Listeria monocytogenes, išskirtų iš ligonių, maisto ir aplinkos šaltinių, įvairovė Norvegijoje

325 Listeria monocytogenes izoliatai iš žmogaus, maisto ir gamtinės aplinkos šaltinių išanalizuoti automatine „DuPont Qualicon RiboPrinter®“ sistema, naudojant EcoR1 fermentus. Visi žmogaus izoliatai (n=137) paimti 1992–2005 metais iš ligonių. Maisto ir gamtinės aplinkos izoliatai surinkti Norvegijoje 1989–2002 metais iš skirtingų su maistu susijusių šaltinių. Iš viso identifikuotos 37 L. monocytogenes padermės. Dažniausiai aptinkamos padermės išskirtos tiek iš žmogaus, tiek ir iš maisto bei aplinkos. Išimtis – padermės DUP-1062D ir 1058A, rastos maiste ir aplinkoje (atitinkamai 14 ir 5 atvejai), o DUP-1042A aptikta tik ligonių izoliatuose. DUP-1030A daržniausiai randama tarp žmogaus izoliatų, o DUP-1042B, DUP-1042C, DUP-1049B ir DUP-1062B – visuose šaltiniuose. Iš ligonių, maisto ir aplinkos išskirtų izoliatų dažniausios padermės buvo DUP-1039C (n=54) ir DUP-1045B (n=27). Izoliatai pagal gautus rezultatus suskirstyti į dvi giminingas linijas. I linijos padermė DUP-1038B iš ligonių išskirta kiekvienais 1992–2005 metais. Iš 137 listeriozės atvejų – 76 (55,6 proc.) priklausė II linijos sukėlėjams. Nustatyta ryški priklausomybė tarp padermių, giminingų linijų ir išskyrimo šaltiniųA total of 325 Listeria monocytogenes isolates from human, food and environmental sources were ribotyped with the Qualicon Automated Riboprinter Microbial Characterization System, using the enzyme EcoR1. The human isolates (n=137) represented all isolates from clinical cases in Norway from 1992 to 2005. The food and environmental isolates (n=188) were collected from different food related sources in Norway in the period 1989–2002. A total of 37 ribotypes were differentiated. Most common ribotypes (i.e., ribotypes represented by >5 isolates) were isolated from human as well as food and environmental sources. The exceptions were ribotypes DUP-1062D and 1058A, which were found only among food and environmental samples (14 and 5 times, respectively), and DUP-1042A, which was identified only among human clinical isolates. DUP-1030A, the most frequent ribotype among the human isolates, as well as ribotypes DUP-1042B, DUP-1042C, DUP-1049B and DUP-1062B were identified from both foods, environmental and human sources. DUP-1039C (n=54) and DUP-1045B (n=27) were frequently isolated from patients, food and environmental samples. The isolates were classified into lineages based on ribotyping results. The lineage I strain DUP-1038B was isolated every year from 1992 to 2005 from the human clinical samples. Out of 137 listeriosis cases, 76 (55.6%) were caused by lineage II strains. We found a considerable overlap between ribotypes, lineages and isolation sources. It does not seem possible to establish food strain specific regulations for L. monocytogenes based on ribotypingBiologijos katedraVytauto Didžiojo universiteta

“Listeria monocytogenes” paplitimas ir įvairovė Norvegijos lašišinių žuvų apdorojimo įmonėse

Penkiose Norvegijos lašišinių žuvų apdorojimo įmonėse buvo tiriamas bakterijų Listeria monocytogenes paplitimas. Iš viso ištirta ir identifikuota 226 L. monocytogenes padermės. Izoliatams atpažinti ir diferencijuoti naudota automatinė „DuPont Qualicon RiboPrinter®“ sistema, pirminėms molekulinėms padermėms nustatyti naudojant EcoR1 fermentus. Tyrimai parodė, kad subtipai DUP-1023C, DUP-1039C, DUP-1044E, DUP- 1045B, DUP-1046A, DUP-1062B ir 1062C tirtose įmonėse buvo visą tyrimų laiką. Iš jų penki (DUP-1023C, DUP- 1039C, DUP-1046A, DUP-1062B ir 1062C) buvo randami dažniausiai, o subtipai DUP-1045B ir DUP-1039C aptikti keturiose iš penkių tirtų įmonių. Devyni subtipai buvo izoliuoti pavieniais atvejaisFive salmon processing plants were investigated for periods of eight (plants A and B) and four (plants C, D and E) months for the occurrence of Listeria monocytogenes. A total of 226 strains of L. monocytogenes were isolated and subtyped. Automated ribotyping with DuPont Qualicon RiboPrinter® system with the enzyme EcoR1 was used to differentiate and characterize isolates for simple molecular tracking. The isolated strains could be divided into 16 DuPont ribotypes. The ribotypes DUP-1023C, DUP-1039C, DUP-1044E, DUP-1045B, DUP-1046A, DUP-1062B and 1062C were found to be persistent in the plants, as they were found through the whole sampling period. The remaining 9 ribotypes were isolated sporadically. Five of the persistent subtypes (DUP-1023C, DUP-1039C, DUP- 1046A, DUP-1062B and 1062C) where isolated in high numbers. Ribotype DUP-1045B and DUP-1039C were found in four of the five investigated plantsBiologijos katedraVytauto Didžiojo universiteta