Martinique et Guadeloupe, ont Ă©tĂ© bancarisĂ©es dans la base de donnĂ©es QuadrigeÂČ entre fin 2011 et dĂ©but 2012. Avec les donnĂ©es dĂ©jĂ saisies pour la RĂ©union, les donnĂ©es bancarisĂ©es couvrent
actuellement une période variable : globalement à partir de 2007, mais les données des deux années 2010 et 2011 ne sont pas toutes saisies.
Pour chaque région, la distribution de la concentration en chlorophylle a varie peu entre les différentes MEC. L'évolution temporelle de la concentration en chlorophylle a apparaßt, elle aussi, relativement uniforme. Cette premiÚre analyse descriptive des données de chlorophylle a
disponibles confirme donc le caractÚre oligotrophe des eaux cÎtiÚres antillaises et réunionnaises.
L'analyse de l'ensemble des donnĂ©es rĂ©cemment bancarisĂ©es dans la base QuadrigeÂČ a permis de rĂ©aliser des simulations dâĂ©valuation de la qualitĂ© des eaux, avec lâoutil dĂ©veloppĂ© au niveau national par Ifremer, et d'affiner la proposition de grilles pour l'indice biomasse, adaptĂ©es aux eaux ultra-marines (cf. livrable 21). Il convient nĂ©anmoins de souligner que les donnĂ©es acquises avec des mĂ©thodes non adaptĂ©es au mileu marin sont trĂšs sujettes Ă caution : il est donc nĂ©cessaire de bancariser le plus rapidement possible les donnĂ©es acquises depuis, avec des mĂ©thodes correctes, pour refaire les simulations. La prioritĂ© est donc de : (i) bancariser les donnĂ©es rĂ©centes, ce qui permettrait de relancer des simulations Ă lâautomne 2012, (ii) planifier le groupe dâexperts Phytoplancton et Hydrologie / DOMs, avant fin 2012
Traitement des donnĂ©es phytoplanctoniques et pigmentaires disponibles dans les DOMs. Analyse prĂ©liminaire des nouvelles donnĂ©es acquises et proposition de nouvelles acquisitions et approches complĂ©mentaires. Livrable 3 : Bilan de ce qui a Ă©tĂ© fait sur lâĂ©tat des lieux et identification des besoins prioritaires dans chaque DOM. Proposition de stratĂ©gies Ă suivre (approches, techniques, etc.). Rapport final
Missions, expertises, participations Ă des rĂ©unions et visio-confĂ©rences, travaux collaboratifs et Ă©changes se sont succĂ©dĂ© pendant l'annĂ©e 2011 entre les experts de mĂ©tropole et les correspondants dans les DOMs. Une mission, qui a eu lieu aux Antilles en mars 2011, ainsi que la participation aux COPILs de Guadeloupe et de Martinique fin 2011, ont permis d'Ă©changer sur les rĂ©sultats du suivi et des Ă©valuations provisoires de lâĂ©tat des masses d'eau, de proposer les ajustements nĂ©cessaires, et de prĂ©parer l'intĂ©gration des donnĂ©es DCE dans QuadrigeÂČ. Une proposition Ă©crite pour l'amĂ©lioration du plan de surveillance 2012 en Martinique a Ă©galement Ă©tĂ© faite, suivie d'effet. A La RĂ©union, l'expertise Ă©tant assurĂ©e par la station Ifremer locale, les contacts entre les experts de mĂ©tropole et La RĂ©union ont essentiellement portĂ© sur les Ă©valuations assurĂ©es par l'outil dĂ©veloppĂ© en mĂ©tropole par Ifremer. Les Ă©tudes spĂ©cifiques sur le phytoplancton menĂ©es dans les DOMs ont permis l'acquisition de premiĂšres connaissances sur l'Ă©cologie du phytoplancton. Au vu des informations disponibles, les indices DCE dĂ©veloppĂ©s pour la mĂ©tropole doivent ĂȘtre adaptĂ©s aux eaux cĂŽtiĂšres oligotrophes des Antilles et de la RĂ©union et des grilles ont Ă©tĂ© proposĂ©es. Par ailleurs, les eaux cĂŽtiĂšres de Guyane subissant une influence importante des apports des estuaires locaux et des apports amazoniens prĂ©sentent des caractĂ©ristiques les assimilant en partie aux eaux estuariennes. Les rĂ©sultats dâune Ă©tude rĂ©alisĂ©e Ă partir des premiĂšres donnĂ©es de mise en place de la DCE en Martinique pourraient permettre dâavancer sur les pistes dâun indice abondance amĂ©liorĂ©, et mĂȘme dâun indice composition, Ă partir des analyses des communautĂ©s micro, pico- et nano-planctoniques, avec dĂ©nombrements classiques au microscope, et mesures en cytomĂ©trie en flux. Pour ces derniĂšres, il apparait nĂ©cessaire d'acquĂ©rir des donnĂ©es supplĂ©mentaires pour pouvoir trouver les bonnes grilles de lecture. La prioritĂ© est clairement de progresser dans la connaissance de l'Ă©cologie du phytoplancton dans les systĂšmes tropicaux et pour progresser dans cette connaissance, il est nĂ©cessaire de disposer de donnĂ©es supplĂ©mentaires qui soient fiables pour une bonne exploitation des rĂ©sultats. Au vu des difficultĂ©s rencontrĂ©es, les efforts doivent ĂȘtre portĂ©s sur les trois postes suivants : vigilance sur les mĂ©thodes de prĂ©lĂšvement et d'analyse, poursuite de la bancarisation, acquisition de donnĂ©es supplĂ©mentaires. Les perspectives et propositions pour le moyen terme sont les suivantes : les analyses du nano- et du pico-phytoplancton pourraient notamment ĂȘtre mises en oeuvre Ă haute rĂ©solution spatio-temporelle grĂące Ă lâapplication en routine de la cytomĂ©trie en flux et lâutilisation de techniques comme les analyses pigmentaires par HPLC. Et d'autres techniques innovantes peuvent ĂȘtre envisagĂ©es telles celles testĂ©es actuellement en mĂ©tropole dans le cadre du projet NTERREG DYMAPHY (cytomĂ©trie en flux de type Cyto Sense, fluorescence totale ou spectrale Ă haute rĂ©solution temporelle, images satellitales) de mĂȘme que lâanalyse dâimage (FlowCAM / PhytoImage). En Guyane, la dĂ©finition de grilles spĂ©cifiques Ă ce dĂ©partement devrait se baser, en complĂ©ment des Ă©tudes IRD 2011 sur l'exploitation des donnĂ©es collectĂ©es dans le cadre de travaux doctoraux (do Rosario Marinho - Jaussaud, 2007) et de missions ultĂ©rieures sur la zone (CNRS â LOG Wimereux, ainsi que des pistes Ă©voquĂ©es pour la dĂ©finition dâindicateurs phytoplanctoniques en milieux estuariens (Caffier & Artigas 2010)
Traitement des donnĂ©es phytoplanctoniques et pigmentaires disponibles dans les DOMs. Analyse complĂ©mentaire des nouvelles donnĂ©es acquises et proposition de nouvelles acquisitions et approches complĂ©mentaires. Livrable 2 : rapport sur lâapplication de possibles indices phytoplanctoniques dans les DOMs Ă partir de lâanalyse des donnĂ©es disponibles ; proposition de mĂ©triques et seuils. Rapport final
Le paramĂštre choisi pour lâĂ©valuation de lâindice biomasse de lâĂ©lĂ©ment de qualitĂ© phytoplancton est la chlorophylle-a, et la mĂ©trique utilisĂ©e est le percentile 90. Des grilles doivent ĂȘtre dĂ©finies pour pouvoir assigner Ă chacune des masses dâeau la classe de qualitĂ© qui lui correspond du point de vue de cet indice. DiffĂ©rentes grilles, adaptĂ©es aux eaux trĂšs oligotrophes des trois dĂ©partements outre mer que sont la Martinique, la Guadeloupe et La RĂ©union, ont Ă©tĂ© testĂ©es, et les rĂ©sultats de ces simulations sont prĂ©sentĂ©s ici. Les Ă©tats des lieux initiaux et les Ă©tudes menĂ©es localement avaient dĂ©jĂ conduit Ă proposer des grilles. En Guadeloupe, les seuils provisoires retenus pour l'indice biomasse sont ceux initialement fixĂ©s Ă lâĂ©tat des lieux de 2006. En Martinique, l'analyse des donnĂ©es disponibles entre 2007 et 2010 a conduit Ă la rĂ©vision des grilles initialement proposĂ©es en 2006, lors de lâĂ©tat des lieux : les nouvelles grilles sont globalement plus contraignantes que celles de 2006. A La RĂ©union, cinq grilles ont Ă©tĂ© testĂ©es, et un groupe de travail Hydrologie rĂ©unissant des experts nationaux et rĂ©gionaux, a proposĂ© en 2010 de retenir la grille la plus contraignante (celle dĂ©finie pour la Corse), adaptĂ©e aux eaux oligotrophes. Un outil national, dĂ©veloppĂ© par Ifremer, permet de faire des simulations pour lâĂ©valuation de lâĂ©lĂ©ment de qualitĂ© phytoplancton, Ă partir de donnĂ©es bancarisĂ©es dans QuadrigeÂČ. Des simulations ont donc Ă©tĂ© rĂ©alisĂ©es avec cet outil pour les trois rĂ©gions Guadeloupe, Martinique et RĂ©union, avec les donnĂ©es disponibles au 7 fĂ©vrier 2012. Ces simulations ont Ă©tĂ© effectuĂ©es pour lâindice biomasse avec les grilles suivantes : (i) une grille 1 « Corse », proposĂ©e pour les eaux cĂŽtiĂšres oligotrophes de Corse, (ii) une grille 2 « Guadeloupe », proposĂ©e en Martinique en 2006, (iii) une grille 3 « Martinique » proposĂ©e en 2010 en Martinique pour le type C29, (iv) une grille 4 « IntermĂ©diaire », basĂ©e sur la grille proposĂ©e pour les masses dâeau cĂŽtiĂšres en Corse, en plus restrictive. Les rĂ©sultats dĂ©taillĂ©s de ces simulations sont prĂ©sentĂ©s en trois annexes, une pour chaque rĂ©gion. Les conclusions de ce travail sont : (i) la grille 3 « Martinique » semble la plus adaptĂ©e aux eaux cĂŽtiĂšres oligotrophes tropicales de Martinique, et pourrait sâĂ©tendre aux eaux de Guadeloupe, moyennant vĂ©rification ultĂ©rieure. Pour La RĂ©union, la grille 1 a Ă©tĂ© retenue par le groupe de travail Hydrologie 2010, il serait cependant intĂ©ressant dâavoir un retour dâavis sur lâutilisation de la grille 3, lĂ©gĂšrement plus contraignante, mais peut ĂȘtre plus nuancĂ©e. Il est maintenant trĂšs important dâavoir des retours des intervenants et experts locaux sur ces conclusions, afin dâaffiner si possible ces choix de grilles. De nouvelles simulations devront de toute façon ĂȘtre rĂ©alisĂ©es quand de nouvelles donnĂ©es auront Ă©tĂ© stockĂ©es dans QÂČ, ce qui permettra de consolider le choix des grilles. Par ailleurs, les donnĂ©es disponibles dans les masses d'eau de transition de Martinique sont insuffisantes pour proposer des grilles adaptĂ©es Ă ce type. De mĂȘme, l'absence de donnĂ©es pour les masses d'eau rĂ©cifales de la RĂ©union ainsi que pour les masses d'eau cĂŽtiĂšres et de transition de Guyane, prĂ©sentant par ailleurs des spĂ©cificitĂ©s Ă©cologiques marquĂ©es, ne permettent pas de rĂ©aliser de telles simulations. La prioritĂ© est donc de : (i) bancariser les donnĂ©es rĂ©centes, ce qui permettrait de relancer des simulations Ă lâautomne 2012, (ii) planifier le groupe dâexperts Phytoplancton et Hydrologie / DOMs, avant fin 2012. Ce rapport comprend trois annexes
DĂ©veloppement dâindicateurs de biodiversitĂ©: comparaison des donnĂ©es classiques et molĂ©culaires pour Ă©tudier les changements de composition des communautĂ©s microbiennes marines
National audienc