C-terminus of transcription factor TnrA from Bacillus subtilis controls DNA-binding domain activity but is not required for dimerization

The transcription factor TnrA, which belongs to the MerR transcription regulators, in Bacillus subtilis controls genes of nitrogen metabolism during nitrogen limiting conditions. As all the DNA-binding proteins, it is active as a dimer in cells, but the dimerization site is still unknown. The multiple alignment of TnrA homologs from other Bacilli allowed to identify the putative dimerization sites. Using the C-terminal truncated TnrA proteins it is established, that, in contrast to other MerR-proteins, the TnrA C-terminus does not participate in dimerization. Surface plasmon resonance has revealed that C-terminus truncations of TnrA do not inactivate its DNA-binding activity. Contrary, increased the affinity towards DNA, confirming that C-terminus controls the DNA-binding activity in a full-length TnrA. © 2013 Pleiades Publishing, Ltd

Роль возникновения задней отслойки стекловидного тела в патогенезе первичной закрытоугольной глаукомы

PURPOSE: Study of changes in the posterior part of eyes predisposed to primary angle-closure glaucoma (PACG) that contribute to patient's conversion from risk group to the disease. METHODS: 135 patients (223 eyes) anatomically predisposed to PACG development (37-88 years old, 87 females, 48 males) were studied and monitored for 4 years. PACG diagnosis had not been verified previous to the study. 176 eyes were pair eyes of 88 patients; in other 47 cases only one eye of the patient was studied because PACG had already been diagnosed in the second eye. Apart from standard ophthalmological study all patients underwent ß-scan ocular ultrasound and prone-position provocative test for angle-closure glaucoma (Hyams test), during which the patients lay in prone position for 1 hour and IOP was measured before and right after the test. RESULTS: The eyes were divided into 2 groups depending on the Hyams test results: the 1-st group included patients with positive test results (IOP increase >5 mmHg) and the 2-nd group (risk group) - patients with negative test results (IOP increaseЦЕЛЬ. Изучение в заднем отрезке глаза изменений, участвующих в переходе глаз, предрасположенных к первичной закрытоугольной глаукоме (ПЗУГ), из группы риска в реальную форму заболевания. МЕТОДЫ. В течение 4 лет обследовано 223 глаза (135 пациентов в возрасте от 37 до 88 лет, из них 87 женщин и 48 мужчин) с анатомической предрасположенностью к ПЗУГ, находящихся в группе риска, но пока еще без зафиксированных подъемов внутриглазного давления (ВГД) и без верифицированного диагноза ПЗУГ. 176 глаз были парными глазами у 88 пациентов. У 47 пациентов исследовался только один глаз, а второй не соответствовал критериям исследования, поскольку ранее на нем уже была диагностирована ПЗУГ и назначено лечение. Среди методов исследования делали акцент на проведение нагрузочной пробы Хеймса (с укладкой пациента вниз лицом на 1 час и контролем ВГД до и после пробы) и на ультразвуковое В-сканирование заднего отрезка глаза. РЕЗУЛЬТАТЫ. После проведения пробы Хеймса пациенты были разделены на 2 группы: 1-я группа с положительным результатом пробы (подъем ВГД более 5 мм) и 2-я - с отрицательным результатом пробы. Положительный результат пробы Хеймса рассматривался как решающий фактор для установления диагноза ПЗУГ и назначения необходимого лазерного или медикаментозного лечения, а случаи с отрицательной пробой Хеймса оставляли в группе риска с последующим мониторингом и контрольными исследованиями 1 раз в 6 месяцев. У 31 пациента, когда исследовались оба глаза, на одном глазу проба Хеймса была положительной, а на другом - отрицательной. Выявлено, что проба Хеймса была положительной только на тех глазах (67,7%), на которых эхографически зафиксировано наличие задней отслойки стекловидного тела (ЗОСТ). При отсутствии ЗОСТ, несмотря на узкий УПК, проба Хеймса всегда была отрицательной. В 27 глазах в процессе динамического мониторинга была выявлена трансформация нагрузочной пробы Хеймса из отрицательной в положительную, что трактовали как переход глаза из группы риска в группу с реальной формой ПЗУГ. Во всех случаях трансформация результатов пробы сопровождалась обнаружением ЗОСТ, которая в этих глазах отсутствовала в начале мониторингового наблюдения. ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Представленные наблюдения позволяют предположить существование связи между возникновением ЗОСТ и переходом глаз с анатомической предрасположенностью к ПЗУГ из группы риска в реальную форму заболевания. Сделано предположение, что возникновение ЗОСТ нарушает стабильность положения СТ в витреальной полости, что при неблагоприятных условиях приводит к микроэкскурсиям СТ и смещению кпереди иридохрусталиковой диафрагмы. Это провоцирует возникновение гидродинамических блоков и повышение ВГД по закрытоугольному типу

Survival and long-term maintenance of tertiary trees in the Iberian Peninsula during the Pleistocene. First record of Aesculus L.

The Italian and Balkan peninsulas have been places traditionally highlighted as Pleistocene glacial refuges. The Iberian Peninsula, however, has been a focus of controversy between geobotanists and palaeobotanists as a result of its exclusion from this category on different occasions. In the current paper, we synthesise geological, molecular, palaeobotanical and geobotanical data that show the importance of the Iberian Peninsula in the Western Mediterranean as a refugium area. The presence of Aesculus aff. hippocastanum L. at the Iberian site at Cal Guardiola (Tarrasa, Barcelona, NE Spain) in the Lower– Middle Pleistocene transition helps to consolidate the remarkable role of the Iberian Peninsula in the survival of tertiary species during the Pleistocene. The palaeodistribution of the genus in Europe highlights a model of area abandonment for a widely-distributed species in the Miocene and Pliocene, leading to a diminished and fragmentary presence in the Pleistocene and Holocene on the southern Mediterranean peninsulas. Aesculus fossils are not uncommon within the series of Tertiary taxa. Many appear in the Pliocene and suffer a radical impoverishment in the Lower–Middle Pleistocene transition. Nonetheless some of these tertiary taxa persisted throughout the Pleistocene and Holocene up to the present in the Iberian Peninsula. Locating these refuge areas on the Peninsula is not an easy task, although areas characterised by a sustained level of humidity must have played an predominant role

C-terminus of transcription factor TnrA from Bacillus subtilis controls DNA-binding domain activity but is not required for dimerization

The transcription factor TnrA, which belongs to the MerR transcription regulators, in Bacillus subtilis controls genes of nitrogen metabolism during nitrogen limiting conditions. As all the DNA-binding proteins, it is active as a dimer in cells, but the dimerization site is still unknown. The multiple alignment of TnrA homologs from other Bacilli allowed to identify the putative dimerization sites. Using the C-terminal truncated TnrA proteins it is established, that, in contrast to other MerR-proteins, the TnrA C-terminus does not participate in dimerization. Surface plasmon resonance has revealed that C-terminus truncations of TnrA do not inactivate its DNA-binding activity. Contrary, increased the affinity towards DNA, confirming that C-terminus controls the DNA-binding activity in a full-length TnrA. © 2013 Pleiades Publishing, Ltd

C-terminus of transcription factor TnrA from Bacillus subtilis controls DNA-binding domain activity but is not required for dimerization

The transcription factor TnrA, which belongs to the MerR transcription regulators, in Bacillus subtilis controls genes of nitrogen metabolism during nitrogen limiting conditions. As all the DNA-binding proteins, it is active as a dimer in cells, but the dimerization site is still unknown. The multiple alignment of TnrA homologs from other Bacilli allowed to identify the putative dimerization sites. Using the C-terminal truncated TnrA proteins it is established, that, in contrast to other MerR-proteins, the TnrA C-terminus does not participate in dimerization. Surface plasmon resonance has revealed that C-terminus truncations of TnrA do not inactivate its DNA-binding activity. Contrary, increased the affinity towards DNA, confirming that C-terminus controls the DNA-binding activity in a full-length TnrA. © 2013 Pleiades Publishing, Ltd