Random regression models in the selection of meat‑type quails for egg production

O objetivo deste trabalho foi avaliar modelos de regressão aleatória com diferentes ordens de polinômios de Legendre, quanto ao melhor ajuste para a produção de ovos de codornas de corte. Foram avaliados os grupos genéticos UFV1 e UFV2 de codornas de corte, de origens distintas, do programa de melhoramento genético da Universidade Federal de Viçosa. Determinou-se a produção semanal de ovos de 1.294 matrizes, da 6ª até a 57ª semana de idade, das quais 644 do grupo genético UFV1 e 650 do UFV2. Utilizou-se o modelo animal em regressão aleatória pelo programa Wombat e, para modelar as trajetórias das características com o tempo, aplicaram-se as funções polinomiais de Legendre. Foram feitas comparações pelo critério de informação de Akaike, critério de informação bayesiano de Schwarz, logaritmo da função de verossimilhança e teste da razão de  verossimilhança. O modelo com K = 3, para efeitos fixos, Ka = 4, para efeitos genéticos, e Kc = 4, para efeito de ambiente, propicia melhor ajuste para ambas as linhagens, não provoca grandes alterações nos componentes de variância e fornece melhores estimativas de herdabilidade.The objective of this work was to evaluate random regression models with different orders of Legendre polynomials, as to the best fit for egg production of meat‑type quails. UFV1 and UFV2 genetic groups of meat‑type quails, from different origins, of the genetic breeding program of the Universidade Federal de Viçosa, Brazil, were evaluated. Egg production was determined weekly for 1,294 quails, from their 6th to their 57th week of age, of which 644 were from the genetic group UFV1, and 650 from UFV2. The animal model was used in random regression by Wombat software, and, for modeling variable trajectories in time, the Legendre’s polynomial functions were applied. Comparisons were made by the Akaike’s information criterion, the Bayesian information criterion of Schwarz, the logarithm of the likelihood function, and the likelihood ratio test. The model with K = 3, for fixed effects, Ka = 4, for genetic effects, and Kc = 4, for the effect of environment provides the best fit, do not causes major changes in the variance components, and provides better estimates of heritability

Utilização de dados parciais na seleção de codornas de corte para produção de ovos

The objective of this work was to verify the possibility of using partial data in the selection of meat-type quail for egg production. The genetic groups UFV1 and UFV2 of meat-type quails, which are from different origins were evaluated. Information from 1,632 mothers, of which 816 from UFV1 and 816 from UFV2 genetic group, was used. The genetic parameters were obtained at the partial periods from the 6th to 24th (P24), 32th (P32), 40th (P40) and 48th (P48) weeks, and at the total period of egg production (P52), from the 6th to 52th week. The components of variance and covariance and the genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood, using a univariate animal model. The partial and total production of eggs were estimated by the multivariate animal model through the Wombat application. For UFV1, the heritability values were: 0.09, P24; 0.09, P32; 0.09, P40; 0.08, P48; and 0.07 for P52; and the genetic correlations ranged from 0.79 to 0.99. For UFV2, the heritability values were: 0.09 for P24; 0.09, P32; 0.10, P40; 0.11, P48; and 0.13 for P52; and correlations ranged from 0.70 to 0.99. For UFV1 selection, it is recommended to consider egg production up to 40 weeks, and for UFV2 selection, egg production until the 48th week. The low heritability estimates suggest that management changes should be done in order to control  environmental effects.O objetivo deste trabalho foi verificar a possibilidade de uso de dados parciais na seleção de codornas de corte para produção de ovos. Foram avaliados os grupos genéticos de codornas de corte UFV1 e UFV2, de origens distintas. Utilizaram-se informações de 1.632 matrizes, das quais 816 provieram do grupo genético UFV1, e 816 do grupo UFV2. Os parâmetros genéticos foram obtidos nos períodos parciais da 6ª semana até a 24ª (P24), a 32ª (P32), a 40ª (P40) e a 48ª (P48) semanas, e no período total de produção de ovos (P52), da 6ª à 52ª semana. Os componentes de variância e covariância e os parâmetros genéticos foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, pelo modelo animal unicaracterístico. A produção parcial e a total de ovos foram estimadas pelo modelo animal multicaracterístico, por meio do aplicativo Wombat. Para UFV1, os valores de herdabilidade foram: 0,09, P24; 0,09, P32; 0,09, P40; 0,08, P48; e 0,07 para P52; as correlações genéticas variaram de 0,79 a 0,99. Para UFV2, os valores de herdabilidade foram: 0,09, P24; 0,09, P32; 0,10, P40; 0,11, P48; e 0,13 para P52; as correlações variaram de 0,70 a 0,99. Para a seleção de UFV1, recomenda-se considerar a produção de ovos até a 40ª semana e, para UFV2, até a 48ª semana. As baixas estimativas de herdabilidade indicam que se devem fazer mudanças de manejo para controlar os efeitos de ambiente

Proportion of different scenarios of selection methods, mating types and sexual reasons in characteristics quail cutting using simulation

Objetivou-se comparar diferentes cenários incluindo métodos de seleção, tipos de acasalamento e razões sexuais em características de interesse econômico de codornas de corte a longo prazo. Foram simulados para cada característica (peso ao abate, rendimento de carcaça e mortalidade) diferentes genomas similares ao da codorna européia por meio do programa computacional GENESYS. A partir de cada genoma foi obtido inicialmente uma população base de 1200 indivíduos (600 machos e 600 fêmeas) heterozigotos sem nenhum parentesco entre si. Posteriormente, foi formada a população inicial através da amostragem e acasalamento aleatório de 204 machos e 204 fêmeas obtendo uma população inicial de 2040 indivíduos correspondentes a um número médio de 10 descendentes por fêmea. Depois de formadas a populações iniciais, teve início à formação das populações de seleção, num total de 24 para cada característica, correspondendo aos cenários formados por dois métodos de seleção (SI= Individual e BP= BLUP), quatro razões sexuais (D1= 204 machos: 204 fêmeas; D2= 102 machos: 204 fêmeas; D3= 68 machos: 204 fêmeas; e D4= 51 machos: 204 fêmeas) e três sistemas de acasalamento (RAA= Reprodutores Acasalados Aleatoriamente; EIC= Exclusão de Irmãos Completos; EICMI= Exclusão de Irmãos Completos e Meio-Irmãos) ao longo de 20 gerações com 10 repetições. As populações sob seleção foram comparadas através dos parâmetros: valor fenotípico, coeficiente médio de endogamia, fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e limite da seleção. Observou-se que quanto ao método de seleção, os valores fenotípicos médios em geral foram superiores para o BLUP, principalmente na característica peso ao abate. Entretanto, os indivíduos submetidos ao BLUP resultaram em maior incremento do coeficiente de endogamia, maior percentagem de fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e a maior redução no limite de seleção. O aumento das razões sexuais influenciou principalmente os coeficientes de endogamia dentro da população. Os sistemas de acasalamento que excluíram o cruzamento entre aparentados (EIC e EICMI) foram determinantes na redução da endogamia, além de proporcionarem um aumento da fixação de alelos favoráveis e redução na fixação de alelos desfavoráveis e no limite da seleção.This study aimed to compare different scenarios including methods of selection, mating and sexual reasons economic interest characteristics of quails in the long term. Were simulated for each trait (slaughter weight, carcass yield and mortality) different genomes similar to the European quail through the computer program GENESYS. From each genome was originally obtained from a population base of 1200 patients (600 males and 600 females) heterozygotes with no relationship to one another. Subsequently, the initial population was formed by random sampling and mating of 204 males and 204 females obtaining an initial population of 2040 individuals corresponding to an average number of offspring per female 10. Formed after the initial populations began the formation of the selected populations, a total of 24 for each characteristic, corresponding to scenarios formed by two selection methods (SI= Single and BP= BLUP), four sex ratios (D1= 204 males: 204 females; D2= 102 males: 204 females; D3= 68 males: 204 females, and D4= 51 males: 204 females) and three mating systems (RAA= Players randomly mated; EIC= Deleting Brothers Completion; EICMI= Deleting Brothers Full and Half-Brothers) over 20 generations with 10 repetitions. Populations under selection were compared using the parameters: phenotypic value, the average coefficient of inbreeding, fixation of favorable and unfavorable alleles and selection limit. It was observed that the method of selection, the phenotypic values were generally higher for the BLUP, especially in the characteristic slaughter weight. However, individuals undergoing BLUP resulted in higher increase in inbreeding coefficient, the greater percentage of fixation favorable and unfavorable alleles and greater reduction in threshold selection. The increase in sex ratios mainly influenced coefficients of inbreeding within the population. Mating systems that excluded the crossing among relatives (EIC and EICMI) were instrumental in reducing inbreeding, besides providing an increased fixation of favorable alleles and reduction in unfavorable allele fixation and selection limit.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológic

Herdabilidade de características de produção e postura em matrizes de codornas de corte Heritability of production and laying traits in meat-type quails

Objetivou-se no presente trabalho determinar herdabilidades de características de desempenho produtivo e reprodutivo de diferentes grupos genéticos de matrizes de codornas de corte, estimando os parâmetros genéticos por meio de análises univariadas. Foram avaliados dois grupos genéticos (UFV1 e UFV2), no período de 2006 a 2009, sendo acompanhadas cinco gerações, totalizando 2136 matrizes. As codornas foram pesadas ao nascimento, 7, 14, 21, 28, 35, 42, 77, 112 e 147 dias de idade. Foram avaliados ovos de cada codorna, coletados por três dias consecutivos, durante quatro períodos de 35 dias e medidos a largura e comprimento dos ovos, pesos de gema, casca e albúmen. Também foi avaliada a gravidade específica dos ovos e mensuradas a taxa de postura total e a idade ao primeiro ovo. Foram realizadas análises univariadas para estimação dos componentes de variância, utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita, por meio do programa MTDFREML e calculadas as hedabilidades. Para as características de qualidade dos ovos, as herdabilidades apresentaram valores de moderados a altos (0,13 à 0,55), valores elevados para crescimento (0,64 à 0,68) e moderados a alto para forma do ovo (0,10 à 0,57). As estimativas de herdabilidades encontradas para qualidade dos ovos indicam uma alta variabilidade genética para ambos os grupos genéticos. Já para os pesos, indicaram que a seleção dentro da população poderia resultar em aumentos dos pesos por meio da seleção baseada na informação individual. Para as características de forma de ovo, os valores de herdabilidade sugerem a possibilidade de grupos genéticos que atendam a um padrão de forma.<br>The objective of this study to determine the heritability of characteristics of productive and reproductive performance of different genetic groups of arrays of meat quails, estimating genetic parameters using univariate analyzes. We evaluated two genetic groups (UFV1 and UFV2) in the period 2006 to 2009, being accompanied by five generations, totaling 2136 arrays. Quail were weighed at birth, 7, 14, 21, 28, 35, 42, 77, 112 and 147 days of age. We evaluated each quail eggs were collected for three consecutive days, during four periods of 35 days and measured the width and length of eggs, yolk weight, albumen and shell. We evaluated the specific gravity of eggs and measured the rate of overall posture and age at first egg. Univariate analyzes were performed to estimate the variance components, using the method of restricted maximum likelihood using the program and calculated the MTDFREML hedabilidades. For the quality of eggs heritability values were moderate to high (0.13 to 0.55), high values for growth (0.64 to 0.68) and moderate to high for egg shape (0.10 to 0.57). Heritability estimates for egg quality found indicate a high genetic variability for both genetic groups. As for the weights indicated that selection within the population could result in increases in weight by selection based on individual information. For the characteristics of an egg shape, the heritability values suggest the possibility of genetic groups that meet a standard shape

Modelos de regressão aleatória na seleção de codornas de corte para produção de ovos

O objetivo deste trabalho foi avaliar modelos de regressão aleatória com diferentes ordens de polinômios de Legendre, quanto ao melhor ajuste para a produção de ovos de codornas de corte. Foram avaliados os grupos genéticos UFV1 e UFV2 de codornas de corte, de origens distintas, do programa de melhoramento genético da Universidade Federal de Viçosa. Determinou-se a produção semanal de ovos de 1.294 matrizes, da 6ª até a 57ª semana de idade, das quais 644 do grupo genético UFV1 e 650 do UFV2. Utilizou-se o modelo animal em regressão aleatória pelo programa Wombat e, para modelar as trajetórias das características com o tempo, aplicaram-se as funções polinomiais de Legendre. Foram feitas comparações pelo critério de informação de Akaike, critério de informação bayesiano de Schwarz, logaritmo da função de verossimilhança e teste da razão de verossimilhança. O modelo com K = 3, para efeitos fixos, Ka = 4, para efeitos genéticos, e Kc = 4, para efeito de ambiente, propicia melhor ajuste para ambas as linhagens, não provoca grandes alterações nos componentes de variância e fornece melhores estimativas de herdabilidade.The objective of this work was to evaluate random regression models with different orders of Legendre polynomials, as to the best fit for egg production of meat‑type quails. UFV1 and UFV2 genetic groups of meat‑type quails, from different origins, of the genetic breeding program of the Universidade Federal de Viçosa, Brazil, were evaluated. Egg production was determined weekly for 1,294 quails, from their 6th to their 57th week of age, of which 644 were from the genetic group UFV1, and 650 from UFV2. The animal model was used in random regression by Wombat software, and, for modeling variable trajectories in time, the Legendre's polynomial functions were applied. Comparisons were made by the Akaike's information criterion, the Bayesian information criterion of Schwarz, the logarithm of the likelihood function, and the likelihood ratio test. The model with K = 3, for fixed effects, Ka = 4, for genetic effects, and Kc = 4, for the effect of environment provides the best fit, do not causes major changes in the variance components, and provides better estimates of heritability

Modelos de regressão aleatória na seleção de codornas de corte para produção de ovos

O objetivo deste trabalho foi avaliar modelos de regressão aleatória com diferentes ordens de polinômios de Legendre, quanto ao melhor ajuste para a produção de ovos de codornas de corte. Foram avaliados os grupos genéticos UFV1 e UFV2 de codornas de corte, de origens distintas, do programa de melhoramento genético da Universidade Federal de Viçosa. Determinou-se a produção semanal de ovos de 1.294 matrizes, da 6ª até a 57ª semana de idade, das quais 644 do grupo genético UFV1 e 650 do UFV2. Utilizou-se o modelo animal em regressão aleatória pelo programa Wombat e, para modelar as trajetórias das características com o tempo, aplicaram-se as funções polinomiais de Legendre. Foram feitas comparações pelo critério de informação de Akaike, critério de informação bayesiano de Schwarz, logaritmo da função de verossimilhança e teste da razão de verossimilhança. O modelo com K = 3, para efeitos fixos, Ka = 4, para efeitos genéticos, e Kc = 4, para efeito de ambiente, propicia melhor ajuste para ambas as linhagens, não provoca grandes alterações nos componentes de variância e fornece melhores estimativas de herdabilidade.The objective of this work was to evaluate random regression models with different orders of Legendre polynomials, as to the best fit for egg production of meat‑type quails. UFV1 and UFV2 genetic groups of meat‑type quails, from different origins, of the genetic breeding program of the Universidade Federal de Viçosa, Brazil, were evaluated. Egg production was determined weekly for 1,294 quails, from their 6th to their 57th week of age, of which 644 were from the genetic group UFV1, and 650 from UFV2. The animal model was used in random regression by Wombat software, and, for modeling variable trajectories in time, the Legendre's polynomial functions were applied. Comparisons were made by the Akaike's information criterion, the Bayesian information criterion of Schwarz, the logarithm of the likelihood function, and the likelihood ratio test. The model with K = 3, for fixed effects, Ka = 4, for genetic effects, and Kc = 4, for the effect of environment provides the best fit, do not causes major changes in the variance components, and provides better estimates of heritability