Detecting spatial aggregation from distance sampling: a probability distribution model of nearest neighbor distance

Spatial point pattern is an important tool for describing the spatial distribution of species in ecology. Negative binomial distribution (NBD) is widely used to model spatial aggregation. In this paper, we derive the probability distribution model of event-to-event nearest neighbor distance (distance from a focal individual to its n-th nearest individual). Compared with the probability distribution model of point-to-event nearest neighbor distance (distance from a randomly distributed sampling point to the n-th nearest individual), the new probability distribution model is more flexible. We propose that spatial aggregation can be detected by fitting this probability distribution model to event-to-event nearest neighbor distances. The performance is evaluated using both simulated and empirical spatial point patterns

The relative importance of dispersal limitation and habitat preference in shaping spatial distribution of saplings in a tropical moist forest: a case study along a combination of hydromorphic and canopy disturbance gradients

International audienceDivers processus gouvernent la composition floristique stationnelle en forêt tropicale hyperdiverse. La contribution relative des facteurs environnementaux et de la dispersion limitée n’est pas clairement établie. Nous examinons dans cette étude deux types de contraintes environnementales: le régime de drainage d’une part et l’impact des perturbations d’une exploitation forestière passée d’autre part. Nous utilisons un modèle logistique pour prédire la présence ou l’absence d’une espèce dans un réseau de placettes de 25m2. L’effet de facteurs environnementaux et d’un terme de corrélation spatiale sont estimés conjointement fournissant ainsi pour chaque espèce une estimation du poids relatif de l’affinité avec chacune des caractéristiques environnementales locale et de la limitation de dispersion. A l’échelle de la communauté la limitation de dispersion se révèle être le facteur prépondérant. Les deux variables environnementales semblent jouer un rôle d’importance comparable. Le poids des facteurs varie très nettement entre espèces. La distribution spatiale d’une grande proportion d’espèces —la majorité des espèces les plus abondantes — est sensible à au moins un des deux facteurs environnementaux étudiés. Nous proposons un classement de 49 espèces en termes de sensibilité à l’ouverture de la canopée (depuis les plus sciaphiles jusqu’aux espèces pionnières) et un classement de 41 espèces en termes de sensibilité (attraction ou répulsion) à l’engorgement saisonnier des sols