Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla

The objective of this work was to evaluate the effect of the distribution of QTL effects, of the type of validation population, and of phenotype adjustment in the accuracy of genome-wide selection. Two populations of full siblings with 500 individuals were simulated, with 1,000 loci markers being genotypically considered – 100 linked to QTL. The QTL effects had uniform or exponential distribution. For validation 1, a 100-individual sample constituted the validation population; in validation 2, cross validation was applied, with a 100-individual sample in five replicates; and in validation 3, a second generation formed the validation population. The analysis methodologies used were RR-Blup and Blasso, with mixed models for phenotype correction. Without phenotypic correction, the exponential distribution led to higher accuracies, and the Blasso method showed greater accuracy with this distribution; while RR-Blup was more accurate with uniform distribution. In this scenario without correction, validations 1 and 3 were more accurate. With phenotypic correction, exponential and uniform distributions led to similar accuracies, and the Blasso method proved more accurate for both of them. In this scenario, validations 1 and 2 were more accurate. Generally, the RR-Blup method was more accurate, and the Blasso method was less biased.O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores – 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RR-Blup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas. No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado

Aves do Parque Nacional da Serra do Cipó: o Vale do Rio Cipó, Minas Gerais, Brasil The birds of "Parque Nacional da Serra do Cipó": the Rio Cipó valley, Minas Gerais, Brazil

Foi conduzido um levantamento de espécies de aves do Vale do alto Rio Cipó durante o período de maio de 1998 a novembro de 2002. A região está totalmente inserida em uma das unidades de conservação mais importantes do sudeste do Brasil, o Parque Nacional da Serra do Cipó, em Minas Gerais. O método utilizado foi o de observação direta ao longo de 'transectos', captura com redes e identificação a partir do uso de vocalizações. A riqueza de espécies foi estimada usando-se o método de 'jackknife'. Foram registradas 226 espécies de aves pertencentes a 43 famílias. Isso corresponde cerca de 27% das 837 espécies já registradas para o bioma do Cerrado. Foram capturados 2.249 indivíduos num total de 4.486,82 horas-rede, onde foram amostradas 119 espécies pertencentes a 23 famílias. A riqueza foi estimada em 239 &plusmn; 5 espécies. Constam nesta lista seis espécies endêmicas do Cerrado: Augastes scutatus (Temminck, 1824) (Trochilidae), Hylocryptus rectirostris (Wied-NeuWied, 1821) (Furnariidae), Antilophia galeata (Lichtenstein, 1832) (Pipridae), Cyanocorax cristatellus (Temminck, 1823) (Corvidae), Charitospiza eucosma (Oberholser, 1905), Saltator atricollis (Vieillot, 1817), e Porphyrospiza caerulescens (Wied-Neuwied, 1830) (Emberizidae). Ocorrem também três espécies quase-ameaçadas de extinção: Sarcoramphus papa (Linnaeus, 1758) (Cathartidae), Cypsnagra hirundinacea (Lesson, 1831) e Charitospiza eucosma (Emberizidae). O Vale do Rio Cipó abriga uma porção significativa da avifauna do Cerrado. Alguns dos habitat encontrados no Vale estão se tornando cada vez mais raros na região do Cerrado de todo o Brasil, como as matas ciliares e o sistema de lagoas temporárias ao longo dos rios. Mesmo as cachoeiras, habitat importante para várias espécies, vêm desaparecendo em outras regiões do Brasil. Nesse sentido, a região do Vale do Rio Cipó dentro Parque consolida um dos seus objetivos que é a conservação da biodiversidade.<br>It is presented a bird survey of Rio Cipó valley from May 1998 to November 2002. The region is within the premises of 'Parque Nacional da Serra do Cipó', one of the most important conservation units of southeastern Brazil. Bird census were carried out through transect, mist-net captures and recording bird vocalizations. Species richness was estimated by jackknife method. It was recorded 226 species, belonging to 43 families. This represents 27% of all 837 bird species recorded at the Cerrado (a Savannah-like biome) region of central Brazil. A total of 2,249 bird individuals were captured with 4,486.82 net-hours. This represented 119 bird species of 23 families. Species richness was estimated at 239 &plusmn; 5 species. Six species are considered endemic to this biome: Augastes scutatus (Temminck, 1824) (Trochilidae), Hylocryptus rectirostris (Wied-NeuWied, 1821) (Furnariidae), Antilophia galeata (Lichtenstein, 1832) (Pipridae), Cyanocorax cristatellus (Temminck, 1823) (Corvidae), Charitospiza eucosma (Oberholser, 1905), Saltator atricollis (Vieillot, 1817), and Porphyrospiza caerulescens (Wied-Neuwied, 1830) (Emberizidae). Three species are considered near-threatened to extinction: Sarcoramphus papa (Linnaeus, 1758) (Cathartidae), Cypsnagra hirundinacea (Lesson, 1831), and Charitospiza eucosma (Emberizidae). The Rio Cipó valley holds a significant number of the Cerrado bird species. Some habitats within this biome are becoming rare in the Cerrado region such as gallery forests, and the temporary lagoons along the rivers. Even waterfalls are disappearing in other regions of Brazil. In this sense, the 'Parque Nacional da Serra do Cipó' is achieving one of its aims, which is biodiversity conservation