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    Mesoamerican tree squirrels evolution (Rodentia: Sciuridae): a molecular phylogenetic analysis

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    The tribe Sciurini comprehends the genera Sciurus, Syntheosiurus, Microsciurus, Tamiasciurus and Rheinthrosciurus. The phylogenetic relationships within Sciurus have been only partially done, and the relation ship between Mesoamerican species remains unsolved. The phylogenetic relationships of the Mesoamerican tree squirrels were examined using molecular data. Sequence data publicly available (12S, 16S, CYTB mitochondrial genes and IRBP nuclear gene) and cytochrome B gene sequences of four previously not sampled Mesoamerican Sciurus species were analyzed under a Bayesian multispecies coalescence model. Phylogenetic analysis of the multilocus data set showed the neotropical tree squirrels as a monophyletic clade. The genus Sciurus was para phyletic due to the inclusion of Microsciurus species (M. alfari and M. flaviventer). The South American species S. aestuans and S. stramineus showed a sister taxa relationship. Single locus analysis based on the most compact and complete data set (i.e. CYTB gene sequences), supported the monophyly of the South American species and recovered a Mesoamerican clade including S. aureogaster, S. granatensis and S. variegatoides. These results corroborated previous findings based on cladistic analysis of cranial and post-cranial characters. Our data sup port a close relationship between Mesoamerican Sciurus species and a sister relationship with South American species, and corroborates previous findings in relation to the polyphyly of Microsciurus and Syntheosciurus’ paraphyly. Rev. Biol. Trop. 62 (2): 649-657. Epub 2014 June 01.La tribu Sciurini comprende los géneros Sciurus, Syntheosiurus, Microsciurus, Tamiasciurus y Rheinthrosciurus. Las relaciones filogenéticas dentro de Sciurus se han hecho solo parcialmente, y la relación entre las especies mesoamericanas sigue sin resolverse. Las relaciones filogenéticas de las ardillas arbóreas mesoamericanas se examinaron utilizando datos moleculares. Los datos de secuencia disponibles públicamente (12S, 16S, genes mitocondriales CYTB y gen nuclear IRBP) y las secuencias del gen del citocromo B de cuatro especies mesoamericanas de Sciurus no muestreadas previamente se analizaron bajo un modelo de coalescencia multiespecie bayesiano. El análisis filogenético del conjunto de datos multilocus mostró que las ardillas arbóreas neotropicales eran un clado monofilético. El género Sciurus fue parafilético debido a la inclusión de especies de Microsciurus (M. alfari y M. flaviventer). Las especies sudamericanas S. aestuans y S. stramineus mostraron una relación taxonómica hermana. El análisis de locus único basado en el conjunto de datos más compacto y completo (es decir, secuencias del gen CYTB), apoyó la monofilia de las especies sudamericanas y recuperó un clado mesoamericano que incluía a S. aureogaster, S. granatensis y S. variegatoides. Estos resultados corroboraron hallazgos previos basados ​​en análisis cladísticos de caracteres craneales y poscraneales. Nuestros datos respaldan una estrecha relación entre las especies mesoamericanas de Sciurus y una relación de hermanas con especies sudamericanas, y corroboran hallazgos previos en relación con la polifilia de Microsciurus y la parafilia de Syntheosciurus. Rev. Biol. trop. 62 (2): 649-657. Epub 2014 01 de junio.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Ciencias Biológica

    Canine distemper virus in wild felids of Costa Rica

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    Several highly infectious diseases can be transmitted through feces and cause elevated mortality among carnivore species. One such infectious agent, canine distemper virus (CDV; Paramyxoviridae: Morbillivirus), has been reported to affect wild carnivores, among them several felid species. We screened free-ranging and captive wild carnivores in Costa Rica for CDV. Between 2006 and 2012, we collected 306 fecal samples from 70 jaguars (Panther onca), 71 ocelots (Leopardus pardalis), five jaguarundis (Puma yaguaroundi), 105 pumas (Puma concolor), five margays (Leopardus wiedii), 23 coyotes (Canis latrans), and 27 undetermined Leopardus spp. We found CDV in six individuals: one captive jaguarundi (rescued in 2009), three free-ranging ocelots (samples collected in 2012), and two freeranging pumas (samples collected in 2007). Phylogenetic analyses were performed using sequences of the phosphoprotein (P) gene. We provide evidence of CDV in wild carnivores in Costa Rica and sequence data from a Costa Rican CDV isolate, adding to the very few sequence data available for CDV isolates from wild Central American carnivores. © Wildlife Disease Association 2016.Varias enfermedades altamente infecciosas pueden transmitirse a través de las heces y causar una elevada mortalidad entre las especies de carnívoros. Se ha informado de que uno de esos agentes infecciosos, el virus del moquillo canino (CDV; Paramyxoviridae: Morbillivirus), afecta a los carnívoros silvestres, entre ellos varias especies de félidos. En Costa Rica se examinaron los carnívoros silvestres en libertad y en cautiverio para detectar el CDV. Entre 2006 y 2012, recogimos 306 muestras fecales de 70 jaguares (Panther onca), 71 ocelotes (Leopardus pardalis), cinco jaguarundis (Puma yaguaroundi), 105 pumas (Puma concolor), cinco tigrillos (Leopardus wiedii), 23 coyotes (Canis latrans) y 27 Leopardus spp. indeterminados. Encontramos VCD en seis individuos: un jaguarundi en cautiverio (rescatado en 2009), tres ocelotes en libertad (muestras recogidas en 2012) y dos pumas en libertad (muestras recogidas en 2007). Se realizaron análisis filogenéticos utilizando secuencias del gen de la fosfoproteína (P). Proporcionamos pruebas del VCD en carnívoros silvestres de Costa Rica y datos de secuencias de un aislado de VCD de Costa Rica, que se suman a los muy pocos datos de secuencias disponibles para aislados de VCD de carnívoros silvestres de América Central.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Medicina Veterinari
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