Endometrial DNA methylation signatures during the time of breeding in relation to the pregnancy outcome in postpartum dairy cows fed a control diet or supplemented with rumen-protected methionine

Post calving metabolic stress reduces the fertility of high producing dairy cows possibly by altering the expression of genes in the maternal environment via epigenetic modifications. Therefore, this study was conducted to identify endometrial DNA methylation marks that can be associated with pregnancy outcomes in postpartum cows at the time of breeding. For this, twelve days post-calving, cows were either offered a control diet or supplemented daily with rumen-protected methionine. Cows showing heat 50–64 days postpartum were artificially inseminated. Endometrial cytobrush samples were collected 4–8 h after artificial insemination and classified based on the pregnancy out comes as those derived from cows that resulted in pregnancy or resulted in no pregnancy. The DNAs isolated from endometrial samples were then subject to reduced representative bisulfite sequencing for DNA methylation analysis. Results showed that in the control diet group, 1,958 differentially methylated CpG sites (DMCGs) were identified between cows that resulted in pregnancy and those that resulted in no pregnancy of which 890 DMCGs were located on chr 27: 6217254–6225600 bp. A total of 537 DMCGs were overlapped with 313 annotated genes that were involved in various pathways including signal transduction, signalling by GPCR, aldosterone synthesis and secretion. Likewise, in methionine supplemented group, 3,430 CpG sites were differentially methylated between the two cow groups of which 18.7% were located on Chr27: 6217254–6225600 bp. A total of 1,781 DMCGS were overlapped with 890 genes which involved in developmental and signalling related pathways including WNT-signalling, focal adhesion and ECM receptor interaction. Interestingly, 149 genes involved in signal transduction, axon guidance and non-integrin membrane-ECM interactions were differentially methylated between the two cow groups irrespective of their feeding regime, while 453 genes involved in axon guidance, notch signalling and collagen formation were differentially methylated between cows that received rumen protected methionine and control diet irrespective of their fertility status. Overall, this study indicated that postpartum cows that could potentially become pregnant could be distinguishable based on their endometrial DNA methylation patterns at the time of breeding

French ichthyological records for 2017

Uncommon records of fishes may evidence local or global changes of fish composition resulting from environmental modifications or anthropic activities. Significant records of uncommon marine fishes, including threatened species, collected in French waters or by French vessels in European waters are reported for the year 2017. They include first, new, rare and unusual records for the following species: Sphyrna zygaena, Acipenser sturio, Muraena helena, Nessorhamphus ingolfianus, Evermannella balbo, Raniceps raninus, Cheilopogon heterurus, Scopelogadus beanii, Zenopsis conchifer, Eutelichthys leptochirus, Serranus cabrilla, Naucrates ductor, Seriola rivoliana, Gobius gasteveni, Gobius paganellus, Lepidocybium flavobrunneum, Ruvettus pretiosus, Hippoglossus hippoglossus, and Sphoeroides pachygaster.Les signalements inhabituels de poissons peuvent témoigner de changements locaux ou globaux résultant de modifications environnementales ou d’activités anthropiques. Des signalements remarquables de poissons marins, comprenant des espèces menacées, collectés dans les eaux françaises ou bien par des navires français dans les eaux européennes sont mentionnés pour l’année 2017. Ils comprennent des premiers et nouveaux signalements ainsi que des signalements rares et inhabituels pour les espèces : Sphyrna zygaena, Acipenser sturio, Muraena helena, Nessorhamphus ingolfianus, Evermannella balbo, Raniceps raninus, Cheilopogon heterurus, Scopelogadus beanii, Zenopsis conchifer, Eutelichthys leptochirus, Serranus cabrilla, Naucrates ductor, Seriola rivoliana, Gobius gasteveni, Gobius paganellus, Lepidocybium flavobrunneum, Ruvettus pretiosus, Hippoglossus hippoglossus et Sphoeroides pachygaster

Situation de la pêche en Guadeloupe en 2017

Le présent document est une restitution globale des données disponibles au sein du SIH sur les navires de pêche français, et en particulier : • le fichier « Flotte de Pêche Communautaire » (FPC), qui référence l'ensemble des navires de pêche professionnelle de la flotte française et leurs caractéristiques techniques (source : DPMA) ; • les données du flux déclaratif, c'est-à-dire les déclarations de captures et d'effort de pêche des pêcheurs professionnels, issues des journaux de bord pour les navires de 10 mètres et plus et des fiches de pêche pour les navires de moins de 10 mètres (source : DPMA) ; • les données de ventes (essentiellement des ventes en criée) des navires de pêche professionnelle (source : DPMA) ; • les données d'enquêtes « Activité » réalisées chaque année par le réseau des observateurs du SIH pour l'ensemble des navires inscrits au fichier Flotte de Pêche Communautaire : ces enquêtes visent à reconstituer le calendrier d'activité des navires, sur une base mensuelle, à partir du flux déclaratif (journaux de bord, fiches de pêche et données de vente en criée) quand il existe, et au moyen d'enquêtes directes auprès des armateurs de ces navires et de leurs représentants professionnels. Chaque mois, le calendrier d'activité précise si le navire a été actif à la pêche, et si oui, les différents métiers pratiqués. Par «métier», on entend la mise en oeuvre d'un engin de pêche afin de capturer une ou plusieurs espèces cibles dans une zone de pêche donnée (source : Ifremer - DPMA) ; • Les données d'observation des marées au débarquement permettent sur la base d'un plan d'échantillonnage de connaître les métiers pratiqués et reconstituer le déroulement de la marée (métiers, effort de pêche, captures et coûts associés) et de mesurer tout ou partie des captures de certaines espèces commerciales. Les données collectées ont bénéficié d'un cofinancement de l'Union Européenne et de la DPMA et de la région Guadeloupe. Ce document correspond à un premier traitement des données de l'année de référence, et ne prétend pas rendre compte de l'ensemble des données disponibles. Les indicateurs présentés portent sur une photographie de la flotte de pêche en 2017 : ils synthétisent ainsi l'ensemble des données 2017 des navires enregistrés au FPC présents sur la région Guadeloupe. NB : La totalité de leur activité de l'année est prise en compte, y compris lorsque le navire a passé une partie de l'année sur un autre secteur. Ceci peut expliquer la présence, dans cette fiche, de métiers, d'engins, d'espèces ou de ports d'exploitation que l'on ne rencontre généralement pas sur le secteur de la région Guadeloupe

Situation de la pêche en Guadeloupe en 2018.

Le présent document est une restitution globale des données disponibles au sein du SIH sur les navires de pêche français, et en particulier : • le fichier « Flotte de Pêche Communautaire » (FPC), qui référence l'ensemble des navires de pêche professionnelle de la flotte française et leurs caractéristiques techniques (source : DPMA) ; • les données du flux déclaratif, c'est-à-dire les déclarations de captures et d'effort de pêche des pêcheurs professionnels, issues des journaux de bord pour les navires de 10 mètres et plus et des fiches de pêche pour les navires de moins de 10 mètres (source : DPMA) ; • les données de ventes (essentiellement des ventes en criée) des navires de pêche professionnelle (source : DPMA) ; • les données d'enquêtes « Activité » réalisées chaque année par le réseau des observateurs du SIH pour l'ensemble des navires inscrits au fichier Flotte de Pêche Communautaire : ces enquêtes visent à reconstituer le calendrier d'activité des navires, sur une base mensuelle, à partir du flux déclaratif (journaux de bord, fiches de pêche et données de vente en criée) quand il existe, et au moyen d'enquêtes directes auprès des armateurs de ces navires et de leurs représentants professionnels. Chaque mois, le calendrier d'activité précise si le navire a été actif à la pêche, et si oui, les différents métiers pratiqués. Par «métier», on entend la mise en oeuvre d'un engin de pêche afin de capturer une ou plusieurs espèces cibles dans une zone de pêche donnée (source : Ifremer - DPMA) ; • Les données d'observation des marées au débarquement permettent sur la base d'un plan d'échantillonnage de connaître les métiers pratiqués et reconstituer le déroulement de la marée (métiers, effort de pêche, captures et coûts associés) et de mesurer tout ou partie des captures de certaines espèces commerciales. Les données collectées ont bénéficié d'un cofinancement de l'Union Européenne et de la DPMA et de la région Guadeloupe. Ce document correspond à un premier traitement des données de l'année de référence, et ne prétend pas rendre compte de l'ensemble des données disponibles. Les indicateurs présentés portent sur une photographie de la flotte de pêche en 2018 : ils synthétisent ainsi l'ensemble des données 2018 des navires enregistrés au FPC présents sur la région Guadeloupe. NB : La totalité de leur activité de l'année est prise en compte, y compris lorsque le navire a passé une partie de l'année sur un autre secteur. Ceci peut expliquer la présence, dans cette fiche, de métiers, d'engins, d'espèces ou de ports d'exploitation que l'on ne rencontre généralement pas sur le secteur de la région Guadeloupe

Compensation écologique

Longtemps ignorée et perçue comme un outil de dernier recours, la priorité devant aller à la prévention des atteintes au milieu naturel, la compensation écologique, mise sous les projecteurs par la loi n° 2016-1087 du 8 août 2016 pour la reconquête de la biodiversité, de la nature et des paysages, est aujourd’hui devenue une notion phare du droit de l’environnement. Des questionnements persistent néanmoins du fait d’imprécisions juridiques qui résident dans la notion même de compensation, les difficultés liées à l’évaluation de la perte de biodiversité, ou encore la pluralité des compensations écologiques donnant lieu à des régimes juridiques afférents dissemblables. Il est certain que l’indétermination initiale d’un régime des mesures de compensation a permis une grande flexibilité dans leur application, au bonheur des acteurs économiques, mais a également généré des difficultés, voire des défaillances pratiques lors de la mise en œuvre effective de ces mesures de compensation. Aux vues de ces différents constats, l’équipe de l’Institut de droit de l’environnement et du développement durable s’est tournée vers l’Agence ITER France, avec qui la Faculté de droit et science politique d’Aix-Marseille a développé un partenariat, afin d’étudier la mise en œuvre de mesures compensatoires, à partir d’un exemple d’une envergure particulièrement contraignante et novatrice du fait, notamment, du cadre de concertation mis en place pour définir les mesures compensatoires pertinentes. L’étude du modèle mis en œuvre permettra d’en retirer les éléments caractéristiques et d’en apprécier la portée. Partir de cette expérience pragmatique, présente l’intérêt scientifique de rechercher à conceptualiser un modèle de référence, tout en examinant également d’autres expériences de compensation mise en œuvre par des maîtres d’ouvrages différents

Synthèse 2017 de l’observation des efforts et débarquements des pêcheries côtières. Estimation des efforts de pêche et des productions dans les régions Méditerranée continentale, La Réunion, Martinique, Guadeloupe et Guyane pour les navires de moins de 12m.

Le programme d’observation des marées au débarquement, appelé « ObsDEB », contribue à l’estimation de l’effort de pêche et des captures des flottes de pêche françaises. Il vise tout particulièrement les flottilles de petite pêche côtière et procède à la collecte des informations requises selon un plan d’échantillonnage adapté à chaque région suivie. Ce rapport est le Rapport annuel de Convention DPMA-Ifremer 2017 et présente les estimations 2017 des efforts de pêche et des productions dans les régions Méditerranée continentale, La Réunion, Martinique, Guadeloupe et Guyane

ORFISH - Development of innovative, low-impact offshore fishing practices for small-scale vessels in outermost regions - MARE/2015/06. WP3 Developing and testing low impact fishing techniques

In many European fisheries and particularly ORs, small-scale vessels are often multipurpose targeting different species using different gears. Given the narrow island shelves, vessels may develop their activity in coastal areas, on the edge of the continental shelf or offshore in deep-water or large pelagic fisheries but it is currently difficult to quantify the distribution of fishing effort between the different fishing gears and between the different areas. it is an important issue to better quantify the fishing effort, its spatial and temporal distribution with the principal objective of alleviating fishing pressure on the coastal fishing resources. The EU legislation requires that all coastal EU countries over 12 meters should set up a Vessel Monitoring System (VMS). Used by the fisheries authorities for real time fisheries controls, VMS data and more generally any geo-tracking devices can also be used for knowledge and scientific purposes, especially for the analysis of fishing effort distribution. Without such geo-tracking device for the smaller vessels, it is much more difficult to spatialize the activity of SSCF, strongly dependent of coastal limited territories and highly submitted to concurrent uses. In this study, we propose to experiment the equipment a sample of voluntary fishing vessels with geo-tracking devices in different ORs, in order to follow the distribution of their fishing activity, only for knowledge purposes. The experiment will concern a maximum of 4 voluntary fishers by OR with a strong priority for the vessels involved in the experimental fishing trips (see previous tasks). The Task benefited from the experience of Ifremer, which developed the Recopesca project in the early 2000s, to equip a high-frequency geolocation system for voluntary vessels, including small-scale coastal fishing vessels. https://wwz.ifremer.fr/recopesca/Le-projet-RECOPESCA/Description-du-projet